Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.11.0 · метрики 1.13.0 · 2026-07-17 11:00 UTC

compomics / ms2pip

MS²PIP: Fast and accurate peptide spectrum prediction for multiple fragmentation methods, instruments, and labeling techniques.

HTML · Jupyter NotebookApache-2.0★ 49 зірок⑂ 19 форківз бер. 2017 р.Переглянути на GitHub ↗

compomics/ms2pip має індекс здоров’я 67 зі 100, що відповідає смузі «Помірний». Найвищий показник — Vitality (77/100), найнижчий — AI Readiness (30/100). Останнє оновлення було 3 дні тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

67
загалом / 100
Помірний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє середнє; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 49 («Під ризиком»). Готовність до ШІ не входить до індексу.

67
Відмінний85-100Зразковий; відповідає практично всім перевіреним критеріям
Добрий70-84Здоровий; незначні прогалини
Помірний50-69Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
У зоні ризику30-49Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-29Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Власність

129 підписників113 публічних репозиторіївз бер. 2015 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікаціяТеги
PyPIms2pip4.2.02 584383 дні томуms2pipproteomicspeptide-fragmentationpeak-intensity-predictionspectrum-predictionmachine-learningspectral-libraryfasta2speclib

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

77Добрий · 22% загального індексу
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 3 дн. тому
9/36Ритм комітів — 13/52 тижнів із комітами
17/18Обсяг комітів — 78 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 22 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year78
human_commit_share
days_since_last_push3
active_weeks_last_year13
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 26 релізів
36/36Свіжість релізів — останній реліз 3 дн. тому
12.6/27Ритм релізів — реліз кожні ~139,8 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count26
latest_release_tagv4.2.0
releases_from_tagsні
days_since_latest_release3
mean_days_between_releases139,8
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

49У зоні ризику · 18% загального індексу
Як обчислюється оцінка
27.3/60Зірки — 49 зірок
10.5/25Форки — 19 форків
6.7/15Спостерігачі — 17 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks19
stars49
watchers17
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (Apache-2.0)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
has_pull_request_templateні
Як обчислюється оцінка
45.5/80Щомісячні завантаження — 2 584 завантажень/місяць у pypi
0/20Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє
Використані вхідні дані
packagesms2pip
dependents
ecosystemspypi
total_downloads
monthly_downloads2 584
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

68Помірний · 24% загального індексу
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
7.6/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 66% комітів
13.5/13.5Широта контриб’юторів — 13 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 5 contributing companies or organizations
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled13
top_contributor_share0,664
Як обчислюється оцінка
44/46.8Вирішення issue — закрито 94% issue
30.1/38.3Прийняття PR — злито 144/183 вирішених PR
1.5/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 1/10 approved changesets -- score normalized to 1
Використані вхідні дані
merged_prs144
open_issues5
closed_issues81
issue_closed_ratio0,942
closed_unmerged_prs39
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен
15.2/25Охоплення власника — 129 підписників у CompOmics
25/25Послужний список — 113 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~11 р.
Використані вхідні дані
followers129
owner_typeOrganization
is_verified
owner_loginCompOmics
public_repos113
account_age_days4 132

Супровід пакетів

100Відмінний
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікацій — остання публікація 3 дн. тому
20/20Історія версій — 38 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesms2pip
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish3

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

77Добрий · 20% загального індексу
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 2 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
0/16Конфігурація лінтера
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 9 out of 9 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configні
has_precommit_configні

Документація

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://ms2pip.readthedocs.io
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 6 тем
0/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsmachine-learning, mass-spectrometry, peptide-identification, proteomics, spectrum-prediction, peptide-spectrum
has_wikiні
homepagehttps://ms2pip.readthedocs.io
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

61Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

61Помірний
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
6/7.5Branch-Protection — branch protection is not maximal on development and all release branches
2.5/2.5CI-Tests — 9 out of 9 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0.8/7.5Code-Review — Found 1/10 approved changesets -- score normalized to 1
2.5/2.5Contributors — project has 5 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
7.5/7.5Dependency-Update-Tool — update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 22 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packaging — packaging workflow detected
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — немає даних
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated17
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive1
scorecard_aggregate6,1
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): signed_releases. Залишкові ваги перенормовано.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Незалежний, експериментальний бейдж — вага 0.0, тож він подається окремо і не впливає на загальний індекс здоров'я.

30У зоні ризику · 0% загального індексу
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
0/40Читабельна історія комітів — немає даних
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
legible_history_share
agent_instruction_files
agent_instruction_max_bytes
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Читабельна історія комітів. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
0/18Розгортання однією командою
22/22Автоматизовані тести
0/11Конфігурація лінтера / форматера
0/11Статична перевірка типів
10/10Відтворюване середовище — lockfile
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — немає даних
0/8Автоматизоване супроводження — немає даних
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfilesuv.lock
has_dockerfileні
typed_languageні
bootstrap_files
has_devcontainerні
has_linter_configні
typecheck_configs
agent_commit_share
toolchain_manifests
dependency_bot_commit_share
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Підтверджена практика роботи з агентами, Автоматизоване супроводження. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований код — HTML без конфігурації перевірки типів
55/55Керовані розміри файлів — 0/25 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageHTML
largest_source_bytes28 997
source_files_sampled25
oversized_source_files0
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto)
0/20Сервер MCP
40/40Придатні до запуску приклади — notebooks
Використані вхідні дані
example_dirsnotebooks
has_mcp_signalні
api_schema_files

Ключові факти

49зірок GitHub
13контриб'юторів
78комітів за останні 12 місяців
3днів від останнього пушу
26релізів
1бас-фактор
5відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Докладніше

OpenSSF Scorecard 6.1 / 10
6.1сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-17 10:59 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
8Branch-Protectionbranch protection is not maximal on development and all release branches
10CI-Tests9 out of 9 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
1Code-ReviewFound 1/10 approved changesets -- score normalized to 1
10Contributorsproject has 5 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
10Dependency-Update-Toolupdate tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained22 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10Vulnerabilities0 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 12
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPInumpy>=1.25,<3pyproject.toml
PyPIpandas>=1,<3pyproject.toml
PyPIpyteomics>=3.5,<5pyproject.toml
PyPIsqlalchemy>=1.4,<3pyproject.toml
PyPIclick>=7,<9pyproject.toml
PyPIxgboost>=1.3,<3pyproject.toml
PyPIlxml>=4,<7pyproject.toml
PyPIrich>=13,<16pyproject.toml
PyPIpydantic>=2,<3pyproject.toml
PyPIwerkzeug>=2,<4pyproject.toml
PyPIpsm_utils>=1.5,<4pyproject.toml
PyPIms2rescore-rs>=0.5.0,<2pyproject.toml
Усі залежності 176

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 15 прямих і 161 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIclick8.4.2пряма
PyPIlxml6.1.1пряма
PyPIms2rescore-rs0.5.0пряма
PyPInumpy1.15.4пряма
PyPInumpy2.4.6пряма
PyPIpandas0.23.4пряма
PyPIpandas2.3.3пряма
PyPIpsm-utils1.5.5пряма
PyPIpydantic2.13.4пряма
PyPIpyteomics3.5.1пряма
PyPIpyteomics4.7.5пряма
PyPIrich14.3.4пряма
PyPIsqlalchemy2.0.51пряма
PyPIwerkzeug3.1.8пряма
PyPIxgboost2.1.4пряма
PyPIaiohappyeyeballs2.7.1непряма
PyPIaiohttp3.14.1непряма
PyPIaiosignal1.4.0непряма
PyPIalabaster1.0.0непряма
PyPIannotated-types0.7.0непряма
PyPIanyio4.14.1непряма
PyPIappnope0.1.4непряма
PyPIasttokens3.0.1непряма
PyPIattrs26.1.0непряма
PyPIbabel2.18.0непряма
PyPIbiopython1.72непряма
PyPIcertifi2026.6.17непряма
PyPIcffi2.1.0непряма
PyPIcharset-normalizer3.4.9непряма
PyPIcolorama0.4.6непряма
PyPIcomm0.2.3непряма
PyPIcommonmark0.9.2непряма
PyPIcontourpy1.3.3непряма
PyPIcuda-bindings13.3.1непряма
PyPIcuda-pathfinder1.5.6непряма
PyPIcuda-toolkit13.0.3.0непряма
PyPIcycler0.12.1непряма
PyPIcython0.29.2непряма
PyPIdebugpy1.8.21непряма
PyPIdecorator5.3.1непряма
PyPIdeeplc4.0.0b1непряма
PyPIdocutils0.22.4непряма
PyPIexecuting2.2.1непряма
PyPIfastobo0.14.1непряма
PyPIfilelock3.29.7непряма
PyPIfonttools4.63.0непряма
PyPIfrozenlist1.8.0непряма
PyPIfsspec2026.6.0непряма
PyPIgreenlet3.5.3непряма
PyPIh110.16.0непряма
PyPIidna3.18непряма
PyPIim2deep2.0.0непряма
PyPIimagesize2.0.0непряма
PyPIiniconfig2.3.0непряма
PyPIipykernel7.3.0непряма
PyPIipython9.15.0непряма
PyPIipython-pygments-lexers1.1.1непряма
PyPIipywidgets8.1.8непряма
PyPIjedi0.20.0непряма
PyPIjinja23.1.6непряма
PyPIjoblib1.5.3непряма
PyPIjupyter-client8.9.1непряма
PyPIjupyter-core5.9.1непряма
PyPIjupyterlab-widgets3.0.16непряма
PyPIkiwisolver1.5.0непряма
PyPIlark1.3.1непряма
PyPIlightning2.6.5непряма
PyPIlightning-utilities0.15.3непряма
PyPIllvmlite0.48.0непряма
PyPImarkdown-it-py4.2.0непряма
PyPImarkupsafe3.0.3непряма
PyPImatplotlib3.0.2непряма
PyPImatplotlib3.11.0непряма
PyPImatplotlib-inline0.2.2непряма
PyPImdurl0.1.2непряма
PyPIml-dtypes0.5.4непряма
PyPImpmath1.3.0непряма
PyPImultidict6.7.1непряма
PyPInarwhals2.23.0непряма
PyPInest-asyncio21.7.2непряма
PyPInetworkx3.6.1непряма
PyPInumba0.66.0непряма
PyPInumpydoc1.10.0непряма
PyPInvidia-cublas13.1.1.3непряма
PyPInvidia-cuda-cupti13.0.85непряма
PyPInvidia-cuda-nvrtc13.0.88непряма
PyPInvidia-cuda-runtime13.0.96непряма
PyPInvidia-cudnn-cu139.20.0.48непряма
PyPInvidia-cufft12.0.0.61непряма
PyPInvidia-cufile1.15.1.6непряма
PyPInvidia-curand10.4.0.35непряма
PyPInvidia-cusolver12.0.4.66непряма
PyPInvidia-cusparse12.6.3.3непряма
PyPInvidia-cusparselt-cu130.8.1непряма
PyPInvidia-nccl-cu122.30.7непряма
PyPInvidia-nccl-cu132.29.7непряма
PyPInvidia-nvjitlink13.3.33непряма
PyPInvidia-nvshmem-cu133.4.5непряма
PyPInvidia-nvtx13.0.85непряма
PyPIonnx1.22.0непряма
PyPIonnx2torch1.5.15непряма
PyPIpackaging26.2непряма
PyPIparso0.8.7непряма
PyPIpexpect4.9.0непряма
PyPIpillow12.3.0непряма
PyPIpip26.1.2непряма
PyPIplatformdirs4.10.0непряма
PyPIpluggy1.6.0непряма
PyPIprompt-toolkit3.0.52непряма
PyPIpropcache0.5.2непряма
PyPIprotobuf7.35.1непряма
PyPIpsims1.3.6непряма
PyPIpsutil7.2.2непряма
PyPIptyprocess0.7.0непряма
PyPIpure-eval0.2.3непряма
PyPIpyarrow25.0.0непряма
PyPIpycparser3.0непряма
PyPIpydantic-core2.46.4непряма
PyPIpygments2.20.0непряма
PyPIpyparsing3.3.2непряма
PyPIpytest9.1.1непряма
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0непряма
PyPIpytorch-lightning2.6.5непряма
PyPIpytz2026.2непряма
PyPIpyyaml6.0.3непряма
PyPIpyzmq27.1.0непряма
PyPIrecommonmark0.7.1непряма
PyPIrequests2.34.2непряма
PyPIroman-numerals4.1.0непряма
PyPIruff0.15.21непряма
PyPIscikit-learn1.9.0непряма
PyPIscipy1.1.0непряма
PyPIscipy1.17.1непряма
PyPIscipy1.18.0непряма
PyPIsemver3.0.4непряма
PyPIsetuptools83.0.0непряма
PyPIsix1.17.0непряма
PyPIsnowballstemmer3.1.1непряма
PyPIspectrum-utils0.5.0непряма
