Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.17.0 · метрики 1.13.0 · 2026-07-21 06:09 UTC

JLSteenwyk / PhyKIT

a UNIX shell toolkit for processing and analyzing multiple sequence alignments and phylogenies

PythonMIT★ 88 зірок⑂ 9 форківз трав. 2020 р.Переглянути на GitHub ↗

#bioinformatics #evolution #evolutionary-biology #genomics #phylogenetics #phylogenomics #python #multiple-sequence-alignments

JLSteenwyk/PhyKIT має індекс здоров’я 65 зі 100, що відповідає смузі «Помірний». Найвищий показник — Vitality (81/100), найнижчий — Community & Adoption (46/100). Останнє оновлення — сьогодні. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

загалом / 100

Помірний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє середнє; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 49 («Під ризиком»). Готовність до ШІ не входить до індексу.

Відмінний85-100Зразковий; відповідає практично всім перевіреним критеріям

Добрий70-84Здоровий; незначні прогалини

Помірний50-69Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку

У зоні ризику30-49Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності

Критичний1-29Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Власність

Jacob L. SteenwykОсобистий обліковий запис

134 підписники51 публічний репозиторійз лют. 2016 р.University of California, Berkeley

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Пакетні екосистеми

Реєстр	Пакет	Версія	Завантажень / міс	Версії	Остання публікація
PyPI	phykit	2.4.1	-	155	0 днів тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

81Добрий · 22% загального індексу

Активність розробки

75Добрий

Як обчислюється оцінка

36/36	Свіжість push — останній push 0 дн. тому
11.1/36	Ритм комітів — 16/52 тижнів із комітами
18/18	Обсяг комітів — 1 355 комітів за останній рік
10/10	OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

commits_last_year	1 355
human_commit_share	—
days_since_last_push	0
active_weeks_last_year	16

Дисципліна релізів

90Відмінний

Як обчислюється оцінка

27/27	Випускає релізи — опубліковано 81 релізів
36/36	Свіжість релізів — останній реліз 0 дн. тому
27/27	Ритм релізів — реліз кожні ~12,3 дн.
0/10	OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.

Використані вхідні дані

releases_count	81
latest_release_tag	v2.4.1
releases_from_tags	ні
days_since_latest_release	0
mean_days_between_releases	12,3

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

46У зоні ризику · 18% загального індексу

Здоров'я спільноти

50Помірний

Як обчислюється оцінка

22.5/22.5	README
22.5/22.5	Ліцензія — визнана ліцензія (MIT)
0/18	Настанови CONTRIBUTING
0/13.5	Кодекс поведінки
0/7.2	Шаблон issue
0/6.3	Шаблон PR

Використані вхідні дані

has_readme	так
has_license	так
has_contributing	ні
has_issue_template	ні
has_code_of_conduct	ні
has_pull_request_template	ні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

60Помірний · 24% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

25Критичний

Як обчислюється оцінка

9/54	Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
0.3/22.5	Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 99% комітів
5.4/13.5	Широта контриб’юторів — 4 контриб’юторів
10/10	OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 4 contributing companies or organizations

Використані вхідні дані

bus_factor	1
contributors_sampled	4
top_contributor_share	0,986

Реактивність на issue та PR

67Помірний

Як обчислюється оцінка

45.1/46.8	Вирішення issue — закрито 96% issue
21.8/38.3	Прийняття PR — злито 29/51 вирішених PR
0/15	OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/2 approved changesets -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

merged_prs	29
open_issues	2
closed_issues	53
issue_closed_ratio	0,964
closed_unmerged_prs	22

Власність та опіка

62Помірний

Як обчислюється оцінка

10/30	Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис
0/20	Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів
15.3/25	Охоплення власника — 134 підписників у JLSteenwyk
24.5/25	Послужний список — 51 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~10 р.

Використані вхідні дані

followers	134
owner_type	User
is_verified	—
owner_login	JLSteenwyk
public_repos	51
account_age_days	3 810

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Відмінний

Як обчислюється оцінка

25/25	Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35	Свіжість публікацій — остання публікація 0 дн. тому
20/20	Історія версій — 155 опублікованих версій
20/20	Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked

Використані вхідні дані

packages	phykit
ecosystems	pypi
any_deprecated	ні
min_days_since_publish	0

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

81Добрий · 20% загального індексу

Інженерні практики

68Помірний

Як обчислюється оцінка

24/24	Процеси CI — 1 процес(ів) CI
24/24	Наявні тести
0/16	Конфігурація лінтера
0/9.6	Pre-commit-хуки
0/6.4	.editorconfig
20/20	OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

has_ci	так
has_tests	так
has_editorconfig	ні
has_linter_config	ні
has_precommit_config	ні

Документація

100Відмінний

Як обчислюється оцінка

30/30	README
25/25	Каталог документації
15/15	Сайт документації / домашня сторінка — https://jlsteenwyk.com/PhyKIT/
10/10	Опис репозиторію
10/10	Теми — 8 тем
10/10	Wiki

Використані вхідні дані

topics	bioinformatics, evolution, evolutionary-biology, genomics, phylogenetics, phylogenomics, python, multiple-sequence-alignments
has_wiki	так
homepage	https://jlsteenwyk.com/PhyKIT/
has_readme	так
has_docs_dir	так
has_description	так

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

52Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

40У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

7.5/7.5	Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5	Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches
2.5/2.5	CI-Tests — 1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5	CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5	Code-Review — Found 0/2 approved changesets -- score normalized to 0
2.5/2.5	Contributors — project has 4 contributing companies or organizations
10/10	Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
7.5/7.5	Dependency-Update-Tool — update tool detected
0/5	Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5	Ліцензія — license file detected
7.5/7.5	Maintained — 30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
0/5	Packaging — немає даних
0/5	Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5	SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5	Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5	Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
0/7.5	Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0/7.5	Vulnerabilities — 25 existing vulnerabilities detected

Використані вхідні дані

source	openssf_scorecard
checks_evaluated	17
scorecard_version	v5.5.0
checks_inconclusive	1
scorecard_aggregate	4

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): packaging. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

100Відмінний

Як обчислюється оцінка

35/35	Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень
0/25	Непрямі залежності без відомих сповіщень — транзитивний набір не відокремлюється від залежностей розробки й тестування в цьому обсязі
0/40	Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації

Використані вхідні дані

source	osv
advisories	55
affected_packages	13
assessed_packages	45
unassessed_packages	7
affected_by_severity	critical 1, high 5, moderate 5, low 1, unknown 1
direct_affected_packages	0

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Непрямі залежності без відомих сповіщень, Немає задавнених сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено 45 резолвлених залежностей із OSV. 7 не вдалося оцінити — немає резолвленої версії, непідтримувана екосистема або поза межами звітованого переліку пакетів. Цей репозиторій не публікує пакета, який резолвить індекс, тож натомість оцінено граф залежностей репозиторію. Цей граф змішує закріплені версії для розробки й тестування зі справді постачаними залежностями, тож оцінюються лише задекларовані runtime-залежності; транзитивні знахідки подаються як контекст і в оцінку не входять. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Незалежний, експериментальний бейдж — вага 0.0, тож він подається окремо і не впливає на загальний індекс здоров'я.

47У зоні ризику · 0% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

25Критичний

Як обчислюється оцінка

0/45	Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
15/15	Машиночитана документація (llms.txt) — llms.txt наявний
0/40	Читабельна історія комітів — немає даних

Використані вхідні дані

has_llms_txt	так
legible_history_share	—
agent_instruction_files	—
agent_instruction_max_bytes	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Читабельна історія комітів. Залишкові ваги перенормовано.

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

61Помірний

Як обчислюється оцінка

18/18	Розгортання однією командою — Makefile, docs/Makefile
22/22	Автоматизовані тести
0/11	Конфігурація лінтера / форматера
0/11	Статична перевірка типів
10/10	Відтворюване середовище — lockfile
0/10	Підтверджена практика роботи з агентами — немає даних
0/8	Автоматизоване супроводження — немає даних
0/10	OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

has_nix	ні
has_tests	так
lockfiles	Pipfile.lock
has_dockerfile	ні
typed_language	ні
bootstrap_files	Makefile, docs/Makefile
has_devcontainer	ні
has_linter_config	ні
typecheck_configs	—
agent_commit_share	—
toolchain_manifests	—
dependency_bot_commit_share	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Підтверджена практика роботи з агентами, Автоматизоване супроводження. Залишкові ваги перенормовано.

Читабельність коду для моделей

52Помірний

Як обчислюється оцінка

0/45	Типізований код — Python без конфігурації перевірки типів
52.4/55	Керовані розміри файлів — 19/409 файлів вихідного коду понад 60 КБ

Використані вхідні дані

primary_language	Python
largest_source_bytes	436 472
source_files_sampled	409
oversized_source_files	19

Ключові факти

88зірок GitHub

4контриб'юторів

1 355комітів за останні 12 місяців

0днів від останнього пушу

81релізів

1бас-фактор

2відкритих issue

PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

deps.dev does not index pypi:phykit@2.4.1; advisories assessed against the repository dependency graph instead

Докладніше

Історія зірок і форків 88 ★ / 0 ⇿

88Зірки

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

Кожна точка охоплює 6 днів.

OpenSSF Scorecard 4.0 / 10

4.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-21 06:08 UTC

10	Binary-Artifacts	no binaries found in the repo
0	Branch-Protection	branch protection not enabled on development/release branches
10	CI-Tests	1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0	CII-Best-Practices	no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0	Code-Review	Found 0/2 approved changesets -- score normalized to 0
10	Contributors	project has 4 contributing companies or organizations
10	Dangerous-Workflow	no dangerous workflow patterns detected
10	Dependency-Update-Tool	update tool detected
0	Fuzzing	project is not fuzzed
10	License	license file detected
10	Maintained	30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
н/д	Packaging	packaging workflow not detected
0	Pinned-Dependencies	dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0	SAST	SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0	Security-Policy	security policy file not detected
0	Signed-Releases	Project has not signed or included provenance with any releases.
0	Token-Permissions	detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0	Vulnerabilities	25 existing vulnerabilities detected

Усі залежності 52

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 0 прямих і 52 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

Реєстр	Пакет	Версія	Зв'язок
PyPI	alabaster	`0.7.16`	непряма
PyPI	anyio	`4.4.0`	непряма
PyPI	babel	`2.15.0`	непряма
PyPI	biopython	`—`	непряма
PyPI	biopython	`1.76`	непряма
PyPI	certifi	`2024.6.2`	непряма
PyPI	charset-normalizer	`3.3.2`	непряма
PyPI	click	`8.1.7`	непряма
PyPI	colorama	`0.4.6`	непряма
PyPI	docutils	`0.20.1`	непряма
PyPI	exceptiongroup	`1.2.1`	непряма
PyPI	h11	`0.14.0`	непряма
PyPI	idna	`3.7`	непряма
PyPI	imagesize	`1.4.1`	непряма
PyPI	importlib-metadata	`7.1.0`	непряма
PyPI	jinja2	`3.1.4`	непряма
PyPI	markupsafe	`2.1.5`	непряма
PyPI	matplotlib	`—`	непряма
PyPI	mock	`5.1.0`	непряма
PyPI	numpy	`—`	непряма
PyPI	packaging	`24.0`	непряма
PyPI	pygments	`2.18.0`	непряма
PyPI	pytest	`8.3.5`	непряма
PyPI	pytest-cov	`4.1.0`	непряма
PyPI	pytest-mock	`3.14.0`	непряма
PyPI	requests	`2.32.3`	непряма
PyPI	scikit-learn	`—`	непряма
PyPI	scikit-learn	`1.4.2`	непряма
PyPI	scipy	`—`	непряма
PyPI	scipy	`1.4.1`	непряма
PyPI	sniffio	`1.3.1`	непряма
PyPI	snowballstemmer	`2.2.0`	непряма
PyPI	sphinx	`7.3.7`	непряма
PyPI	sphinx-autobuild	`2024.4.16`	непряма
PyPI	sphinx-rtd-theme	`2.0.0`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-applehelp	`1.0.8`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-devhelp	`1.0.6`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-htmlhelp	`2.0.5`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-jquery	`4.1`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-jsmath	`1.0.1`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-qthelp	`1.0.7`	непряма
PyPI	sphinxcontrib-serializinghtml	`1.1.10`	непряма
PyPI	starlette	`0.37.2`	непряма
PyPI	tomli	`2.0.1`	непряма
PyPI	tqdm	`—`	непряма
PyPI	typing-extensions	`4.12.1`	непряма
PyPI	umap-learn	`—`	непряма
PyPI	urllib3	`2.2.1`	непряма
PyPI	uvicorn	`0.30.1`	непряма
PyPI	watchfiles	`0.22.0`	непряма
PyPI	websockets	`12.0`	непряма
PyPI	zipp	`3.19.1`	непряма

Сповіщення про залежності 13

Цей репозиторій не публікує пакета, який розпізнає індекс, тож оцінено його власний граф залежностей — 45 пакетів, серед яких є й піниї розробки та тестування, що ніколи не постачаються: 13 мають відомі сповіщення, з них 0 прямі. 7 не вдалося оцінити — немає резолвленої версії, непідтримувана екосистема або поза наведеним переліком пакетів.

