Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-10-11 20:09 UTC

antigenomics / mirpy

Machine learning for Immune Repertoires

PythonGPL-3.0★ 8 зірок⑂ 4 форкиз жовт. 2023 р.Переглянути на GitHub ↗

ТипІнструмент командного рядкаБібліотекаяк це визначено

#adaptive #antibody #b-cell #bcr #immune #sequencing #t-cell #tcr #deep-learning #embedding #machine-learning

antigenomics/mirpy має індекс здоров’я 14 зі 100, що відповідає смузі «Критичний». Найвищий показник — Vitality (89/100), найнижчий — Security (10/100). Останнє оновлення — сьогодні. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

загалом / 100

Критичний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям

Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини

Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані

Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку

Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах

У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності

Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 62 калібровано до 69 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02). Політика юрисдикцій високого ризику застосовує множник 20% до зваженого загального індексу здоров’я і встановлює для нього межу «У зоні ризику» на рівні 34.

Власність

AntigenOmicsОрганізація · підтверджений домен

34 підписники63 публічні репозиторіїз трав. 2014 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

Реєстр	Пакет	Версія	Завантажень / міс	Версії	Остання публікація	Теги
PyPI	mirpy-lib	4.5.1	2 540	29	0 днів тому	airr bcr tcr vdjdb embedding immunosequencing prototypes

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

89Відмінний · 21% загального індексу

Активність розробки

81Відмінний

Як обчислюється оцінка

36/36	Свіжість push — останній push 0 дн. тому
17.3/36	Ритм комітів — 25/52 тижнів із комітами
18/18	Обсяг комітів — 536 комітів за останній рік
10/10	OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

commits_last_year	536
human_commit_share	1
days_since_last_push	0
active_weeks_last_year	25

Дисципліна релізів

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

27/27	Випускає релізи — опубліковано 34 релізів
36/36	Свіжість релізів — останній реліз 0 дн. тому
27/27	Ритм релізів — реліз кожні ~1,7 дн.
0/10	OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних

Використані вхідні дані

releases_count	34
latest_release_tag	v4.5.1
releases_from_tags	ні
days_since_latest_release	0
mean_days_between_releases	1,7

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

39Слабкий · 17% загального індексу

Здоров'я спільноти

50Помірний

Як обчислюється оцінка

22.5/22.5	README
22.5/22.5	Ліцензія — визнана ліцензія (GPL-3.0)
0/18	Настанови CONTRIBUTING
0/13.5	Кодекс поведінки
0/7.2	Шаблон issue
0/6.3	Шаблон PR

Використані вхідні дані

has_readme	так
has_license	так
readme_badges	5
has_contributing	ні
has_issue_template	ні
has_code_of_conduct	ні
readme_badge_services	github.com, shields.io
has_pull_request_template	ні

Впровадження в екосистемі (завантаження)

57Помірний

Як обчислюється оцінка

45.4/80	Щомісячні завантаження — 2 540 завантажень/місяць у pypi
0/20	Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє

Використані вхідні дані

packages	mirpy-lib
dependents	—
ecosystems	pypi
total_downloads	—
monthly_downloads	2 540
unverified_packages_excluded	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

71Добрий · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

31У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

9/54	Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
4.1/22.5	Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 82% комітів
8.1/13.5	Широта контриб’юторів — 6 контриб’юторів
10/10	OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 4 contributing companies or organizations

Використані вхідні дані

bus_factor	1
contributors_sampled	6
top_contributor_share	0,819

Реактивність на issue та PR

81Відмінний

Як обчислюється оцінка

42/42	Вирішення issue — закрито 100% issue
28.2/30	Прийняття PR — злито 47/50 вирішених PR
0/13	Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15	OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/24 approved changesets -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

merged_prs	47
open_issues	0
closed_issues	9
prs_merged_7d	3
prs_decided_7d	3
prs_merged_30d	3
prs_decided_30d	3
issue_closed_ratio	1
closed_unmerged_prs	3
first_time_authors_30d	0
first_time_prs_merged_30d	0
first_time_prs_decided_30d	0

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

86Відмінний

Як обчислюється оцінка

30/30	Підтримка власника — у власності організації
20/20	Верифікований домен
11.1/25	Охоплення власника — 34 підписників у antigenomics
25/25	Послужний список — 63 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~12 р.

Використані вхідні дані

followers	34
owner_type	Organization
is_verified	так
owner_login	antigenomics
public_repos	63
account_age_days	4 516

Супровід пакетів

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

25/25	Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35	Свіжість публікацій — остання публікація 0 дн. тому
20/20	Історія версій — 29 опублікованих версій
20/20	Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked

Використані вхідні дані

packages	mirpy-lib
ecosystems	pypi
any_deprecated	ні
min_days_since_publish	0

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

86Відмінний · 19% загального індексу

Інженерні практики

84Відмінний

Як обчислюється оцінка

24/24	Процеси CI — 4 процес(ів) CI
24/24	Наявні тести
16/16	Конфігурація лінтера — pyproject.toml ([tool.ruff])
0/9.6	Pre-commit-хуки
0/6.4	.editorconfig
20/20	OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

has_ci	так
has_tests	так
has_editorconfig	ні
has_linter_config	так
has_precommit_config	ні

Документація

90Відмінний

Як обчислюється оцінка

30/30	README
25/25	Каталог документації
15/15	Сайт документації / домашня сторінка — https://docs.isalgo.dev/mirpy/
10/10	Опис репозиторію
10/10	Теми — 11 тем
0/10	Wiki

Використані вхідні дані

topics	adaptive, antibody, b-cell, bcr, immune, sequencing, t-cell, tcr, deep-learning, embedding, machine-learning
has_wiki	ні
homepage	https://docs.isalgo.dev/mirpy/
docs_site	https://docs.isalgo.dev/mirpy/
has_readme	так
has_docs_dir	так
has_description	так

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

10Критичний · 16% загального індексу

Стан безпеки

10Критичний

Попередження про юрисдикційний ризик

Виявлено пов’язаність із юрисдикцією високого ризику

2 профілі організацій контриб’юторівRussia1 software.redFlag.role.ownerRussia2 профілі ключових контриб’юторівRussia

Сигнал ґрунтується на публічних локаціях, самостійно вказаних у профілях. Він не визначає національність, громадянство, наміри, санкційний статус чи надійність людини.

Як оцінюється юрисдикційна пов’язаність

Як обчислюється оцінка

7.5/7.5	Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
3.8/7.5	Branch-Protection — branch protection is not maximal on development and all release branches
2.5/2.5	CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5	CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5	Code-Review — Found 0/24 approved changesets -- score normalized to 0
2.5/2.5	Contributors — project has 4 contributing companies or organizations
10/10	Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5	Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5	Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5	Ліцензія — license file detected
7.5/7.5	Maintained — 30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5	Packaging — packaging workflow detected
0/5	Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5	SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5	Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5	Signed-Releases — немає даних
0/7.5	Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5	Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected

Використані вхідні дані

source	openssf_scorecard
checks_evaluated	17
scorecard_version	v5.5.0
checks_inconclusive	1
scorecard_aggregate	5
high_risk_jurisdiction_cap	34
high_risk_jurisdiction_multiplier	20
security_posture_after_multiplier	10
security_posture_before_jurisdiction	50

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано. Політика юрисдикцій високого ризику застосовує множник 20% і встановлює для стану безпеки межу «У зоні ризику» на рівні 34.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

68Добрий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

40Слабкий

Як обчислюється оцінка

0/45	Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15	Машиночитана документація (llms.txt)
40/40	Читабельна історія комітів — намір зазначено у 90 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)

Використані вхідні дані

has_llms_txt	ні
llms_txt_url	—
legible_history_share	0,9
agent_instruction_files	—
agent_instruction_max_bytes	—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

72Добрий

Як обчислюється оцінка

18/18	Розгортання однією командою — docs/Makefile
22/22	Автоматизовані тести
11/11	Конфігурація лінтера / форматера — pyproject.toml ([tool.ruff])
11/11	Статична перевірка типів — src/mir/py.typed
0/10	Відтворюване середовище
10/10	Підтверджена практика роботи з агентами — 90 з останніх 100 комітів створено агентом або з його зазначенням
0/8	Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10	OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

has_nix	ні
has_tests	так
lockfiles	—
has_dockerfile	ні
typed_language	ні
bootstrap_files	docs/Makefile
has_devcontainer	ні
has_linter_config	так
typecheck_configs	src/mir/py.typed
agent_commit_share	0,9
toolchain_manifests	—
dependency_bot_commit_share	0

Читабельність коду для моделей

81Відмінний

Як обчислюється оцінка

27/45	Типізований код — Python з конфігурацією перевірки типів (src/mir/py.typed)
54.4/55	Керовані розміри файлів — 1/85 файлів вихідного коду понад 60 КБ

Використані вхідні дані

primary_language	Python
largest_source_bytes	75 844
source_files_sampled	85
oversized_source_files	1

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

0/40	Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20	Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40	Придатні до запуску приклади — examples

Використані вхідні дані

example_dirs	examples
has_mcp_signal	ні
api_schema_files	—
interfaces_expected_of	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

8зірок GitHub

6контриб'юторів

536комітів за останні 12 місяців

0днів від останнього пушу

34релізів

1бас-фактор

0відкритих issue

PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
deps.dev does not index pypi:mirpy-lib@4.5.1; advisories assessed against the repository dependency graph instead
No resolved dependencies carried a version and a supported ecosystem

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 4 ⇿

0Зірки

4Форки

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

Кожна точка охоплює 2 днів.

OpenSSF Scorecard 5.0 / 10

5.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-10-11 20:09 UTC

10	Binary-Artifacts	no binaries found in the repo
5	Branch-Protection	branch protection is not maximal on development and all release branches
10	CI-Tests	3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0	CII-Best-Practices	no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0	Code-Review	Found 0/24 approved changesets -- score normalized to 0
10	Contributors	project has 4 contributing companies or organizations
10	Dangerous-Workflow	no dangerous workflow patterns detected
0	Dependency-Update-Tool	no update tool detected
0	Fuzzing	project is not fuzzed
10	License	license file detected
10	Maintained	30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10	Packaging	packaging workflow detected
0	Pinned-Dependencies	dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0	SAST	SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0	Security-Policy	security policy file not detected
н/д	Signed-Releases	no releases found
0	Token-Permissions	detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10	Vulnerabilities	0 existing vulnerabilities detected

Прямі залежності 6

Реєстр	Пакет	Обмеження версії	Маніфест
PyPI	numpy	`—`	pyproject.toml
PyPI	polars	`>=1.0,<2`	pyproject.toml
PyPI	scikit-learn	`—`	pyproject.toml
PyPI	scipy	`—`	pyproject.toml
PyPI	seqtree	`>=1.0.0`	pyproject.toml
PyPI	vdjtools	`>=5.0.1`	pyproject.toml

Усі залежності 9

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 4 прямих і 5 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

Реєстр	Пакет	Версія	Зв'язок
PyPI	numpy	`—`	пряма
PyPI	polars	`—`	пряма
PyPI	seqtree	`—`	пряма
PyPI	vdjtools	`—`	пряма
PyPI	numba	`—`	непряма
PyPI	psutil	`—`	непряма
PyPI	pydata-sphinx-theme	`—`	непряма
PyPI	pytest	`—`	непряма
PyPI	sphinx	`—`	непряма

Сповіщення про залежності не оцінено

Звірка сповіщень не відбулася для цього звіту: No resolved dependencies carried a version and a supported ecosystem

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.

13.7/60	Зірки — 8 зірок
4/25	Форки — 4 форків
0/15	Спостерігачі — 1 спостерігачів

forks	4
stars	8
watchers	1
growth_state	unverified
growth_factor_pct	100
growth_unverified_reason	no_history

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Профіль оцінок

Власність

Пакетні екосистеми

Метрики за категоріями

Ключові факти

Попередження щодо збору даних

Докладніше

Зворотний зв’язок

Пов’язані записи