Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.27.0 · метрики 2.5.0 · 2026-07-28 12:43 UTC

EBI-Metagenomics / mobilome-annotation-pipeline

JavaScript · Python · NextflowApache-2.0★ 112 зірок⑂ 7 форківз трав. 2022 р.Переглянути на GitHub ↗

EBI-Metagenomics/mobilome-annotation-pipeline має індекс здоров’я 71 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Vitality (86/100), найнижчий — Community & Adoption (45/100). Останнє оновлення було 3 дні тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

71
загалом / 100
Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

71
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 63 калібровано до 71 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

MGnifyОрганізація
172 підписники225 публічних репозиторіївз жовт. 2017 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

86Відмінний · 21% загального індексу

Активність розробки

82Відмінний
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 3 дн. тому
18/36Ритм комітів — 26/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів — 108 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 15 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year108
human_commit_share1
days_since_last_push3
active_weeks_last_year26

Дисципліна релізів

92Відмінний
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 14 релізів
36/36Свіжість релізів — останній реліз 11 дн. тому
19.8/27Ритм релізів — реліз кожні ~78,9 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count14
latest_release_tagv5.0.0
releases_from_tagsні
days_since_latest_release11
mean_days_between_releases78,9
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

45Слабкий · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

41Слабкий
Як обчислюється оцінка
33.2/60Зірки — 112 зірок
6.5/25Форки — 7 форків
1.7/15Спостерігачі — 3 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks7
stars112
watchers3
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (Apache-2.0)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges—
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services—
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

62Помірний · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

34У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
7.2/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 68% комітів
8.1/13.5Широта контриб’юторів — 6 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled6
top_contributor_share0,679

Реактивність на issue та PR

86Відмінний
Як обчислюється оцінка
39.4/42Вирішення issue — закрито 94% issue
27.6/30Прийняття PR — злито 80/87 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
7.5/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 11/22 approved changesets -- score normalized to 5
Використані вхідні дані
merged_prs80
open_issues1
closed_issues15
prs_merged_7d—
prs_decided_7d—
prs_merged_30d—
prs_decided_30d—
issue_closed_ratio0,938
closed_unmerged_prs7
first_time_authors_30d—
first_time_prs_merged_30d—
first_time_prs_decided_30d—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): newcomer_pr_acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

71Добрий
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен
16.1/25Охоплення власника — 172 підписників у EBI-Metagenomics
25/25Послужний список — 225 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~8 р.
Використані вхідні дані
followers172
owner_typeOrganization
is_verified—
owner_loginEBI-Metagenomics
public_repos225
account_age_days3 205

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

63Помірний · 19% загального індексу

Інженерні практики

68Добрий
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 2 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
0/16Конфігурація лінтера
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 18 out of 18 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configні
has_precommit_configні

Документація

55Помірний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
0/15Сайт документації / домашня сторінка
0/10Опис репозиторію
0/10Теми
0/10Wiki
Використані вхідні дані
topics—
has_wikiні
homepage—
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionні

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

52Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

50Помірний
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — немає даних
2.5/2.5CI-Tests — 18 out of 18 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
3.8/7.5Code-Review — Found 11/22 approved changesets -- score normalized to 5
2.5/2.5Contributors — project has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 15 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
0/5Packaging — немає даних
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — немає даних
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
6/7.5Vulnerabilities — 2 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated15
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive3
scorecard_aggregate5
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): branch_protection, packaging, signed_releases. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

60Помірний
Як обчислюється оцінка
14.2/35Прямі залежності без відомих сповіщень — уражено 2: biopython 1.85 (moderate 4.9), pytest 8.4.1 (moderate 6.8)
0/25Непрямі залежності без відомих сповіщень — транзитивний набір не відокремлюється від залежностей розробки й тестування в цьому обсязі
30.9/40Немає задавнених сповіщень — 2 пакет(ів) зі сповіщеннями без реакції понад 90 дн.; найдавніше опубліковано 222 дн. тому
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories4
affected_packages2
assessed_packages16
unassessed_packages0
affected_by_severitymoderate 2
direct_affected_packages2
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Непрямі залежності без відомих сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено 16 резолвлених залежностей із OSV. Цей репозиторій не публікує пакета, який резолвить індекс, тож натомість оцінено граф залежностей репозиторію. Цей граф змішує закріплені версії для розробки й тестування зі справді постачаними залежностями, тож оцінюються лише задекларовані runtime-залежності; транзитивні знахідки подаються як контекст і в оцінку не входять. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