Пакет	Версія	Зв'язок	Критичність	Сповіщень	Виправлено в
h11	`0.14.0`	непряма	критична	2	`0.16.0`
certifi	`2024.6.2`	непряма	висока	2	`2024.7.4`
click	`8.1.7`	непряма	висока	1	`8.3.3`
jinja2	`3.1.4`	непряма	висока	6	`3.1.6`
starlette	`0.37.2`	непряма	висока	14	`1.3.1`
urllib3	`2.2.1`	непряма	висока	14	`2.7.0`
biopython	`1.76`	непряма	помірна	2	`1.87`
idna	`3.7`	непряма	помірна	2	`3.15`
pytest	`8.3.5`	непряма	помірна	2	`9.0.3`
requests	`2.32.3`	непряма	помірна	4	`2.33.0`
scikit-learn	`1.4.2`	непряма	помірна	2	`1.5.0`
pygments	`2.18.0`	непряма	низька	2	`2.20.0`
scipy	`1.4.1`	непряма	невідома	2	`1.10.0`

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

{
  "data": {
    "repo": {
      "topics": [
        "bioinformatics",
        "evolution",
        "evolutionary-biology",
        "genomics",
        "phylogenetics",
        "phylogenomics",
        "python",
        "multiple-sequence-alignments"
      ],
      "is_fork": false,
      "size_kb": 32688,
      "has_wiki": true,
      "homepage": "https://jlsteenwyk.com/PhyKIT/",
      "languages": {
        "R": 89438,
        "Python": 8120620,
        "Makefile": 5432
      },
      "pushed_at": "2026-07-20T17:08:09Z",
      "created_at": "2020-05-12T14:29:24Z",
      "owner_type": "User",
      "updated_at": "2026-07-20T17:06:34Z",
      "description": "a UNIX shell toolkit for processing and analyzing multiple sequence alignments and phylogenies",
      "is_archived": false,
      "is_disabled": false,
      "license_spdx": "MIT",
      "default_branch": "master",
      "license_spdx_raw": "MIT",
      "primary_language": "Python",
      "significant_languages": [
        "Python"
      ]
    },
    "owner": {
      "blog": "jlsteenwyk.com",
      "name": "Jacob L. Steenwyk",
      "type": "User",
      "login": "JLSteenwyk",
      "company": "University of California, Berkeley",
      "location": "Berkeley, CA",
      "followers": 134,
      "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/17225603?v=4",
      "created_at": "2016-02-13T22:41:33Z",
      "is_verified": null,
      "public_repos": 51,
      "account_age_days": 3810
    },
    "license": {
      "state": "standard",
      "spdx_id": "MIT",
      "raw_spdx": "MIT",
      "file_present": true,
      "scorecard_found": true,
      "profile_has_license": true
    },
    "activity": {
      "releases_count": 81,
      "commits_last_year": 1355,
      "latest_release_at": "2026-07-20T17:06:08Z",
      "latest_release_tag": "v2.4.1",
      "releases_from_tags": false,
      "days_since_last_push": 0,
      "active_weeks_last_year": 16,
      "days_since_latest_release": 0,
      "mean_days_between_releases": 12.3
    },
    "community": {
      "has_readme": true,
      "has_license": true,
      "has_description": true,
      "has_contributing": false,
      "health_percentage": 42,
      "has_issue_template": false,
      "has_code_of_conduct": false,
      "has_pull_request_template": false
    },
    "ecosystem": {
      "packages": [
        {
          "name": "phykit",
          "exists": true,
          "license": null,
          "keywords": [
            "Intended Audience :: Science/Research",
            "Operating System :: OS Independent",
            "Programming Language :: Python",
            "Programming Language :: Python :: 3.10",
            "Programming Language :: Python :: 3.11",
            "Programming Language :: Python :: 3.12",
            "Programming Language :: Python :: 3.13",
            "Topic :: Scientific/Engineering"
          ],
          "ecosystem": "pypi",
          "matches_repo": true,
          "registry_url": "https://pypi.org/project/phykit/",
          "is_deprecated": false,
          "latest_version": "2.4.1",
          "repository_url": "https://github.com/jlsteenwyk/phykit",
          "versions_count": 155,
          "total_downloads": null,
          "dependents_count": null,
          "deprecation_note": null,
          "maintainers_count": null,
          "monthly_downloads": null,
          "first_published_at": "2020-10-22T13:44:56.509614Z",
          "latest_published_at": "2026-07-20T17:06:21.719364Z",
          "latest_version_yanked": null,
          "days_since_latest_publish": 0
        }
      ]
    },
    "popularity": {
      "forks": 9,
      "stars": 88,
      "watchers": 4,
      "star_history": {
        "days": [
          {
            "date": "2020-10-28",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2020-10-29",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2020-10-30",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2020-11-10",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-01-20",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-02-09",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2021-02-10",
            "count": 3
          },
          {
            "date": "2021-02-15",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2021-03-01",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-03-06",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-03-07",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-04-12",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2021-04-19",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-09-03",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-10-06",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-10-17",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-10-18",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2021-10-21",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-10-26",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2021-12-02",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-02-04",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-04-18",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-05-01",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-07-07",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-11-02",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-11-25",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2022-12-16",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-02-26",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-03-07",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-05-22",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-10-18",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2023-10-22",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-10-23",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-11-29",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2023-12-23",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2024-02-08",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-03-22",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-05-04",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-05-05",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-05-07",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-05-10",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-05-16",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2024-07-31",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-08-02",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-08-13",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-08-27",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-09-10",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-09-24",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-10-30",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-11-10",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-11-14",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-11-26",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-11-28",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2024-11-29",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-12-08",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2024-12-23",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-03-14",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-04-19",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-05-14",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-05-15",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-05-27",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-06-04",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-08-17",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-09-24",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-11-13",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-11-20",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-11-22",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2025-12-02",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-02-11",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-02-19",
            "count": 2
          },
          {
            "date": "2026-03-27",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-04-02",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-04-15",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-05-19",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-06-11",
            "count": 1
          },
          {
            "date": "2026-07-12",
            "count": 1
          }
        ],
        "complete": true,
        "collected": 88,
        "total_stars": 88
      },
      "open_issues_and_prs": 3
    },
    "ai_readiness": {
      "has_nix": false,
      "example_dirs": [],
      "has_llms_txt": true,
      "has_dockerfile": false,
      "has_mcp_signal": false,
      "bootstrap_files": [
        "Makefile",
        "docs/Makefile"
      ],
      "api_schema_files": [],
      "has_devcontainer": false,
      "typecheck_configs": [],
      "largest_source_bytes": 436472,
      "source_files_sampled": 409,
      "oversized_source_files": 19,
      "agent_instruction_files": [],
      "agent_instruction_max_bytes": null
    },
    "dependencies": {
      "manifests": [
        "Pipfile",
        "docs/Pipfile",
        "requirements.txt",
        "setup.py",
        "tests/requirements.txt"
      ],
      "advisories": {
        "error": null,
        "scope": "repository_graph",
        "source": "osv",
        "findings": [
          {
            "name": "h11",
            "direct": false,
            "version": "0.14.0",
            "severity": "critical",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 9.1,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-vqfr-h8mv-ghfj",
              "PYSEC-2026-348"
            ],
            "fixed_version": "0.16.0",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 452
          },
          {
            "name": "certifi",
            "direct": false,
            "version": "2024.6.2",
            "severity": "high",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 7.5,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-248v-346w-9cwc",
              "PYSEC-2024-230"
            ],
            "fixed_version": "2024.7.4",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 745
          },
          {
            "name": "click",
            "direct": false,
            "version": "8.1.7",
            "severity": "high",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 7.2,
            "advisory_ids": [
              "PYSEC-2026-2132"
            ],
            "fixed_version": "8.3.3",
            "advisory_count": 1,
            "oldest_advisory_days": 81
          },
          {
            "name": "jinja2",
            "direct": false,
            "version": "3.1.4",
            "severity": "high",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 8.8,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-cpwx-vrp4-4pq7",
              "GHSA-gmj6-6f8f-6699",
              "GHSA-q2x7-8rv6-6q7h",
              "PYSEC-2026-1471",
              "PYSEC-2026-1472",
              "PYSEC-2026-1475"
            ],
            "fixed_version": "3.1.6",
            "advisory_count": 6,
            "oldest_advisory_days": 574
          },
          {
            "name": "starlette",
            "direct": false,
            "version": "0.37.2",
            "severity": "high",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 7.5,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-2c2j-9gv5-cj73",
              "GHSA-82w8-qh3p-5jfq",
              "GHSA-86qp-5c8j-p5mr",
              "GHSA-f96h-pmfr-66vw",
              "GHSA-jp82-jpqv-5vv3",
              "GHSA-wqp7-x3pw-xc5r",
              "GHSA-x746-7m8f-x49c",
              "PYSEC-2026-161",
              "PYSEC-2026-1941",
              "PYSEC-2026-1943"
            ],
            "fixed_version": "1.3.1",
            "advisory_count": 14,
            "oldest_advisory_days": 643
          },
          {
            "name": "urllib3",
            "direct": false,
            "version": "2.2.1",
            "severity": "high",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 7.5,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-2xpw-w6gg-jr37",
              "GHSA-34jh-p97f-mpxf",
              "GHSA-38jv-5279-wg99",
              "GHSA-48p4-8xcf-vxj5",
              "GHSA-gm62-xv2j-4w53",
              "GHSA-pq67-6m6q-mj2v",
              "GHSA-qccp-gfcp-xxvc",
              "PYSEC-2026-141",
              "PYSEC-2026-1994",
              "PYSEC-2026-1995"
            ],
            "fixed_version": "2.7.0",
            "advisory_count": 14,
            "oldest_advisory_days": 763
          },
          {
            "name": "biopython",
            "direct": false,
            "version": "1.76",
            "severity": "moderate",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 4.9,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-x3vf-39hj-gxr4",
              "PYSEC-2026-1221"
            ],
            "fixed_version": "1.87",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 214
          },
          {
            "name": "idna",
            "direct": false,
            "version": "3.7",
            "severity": "moderate",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 5.3,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-65pc-fj4g-8rjx",
              "PYSEC-2026-215"
            ],
            "fixed_version": "3.15",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 62
          },
          {
            "name": "pytest",
            "direct": false,
            "version": "8.3.5",
            "severity": "moderate",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 6.8,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-6w46-j5rx-g56g",
              "PYSEC-2026-1845"
            ],
            "fixed_version": "9.0.3",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 179
          },
          {
            "name": "requests",
            "direct": false,
            "version": "2.32.3",
            "severity": "moderate",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 5.5,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-9hjg-9r4m-mvj7",
              "GHSA-gc5v-m9x4-r6x2",
              "PYSEC-2026-1872",
              "PYSEC-2026-2275"
            ],
            "fixed_version": "2.33.0",
            "advisory_count": 4,
            "oldest_advisory_days": 406
          },
          {
            "name": "scikit-learn",
            "direct": false,
            "version": "1.4.2",
            "severity": "moderate",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 5.3,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-jw8x-6495-233v",
              "PYSEC-2024-110"
            ],
            "fixed_version": "1.5.0",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 774
          },
          {
            "name": "pygments",
            "direct": false,
            "version": "2.18.0",
            "severity": "low",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": 3.3,
            "advisory_ids": [
              "GHSA-5239-wwwm-4pmq",
              "PYSEC-2026-2987"
            ],
            "fixed_version": "2.20.0",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 120
          },
          {
            "name": "scipy",
            "direct": false,
            "version": "1.4.1",
            "severity": "unknown",
            "ecosystem": "pypi",
            "cvss_score": null,
            "advisory_ids": [
              "PYSEC-2023-102",
              "PYSEC-2023-114"
            ],
            "fixed_version": "1.10.0",
            "advisory_count": 2,
            "oldest_advisory_days": 1111
          }
        ],
        "collected": true,
        "truncated": false,
        "by_severity": {
          "low": 1,
          "high": 5,
          "unknown": 1,
          "critical": 1,
          "moderate": 5
        },
        "advisory_count": 55,
        "affected_count": 13,
        "assessed_count": 45,
        "assessed_package": null,
        "unassessed_count": 7,
        "direct_affected_count": 0
      },
      "ecosystems": [
        "pypi"
      ],
      "dependencies": [],
      "all_dependencies": {
        "error": null,
        "source": "github-sbom",
        "packages": [
          {
            "name": "alabaster",
            "direct": false,
            "version": "0.7.16",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "anyio",
            "direct": false,
            "version": "4.4.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "babel",
            "direct": false,
            "version": "2.15.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "biopython",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "biopython",
            "direct": false,
            "version": "1.76",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "certifi",
            "direct": false,
            "version": "2024.6.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "charset-normalizer",
            "direct": false,
            "version": "3.3.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "click",
            "direct": false,
            "version": "8.1.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "colorama",
            "direct": false,
            "version": "0.4.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "docutils",
            "direct": false,
            "version": "0.20.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "exceptiongroup",
            "direct": false,
            "version": "1.2.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "h11",
            "direct": false,
            "version": "0.14.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "idna",
            "direct": false,
            "version": "3.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "imagesize",
            "direct": false,
            "version": "1.4.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "importlib-metadata",
            "direct": false,
            "version": "7.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "jinja2",
            "direct": false,
            "version": "3.1.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "markupsafe",
            "direct": false,
            "version": "2.1.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "matplotlib",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "mock",
            "direct": false,
            "version": "5.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "numpy",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "packaging",
            "direct": false,
            "version": "24.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pygments",
            "direct": false,
            "version": "2.18.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pytest",
            "direct": false,
            "version": "8.3.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pytest-cov",
            "direct": false,
            "version": "4.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pytest-mock",
            "direct": false,
            "version": "3.14.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "requests",
            "direct": false,
            "version": "2.32.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scikit-learn",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scikit-learn",
            "direct": false,
            "version": "1.4.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scipy",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scipy",
            "direct": false,
            "version": "1.4.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sniffio",
            "direct": false,
            "version": "1.3.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "snowballstemmer",
            "direct": false,
            "version": "2.2.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx",
            "direct": false,
            "version": "7.3.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx-autobuild",
            "direct": false,
            "version": "2024.4.16",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx-rtd-theme",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-applehelp",
            "direct": false,
            "version": "1.0.8",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-devhelp",
            "direct": false,
            "version": "1.0.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-htmlhelp",
            "direct": false,
            "version": "2.0.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-jquery",
            "direct": false,
            "version": "4.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-jsmath",
            "direct": false,
            "version": "1.0.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-qthelp",
            "direct": false,
            "version": "1.0.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-serializinghtml",
            "direct": false,
            "version": "1.1.10",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "starlette",
            "direct": false,
            "version": "0.37.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "tomli",
            "direct": false,
            "version": "2.0.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "tqdm",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "typing-extensions",
            "direct": false,
            "version": "4.12.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "umap-learn",
            "direct": false,
            "version": null,
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "urllib3",
            "direct": false,
            "version": "2.2.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "uvicorn",
            "direct": false,
            "version": "0.30.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "watchfiles",
            "direct": false,
            "version": "0.22.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "websockets",
            "direct": false,
            "version": "12.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "zipp",
            "direct": false,
            "version": "3.19.1",
            "ecosystem": "pypi"
          }
        ],
        "collected": true,
        "truncated": false,
        "total_count": 52,
        "direct_count": 0,
        "indirect_count": 52
      }
    },
    "maintainership": {
      "issues": {
        "open_prs": 1,
        "merged_prs": 29,
        "open_issues": 2,
        "closed_ratio": 0.964,
        "closed_issues": 53,
        "closed_unmerged_prs": 22
      },
      "bus_factor": 1,
      "top_contributors": [
        {
          "type": "User",
          "login": "JLSteenwyk",
          "commits": 1716,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/17225603?v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "TJBIII",
          "commits": 22,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/13630281?v=4"
        },
        {
          "type": "Bot",
          "login": "dependabot[bot]",
          "commits": 2,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/in/29110?v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "hyphaltip",
          "commits": 1,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/48827?v=4"
        }
      ],
      "contributors_sampled": 4,
      "top_contributor_share": 0.986
    },
    "quality_signals": {
      "has_ci": true,
      "has_tests": true,
      "ci_workflows": [
        "ci.yml"
      ],
      "has_docs_dir": true,
      "linter_configs": [],
      "has_editorconfig": false,
      "has_linter_config": false,
      "has_precommit_config": false
    },
    "security_signals": {
      "lockfiles": [
        "Pipfile.lock"
      ],
      "scorecard": {
        "checks": [
          {
            "name": "Binary-Artifacts",
            "score": 10,
            "reason": "no binaries found in the repo",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#binary-artifacts"
          },
          {
            "name": "Branch-Protection",
            "score": 0,
            "reason": "branch protection not enabled on development/release branches",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#branch-protection"
          },
          {
            "name": "CI-Tests",
            "score": 10,
            "reason": "1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#ci-tests"
          },
          {
            "name": "CII-Best-Practices",
            "score": 0,
            "reason": "no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#cii-best-practices"
          },
          {
            "name": "Code-Review",
            "score": 0,
            "reason": "Found 0/2 approved changesets -- score normalized to 0",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#code-review"
          },
          {
            "name": "Contributors",
            "score": 10,
            "reason": "project has 4 contributing companies or organizations",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#contributors"
          },
          {
            "name": "Dangerous-Workflow",
            "score": 10,
            "reason": "no dangerous workflow patterns detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#dangerous-workflow"
          },
          {
            "name": "Dependency-Update-Tool",
            "score": 10,
            "reason": "update tool detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#dependency-update-tool"
          },
          {
            "name": "Fuzzing",
            "score": 0,
            "reason": "project is not fuzzed",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#fuzzing"
          },
          {
            "name": "License",
            "score": 10,
            "reason": "license file detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#license"
          },
          {
            "name": "Maintained",
            "score": 10,
            "reason": "30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#maintained"
          },
          {
            "name": "Packaging",
            "score": null,
            "reason": "packaging workflow not detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#packaging"
          },
          {
            "name": "Pinned-Dependencies",
            "score": 0,
            "reason": "dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#pinned-dependencies"
          },
          {
            "name": "SAST",
            "score": 0,
            "reason": "SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#sast"
          },
          {
            "name": "Security-Policy",
            "score": 0,
            "reason": "security policy file not detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#security-policy"
          },
          {
            "name": "Signed-Releases",
            "score": 0,
            "reason": "Project has not signed or included provenance with any releases.",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#signed-releases"
          },
          {
            "name": "Token-Permissions",
            "score": 0,
            "reason": "detected GitHub workflow tokens with excessive permissions",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#token-permissions"
          },
          {
            "name": "Vulnerabilities",
            "score": 0,
            "reason": "25 existing vulnerabilities detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#vulnerabilities"
          }
        ],
        "commit": "fd5c3c0d9bf86ff6b2afb6bd94082c2cf3d0bccd",
        "ran_at": "2026-07-21T06:08:52Z",
        "aggregate_score": 4,
        "scorecard_version": "v5.5.0"
      },
      "has_codeql_workflow": false,
      "has_security_policy": false,
      "has_dependabot_config": false
    }
  },
  "config": {
    "disabled_metrics": [],
    "disabled_categories": [],
    "disabled_components": {}
  },
  "source": {
    "url": "https://github.com/JLSteenwyk/PhyKIT",
    "host": "github.com",
    "name": "PhyKIT",
    "owner": "JLSteenwyk"
  },
  "metrics": {
    "overall": {
      "key": "overall",
      "band": "moderate",
      "name": "Overall health",
      "note": null,
      "notes": [],
      "value": 65,
      "inputs": {
        "security": 52,
        "vitality": 81,
        "community": 46,
        "governance": 60,
        "engineering": 81
      },
      "components": []
    },
    "categories": [
      {
        "key": "vitality",
        "band": "good",
        "name": "Vitality",
        "value": 81,
        "weight": 0.22,
        "metrics": [
          {
            "key": "development_activity",
            "band": "good",
            "name": "Development activity",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 75,
            "inputs": {
              "commits_last_year": 1355,
              "human_commit_share": null,
              "days_since_last_push": 0,
              "active_weeks_last_year": 16
            },
            "components": [
              {
                "key": "push_recency",
                "name": "Push recency",
                "detail": "last push 0 days ago",
                "points": 36,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "push_recency",
                    "params": {
                      "days": 0
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 36
              },
              {
                "key": "commit_cadence",
                "name": "Commit cadence",
                "detail": "16/52 weeks with commits",
                "points": 11.1,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "commit_cadence_weeks",
                    "params": {
                      "weeks": 16
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 36
              },
              {
                "key": "commit_volume",
                "name": "Commit volume",
                "detail": "1355 commits in the last year",
                "points": 18,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "commits_last_year",
                    "params": {
                      "count": 1355
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 18
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_maintained",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Maintained",
                "detail": "30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "release_discipline",
            "band": "excellent",
            "name": "Release discipline",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 90,
            "inputs": {
              "releases_count": 81,
              "latest_release_tag": "v2.4.1",
              "releases_from_tags": false,
              "days_since_latest_release": 0,
              "mean_days_between_releases": 12.3
            },
            "components": [
              {
                "key": "ships_releases",
                "name": "Ships releases",
                "detail": "81 releases published",
                "points": 27,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "releases_published",
                    "params": {
                      "count": 81
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 27
              },
              {
                "key": "release_recency",
                "name": "Release recency",
                "detail": "latest release 0 days ago",
                "points": 36,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "release_recency",
                    "params": {
                      "days": 0
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 36
              },
              {
                "key": "release_cadence",
                "name": "Release cadence",
                "detail": "a release every ~12.3 days",
                "points": 27,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "release_cadence",
                    "params": {
                      "gap": 12.3
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 27
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_signed_releases",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Signed-Releases",
                "detail": "Project has not signed or included provenance with any releases.",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "abandonment",
            "band": "excellent",
            "name": "Abandonment",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "cap": null,
              "state": "unverified",
              "guards": [],
              "signals": [],
              "red_flag": false,
              "multiplier_pct": 100,
              "declared_reason": null,
              "unverified_reason": "no_commit_sample",
              "unanswered_open_prs": null,
              "unanswered_open_issues": null,
              "days_since_last_merged_pr": null,
              "days_since_last_human_commit": null,
              "days_since_last_human_commit_is_floor": false
            },
            "components": [
              {
                "key": "project_is_still_maintained",
                "name": "Project is still maintained",
                "detail": "maintenance record not established from the collected data",
                "points": 100,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "abandonment_unverified",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 100
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Is the project alive — is code being written and are releases shipping?"
      },
      {
        "key": "community",
        "band": "at_risk",
        "name": "Community & Adoption",
        "value": 46,
        "weight": 0.18,
        "metrics": [
          {
            "key": "popularity",
            "band": "at_risk",
            "name": "Popularity & adoption",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 42,
            "inputs": {
              "forks": 9,
              "stars": 88,
              "watchers": 4,
              "growth_state": "unverified",
              "growth_factor_pct": 100,
              "growth_unverified_reason": "below_threshold"
            },
            "components": [
              {
                "key": "stars",
                "name": "Stars",
                "detail": "88 stars",
                "points": 31.5,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "stars",
                    "params": {
                      "count": 88
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 60
              },
              {
                "key": "forks",
                "name": "Forks",
                "detail": "9 forks",
                "points": 7.5,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "forks",
                    "params": {
                      "count": 9
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "watchers",
                "name": "Watchers",
                "detail": "4 watchers",
                "points": 2.7,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "watchers",
                    "params": {
                      "count": 4
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 15
              }
            ]
          },
          {
            "key": "community_health",
            "band": "moderate",
            "name": "Community health",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 50,
            "inputs": {
              "has_readme": true,
              "has_license": true,
              "has_contributing": false,
              "has_issue_template": false,
              "has_code_of_conduct": false,
              "has_pull_request_template": false
            },
            "components": [
              {
                "key": "readme",
                "name": "README",
                "detail": null,
                "points": 22.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 22.5
              },
              {
                "key": "license",
                "name": "License",
                "detail": "recognized license (MIT)",
                "points": 22.5,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "license_standard",
                    "params": {}
                  },
                  {
                    "code": "license_spdx",
                    "params": {
                      "spdx": "MIT"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 22.5
              },
              {
                "key": "contributing_guide",
                "name": "CONTRIBUTING guide",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 18
              },
              {
                "key": "code_of_conduct",
                "name": "Code of conduct",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 13.5
              },
              {
                "key": "issue_template",
                "name": "Issue template",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.2
              },
              {
                "key": "pr_template",
                "name": "PR template",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 6.3
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Does the project have users, downloads, attention, and a welcoming setup for contributors?"
      },
      {
        "key": "governance",
        "band": "moderate",
        "name": "Sustainability & Governance",
        "value": 60,
        "weight": 0.24,
        "metrics": [
          {
            "key": "maintainer_resilience",
            "band": "critical",
            "name": "Maintainer resilience (bus factor)",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 25,
            "inputs": {
              "bus_factor": 1,
              "contributors_sampled": 4,
              "top_contributor_share": 0.986
            },
            "components": [
              {
                "key": "bus_factor",
                "name": "Bus factor",
                "detail": "1 contributor(s) cover half of all commits",
                "points": 9,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "bus_factor",
                    "params": {
                      "count": 1
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 54
              },
              {
                "key": "commit_distribution",
                "name": "Commit distribution",
                "detail": "top contributor authored 99% of commits",
                "points": 0.3,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "top_contributor_share",
                    "params": {
                      "share": 99
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 22.5
              },
              {
                "key": "contributor_breadth",
                "name": "Contributor breadth",
                "detail": "4 contributors",
                "points": 5.4,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "contributors_sampled",
                    "params": {
                      "count": 4
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 13.5
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_contributors",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Contributors",
                "detail": "project has 4 contributing companies or organizations",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "responsiveness",
            "band": "moderate",
            "name": "Issue & PR responsiveness",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 67,
            "inputs": {
              "merged_prs": 29,
              "open_issues": 2,
              "closed_issues": 53,
              "issue_closed_ratio": 0.964,
              "closed_unmerged_prs": 22
            },
            "components": [
              {
                "key": "issue_resolution",
                "name": "Issue resolution",
                "detail": "96% of issues closed",
                "points": 45.1,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "issues_closed_share",
                    "params": {
                      "share": 96
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 46.75
              },
              {
                "key": "pr_acceptance",
                "name": "PR acceptance",
                "detail": "29/51 decided PRs merged",
                "points": 21.8,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "decided_prs_merged",
                    "params": {
                      "merged": 29,
                      "decided": 51
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 38.25
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_code_review",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Code-Review",
                "detail": "Found 0/2 approved changesets -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 15
              }
            ]
          },
          {
            "key": "stewardship",
            "band": "moderate",
            "name": "Ownership & stewardship",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Verified domain. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "verified_domain"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 62,
            "inputs": {
              "followers": 134,
              "owner_type": "User",
              "is_verified": null,
              "owner_login": "JLSteenwyk",
              "public_repos": 51,
              "account_age_days": 3810
            },
            "components": [
              {
                "key": "ownership_backing",
                "name": "Ownership backing",
                "detail": "personal (user) account",
                "points": 10,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "owner_personal",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 30
              },
              {
                "key": "verified_domain",
                "name": "Verified domain",
                "detail": "not applicable to user accounts",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "not_applicable_to_user_accounts",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 20
              },
              {
                "key": "owner_reach",
                "name": "Owner reach",
                "detail": "134 followers of JLSteenwyk",
                "points": 15.3,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "owner_followers",
                    "params": {
                      "count": 134,
                      "login": "JLSteenwyk"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "track_record",
                "name": "Track record",
                "detail": "51 public repos, account ~10 yr old",
                "points": 24.5,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "public_repos",
                    "params": {
                      "count": 51
                    }
                  },
                  {
                    "code": "account_age_years",
                    "params": {
                      "years": 10
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              }
            ]
          },
          {
            "key": "package_maintenance",
            "band": "excellent",
            "name": "Package maintenance",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "packages": [
                "phykit"
              ],
              "ecosystems": "pypi",
              "any_deprecated": false,
              "min_days_since_publish": 0
            },
            "components": [
              {
                "key": "published_resolvable",
                "name": "Published & resolvable",
                "detail": "1 package(s) on pypi",
                "points": 25,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "packages_published",
                    "params": {
                      "count": 1,
                      "ecosystems": "pypi"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "publish_recency",
                "name": "Publish recency",
                "detail": "latest publish 0 days ago",
                "points": 35,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "publish_recency",
                    "params": {
                      "days": 0
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 35
              },
              {
                "key": "version_history",
                "name": "Version history",
                "detail": "155 published versions",
                "points": 20,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "published_versions",
                    "params": {
                      "count": 155
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 20
              },
              {
                "key": "not_deprecated",
                "name": "Not deprecated",
                "detail": "active, not deprecated or yanked",
                "points": 20,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "package_not_deprecated",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 20
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Will the project survive its people — bus factor, responsiveness, who backs it, and package upkeep?"
      },
      {
        "key": "engineering",
        "band": "good",
        "name": "Engineering Quality",
        "value": 81,
        "weight": 0.2,
        "metrics": [
          {
            "key": "engineering_practices",
            "band": "moderate",
            "name": "Engineering practices",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 68,
            "inputs": {
              "has_ci": true,
              "has_tests": true,
              "has_editorconfig": false,
              "has_linter_config": false,
              "has_precommit_config": false
            },
            "components": [
              {
                "key": "ci_workflows",
                "name": "CI workflows",
                "detail": "1 workflow(s)",
                "points": 24,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "ci_workflows",
                    "params": {
                      "count": 1
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 24
              },
              {
                "key": "tests_present",
                "name": "Tests present",
                "detail": null,
                "points": 24,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 24
              },
              {
                "key": "linter_config",
                "name": "Linter config",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 16
              },
              {
                "key": "pre_commit_hooks",
                "name": "Pre-commit hooks",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 9.6
              },
              {
                "key": "editorconfig",
                "name": ".editorconfig",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 6.4
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_ci_tests",
                "name": "OpenSSF Scorecard: CI-Tests",
                "detail": "1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10",
                "points": 20,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 20
              }
            ]
          },
          {
            "key": "documentation",
            "band": "excellent",
            "name": "Documentation",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "topics": [
                "bioinformatics",
                "evolution",
                "evolutionary-biology",
                "genomics",
                "phylogenetics",
                "phylogenomics",
                "python",
                "multiple-sequence-alignments"
              ],
              "has_wiki": true,
              "homepage": "https://jlsteenwyk.com/PhyKIT/",
              "has_readme": true,
              "has_docs_dir": true,
              "has_description": true
            },
            "components": [
              {
                "key": "readme",
                "name": "README",
                "detail": null,
                "points": 30,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 30
              },
              {
                "key": "documentation_directory",
                "name": "Documentation directory",
                "detail": null,
                "points": 25,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "documentation_homepage_site",
                "name": "Documentation / homepage site",
                "detail": "https://jlsteenwyk.com/PhyKIT/",
                "points": 15,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 15
              },
              {
                "key": "repository_description",
                "name": "Repository description",
                "detail": null,
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "topics",
                "name": "Topics",
                "detail": "8 topics",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "topics_count",
                    "params": {
                      "count": 8
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "wiki",
                "name": "Wiki",
                "detail": null,
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Are baseline engineering and documentation practices in place?"
      },
      {
        "key": "security",
        "band": "moderate",
        "name": "Security",
        "value": 52,
        "weight": 0.16,
        "metrics": [
          {
            "key": "security_posture",
            "band": "at_risk",
            "name": "Security posture",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Packaging. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "packaging"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 40,
            "inputs": {
              "source": "openssf_scorecard",
              "checks_evaluated": 17,
              "scorecard_version": "v5.5.0",
              "checks_inconclusive": 1,
              "scorecard_aggregate": 4
            },
            "components": [
              {
                "key": "binary_artifacts",
                "name": "Binary-Artifacts",
                "detail": "no binaries found in the repo",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "branch_protection",
                "name": "Branch-Protection",
                "detail": "branch protection not enabled on development/release branches",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "ci_tests",
                "name": "CI-Tests",
                "detail": "1 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10",
                "points": 2.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "cii_best_practices",
                "name": "CII-Best-Practices",
                "detail": "no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "code_review",
                "name": "Code-Review",
                "detail": "Found 0/2 approved changesets -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "contributors",
                "name": "Contributors",
                "detail": "project has 4 contributing companies or organizations",
                "points": 2.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "dangerous_workflow",
                "name": "Dangerous-Workflow",
                "detail": "no dangerous workflow patterns detected",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "dependency_update_tool",
                "name": "Dependency-Update-Tool",
                "detail": "update tool detected",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "fuzzing",
                "name": "Fuzzing",
                "detail": "project is not fuzzed",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "license",
                "name": "License",
                "detail": "license file detected",
                "points": 2.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "maintained",
                "name": "Maintained",
                "detail": "30 commit(s) and 2 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "packaging",
                "name": "Packaging",
                "detail": "packaging workflow not detected",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "pinned_dependencies",
                "name": "Pinned-Dependencies",
                "detail": "dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "sast",
                "name": "SAST",
                "detail": "SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "security_policy",
                "name": "Security-Policy",
                "detail": "security policy file not detected",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "signed_releases",
                "name": "Signed-Releases",
                "detail": "Project has not signed or included provenance with any releases.",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "token_permissions",
                "name": "Token-Permissions",
                "detail": "detected GitHub workflow tokens with excessive permissions",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "vulnerabilities",
                "name": "Vulnerabilities",
                "detail": "25 existing vulnerabilities detected",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              }
            ]
          },
          {
            "key": "dependency_advisories",
            "band": "excellent",
            "name": "Dependency advisories",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Indirect dependencies free of known advisories, No advisories left outstanding. Remaining weights renormalized. Matched 45 resolved dependencies against OSV; 7 could not be assessed (no resolved version, an unsupported ecosystem, or beyond the reported package list). This repository publishes no package the index resolves, so the repository dependency graph was assessed instead. That graph mixes development and test pins with shipped dependencies, so only the declared runtime dependencies are scored; transitive findings are reported as context and excluded from the score. Reachability is not analyzed.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "indirect_dependencies_free_of_known_advisories",
                    "no_advisories_left_outstanding"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              },
              {
                "code": "advisories_scope_repository",
                "params": {
                  "assessed": 45
                }
              },
              {
                "code": "advisories_unassessed",
                "params": {
                  "count": 7
                }
              },
              {
                "code": "advisories_repo_graph_caveat",
                "params": {}
              },
              {
                "code": "advisories_reachability",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "source": "osv",
              "advisories": 55,
              "affected_packages": 13,
              "assessed_packages": 45,
              "unassessed_packages": 7,
              "affected_by_severity": "critical 1, high 5, moderate 5, low 1, unknown 1",
              "direct_affected_packages": 0
            },
            "components": [
