Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-10-23 21:26 UTC

zmactep / patinae

A fast, programmable molecular viewer for research, scripting, and the web

RustBSD-3-Clause★ 217 зірок⑂ 19 форківз січ. 2026 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипБібліотекаІнструмент командного рядкаяк це визначено

zmactep/patinae має індекс здоров’я 14 зі 100, що відповідає смузі «Критичний». Найвищий показник — Vitality (86/100), найнижчий — Security (8/100). Останнє оновлення — сьогодні. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

14
загалом / 100
Критичний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

14
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 62 калібровано до 69 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02). Політика юрисдикцій високого ризику застосовує множник 20% до зваженого загального індексу здоров’я і встановлює для нього межу «У зоні ризику» на рівні 34.

Власність

Pavel YakovlevОсобистий обліковий запис
75 підписників66 публічних репозиторіївз вер. 2011 р.@biocad

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікаціяТеги
PyPIpatinae0.5.23 257150 днів томуpatinaemolecularvisualizationchemistrybiology

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

86Відмінний · 21% загального індексу

Активність розробки

83Відмінний
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 0 дн. тому
18.7/36Ритм комітів — 27/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів — 425 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 7 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year425
human_commit_share1
days_since_last_push0
active_weeks_last_year27

Дисципліна релізів

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 38 релізів
36/36Свіжість релізів — останній реліз 0 дн. тому
27/27Ритм релізів — реліз кожні ~14,3 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
Використані вхідні дані
releases_count38
latest_release_tagv0.5.2
releases_from_tagsні
days_since_latest_release0
mean_days_between_releases14,3

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

53Помірний · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

52Помірний
Як обчислюється оцінка
37.9/60Зірки — 217 зірок
10.5/25Форки — 19 форків
3.3/15Спостерігачі — 5 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks19
stars217
watchers5
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (BSD-3-Clause)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges3
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_servicesshields.io
has_pull_request_templateні

Впровадження в екосистемі (завантаження)

58Помірний
Як обчислюється оцінка
46.8/80Щомісячні завантаження — 3 257 завантажень/місяць у pypi
0/20Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє
Використані вхідні дані
packagespatinae
dependents—
ecosystemspypi
total_downloads—
monthly_downloads3 257
unverified_packages_excluded—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

61Помірний · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

21У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
0.7/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 97% комітів
8.1/13.5Широта контриб’юторів — 6 контриб’юторів
3/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled6
top_contributor_share0,97

Реактивність на issue та PR

78Добрий
Як обчислюється оцінка
39.8/42Вирішення issue — закрито 95% issue
25/30Прийняття PR — злито 10/12 вирішених PR
13/13Newcomer PR acceptance — злито 1/1 PR від новачків за 30 дн.
0/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 1/28 approved changesets -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
merged_prs10
open_issues1
closed_issues18
prs_merged_7d0
prs_decided_7d0
prs_merged_30d1
prs_decided_30d1
issue_closed_ratio0,947
closed_unmerged_prs2
first_time_authors_30d1
first_time_prs_merged_30d1
first_time_prs_decided_30d1

Власність та опіка

61Помірний
Як обчислюється оцінка
10/30Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис
0/20Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів
13.5/25Охоплення власника — 75 підписників у zmactep
25/25Послужний список — 66 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~15 р.
Використані вхідні дані
followers75
owner_typeUser
is_verified—
owner_loginzmactep
public_repos66
account_age_days5 524
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікацій — остання публікація 0 дн. тому
20/20Історія версій — 15 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagespatinae
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish0

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

86Відмінний · 19% загального індексу

Інженерні практики

84Відмінний
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 3 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
16/16Конфігурація лінтера — Cargo.toml ([workspace.lints]), bench/Cargo.toml ([lints]), patinae/Cargo.toml ([lints]), python/Cargo.toml ([lints])
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configтак
has_precommit_configні

Документація

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://zmactep.github.io/patinae/
10/10Опис репозиторію
0/10Теми
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topics—
has_wikiтак
homepagehttps://zmactep.github.io/patinae/
docs_sitehttps://zmactep.github.io/patinae/
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

8Критичний · 16% загального індексу

Стан безпеки

8Критичний
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches
2.5/2.5CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5Code-Review — Found 1/28 approved changesets -- score normalized to 0
0.8/2.5Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 30 commit(s) and 7 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packaging — packaging workflow detected
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
7.5/7.5Token-Permissions — GitHub workflow tokens follow principle of least privilege
0/7.5Vulnerabilities — 29 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated18
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive0
scorecard_aggregate4,1
high_risk_jurisdiction_cap34
high_risk_jurisdiction_multiplier20
security_posture_after_multiplier8
security_posture_before_jurisdiction41
Політика юрисдикцій високого ризику застосовує множник 20% і встановлює для стану безпеки межу «У зоні ризику» на рівні 34.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

74Добрий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

40Слабкий
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
40/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 100 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share1
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

80Відмінний
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — Makefile
22/22Автоматизовані тести
11/11Конфігурація лінтера / форматера — Cargo.toml ([workspace.lints]), bench/Cargo.toml ([lints]), patinae/Cargo.toml ([lints]), python/Cargo.toml ([lints])
11/11Статична перевірка типів — web/tsconfig.json
10/10Відтворюване середовище — lockfile
8/10Підтверджена практика роботи з агентами — 4 з останніх 100 комітів створено агентом або з його зазначенням
0/8Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfilesCargo.lock, package-lock.json
has_dockerfileні
typed_languageтак
bootstrap_filesMakefile
has_devcontainerні
has_linter_configтак
typecheck_configsweb/tsconfig.json
agent_commit_share0,04
toolchain_manifestsCargo.toml, bench/Cargo.toml, crates/patinae-algos/Cargo.toml, crates/patinae-cmd/Cargo.toml, crates/patinae-color/Cargo.toml, crates/patinae-framework/Cargo.toml, crates/patinae-io/Cargo.toml, crates/patinae-mm/Cargo.toml, crates/patinae-mol/Cargo.toml, crates/patinae-plugin-host/Cargo.toml, crates/patinae-plugin/Cargo.toml, crates/patinae-render/Cargo.toml, crates/patinae-scene/Cargo.toml, crates/patinae-select/Cargo.toml, crates/patinae-session/Cargo.toml, crates/patinae-settings/Cargo.toml, patinae/Cargo.toml, plugins/ai/Cargo.toml, plugins/hello/Cargo.toml, plugins/ipc/Cargo.toml, plugins/python/Cargo.toml, plugins/raytracer/Cargo.toml, python/Cargo.toml, tools/prs-upgrade/Cargo.toml, web/Cargo.toml
dependency_bot_commit_share0

Читабельність коду для моделей

98Винятковий
Як обчислюється оцінка
45/45Типізований код — Rust (статично типізована)
53.4/55Керовані розміри файлів — 17/577 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageRust
largest_source_bytes284 929
source_files_sampled577
oversized_source_files17

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40Придатні до запуску приклади — examples
Використані вхідні дані
example_dirsexamples
has_mcp_signalні
api_schema_files—
interfaces_expected_of—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

217зірок GitHub
6контриб'юторів
425комітів за останні 12 місяців
0днів від останнього пушу
38релізів
1бас-фактор
1відкритих issue
crates.io, npm, PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
  • Could not fetch crates package 'patinae-web' from its registry
  • Could not fetch crates package 'patinae-bench' from its registry
  • Could not fetch npm package '@patinae/viewer' from its registry
  • Could not fetch crates package 'patinae-python' from its registry
  • Could not fetch crates package 'patinae' from its registry
  • GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository
  • deps.dev does not index pypi:patinae@0.5.2; advisories assessed against the repository dependency graph instead

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 19 ⇿
0Зірки
19Форки
19Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

051015201942026-032026-062026-09
Мажорні 0Мінорні 3Патчі 16
OpenSSF Scorecard 4.1 / 10
4.1сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-10-23 21:26 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0Branch-Protectionbranch protection not enabled on development/release branches
10CI-Tests1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0Code-ReviewFound 1/28 approved changesets -- score normalized to 0
3Contributorsproject has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 7 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
0Signed-ReleasesProject has not signed or included provenance with any releases.
10Token-PermissionsGitHub workflow tokens follow principle of least privilege
0Vulnerabilities29 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 63
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
crates.ioslint—patinae/Cargo.toml
crates.iowgpu—patinae/Cargo.toml
crates.iolog—patinae/Cargo.toml
crates.ioenv_logger—patinae/Cargo.toml
crates.ioserde—patinae/Cargo.toml
crates.ioserde_json—patinae/Cargo.toml
crates.iowebbrowser—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-cmd—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-color—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-framework—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-io—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-mol—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-plugin-host—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-render—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-scene—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-select—patinae/Cargo.toml
crates.iopatinae-settings—patinae/Cargo.toml
crates.iolin_alg—patinae/Cargo.toml
crates.iopollster0.4patinae/Cargo.toml
crates.ioimage—patinae/Cargo.toml
crates.ioab_glyph—patinae/Cargo.toml
crates.iotokio—patinae/Cargo.toml
crates.iocopypasta0.10patinae/Cargo.toml
crates.iopulldown-cmark0.13patinae/Cargo.toml
crates.iorfd0.17.2patinae/Cargo.toml
crates.iopyo30.27.2python/Cargo.toml
crates.iopatinae-mol—python/Cargo.toml
crates.iopatinae-io—python/Cargo.toml
crates.iopatinae-select—python/Cargo.toml
crates.iopatinae-color—python/Cargo.toml
crates.iopatinae-settings—python/Cargo.toml
crates.iopatinae-scene—python/Cargo.toml
crates.iopatinae-cmd—python/Cargo.toml
crates.iolin_alg1.1python/Cargo.toml
crates.iothiserror2python/Cargo.toml
crates.iolog0.4python/Cargo.toml
crates.ioenv_logger0.11python/Cargo.toml
crates.ioserde1python/Cargo.toml
crates.ioserde_json1python/Cargo.toml
crates.iotokio1python/Cargo.toml
crates.ionumpy0.27.1python/Cargo.toml
crates.iopatinae-mol—web/Cargo.toml
crates.iopatinae-select—web/Cargo.toml
crates.iopatinae-color—web/Cargo.toml
crates.iopatinae-settings—web/Cargo.toml
crates.iopatinae-scene—web/Cargo.toml
crates.iopatinae-cmd—web/Cargo.toml
crates.iopatinae-render—web/Cargo.toml
crates.iolin_alg1.1web/Cargo.toml
crates.iowasm-bindgen0.2web/Cargo.toml
crates.iowasm-bindgen-futures0.4web/Cargo.toml
crates.ioweb-sys0.3web/Cargo.toml
crates.iojs-sys0.3web/Cargo.toml
crates.iowgpu30web/Cargo.toml
crates.ioserde1web/Cargo.toml
crates.ioserde-wasm-bindgen0.6web/Cargo.toml
crates.ioserde_json1web/Cargo.toml
crates.iolog0.4web/Cargo.toml
crates.ioconsole_log1web/Cargo.toml
crates.ioconsole_error_panic_hook0.1web/Cargo.toml
crates.iogetrandom0.3web/Cargo.toml
npmdompurify^3.4.12web/package.json
npmmarked^18.0.7web/package.json
Усі залежності не зібрано

Не вдалося зібрати розв'язаний набір залежностей для цього звіту: GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з zmactep/patinae. Читати поруч →

86megane-labs/meganeВідмінний98rerun-io/rerunVisualize, query, and stream to train on multimodal robotics data.Винятковий94apple/embedding-atlasEmbedding Atlas is a tool that provides interactive visualizations for large embeddings. It allows you to visualize, cross-filter, and search embeddings and metadata.Винятковий94foxglove/foxglove-sdkLog and visualize multimodal data for robotics and physical AIВинятковий99voxel51/fiftyoneRefine high-quality datasets and visual AI modelsВинятковий99apache/supersetApache Superset is a Data Visualization and Data Exploration PlatformВинятковий

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.