amckenna41 / protPy
Calculating a range of protein descriptors using their physicochemical, biological and structural properties 🔬.
amckenna41/protPy erreicht einen Gesundheitsindex von 56 von 100 und liegt damit im Bereich Mittel. Am stärksten schneidet es bei Engineering Quality (75/100) ab, am schwächsten bei AI Readiness (43/100). Zuletzt heute aktualisiert. Ein einzelner Mitwirkender trägt den Großteil der jüngsten Arbeit.
Software-Gesundheitsindex
Metriken werden auf einer standardisierten Skala von 1–100 in gewichtete Kategorien gruppiert. Der Gesamtwert beginnt als ihr gewichtetes Mittel, kalibriert auf die Verteilung des öffentlichen Registers, sodass die Stufen Perzentilbedeutung tragen; sobald öffentliche Evidenz die Richtlinie für Hochrisikojurisdiktionen auslöst, wird die Bewertung angepasst und erhält die Obergrenze Gefährdet von 34.
Bewertungsprofil
Jede Achse ist eine Kategorie. Die Form zählt mehr als der Durchschnitt — ein gesundes Projekt füllt die gesamte Fläche, während ein Profil aus Spitzen und Kratern bedeutet, dass Stärke in einer Dimension Risiken in einer anderen verdeckt.
Der gewichtete Gesamtwert 54 wird auf der veröffentlichten Indexskala auf 56 kalibriert (Register-Kalibrierung 2026-08-02).
Eigentümerschaft
Dieses Repository gehört einem persönlichen Konto. Ein Projekt mit nur einem Eigentümer trägt ein höheres Kontinuitätsrisiko als ein organisationsgetragenes.
Paket-Ökosysteme
| Registry | Paket | Version | Downloads / Monat | Versionen | Zuletzt veröffentlicht | Tags |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PyPI | protpy | 1.5.0 | 2.429 | 21 | vor 0 Tagen | bioinformaticsprotein-engineeringpythonpypimachine-learningaaindexprotein-descriptorsphysicochemical-descriptorsbiochemical-descriptorsstructural-descriptorspysar |
Metriken nach Kategorie
Vitalität
Lebt das Projekt — wird Code geschrieben und werden Releases ausgeliefert?
Entwicklungsaktivität
Wie die Bewertung erfolgt
| 36/36 | Push-Aktualität — letzter Push vor 0 Tagen |
| 3.5/36 | Commit-Rhythmus — 5/52 Wochen mit Commits |
| 12.9/18 | Commit-Volumen — 26 Commits im letzten Jahr |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 18 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
Verwendete Eingangsdaten
| commits_last_year | 26 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 0 |
| active_weeks_last_year | 5 |
Release-Disziplin
Wie die Bewertung erfolgt
| 27/27 | Liefert Releases aus — 4 Releases veröffentlicht |
| 16.2/36 | Release-Aktualität — letztes Release vor 195 Tagen |
| 5.4/27 | Release-Rhythmus — ein Release etwa alle 380,7 Tage |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
Verwendete Eingangsdaten
| releases_count | 4 |
| latest_release_tag | v1.3.0 |
| releases_from_tags | nein |
| days_since_latest_release | 195 |
| mean_days_between_releases | 380,7 |
Community & Verbreitung
Hat das Projekt Nutzer, Downloads, Aufmerksamkeit und ein einladendes Umfeld für Beitragende?
Popularität & Verbreitung
Wie die Bewertung erfolgt
| 19.5/60 | Stars — 17 Stars |
| 0/25 | Forks — 0 Forks |
| 0/15 | Watcher — 1 Watcher |
Verwendete Eingangsdaten
| forks | 0 |
| stars | 17 |
| watchers | 1 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Community-Gesundheit
Wie die Bewertung erfolgt
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Lizenz — anerkannte Lizenz (MIT) |
| 18/18 | CONTRIBUTING-Leitfaden |
| 0/13.5 | Verhaltenskodex |
| 0/7.2 | Issue-Vorlage |
| 0/6.3 | PR-Vorlage |
Verwendete Eingangsdaten
| has_readme | ja |
| has_license | ja |
| readme_badges | 11 |
| has_contributing | ja |
| has_issue_template | nein |
| has_code_of_conduct | nein |
| readme_badge_services | codecov.io, github.com, readthedocs.org, shields.io |
| has_pull_request_template | nein |
Wie die Bewertung erfolgt
| 45.1/80 | Downloads pro Monat — 2.429 Downloads/Monat über pypi |
| 0/20 | Abhängige in der Registry — von diesem Ökosystem nicht ausgewiesen |
Verwendete Eingangsdaten
| packages | protpy |
| dependents | — |
| ecosystems | pypi |
| total_downloads | — |
| monthly_downloads | 2.429 |
| unverified_packages_excluded | — |
Nachhaltigkeit & Governance
Überdauert das Projekt die Menschen, die es tragen — Bus-Faktor, Reaktionsfähigkeit, Trägerschaft und Paketpflege?
Maintainer-Resilienz (Bus-Faktor)
Wie die Bewertung erfolgt
| 9/54 | Bus-Faktor — 1 Beitragende decken die Hälfte aller Commits ab |
| 0/22.5 | Commit-Verteilung — wichtigste beitragende Person verfasste 100 % der Commits |
| 1.4/13.5 | Breite der Beitragenden — 1 Beitragende |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 0 contributing companies or organizations -- score normalized to 0 |
Verwendete Eingangsdaten
| bus_factor | 1 |
| contributors_sampled | 1 |
| top_contributor_share | 1 |
Wie die Bewertung erfolgt
| 42/42 | Issue-Lösungsquote — 100 % der Issues geschlossen |
| 2.3/30 | PR-Annahme — 1/13 entschiedene PRs gemergt |
| 13/13 | Newcomer PR acceptance — 1/1 PRs von Erstbeitragenden in 30 Tagen gemergt |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/13 approved changesets -- score normalized to 0 |
Verwendete Eingangsdaten
| merged_prs | 1 |
| open_issues | 0 |
| closed_issues | 2 |
| prs_merged_7d | 1 |
| prs_decided_7d | 1 |
| prs_merged_30d | 1 |
| prs_decided_30d | 1 |
| issue_closed_ratio | 1 |
| closed_unmerged_prs | 12 |
| first_time_authors_30d | 1 |
| first_time_prs_merged_30d | 1 |
| first_time_prs_decided_30d | 1 |
Eigentümerschaft & Trägerschaft
Wie die Bewertung erfolgt
| 10/30 | Organisatorische Trägerschaft — persönliches (Nutzer-)Konto |
| 0/20 | Verifizierte Domain — für Nutzerkonten nicht anwendbar |
| 9.4/25 | Reichweite des Inhabers — 19 Follower von amckenna41 |
| 23.2/25 | Kontohistorie — 34 öffentliche Repos, Kontoalter ca. 7 Jahre |
Verwendete Eingangsdaten
| followers | 19 |
| owner_type | User |
| is_verified | — |
| owner_login | amckenna41 |
| public_repos | 34 |
| account_age_days | 2.830 |
Paketpflege
Wie die Bewertung erfolgt
| 25/25 | Veröffentlicht & auflösbar — 1 Paket(e) auf pypi |
| 35/35 | Veröffentlichungsaktualität — letzte Veröffentlichung vor 0 Tagen |
| 20/20 | Versionshistorie — 21 veröffentlichte Versionen |
| 20/20 | Nicht veraltet — aktiv, nicht veraltet oder zurückgezogen |
Verwendete Eingangsdaten
| packages | protpy |
| ecosystems | pypi |
| any_deprecated | nein |
| min_days_since_publish | 0 |
Engineering-Qualität
Sind grundlegende Engineering- und Dokumentationspraktiken vorhanden?
Wie die Bewertung erfolgt
| 24/24 | CI-Workflows — 3 Workflow(s) |
| 24/24 | Tests vorhanden |
| 0/16 | Linter-Konfiguration |
| 0/9.6 | Pre-Commit-Hooks |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 20/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
Verwendete Eingangsdaten
| has_ci | ja |
| has_tests | ja |
| has_editorconfig | nein |
| has_linter_config | nein |
| has_precommit_config | nein |
Dokumentation
Wie die Bewertung erfolgt
| 30/30 | README |
| 25/25 | Dokumentationsverzeichnis |
| 0/15 | Dokumentations-/Homepage-Site |
| 10/10 | Repository-Beschreibung |
| 10/10 | Topics — 8 Topics |
| 10/10 | Wiki |
Verwendete Eingangsdaten
| topics | bioinformatics, biological-data-analysis, protein-sequences, protein-structure, protein-structure-prediction, pypi, python, pysar |
| has_wiki | ja |
| homepage | — |
| docs_site | — |
| has_readme | ja |
| has_docs_dir | ja |
| has_description | ja |
Sicherheit
Sind die sichtbaren Sicherheits- und Lieferkettenpraktiken belastbar, ohne ungeklärte Exposition gegenüber Hochrisikojurisdiktionen?
Sicherheitslage
Wie die Bewertung erfolgt
| 7.5/7.5 | Binary-Artifacts — no binaries found in the repo |
| 0/7.5 | Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches |
| 2.5/2.5 | CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0/7.5 | Code-Review — Found 0/13 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 0/2.5 | Contributors — project has 0 contributing companies or organizations -- score normalized to 0 |
| 10/10 | Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected |
| 7.5/7.5 | Dependency-Update-Tool — update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Lizenz — license file detected |
| 7.5/7.5 | Maintained — 18 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| 0/5 | Packaging — keine Daten |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0/5 | SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 0/7.5 | Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 7.5/7.5 | Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected |
Verwendete Eingangsdaten
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 17 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 1 |
| scorecard_aggregate | 4,5 |
AI Readiness
Wie gut ist das Repository dafür ausgestattet, mit KI-Coding-Agenten entwickelt und gepflegt zu werden? Trägt ein bewusst kleines Gewicht (4 %): Agenten-Tooling ist ein echtes Pflegesignal, doch ein Repository ohne jedes Signal kann weiterhin 100/100 erreichen.
AI-Agentenkontext & Leitlinien
Wie die Bewertung erfolgt
| 0/45 | Agentenanweisungen — keine CLAUDE.md / AGENTS.md / Editor-Regeln |
| 0/15 | Maschinenlesbare Doku (llms.txt) |
| 4.2/40 | Lesbare Commit-Historie — 5 von 64 menschlichen Commits benennen ihre Absicht (strukturierter Betreff oder erläuternder Text) |
Verwendete Eingangsdaten
| has_llms_txt | nein |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,078 |
| agent_instruction_files | — |
| agent_instruction_max_bytes | — |
Wie die Bewertung erfolgt
| 18/18 | Bootstrap mit einem Befehl — docs/Makefile |
| 22/22 | Automatisierte Tests |
| 0/11 | Lint-/Format-Konfiguration |
| 0/11 | Statische Typprüfung |
| 0/10 | Reproduzierbare Umgebung |
| 3.1/10 | Belegte Agentenpraxis — 1 der letzten 64 Commits von Agenten verfasst oder ihnen zugeschrieben |
| 5/8 | Automatisierte Wartung — Abhängigkeits-Automatisierung konfiguriert, in den erfassten Commits nicht beobachtet |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
Verwendete Eingangsdaten
| has_nix | nein |
| has_tests | ja |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | nein |
| typed_language | nein |
| bootstrap_files | docs/Makefile |
| has_devcontainer | nein |
| has_linter_config | nein |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0,016 |
| toolchain_manifests | — |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
AI-Code-Lesbarkeit für Modelle
Wie die Bewertung erfolgt
| 0/45 | Typprüfbarer Code — Python ohne Typprüfungs-Konfiguration |
| 50.4/55 | Handhabbare Dateigrößen — 3/36 Quelldateien über 60 KB |
Verwendete Eingangsdaten
| primary_language | Python |
| largest_source_bytes | 86.825 |
| source_files_sampled | 36 |
| oversized_source_files | 3 |
Maschinenlesbare AI-Schnittstellen
Wie die Bewertung erfolgt
| 0/40 | API-Schema (OpenAPI/GraphQL/proto) — für diese Art von Software nicht anwendbar |
| 0/20 | MCP-Server — für diese Art von Software nicht anwendbar |
| 40/40 | Lauffähige Beispiele — examples, notebooks |
Verwendete Eingangsdaten
| example_dirs | examples, notebooks |
| has_mcp_signal | nein |
| api_schema_files | — |
| interfaces_expected_of | — |
Eckdaten
Warnungen zur Datenerhebung
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
- deps.dev does not index pypi:protpy@1.5.0; advisories assessed against the repository dependency graph instead
- No resolved dependencies carried a version and a supported ecosystem
Weitere Details
OpenSSF Scorecard 4.5 / 10
Unabhängige, werkzeugneutrale Sicherheitsbewertung durch das quelloffene OpenSSF Scorecard. Jede Prüfung honoriert eine Sicherheits-Praxis, nicht das Werkzeug eines bestimmten Anbieters. Prüfungen, die Scorecard nicht ermitteln konnte, sind mit k. A. markiert und vom Sicherheitswert ausgeschlossen (nie als null gezählt).
| 10 | Binary-Artifacts | no binaries found in the repo |
| 0 | Branch-Protection | branch protection not enabled on development/release branches |
| 10 | CI-Tests | 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0 | Code-Review | Found 0/13 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 0 | Contributors | project has 0 contributing companies or organizations -- score normalized to 0 |
| 10 | Dangerous-Workflow | no dangerous workflow patterns detected |
| 10 | Dependency-Update-Tool | update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 10 | Maintained | 18 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| k. A. | Packaging | packaging workflow not detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0 | SAST | SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| 0 | Signed-Releases | Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 0 | Token-Permissions | detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 10 | Vulnerabilities | 0 existing vulnerabilities detected |
Direkte Abhängigkeiten 5
| Registry | Paket | Versionsvorgabe | Manifest |
|---|---|---|---|
| PyPI | aaindex | >=1.3.1 | pyproject.toml |
| PyPI | numpy | >=2.0.0 | pyproject.toml |
| PyPI | pandas | >=2.0.2 | pyproject.toml |
| PyPI | tqdm | >=4.0.0 | pyproject.toml |
| PyPI | varname | >=0.15.1 | pyproject.toml |
Alle Abhängigkeiten 15
Vollständig aufgelöster Abhängigkeitssatz aus dem GitHub-Abhängigkeitsgraphen: 5 direkte und 10 indirekte (transitive) Pakete. Die transitive Hülle ist vollständig, wenn das Repository eine Lockfile eincheckt.
| Registry | Paket | Version | Beziehung |
|---|---|---|---|
| PyPI | aaindex | — | direkt |
| PyPI | numpy | — | direkt |
| PyPI | pandas | — | direkt |
| PyPI | tqdm | — | direkt |
| PyPI | varname | — | direkt |
| PyPI | biopython | — | indirekt |
| PyPI | pytest | — | indirekt |
| PyPI | pytest-cov | — | indirekt |
| PyPI | pytest-flake8 | — | indirekt |
| PyPI | pytest-timeout | — | indirekt |
| PyPI | setuptools | — | indirekt |
| PyPI | sphinx | — | indirekt |
| PyPI | sphinx-autodoc-defaultargs | — | indirekt |
| PyPI | sphinx-autodoc-typehints | — | indirekt |
| PyPI | sphinx-rtd-theme | — | indirekt |
Abhängigkeits-Advisories nicht bewertet
Der Advisory-Abgleich konnte für diesen Bericht nicht ausgeführt werden: No resolved dependencies carried a version and a supported ecosystem
JSON-Rohbericht maschinenlesbar
Feedback
Stimmt etwas in diesem Bericht nicht, oder gibt es Gedanken dazu? Falsche Messungen, übersehene Tools, Ideen, Fragen — alles ist willkommen. Jede Nachricht wird gelesen und beantwortet.
Bewertungen sind Signale, keine Garantien. Sie spiegeln öffentlich sichtbare Praxis auf GitHub wider — kein Code-Audit und keine Sicherheitsgarantie.
Fehlende Daten werden ausgeschlossen und die Gewichte neu normiert, nie als null bewertet. Die Methodik ist versioniert und offen: Metriken v2.10.0, Schema v0.34.0 — vollständige Methodik · Metriken-Wiki.
Wie ein einzelnes Ergebnis im Gesamtregister steht: aggregierte Statistiken — PyPI.