57Помірний · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

69Добрий
Як обчислюється оцінка
45/45Інструкції для агентів — CLAUDE.md
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
24/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 45 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
legible_history_share0,45
agent_instruction_filesCLAUDE.md
agent_instruction_max_bytes6 379

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

50Помірний
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — Taskfile.yaml
22/22Автоматизовані тести
0/11Конфігурація лінтера / форматера
0/11Статична перевірка типів
10/10Відтворюване середовище — lockfile
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfilesuv.lock
has_dockerfileні
typed_languageні
bootstrap_filesTaskfile.yaml
has_devcontainerні
has_linter_configні
typecheck_configs—
agent_commit_share0
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share0

Читабельність коду для моделей

54Помірний
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований код — JavaScript без конфігурації перевірки типів
53.7/55Керовані розміри файлів — 1/43 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageJavaScript
largest_source_bytes740 046
source_files_sampled43
oversized_source_files1

Ключові факти

112зірок GitHub
6контриб'юторів
108комітів за останні 12 місяців
3днів від останнього пушу
14релізів
1бас-фактор
1відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
  • Could not fetch pypi package 'mobilome-annotation-pipeline' from its registry

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 7 ⇿
0Зірки
7Форки
7Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

1234567712025-012025-082026-04
Мажорні 2Мінорні 2Патчі 3

Кожна точка охоплює 2 днів.

OpenSSF Scorecard 5.0 / 10
5.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-28 12:43 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
н/дBranch-Protectioninternal error: error during GetBranch(main): error during branchesHandler.query: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10CI-Tests18 out of 18 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
5Code-ReviewFound 11/22 approved changesets -- score normalized to 5
10Contributorsproject has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained15 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
н/дPackagingpackaging workflow not detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
8Vulnerabilities2 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 4
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPInumpy==2.0.2pyproject.toml
PyPIbiopython==1.85pyproject.toml
PyPIpytest==8.4.1pyproject.toml
PyPIpytest-cov==6.2.1pyproject.toml
Усі залежності 16

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 4 прямих і 12 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIbiopython1.85пряма
PyPInumpy2.0.2пряма
PyPIpytest8.4.1пряма
PyPIpytest-cov6.2.1пряма
PyPIcolorama0.4.6непряма
PyPIcoverage7.10.7непряма
PyPIcoverage7.14.1непряма
PyPIexceptiongroup1.3.1непряма
PyPIiniconfig2.1.0непряма
PyPIiniconfig2.3.0непряма
PyPImobilome-annotation-pipeline2.0.2непряма
PyPIpackaging26.2непряма
PyPIpluggy1.6.0непряма
PyPIpygments2.20.0непряма
PyPItomli2.4.1непряма
PyPItyping-extensions4.15.0непряма
Сповіщення про залежності 2

Цей репозиторій не публікує пакета, який розпізнає індекс, тож оцінено його власний граф залежностей — 16 пакетів, серед яких є й піниї розробки та тестування, що ніколи не постачаються: 2 мають відомі сповіщення, з них 2 прямі.

ПакетВерсіяЗв'язокКритичністьСповіщеньВиправлено в
biopython1.85прямапомірна21.87
pytest8.4.1прямапомірна29.0.3

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з EBI-Metagenomics/mobilome-annotation-pipeline. Читати поруч →

100wandb/wandbThe AI developer platform. Use Weights & Biases to train and fine-tune models, and manage models from experimentation to production.Винятковий100optuna/optunaA hyperparameter optimization frameworkВинятковий100Elastic/beats:tropical_fish: Beats - Lightweight shippers for Elasticsearch & LogstashВинятковий100pylint-dev/pylintIt's not just a linter that annoys you!Винятковий100matplotlib/matplotlibmatplotlib: plotting with PythonВинятковий100deepset-ai/haystackOpen-source AI orchestration framework for building context-engineered, production-ready LLM applications. Design modular pipelines and agent workflows with explicit control over retrieval, routing, memory, and generation. Built for scalable agents, RAG, multimodal applications, semantic search, and conversational systems.Винятковий

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.5.0, схема v0.27.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика.