Усі теги
Тег каталогу

#genomics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

22 записи
З тегом «genomics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
77Добрийіндекс здоров'я
biopython/biopython
Official git repository for Biopython (originally converted from CVS)
Python★ 5 13122 лип. 2026 р.
Власна ліцензія22 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
Maven
76Добрийіндекс здоров'я
miso-lims/miso-lims
MISO: An open-source LIMS for NGS sequencing centres
Java · JavaScript★ 30518 лип. 2026 р.
GPL-3.018 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · crates.io
71Добрийіндекс здоров'я
genomoncology/biomcp
BioMCP: Biomedical Model Context Protocol
Rust · Python★ 55421 лип. 2026 р.
MIT21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
67Помірнийіндекс здоров'я
iGVteam/igv.js
Embeddable genomic visualization component based on the Integrative Genomics Viewer
JavaScript · HTML★ 728↓ 81.9K/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
67Помірнийіндекс здоров'я
michael-denyer/jamma
JAMMA (Highly-Accelerated Multi-method Mixed-model Association) -- a fast and modern Python and C reimplementation of GEMMA for large-scale GWAS.
Python · C★ 120 лип. 2026 р.
GPL-3.020 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
66Помірнийіндекс здоров'я
EBI-Metagenomics/assembly-analysis-pipeline
MGnify Assembly Analysis Pipeline
JavaScript · Nextflow★ 118 лип. 2026 р.
Apache-2.018 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm · crates.io
66Помірнийіндекс здоров'я
GMOD/bbi-js
Parser for bigwig and bigbed files
TypeScript · JavaScript★ 9↓ 13.7K/міс18 лип. 2026 р.
MIT18 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
65Помірнийіндекс здоров'я
JLSteenwyk/PhyKIT
a UNIX shell toolkit for processing and analyzing multiple sequence alignments and phylogenies
Python★ 8821 лип. 2026 р.
MIT21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
64Помірнийіндекс здоров'я
gmod/apollo3
Monorepo for Apollo 3 server-side and client-side (JBrowse 2 plugin) components.
TypeScript★ 1518 лип. 2026 р.
Apache-2.018 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
brentp/cyvcf2
cython + htslib == fast VCF and BCF processing
Cython · Python★ 44621 лип. 2026 р.
MIT21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · Go
60Помірнийіндекс здоров'я
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
58Помірнийіндекс здоров'я
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 0↓ 0/міс14 лип. 2026 р.
Apache-2.014 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
57Помірнийіндекс здоров'я
brentp/somalier
fast sample-swap and relatedness checks on BAMs/CRAMs/VCFs/GVCFs... "like damn that is one smart wine guy"
Nim · HTML★ 32921 лип. 2026 р.
MIT21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
57Помірнийіндекс здоров'я
igvteam/igv-reports
Python application to generate self-contained pages embedding IGV visualizations, with no dependency on original input files.
Python · HTML★ 435↓ 1 420/міс23 лип. 2026 р.
MIT23 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
jlsteenwyk/orthosnap
a tree splitting and pruning algorithm for retrieving single-copy orthologs from gene family trees
Python★ 31↓ 221/міс18 лип. 2026 р.
MIT18 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io
55Помірнийіндекс здоров'я
ArcInstitute/binseq
A high efficiency binary format for sequencing data
Rust★ 103↓ 2 137/міс21 лип. 2026 р.
Без ліцензії21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
51Помірнийіндекс здоров'я
kmaneesh/biopython-mcp
MCP interface to BioPython
Python★ 2↓ 503/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
40У зоні ризикуіндекс здоров'я
goginea/aws-healthomics-ai-troubleshooting-assistant
AI-assisted troubleshooting for AWS HealthOmics genomic workflows with custom knowledge base support
TypeScript★ 0↓ 100/міс17 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
40У зоні ризикуіндекс здоров'я
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Опис репозиторію не опубліковано.
TypeScript★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
36У зоні ризикуіндекс здоров'я
smartsbio/node-sdk
Official TypeScript/JavaScript SDK for smarts.bio
TypeScript★ 0↓ 73/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
31У зоні ризикуіндекс здоров'я
bbglab/muts-needle-plot
A needle plot for mutation data
JavaScript★ 27↓ 113/міс17 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
16Критичнийіндекс здоров'я
biojs/generator-biojs-webcomponents
Generate all the boilerplate for your next BioJS tool!
JavaScript★ 10↓ 85/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0