Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-09-29 00:10 UTC

gyorilab / mira

MIRA: machine-assisted modeling of dynamical systems

Jupyter NotebookBSD-2-Clause★ 14 зірок⑂ 11 форківз лип. 2022 р.Переглянути на GitHub ↗
#differential-equations#epidemiology#knowledge-graphs#modeling#modeling-and-simulation#ontologies#systems-biology

gyorilab/mira має індекс здоров’я 75 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Engineering Quality (78/100), найнижчий — Community & Adoption (37/100). Останнє оновлення було 5 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконують 2 учасники.

75
загалом / 100
Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

75
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 65 калібровано до 75 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Gyori Lab for Computational BiomedicineОрганізація
38 підписників66 публічних репозиторіївз лип. 2018 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікація
PyPImiraвказує на інший репозиторій — не оцінюється0.9.36325115229 днів тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

74Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

83Відмінний
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 5 дн. тому
18.7/36Ритм комітів — 27/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів — 262 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year262
human_commit_share1
days_since_last_push5
active_weeks_last_year27

Дисципліна релізів

60Помірний
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 9 релізів
7.2/36Свіжість релізів — останній реліз 603 дн. тому
19.8/27Ритм релізів — реліз кожні ~51,3 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count9
latest_release_tag0.10.1
releases_from_tagsні
days_since_latest_release603
mean_days_between_releases51,3
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

37Слабкий · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

26У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
18.1/60Зірки — 14 зірок
8.3/25Форки — 11 форків
0/15Спостерігачі — 2 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks11
stars14
watchers2
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (BSD-2-Clause)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges—
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services—
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

72Добрий · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

63Помірний
Як обчислюється оцінка
25.2/54Бас-фактор — на 2 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
14.4/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 36% комітів
13.5/13.5Широта контриб’юторів — 11 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 34 contributing companies or organizations
Використані вхідні дані
bus_factor2
contributors_sampled11
top_contributor_share0,361

Реактивність на issue та PR

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
34.9/42Вирішення issue — закрито 83% issue
28.7/30Прийняття PR — злито 341/357 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
15/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — all changesets reviewed
Використані вхідні дані
merged_prs341
open_issues18
closed_issues89
prs_merged_7d0
prs_decided_7d0
prs_merged_30d1
prs_decided_30d1
issue_closed_ratio0,832
closed_unmerged_prs16
first_time_authors_30d0
first_time_prs_merged_30d0
first_time_prs_decided_30d0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

66Добрий
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен
11.4/25Охоплення власника — 38 підписників у gyorilab
25/25Послужний список — 66 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~8 р.
Використані вхідні дані
followers38
owner_typeOrganization
is_verifiedні
owner_logingyorilab
public_repos66
account_age_days2 994

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

78Добрий · 19% загального індексу

Інженерні практики

74Добрий
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 2 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
16/16Конфігурація лінтера — pyproject.toml ([tool.black], [tool.isort]), setup.cfg ([flake8]), tox.ini
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
10/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 1 out of 2 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 5
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configтак
has_precommit_configні

Документація

85Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
0/15Сайт документації / домашня сторінка
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 7 тем
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsdifferential-equations, epidemiology, knowledge-graphs, modeling, modeling-and-simulation, ontologies, systems-biology
has_wikiтак
homepage—
docs_site—
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

60Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

50Помірний
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches
1.2/2.5CI-Tests — 1 out of 2 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 5
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
7.5/7.5Code-Review — all changesets reviewed
2.5/2.5Contributors — project has 34 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 30 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
0/5Packaging — немає даних
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — немає даних
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate5
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Packaging, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
35/35Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень
25/25Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень
0/40Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories0
affected_packages0
assessed_packages42
unassessed_packages0
affected_by_severitynone
direct_affected_packages0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Немає задавнених сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:mira@0.9.36 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 42 пакетів. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

49Слабкий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

5Критичний
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
5.3/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 10 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share0,1
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

61Помірний
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — docs/Makefile
22/22Автоматизовані тести
11/11Конфігурація лінтера / форматера — pyproject.toml ([tool.black], [tool.isort]), setup.cfg ([flake8]), tox.ini
0/11Статична перевірка типів
10/10Відтворюване середовище — Dockerfile
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfiles—
has_dockerfileтак
typed_languageні
bootstrap_filesdocs/Makefile
has_devcontainerні
has_linter_configтак
typecheck_configs—
agent_commit_share0
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share0

Читабельність коду для моделей

55Помірний
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований код — Jupyter Notebook без конфігурації перевірки типів
54.7/55Керовані розміри файлів — 1/190 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageJupyter Notebook
largest_source_bytes74 912
source_files_sampled190
oversized_source_files1

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40Придатні до запуску приклади — examples, notebooks
Використані вхідні дані
example_dirsexamples, notebooks
has_mcp_signalні
api_schema_files—
interfaces_expected_of—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

14зірок GitHub
11контриб'юторів
262комітів за останні 12 місяців
5днів від останнього пушу
9релізів
2бас-фактор
18відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
  • pypi package 'mira' points at a different repository (https://github.com/faustomorales/mira); excluded from ecosystem scoring

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 11 ⇿
0Зірки
11Форки
9Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

0246810121112022-082024-072026-07
Мажорні 0Мінорні 8Патчі 1

Кожна точка охоплює 4 днів.

OpenSSF Scorecard 5.0 / 10
5.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-09-29 00:10 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0Branch-Protectionbranch protection not enabled on development/release branches
5CI-Tests1 out of 2 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 5
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
10Code-Reviewall changesets reviewed
10Contributorsproject has 34 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
н/дPackagingpackaging workflow not detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10Vulnerabilities0 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 15
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPIpydantic>=2.0.0setup.cfg
PyPIsympy>=1.14.0setup.cfg
PyPItyping_extensions—setup.cfg
PyPInetworkx—setup.cfg
PyPItqdm—setup.cfg
PyPIsbmlmath<0.4.0setup.cfg
PyPIrequests—setup.cfg
PyPIurllib3<2.0setup.cfg
PyPIjsonschema—setup.cfg
PyPItabulate—setup.cfg
PyPIpysd—setup.cfg
PyPImore_itertools—setup.cfg
PyPIindra@ git+https://github.com/gyorilab/indra.git@mastersetup.cfg
PyPIpysb@ git+https://github.com/pysb/pysb.gitsetup.cfg
PyPIdecorator>=5.0.0setup.cfg
Усі залежності 54

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 13 прямих і 41 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIdecorator—пряма
PyPIjsonschema—пряма
PyPImore-itertools—пряма
PyPInetworkx—пряма
PyPIpydantic—пряма
PyPIpysd—пряма
PyPIrequests—пряма
PyPIsbmlmath—пряма
PyPIsympy—пряма
PyPItabulate—пряма
PyPItqdm—пряма
PyPItyping-extensions—пряма
PyPIurllib3—пряма
PyPIbiomappings—непряма
PyPIbioontologies—непряма
PyPIbioregistry—непряма
PyPIbioversions—непряма
PyPIbootstrap-flask—непряма
PyPIclick—непряма
PyPIcoverage—непряма
PyPIfastapi—непряма
PyPIflasgger—непряма
PyPIflask—непряма
PyPIgilda—непряма
PyPIgrape—непряма
PyPIgunicorn—непряма
PyPIhttpx—непряма
PyPIlxml—непряма
PyPIm2r2—непряма
PyPImatplotlib—непряма
PyPImatplotlib-venn—непряма
PyPImineru2.6.4непряма
PyPImock—непряма
PyPImore-click—непряма
PyPIneo4j—непряма
PyPInumpy—непряма
PyPIopenai—непряма
PyPIpandas—непряма
PyPIpint—непряма
PyPIpygraphviz—непряма
PyPIpyobo—непряма
PyPIpystow—непряма
PyPIpytest—непряма
PyPIpytest-timeout—непряма
PyPIpython-libsbml—непряма
PyPIrdflib—непряма
PyPIscipy—непряма
PyPIsphinx—непряма
PyPIsphinx-autodoc-typehints—непряма
PyPIsphinx-automodapi—непряма
PyPIsphinx-rtd-theme—непряма
PyPIultralytics-thop—непряма
PyPIuvicorn—непряма
PyPIwget—непряма
Сповіщення про залежності 0

Встановлення pypi:mira@0.9.36 тягне 42 пакетів, прямих і транзитивних: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 — прямі залежності.

Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з gyorilab/mira. Читати поруч →

75cthoyt/functional-owlA Python implementation of the Functional OWL (OFN) object model.Добрий100astropy/astropyAstronomy and astrophysics core libraryВинятковий99open-metadata/OpenMetadataThe Open Context Layer for Data and AI , OpenMetadata is the open platform for building trusted data context and business semantics for humans, AI assistants, and agents.Винятковий98linkml/linkmlLinked Open Data Modeling LanguageВинятковий97mesa/mesaMesa is an open-source Python library for agent-based modeling, ideal for simulating complex systems and exploring emergent behaviors.Винятковий94pymc-devs/pymc-extrasPowerful add-ons for PyMCВинятковий

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.