              {
                "key": "direct_dependencies_free_of_known_advisories",
                "name": "Direct dependencies free of known advisories",
                "detail": "no direct dependency carries a known advisory",
                "points": 35,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_direct_advisories",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 35
              },
              {
                "key": "indirect_dependencies_free_of_known_advisories",
                "name": "Indirect dependencies free of known advisories",
                "detail": "transitive set not separable from development and test dependencies in this scope",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "advisories_scope_not_separable",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "no_advisories_left_outstanding",
                "name": "No advisories left outstanding",
                "detail": "no advisory carries a publication date",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "advisories_no_publication_date",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 40
              }
            ]
          },
          {
            "key": "malicious_dependencies",
            "band": "excellent",
            "name": "Malicious dependencies",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "source": "osv",
              "meaning": "reported as a malicious package by the OpenSSF corpus; the remedy is removal or moving off the compromised name, never an upgrade of the same artifact. Versions the registry has since pulled are listed but not scored",
              "packages": [],
              "red_flag": false,
              "assessed_packages": 45,
              "malicious_packages": 0,
              "direct_malicious_packages": 0,
              "withdrawn_malicious_packages": 0,
              "installable_malicious_packages": 0
            },
            "components": [
              {
                "key": "no_dependency_reported_as_a_malicious_package",
                "name": "No dependency reported as a malicious package",
                "detail": "no dependency is reported as a malicious package",
                "points": 100,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_malicious_dependencies",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 100
              }
            ]
          },
          {
            "key": "high_risk_jurisdiction_exposure",
            "band": "excellent",
            "name": "High-Risk Jurisdiction Exposure",
            "note": "Only high-confidence self-published location evidence affects this multiplier. Ambiguous matches are review-only; country evidence is not proof of nationality, citizenship, legal registration, malicious intent, or sanctions status.",
            "notes": [
              {
                "code": "jurisdiction_evidence_limits",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "meaning": "self-published location evidence; not nationality or citizenship",
              "red_flag": false,
              "exposures": [],
              "policy_countries": [
                "Russia",
                "Iran",
                "North Korea"
              ],
              "review_only_matches": 0,
              "assessed_self_published_locations": 8
            },
            "components": [
              {
                "key": "policy_exposure_multiplier",
                "name": "Policy exposure multiplier",
                "detail": "no confirmed policy-scope location match",
                "points": 100,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "jurisdiction_no_match",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 100
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Are visible security and supply-chain practices strong, with no malicious dependency and no unresolved high-risk jurisdiction exposure?"
      },
      {
        "key": "ai_readiness",
        "band": "at_risk",
        "name": "AI Readiness",
        "value": 47,
        "weight": 0,
        "metrics": [
          {
            "key": "ai_agent_context",
            "band": "critical",
            "name": "Agent context & guidance",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Legible commit history. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "legible_commit_history"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 25,
            "inputs": {
              "has_llms_txt": true,
              "legible_history_share": null,
              "agent_instruction_files": [],
              "agent_instruction_max_bytes": null
            },
            "components": [
              {
                "key": "agent_instructions",
                "name": "Agent instructions",
                "detail": "no CLAUDE.md / AGENTS.md / editor rules",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_agent_instructions",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 45
              },
              {
                "key": "machine_readable_docs_llms_txt",
                "name": "Machine-readable docs (llms.txt)",
                "detail": "llms.txt present",
                "points": 15,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "llms_txt_present",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 15
              },
              {
                "key": "legible_commit_history",
                "name": "Legible commit history",
                "detail": "no data",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 40
              }
            ]
          },
          {
            "key": "ai_verify_loop",
            "band": "moderate",
            "name": "Verify loop (build / test / typecheck)",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Demonstrated agent practice, Automated maintenance. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "demonstrated_agent_practice",
                    "automated_maintenance"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 61,
            "inputs": {
              "has_nix": false,
              "has_tests": true,
              "lockfiles": [
                "Pipfile.lock"
              ],
              "has_dockerfile": false,
              "typed_language": false,
              "bootstrap_files": [
                "Makefile",
                "docs/Makefile"
              ],
              "has_devcontainer": false,
              "has_linter_config": false,
              "typecheck_configs": [],
              "agent_commit_share": null,
              "toolchain_manifests": [],
              "dependency_bot_commit_share": null
            },
            "components": [
              {
                "key": "one_command_bootstrap",
                "name": "One-command bootstrap",
                "detail": "Makefile, docs/Makefile",
                "points": 18,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "file_list",
                    "params": {
                      "files": "Makefile, docs/Makefile"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 18
              },
              {
                "key": "automated_tests",
                "name": "Automated tests",
                "detail": null,
                "points": 22,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 22
              },
              {
                "key": "lint_format_config",
                "name": "Lint / format config",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 11
              },
              {
                "key": "static_type_checking",
                "name": "Static type checking",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 11
              },
              {
                "key": "reproducible_environment",
                "name": "Reproducible environment",
                "detail": "lockfile",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "file_list",
                    "params": {
                      "files": "lockfile"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "demonstrated_agent_practice",
                "name": "Demonstrated agent practice",
                "detail": "no data",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "automated_maintenance",
                "name": "Automated maintenance",
                "detail": "no data",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 8
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_pinned_dependencies",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies",
                "detail": "dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "ai_code_legibility",
            "band": "moderate",
            "name": "Code legibility for models",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 52,
            "inputs": {
              "primary_language": "Python",
              "largest_source_bytes": 436472,
              "source_files_sampled": 409,
              "oversized_source_files": 19
            },
            "components": [
              {
                "key": "type_checkable_code",
                "name": "Type-checkable code",
                "detail": "Python without a type-check config",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_typecheck_config_language",
                    "params": {
                      "language": "Python"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 45
              },
              {
                "key": "manageable_file_sizes",
                "name": "Manageable file sizes",
                "detail": "19/409 source files over 60KB",
                "points": 52.4,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "oversized_source_files",
                    "params": {
                      "kb": 60,
                      "sampled": 409,
                      "oversized": 19
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 55
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "How well is the repo equipped to be developed and maintained with AI coding agents? An independent, experimental badge — weight 0.0, so it is surfaced on its own and does not affect the overall health score."
      }
    ],
    "metrics_version": "1.13.0"
  },
  "warnings": [
    "deps.dev does not index pypi:phykit@2.4.1; advisories assessed against the repository dependency graph instead"
  ],
  "report_type": "repository",
  "generated_at": "2026-07-21T06:09:10.014644Z",
  "schema_version": "0.17.0",
  "badge_url": "https://raw.githubusercontent.com/inspect-software/badges/main/v1/j/JLSteenwyk/PhyKIT.svg",
  "full_name": "JLSteenwyk/PhyKIT",
  "license_state": "standard",
  "license_spdx": "MIT"
}

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v1.13.0, схема v0.17.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.

31.5/60	Зірки — 88 зірок
7.5/25	Форки — 9 форків
2.7/15	Спостерігачі — 4 спостерігачів

forks	9
stars	88
watchers	4
growth_state	unverified
growth_factor_pct	100
growth_unverified_reason	below_threshold

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Профіль оцінок

Власність

Пакетні екосистеми

Метрики за категоріями

Ключові факти

Попередження щодо збору даних

Докладніше

Пов’язані записи