Benson-Genomics-Lab / VNTRseek
VNTRSeek is a computational pipeline for the detection of VNTRs in short read sequencing data. It was developed by Yevgeniy Gelfand, Yozen Hernandez, and Gary Benson, with contributions from Marzie Rasekh, and more recently streamlined by Kyler Anderson in the Benson Lab for Biocomputing and Informatics at Boston University.
Benson-Genomics-Lab/VNTRseek має індекс здоров’я 21 зі 100, що відповідає смузі «У зоні ризику». Найвищий показник — AI Readiness (47/100), найнижчий — Community & Adoption (24/100). Останнє оновлення було 52 дні тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.
Індекс здоров'я програмного забезпечення
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
Профіль оцінок
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 31 калібровано до 25 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
Власність
За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.
Метрики за категоріями
Життєздатність
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
Активність розробки
Робота надійшла, і нею ніхто не зайнявся
Сама лише тиша ніколи не є підставою — невеликій завершеній бібліотеці коміти можуть бути не потрібні роками. Ця ознака вимагає двох умов водночас: тривалої відсутності людських комітів і зобов'язань, які проєкт очевидно не виконує. Автоматичні коміти супроводженням не вважаються.
Як оцінюється покинутістьЯк обчислюється оцінка
| 18/36 | Свіжість push — останній push 52 дн. тому |
| 0/36 | Ритм комітів — 0/52 тижнів із комітами |
| 0/18 | Обсяг комітів — 0 комітів за останній рік |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| commits_last_year | 0 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 52 |
| active_weeks_last_year | 0 |
Дисципліна релізів
Як обчислюється оцінка
| 27/27 | Випускає релізи — опубліковано 1 релізів |
| 0/36 | Свіжість релізів — останній реліз 1 173 дн. тому |
| 12.6/27 | Ритм релізів — ритм невідомий (єдиний реліз) |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних |
Використані вхідні дані
| releases_count | 1 |
| latest_release_tag | v2.0.3 |
| releases_from_tags | ні |
| days_since_latest_release | 1 173 |
| mean_days_between_releases | — |
Спільнота та впровадження
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
Популярність і впровадження
Як обчислюється оцінка
| 0/60 | Зірки — 2 зірок |
| 0/25 | Форки — 2 форків |
| 0/15 | Спостерігачі — 2 спостерігачів |
Використані вхідні дані
| forks | 2 |
| stars | 2 |
| watchers | 2 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Здоров'я спільноти
Як обчислюється оцінка
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Ліцензія — визнана ліцензія (GPL-3.0) |
| 0/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 0/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
Використані вхідні дані
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | 0 |
| has_contributing | ні |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | ні |
| readme_badge_services | — |
| has_pull_request_template | ні |
Сталість та врядування
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)
Як обчислюється оцінка
| 9/54 | Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 3.1/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 86% комітів |
| 4.1/13.5 | Широта контриб’юторів — 3 контриб’юторів |
| 6/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6 |
Використані вхідні дані
| bus_factor | 1 |
| contributors_sampled | 3 |
| top_contributor_share | 0,863 |
Реактивність на issue та PR
Як обчислюється оцінка
| 0/42 | Вирішення issue — закрито 0% issue |
| 30/30 | Прийняття PR — злито 6/6 вирішених PR |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 1/18 approved changesets -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| merged_prs | 6 |
| open_issues | 13 |
| closed_issues | 0 |
| prs_merged_7d | 0 |
| prs_decided_7d | 0 |
| prs_merged_30d | 0 |
| prs_decided_30d | 0 |
| issue_closed_ratio | 0 |
| closed_unmerged_prs | 0 |
| first_time_authors_30d | 0 |
| first_time_prs_merged_30d | 0 |
| first_time_prs_decided_30d | 0 |
Власність та опіка
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | Підтримка власника — у власності організації |
| 0/20 | Верифікований домен |
| 8.2/25 | Охоплення власника — 13 підписників у Benson-Genomics-Lab |
| 17.1/25 | Послужний список — 4 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~7 р. |
Використані вхідні дані
| followers | 13 |
| owner_type | Organization |
| is_verified | ні |
| owner_login | Benson-Genomics-Lab |
| public_repos | 4 |
| account_age_days | 2 556 |
Інженерна якість
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
Інженерні практики
Як обчислюється оцінка
| 0/24 | Процеси CI |
| 24/24 | Наявні тести |
| 0/16 | Конфігурація лінтера |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 0/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 0 out of 4 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| has_ci | ні |
| has_tests | так |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | ні |
| has_precommit_config | ні |
Документація
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | README |
| 0/25 | Каталог документації |
| 0/15 | Сайт документації / домашня сторінка |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 0/10 | Теми |
| 10/10 | Wiki |
Використані вхідні дані
| topics | — |
| has_wiki | так |
| homepage | — |
| docs_site | — |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | ні |
| has_description | так |
Безпека
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
Стан безпеки
Як обчислюється оцінка
| 7.5/7.5 | Binary-Artifacts — no binaries found in the repo |
| 0/7.5 | Branch-Protection — немає даних |
| 0/2.5 | CI-Tests — 0 out of 4 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0 |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0/7.5 | Code-Review — Found 1/18 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 1.5/2.5 | Contributors — project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6 |
| 0/10 | Dangerous-Workflow — немає даних |
| 0/7.5 | Dependency-Update-Tool — no update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 0/7.5 | Maintained — 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| 0/5 | Packaging — немає даних |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — немає даних |
| 0/5 | SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — немає даних |
| 0/7.5 | Token-Permissions — немає даних |
| 7.5/7.5 | Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected |
Використані вхідні дані
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 12 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 6 |
| scorecard_aggregate | 3 |
Готовність до ШІ
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
Контекст і настанови для агентів
Як обчислюється оцінка
| 0/45 | Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 11.2/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 21 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
Використані вхідні дані
| has_llms_txt | ні |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,21 |
| agent_instruction_files | — |
| agent_instruction_max_bytes | — |
Як обчислюється оцінка
| 18/18 | Розгортання однією командою — src/trf2proclu-ngs/Makefile |
| 22/22 | Автоматизовані тести |
| 0/11 | Конфігурація лінтера / форматера |
| 11/11 | Статична перевірка типів — C (статично типізована) |
| 0/10 | Відтворюване середовище |
| 0/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом |
| 0/8 | Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — немає даних |
Використані вхідні дані
| has_nix | ні |
| has_tests | так |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | ні |
| typed_language | так |
| bootstrap_files | src/trf2proclu-ngs/Makefile |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | ні |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0 |
| toolchain_manifests | — |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
Читабельність коду для моделей
Як обчислюється оцінка
| 45/45 | Типізований код — C (статично типізована) |
| 48.4/55 | Керовані розміри файлів — 6/50 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
Використані вхідні дані
| primary_language | C |
| largest_source_bytes | 99 179 |
| source_files_sampled | 50 |
| oversized_source_files | 6 |
Ключові факти
Попередження щодо збору даних
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
- GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository
Докладніше
Історія зірок і форків 0 ★ / 2 ⇿
Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.
OpenSSF Scorecard 3.0 / 10
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 10 | Binary-Artifacts | no binaries found in the repo |
| н/д | Branch-Protection | internal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md |
| 0 | CI-Tests | 0 out of 4 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0 |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0 | Code-Review | Found 1/18 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 6 | Contributors | project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6 |
| н/д | Dangerous-Workflow | no workflows found |
| 0 | Dependency-Update-Tool | no update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 0 | Maintained | 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| н/д | Packaging | packaging workflow not detected |
| н/д | Pinned-Dependencies | no dependencies found |
| 0 | SAST | SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| н/д | Signed-Releases | no releases found |
| н/д | Token-Permissions | No tokens found |
| 10 | Vulnerabilities | 0 existing vulnerabilities detected |
Усі залежності не зібрано
Не вдалося зібрати розв'язаний набір залежностей для цього звіту: GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository
Звіт у форматі JSON машиночитний
Зворотний зв’язок
Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика.