Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.12.0 · метрики 2.10.0 · 2026-07-17 17:23 UTC

anton-bushuiev / ppiref

Dataset and package for working with protein-protein interactions in 3D

Jupyter Notebook · PythonMIT★ 108 зірок⑂ 9 форківз жовт. 2023 р.Переглянути на GitHub ↗
#datasets#machine-learning#protein-protein-interaction#proteins

anton-bushuiev/ppiref має індекс здоров’я 41 зі 100, що відповідає смузі «Слабкий». Найвищий показник — Engineering Quality (76/100), найнижчий — Security (23/100). Останнє оновлення було 444 дні тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

41
загалом / 100
Слабкий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

41
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 44 калібровано до 41 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Anton BushuievОсобистий обліковий запис
76 підписників36 публічних репозиторіївз лип. 2020 р.Czech Technical University in Prague

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

25У зоні ризику · 21% загального індексу

Активність розробки

1Критичний
Як обчислюється оцінка
0/36Свіжість push — останній push 444 дн. тому
0/36Ритм комітів — 0/52 тижнів із комітами
0/18Обсяг комітів — 0 комітів за останній рік
0/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
commits_last_year0
human_commit_share—
days_since_last_push444
active_weeks_last_year0

Дисципліна релізів

60Помірний
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 5 релізів
7.2/36Свіжість релізів — останній реліз 521 дн. тому
19.8/27Ритм релізів — реліз кожні ~96,1 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count5
latest_release_tagv1.4.0
releases_from_tagsні
days_since_latest_release521
mean_days_between_releases96,1
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

46Слабкий · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

43Слабкий
Як обчислюється оцінка
32.9/60Зірки — 108 зірок
7.5/25Форки — 9 форків
2.7/15Спостерігачі — 4 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks9
stars108
watchers4
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (MIT)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges—
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services—
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

47Слабкий · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

13Критичний
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
0/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 100% комітів
1.4/13.5Широта контриб’юторів — 1 контриб’юторів
3/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled1
top_contributor_share1

Реактивність на issue та PR

77Добрий
Як обчислюється оцінка
36.8/42Вирішення issue — закрито 88% issue
30/30Прийняття PR — злито 2/2 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
merged_prs2
open_issues1
closed_issues7
prs_merged_7d—
prs_decided_7d—
prs_merged_30d—
prs_decided_30d—
issue_closed_ratio0,875
closed_unmerged_prs0
first_time_authors_30d—
first_time_prs_merged_30d—
first_time_prs_decided_30d—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

59Помірний
Як обчислюється оцінка
10/30Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис
0/20Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів
13.6/25Охоплення власника — 76 підписників у anton-bushuiev
23.4/25Послужний список — 36 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~6 р.
Використані вхідні дані
followers76
owner_typeUser
is_verified—
owner_loginanton-bushuiev
public_repos36
account_age_days2 201
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

76Добрий · 19% загального індексу

Інженерні практики

60Помірний
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 1 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
0/16Конфігурація лінтера
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
0/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — немає даних
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configні
has_precommit_configні
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: CI-Tests. Залишкові ваги перенормовано.

Документація

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://ppiref.readthedocs.io
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 4 тем
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsdatasets, machine-learning, protein-protein-interaction, proteins
has_wikiтак
homepagehttps://ppiref.readthedocs.io
docs_sitehttps://ppiref.readthedocs.io
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

23У зоні ризику · 16% загального індексу

Стан безпеки

23У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches
0/2.5CI-Tests — немає даних
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0
0.8/2.5Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
0/7.5Maintained — 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0
0/5Packaging — немає даних
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — no SAST tool detected
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — немає даних
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0/7.5Vulnerabilities — 100 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated15
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive3
scorecard_aggregate2,3
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): CI-Tests, Packaging, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

43Слабкий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

1Критичний
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
0/40Читабельна історія комітів — немає даних
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share—
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Читабельна історія комітів. Залишкові ваги перенормовано.

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

49Слабкий
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — docs/Makefile
22/22Автоматизовані тести
0/11Конфігурація лінтера / форматера
0/11Статична перевірка типів
0/10Відтворюване середовище
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — немає даних
0/8Автоматизоване супроводження — немає даних
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfiles—
has_dockerfileні
typed_languageні
bootstrap_filesdocs/Makefile
has_devcontainerні
has_linter_configні
typecheck_configs—
agent_commit_share—
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Підтверджена практика роботи з агентами, Автоматизоване супроводження. Залишкові ваги перенормовано.

Читабельність коду для моделей

55Помірний
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований код — Jupyter Notebook без конфігурації перевірки типів
55/55Керовані розміри файлів — 0/26 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageJupyter Notebook
largest_source_bytes46 346
source_files_sampled26
oversized_source_files0

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40Придатні до запуску приклади — notebooks
Використані вхідні дані
example_dirsnotebooks
has_mcp_signalні
api_schema_files—
interfaces_expected_of—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

108зірок GitHub
1контриб'юторів
0комітів за останні 12 місяців
444днів від останнього пушу
5релізів
1бас-фактор
1відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Could not fetch pypi package 'ppiref' from its registry

Докладніше

OpenSSF Scorecard 2.3 / 10
2.3сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-17 17:23 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0Branch-Protectionbranch protection not enabled on development/release branches
н/дCI-Testsno pull request found
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0Code-ReviewFound 0/30 approved changesets -- score normalized to 0
3Contributorsproject has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
0Maintained0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0
н/дPackagingpackaging workflow not detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTno SAST tool detected
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0Vulnerabilities100 existing vulnerabilities detected
Усі залежності 162

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 0 прямих і 162 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIanyio3.6.2непряма
PyPIappdirs1.4.4непряма
PyPIappnope0.1.3непряма
PyPIargon2-cffi21.3.0непряма
PyPIargon2-cffi-bindings21.2.0непряма
PyPIarrow1.2.3непряма
PyPIasttokens2.2.1непряма
PyPIattrs23.1.0непряма
PyPIbackcall0.2.0непряма
PyPIbackports-functools-lru-cache1.6.4непряма
PyPIbeautifulsoup44.12.2непряма
PyPIbiopandas0.5.0.dev0непряма
PyPIbiopython1.81непряма
PyPIbioservices1.11.2непряма
PyPIbleach6.0.0непряма
PyPIcattrs22.2.0непряма
PyPIcertifi2024.7.4непряма
PyPIcffi1.15.1непряма
PyPIcharset-normalizer3.1.0непряма
PyPIclick8.1.3непряма
PyPIcolorama0.4.6непряма
PyPIcolorlog6.7.0непряма
PyPIcontourpy1.0.7непряма
PyPIcycler0.11.0непряма
PyPIdebugpy1.5.1непряма
PyPIdecorator5.1.1непряма
PyPIdeepdiff6.3.0непряма
PyPIdefusedxml0.7.1непряма
PyPIdill0.3.6непряма
PyPIeasydev0.12.1непряма
PyPIentrypoints0.4непряма
PyPIexceptiongroup1.1.1непряма
PyPIexecuting1.2.0непряма
PyPIfastjsonschema2.17.1непряма
PyPIfonttools4.39.4непряма
PyPIfqdn1.5.1непряма
PyPIgraphein1.7.6непряма
PyPIgreenlet2.0.2непряма
PyPIgrequests0.6.0непряма
PyPIidna3.4непряма
PyPIimportlib-metadata6.6.0непряма
PyPIimportlib-resources5.12.0непряма
PyPIiniconfig2.0.0непряма
PyPIipykernel6.15.0непряма
PyPIipython8.13.2непряма
PyPIipython-genutils0.2.0непряма
PyPIipywidgets8.0.6непряма
PyPIisoduration20.11.0непряма
PyPIjaxtyping0.2.19непряма
PyPIjedi0.18.2непряма
PyPIjinja23.1.2непряма
PyPIjoblib1.2.0непряма
PyPIjsonpointer2.3непряма
PyPIjsonschema4.17.3непряма
PyPIjupyter1.0.0непряма
PyPIjupyter-client8.2.0непряма
PyPIjupyter-console6.6.3непряма
PyPIjupyter-core5.3.0непряма
PyPIjupyter-events0.6.3непряма
PyPIjupyter-server2.6.0непряма
PyPIjupyter-server-terminals0.4.4непряма
PyPIjupyterlab-pygments0.2.2непряма
PyPIjupyterlab-widgets3.0.7непряма
PyPIkiwisolver1.4.4непряма
PyPIloguru0.7.0непряма
PyPIlooseversion1.1.2непряма
PyPIlxml4.9.2непряма
PyPIlxml-html-clean0.2.2непряма
PyPIm2r20.3.3.post2непряма
PyPImarkdown-it-py2.2.0непряма
PyPImarkupsafe2.1.2непряма
PyPImatplotlib3.7.1непряма
PyPImatplotlib-inline0.1.6непряма
PyPImdurl0.1.2непряма
PyPImistune0.8.4непряма
PyPImistune2.0.5непряма
PyPImmtf-python1.1.3непряма
PyPImsgpack1.0.5непряма
PyPImultipledispatch0.6.0непряма
PyPInbclassic1.0.0непряма
PyPInbclient0.8.0непряма
PyPInbconvert7.4.0непряма
PyPInbformat5.8.0непряма
PyPInbsphinx0.9.4непряма
PyPInest-asyncio1.5.6непряма
PyPInetworkx3.1непряма
PyPInotebook6.5.4непряма
PyPInotebook-shim0.2.3непряма
PyPInumpy1.23.5непряма
PyPIordered-set4.1.0непряма
PyPIoverrides7.3.1непряма
PyPIpackaging23.1непряма
PyPIpandas1.5.3непряма
PyPIpandocfilters1.5.0непряма
PyPIparso0.8.3непряма
PyPIpexpect4.8.0непряма
PyPIpickleshare0.7.5непряма
PyPIpillow9.5.0непряма
PyPIplatformdirs3.5.1непряма
PyPIplotly5.14.1непряма
PyPIpluggy1.0.0непряма
PyPIprometheus-client0.17.0непряма
PyPIprompt-toolkit3.0.38непряма
PyPIpsutil5.9.0непряма
PyPIptyprocess0.7.0непряма
PyPIpure-eval0.2.2непряма
PyPIpycparser2.21непряма
PyPIpydantic1.10.8непряма
PyPIpygments2.15.1непряма
PyPIpyparsing3.0.9непряма
PyPIpyrsistent0.19.3непряма
PyPIpytest7.3.1непряма
PyPIpython-dateutil2.8.2непряма
PyPIpython-json-logger2.0.7непряма
PyPIpytz2023.3непряма
PyPIpyzmq25.0.2непряма
PyPIqtconsole5.4.3непряма
PyPIqtpy2.3.1непряма
PyPIrequests2.31.0непряма
PyPIrequests-cache1.0.1непряма
PyPIrfc3339-validator0.1.4непряма
PyPIrfc3986-validator0.1.1непряма
PyPIrich13.3.5непряма
PyPIrich-click1.6.1непряма
PyPIscikit-learn1.2.2непряма
PyPIscipy1.10.1непряма
PyPIseaborn0.12.2непряма
PyPIsend2trash1.8.2непряма
PyPIsetuptools—непряма
PyPIsix1.16.0непряма
PyPIsniffio1.3.0непряма
PyPIsoupsieve2.4.1непряма
PyPIsphinx7.4.7непряма
PyPIsphinx-rtd-theme2.0.0непряма
PyPIstack-data0.6.2непряма
PyPIsuds-community1.1.2непряма
PyPItenacity8.2.2непряма
PyPIterminado0.17.1непряма
PyPIthreadpoolctl3.1.0непряма
PyPItinycss21.2.1непряма
PyPItomli2.0.1непряма
PyPItornado6.3.2непряма
PyPItqdm4.65.0непряма
PyPItraitlets5.9.0непряма
PyPItypeguard4.0.0непряма
PyPItzdata2023.3непряма
PyPIuri-template1.2.0непряма
PyPIurl-normalize1.4.3непряма
PyPIurllib32.0.2непряма
PyPIwcwidth0.2.6непряма
PyPIwebcolors1.13непряма
PyPIwebencodings0.5.1непряма
PyPIwebsocket-client1.5.2непряма
PyPIwget3.2непряма
PyPIwheel0.38.4непряма
PyPIwidgetsnbextension4.0.7непряма
PyPIwrapt1.15.0непряма
PyPIxarray2023.5.0непряма
PyPIxmltodict0.13.0непряма
PyPIzipp3.15.0непряма
PyPIzope-event4.6непряма
PyPIzope-interface6.0непряма
Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з anton-bushuiev/ppiref. Читати поруч →

98huggingface/datasets🤗 The largest hub of ready-to-use datasets for AI models with fast, easy-to-use and efficient data manipulation toolsВинятковий100onnx/onnxOpen standard for machine learning interoperabilityВинятковий100microsoft/onnxruntimeONNX Runtime: cross-platform, high performance ML inferencing and training acceleratorВинятковий100apache/airflowApache Airflow - A platform to programmatically author, schedule, and monitor workflowsВинятковий100Arize-ai/phoenixAI Observability & EvaluationВинятковий100ray-project/rayRay is an AI compute engine. Ray consists of a core distributed runtime and a set of AI Libraries for accelerating ML workloads.Винятковий

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.12.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика.