Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-10-19 07:05 UTC

SigProfilerSuite / SigProfilerExtractor

SigProfilerExtractor allows de novo extraction of mutational signatures from data generated in a matrix format. The tool identifies the number of operative mutational signatures, their activities in each sample, and the probability for each signature to cause a specific mutation type in a cancer sample. The tool makes use of SigProfilerMatrixGenerator and SigProfilerPlotting.

PythonBSD-2-Clause★ 188 зірок⑂ 62 форкиз серп. 2018 р.Переглянути на GitHub ↗

ТипІнструмент командного рядкаБібліотекаяк це визначено

#bioinformatics #somatic-variants #cancer-genomics #mutational-signatures #mutation-analysis

SigProfilerSuite/SigProfilerExtractor має індекс здоров’я 73 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Engineering Quality (75/100), найнижчий — AI Readiness (33/100). Останнє оновлення було 20 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

загалом / 100

Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям

Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини

Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані

Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку

Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах

У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності

Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 64 калібровано до 73 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

SigProfilerSuiteОрганізація

11 підписників16 публічних репозиторіївз січ. 2026 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

Реєстр	Пакет	Версія	Завантажень / міс	Версії	Остання публікація
PyPI	SigProfilerExtractor	1.4.1	1 971	61	75 днів тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

72Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

66Добрий

Як обчислюється оцінка

28.8/36	Свіжість push — останній push 20 дн. тому
10.4/36	Ритм комітів — 15/52 тижнів із комітами
17.1/18	Обсяг комітів — 79 комітів за останній рік
10/10	OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 3 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

commits_last_year	79
human_commit_share	0,99
days_since_last_push	20
active_weeks_last_year	15

Дисципліна релізів

82Відмінний

Як обчислюється оцінка

27/27	Випускає релізи — опубліковано 14 релізів
27/36	Свіжість релізів — останній реліз 122 дн. тому
19.8/27	Ритм релізів — реліз кожні ~61,8 дн.
0/10	OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних

Використані вхідні дані

releases_count	14
latest_release_tag	v1.4.0
releases_from_tags	ні
days_since_latest_release	122
mean_days_between_releases	61,8

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

55Помірний · 17% загального індексу

Здоров'я спільноти

50Помірний

Як обчислюється оцінка

22.5/22.5	README
22.5/22.5	Ліцензія — визнана ліцензія (BSD-2-Clause)
0/18	Настанови CONTRIBUTING
0/13.5	Кодекс поведінки
0/7.2	Шаблон issue
0/6.3	Шаблон PR

Використані вхідні дані

has_readme	так
has_license	так
readme_badges	3
has_contributing	ні
has_issue_template	ні
has_code_of_conduct	ні
readme_badge_services	github.com, shields.io
has_pull_request_template	ні

Впровадження в екосистемі (завантаження)

55Помірний

Як обчислюється оцінка

43.9/80	Щомісячні завантаження — 1 971 завантажень/місяць у pypi
0/20	Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє

Використані вхідні дані

packages	SigProfilerExtractor
dependents	—
ecosystems	pypi
total_downloads	—
monthly_downloads	1 971
unverified_packages_excluded	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

64Помірний · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

40Слабкий

Як обчислюється оцінка

9/54	Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
9.9/22.5	Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 56% комітів
10.8/13.5	Широта контриб’юторів — 8 контриб’юторів
10/10	OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 9 contributing companies or organizations

Використані вхідні дані

bus_factor	1
contributors_sampled	8
top_contributor_share	0,558

Реактивність на issue та PR

81Відмінний

Як обчислюється оцінка

42/42	Вирішення issue — закрито 100% issue
28.7/30	Прийняття PR — злито 68/71 вирішених PR
0/13	Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15	OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/5 approved changesets -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

merged_prs	68
open_issues	0
closed_issues	243
prs_merged_7d	0
prs_decided_7d	0
prs_merged_30d	2
prs_decided_30d	2
issue_closed_ratio	1
closed_unmerged_prs	3
first_time_authors_30d	0
first_time_prs_merged_30d	0
first_time_prs_decided_30d	0

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

48Слабкий

Як обчислюється оцінка

30/30	Підтримка власника — у власності організації
0/20	Верифікований домен
7.8/25	Охоплення власника — 11 підписників у SigProfilerSuite
10.5/25	Послужний список — 16 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~0 р.

Використані вхідні дані

followers	11
owner_type	Organization
is_verified	ні
owner_login	SigProfilerSuite
public_repos	16
account_age_days	276

Супровід пакетів

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

25/25	Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35	Свіжість публікацій — остання публікація 75 дн. тому
20/20	Історія версій — 61 опублікованих версій
20/20	Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked

Використані вхідні дані

packages	SigProfilerExtractor
ecosystems	pypi
any_deprecated	ні
min_days_since_publish	75

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

75Добрий · 19% загального індексу

Інженерні практики

68Добрий

Як обчислюється оцінка

24/24	Процеси CI — 5 процес(ів) CI
24/24	Наявні тести
0/16	Конфігурація лінтера
0/9.6	Pre-commit-хуки
0/6.4	.editorconfig
20/20	OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

has_ci	так
has_tests	так
has_editorconfig	ні
has_linter_config	ні
has_precommit_config	ні

Документація

85Відмінний

Як обчислюється оцінка

30/30	README
25/25	Каталог документації
0/15	Сайт документації / домашня сторінка
10/10	Опис репозиторію
10/10	Теми — 5 тем
10/10	Wiki

Використані вхідні дані

topics	bioinformatics, somatic-variants, cancer-genomics, mutational-signatures, mutation-analysis
has_wiki	так
homepage	—
docs_site	—
has_readme	так
has_docs_dir	так
has_description	так

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

60Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

50Помірний

Як обчислюється оцінка

7.5/7.5	Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5	Branch-Protection — немає даних
2.5/2.5	CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5	CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5	Code-Review — Found 0/5 approved changesets -- score normalized to 0
2.5/2.5	Contributors — project has 9 contributing companies or organizations
10/10	Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5	Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5	Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5	Ліцензія — license file detected
7.5/7.5	Maintained — 30 commit(s) and 3 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5	Packaging — packaging workflow detected
0/5	Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5	SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5	Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5	Signed-Releases — немає даних
0/7.5	Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5	Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected

Використані вхідні дані

source	openssf_scorecard
checks_evaluated	16
scorecard_version	v5.5.0
checks_inconclusive	2
scorecard_aggregate	5

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Branch-Protection, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

35/35	Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень
25/25	Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень
0/40	Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації

Використані вхідні дані

source	osv
advisories	0
affected_packages	0
assessed_packages	63
unassessed_packages	0
affected_by_severity	none
direct_affected_packages	0

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Немає задавнених сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:SigProfilerExtractor@1.4.1 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 63 пакетів. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

33У зоні ризику · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

23У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

0/45	Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15	Машиночитана документація (llms.txt)
23.2/40	Читабельна історія комітів — намір зазначено у 43 з 99 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)

Використані вхідні дані

has_llms_txt	ні
llms_txt_url	—
legible_history_share	0,434
agent_instruction_files	—
agent_instruction_max_bytes	—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

32У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

0/18	Розгортання однією командою
22/22	Автоматизовані тести
0/11	Конфігурація лінтера / форматера
0/11	Статична перевірка типів
10/10	Відтворюване середовище — Dockerfile
0/10	Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8	Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10	OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

has_nix	ні
has_tests	так
lockfiles	—
has_dockerfile	так
typed_language	ні
bootstrap_files	—
has_devcontainer	ні
has_linter_config	ні
typecheck_configs	—
agent_commit_share	0
toolchain_manifests	—
dependency_bot_commit_share	0

Читабельність коду для моделей

53Помірний

Як обчислюється оцінка

0/45	Типізований код — Python без конфігурації перевірки типів
53.2/55	Керовані розміри файлів — 1/31 файлів вихідного коду понад 60 КБ

Використані вхідні дані

primary_language	Python
largest_source_bytes	72 042
source_files_sampled	31
oversized_source_files	1

Ключові факти

188зірок GitHub

8контриб'юторів

79комітів за останні 12 місяців

20днів від останнього пушу

14релізів

1бас-фактор

0відкритих issue

PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 62 ⇿

0Зірки

62Форки

13Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

Мажорні 0Мінорні 1Патчі 11

Кожна точка охоплює 7 днів.

OpenSSF Scorecard 5.0 / 10

5.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-10-19 07:05 UTC

10	Binary-Artifacts	no binaries found in the repo
н/д	Branch-Protection	internal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10	CI-Tests	3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0	CII-Best-Practices	no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0	Code-Review	Found 0/5 approved changesets -- score normalized to 0
10	Contributors	project has 9 contributing companies or organizations
10	Dangerous-Workflow	no dangerous workflow patterns detected
0	Dependency-Update-Tool	no update tool detected
0	Fuzzing	project is not fuzzed
10	License	license file detected
10	Maintained	30 commit(s) and 3 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10	Packaging	packaging workflow detected
0	Pinned-Dependencies	dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0	SAST	SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0	Security-Policy	security policy file not detected
н/д	Signed-Releases	no releases found
0	Token-Permissions	detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10	Vulnerabilities	0 existing vulnerabilities detected

Усі залежності 12

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 0 прямих і 12 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

Реєстр	Пакет	Версія	Зв'язок
PyPI	numpy	`—`	непряма
PyPI	pandas	`—`	непряма
PyPI	psutil	`—`	непряма
PyPI	scikit-learn	`—`	непряма
PyPI	scipy	`—`	непряма
PyPI	setuptools	`—`	непряма
PyPI	setuptools-scm	`—`	непряма
PyPI	sigprofilerassignment	`—`	непряма
PyPI	sigprofilermatrixgenerator	`—`	непряма
PyPI	sigprofilerplotting	`—`	непряма
PyPI	statsmodels	`—`	непряма
PyPI	torch	`—`	непряма

Сповіщення про залежності 0

Встановлення pypi:SigProfilerExtractor@1.4.1 тягне 63 пакетів, прямих і транзитивних: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 — прямі залежності.

Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.

36.9/60	Зірки — 188 зірок
14.9/25	Форки — 62 форків
7/15	Спостерігачі — 19 спостерігачів

forks	62
stars	188
watchers	19
growth_state	unverified
growth_factor_pct	100
growth_unverified_reason	no_history

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Профіль оцінок

Власність

Пакетні екосистеми

Метрики за категоріями

Ключові факти

Попередження щодо збору даних

Докладніше

Зворотний зв’язок

Пов’язані записи