mass-spectrometry — 开源软件健康

PyPI

84优秀健康指数

CompOmics/ms2rescore

Modular and user-friendly platform for AI-assisted rescoring of peptide identifications

Python★ 66↓ 21.8K/月2026年9月14日

Apache-2.02026年9月14日 · 指标 2.10.0

PyPI

84优秀健康指数

M4i-Imaging-Mass-Spectrometry/thyra

A modern Python library for converting Mass Spectrometry Imaging (MSI) data into standardized SpatialData/Zarr format, enabling seamless integration with spatial omics analysis workflows.

Python★ 25↓ 3,640/月2026年10月19日

MIT2026年10月19日 · 指标 2.10.0

PyPI · crates.io · npm

83优秀健康指数

Sigilweaver/OpenTFRaw

Pure-Rust reader for Thermo Fisher .raw mass-spectrometry files, with Python bindings.

Rust★ 13↓ 7,263/月2026年9月8日

自定义许可证2026年9月8日 · 指标 2.10.0

—

83优秀健康指数

smith-chem-wisc/mzLib

Library for mass spectrometry projects

C#★ 282026年9月17日

LGPL-3.02026年9月17日 · 指标 2.10.0

PyPI

78良好健康指数

CompOmics/ms2pip

MS²PIP: Fast and accurate peptide spectrum prediction for multiple fragmentation methods, instruments, and labeling techniques.

HTML · Jupyter Notebook★ 50↓ 23.7K/月2026年9月14日

Apache-2.02026年9月14日 · 指标 2.10.0

crates.io · PyPI

78良好健康指数

mobiusklein/mzdata

该仓库未发布描述。

Rust★ 44↓ 2,003/月2026年10月9日

Apache-2.02026年10月9日 · 指标 2.10.0

crates.io

75良好健康指数

Sigilweaver/OpenMassSpecCore

Shared core types and traits for the OpenProteo proteomics reader family.

Rust★ 1↓ 2,196/月2026年10月13日

自定义许可证2026年10月13日 · 指标 2.10.0

PyPI

73良好健康指数

MannLabs/alpharaw

An open-source Python package to unify raw MS data accession and storage.

Python · Jupyter Notebook★ 36↓ 4,389/月2026年10月19日

Apache-2.02026年10月19日 · 指标 2.10.0

—

69良好健康指数

HUPO-PSI/psi-ms-CV

HUPO-PSI mass spectrometry CV

Python★ 422026年9月20日

自定义许可证2026年9月20日 · 指标 2.10.0

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65良好健康指数

Vitek-Lab/MSstatsConvert

Converter functions for the MSstats package

R★ 122026年9月12日

自定义许可证2026年9月12日 · 指标 2.10.0

PyPI

63中等健康指数

MannLabs/alphaquant

An open-source Python package for accurate and sensitive peptide and protein quantification.

Python · Jupyter Notebook★ 21↓ 655/月2026年10月16日

Apache-2.02026年10月16日 · 指标 2.10.0

PyPI

60中等健康指数

EttoreRocchi/MaldiAMRKit

Comprehensive toolkit for MALDI-TOF mass spectrometry data preprocessing for antimicrobial resistance (AMR) prediction purposes

Jupyter Notebook · Python★ 3↓ 637/月2026年10月14日

MIT2026年10月14日 · 指标 2.10.0

PyPI

60中等健康指数

JnliaH/ChromaQuant

A project designed to ease the analysis and reporting of complex chromatography datasets.

Python★ 2↓ 74/月2026年9月10日

自定义许可证2026年9月10日 · 指标 2.10.0

PyPI

59中等健康指数

josiehong/3DMolMS

[Bioinformatics] 3DMolMS: prediction of tandem mass spectra from 3D molecular conformations

Python★ 24↓ 82/月2026年10月21日

自定义许可证2026年10月21日 · 指标 2.10.0

PyPI

51中等健康指数

bigbio/quantms-rescoring

quantms and ms2rescore helper functions and scripts

Python★ 1↓ 205/月2026年9月19日

Apache-2.02026年9月19日 · 指标 2.10.0

PyPI

45薄弱健康指数

Bio2Byte/scop3p-api-client

The official Scop3P REST API Python client for retrieving phospho-sites

Python★ 0↓ 97/月2026年9月8日

自定义许可证2026年9月8日 · 指标 2.10.0

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