PyPIsphinx9.0.4непряма
PyPIsphinx9.1.0непряма
PyPIsphinx-autobuild2025.8.25непряма
PyPIsphinx-automodapi0.22.0непряма
PyPIsphinx-click6.2.0непряма
PyPIsphinx-rtd-theme3.1.0непряма
PyPIsphinxcontrib-applehelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-devhelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-htmlhelp2.1.0непряма
PyPIsphinxcontrib-jquery4.1непряма
PyPIsphinxcontrib-jsmath1.0.1непряма
PyPIsphinxcontrib-qthelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-serializinghtml2.0.0непряма
PyPIstack-data0.6.3непряма
PyPIstarlette1.3.1непряма
PyPIsympy1.14.0непряма
PyPItables3.4.4непряма
PyPIthreadpoolctl3.6.0непряма
PyPItoml0.10.2непряма
PyPItorch2.13.0непряма
PyPItorchmetrics1.9.0непряма
PyPItorchvision0.28.0непряма
PyPItornado6.5.7непряма
PyPItqdm4.68.4непряма
PyPItraitlets5.15.1непряма
PyPItriton3.7.1непряма
PyPIty0.0.58непряма
PyPItyping-extensions4.16.0непряма
PyPItyping-inspection0.4.2непряма
PyPItzdata2026.3непряма
PyPIurllib32.7.0непряма
PyPIuvicorn0.51.0непряма
PyPIwatchfiles1.2.0непряма
PyPIwcwidth0.8.2непряма
PyPIwebsockets16.1непряма
PyPIwidgetsnbextension4.0.15непряма
PyPIyarl1.24.2непряма
Звіт у форматі JSON машиночитний
{
  "data": {
    "repo": {
      "topics": [
        "machine-learning",
        "mass-spectrometry",
        "peptide-identification",
        "proteomics",
        "spectrum-prediction",
        "peptide-spectrum"
      ],
      "is_fork": false,
      "size_kb": 110157,
      "has_wiki": false,
      "homepage": "https://ms2pip.readthedocs.io",
      "languages": {
        "CSS": 775,
        "HTML": 1557925,
        "Python": 180950,
        "Jupyter Notebook": 565346
      },
      "pushed_at": "2026-07-13T17:01:59Z",
      "created_at": "2017-03-15T13:02:26Z",
      "owner_type": "Organization",
      "updated_at": "2026-07-13T17:01:11Z",
      "description": "MS²PIP: Fast and accurate peptide spectrum prediction for multiple fragmentation methods, instruments, and labeling techniques.",
      "is_archived": false,
      "is_disabled": false,
      "license_spdx": "Apache-2.0",
      "default_branch": "main",
      "primary_language": "HTML",
      "significant_languages": [
        "HTML",
        "Jupyter Notebook"
      ]
    },
    "owner": {
      "blog": "https://www.compomics.com/",
      "name": "Computational Omics and Systems Biology Group",
      "type": "Organization",
      "login": "CompOmics",
      "company": null,
      "location": "Belgium",
      "followers": 129,
      "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/11630937?v=4",
      "created_at": "2015-03-24T13:14:30Z",
      "is_verified": null,
      "public_repos": 113,
      "account_age_days": 4132
    },
    "activity": {
      "releases_count": 26,
      "commits_last_year": 78,
      "latest_release_at": "2026-07-13T17:02:00Z",
      "latest_release_tag": "v4.2.0",
      "releases_from_tags": false,
      "days_since_last_push": 3,
      "active_weeks_last_year": 13,
      "days_since_latest_release": 3,
      "mean_days_between_releases": 139.8
    },
    "community": {
      "has_readme": true,
      "has_license": true,
      "has_description": true,
      "has_contributing": false,
      "health_percentage": 37,
      "has_issue_template": false,
      "has_code_of_conduct": false,
      "has_pull_request_template": false
    },
    "ecosystem": {
      "packages": [
        {
          "name": "ms2pip",
          "exists": true,
          "license": null,
          "keywords": [
            "MS2PIP",
            "proteomics",
            "peptide fragmentation",
            "peak intensity prediction",
            "spectrum prediction",
            "machine learning",
            "spectral library",
            "fasta2speclib",
            "Development Status :: 5 - Production/Stable",
            "Intended Audience :: Science/Research",
            "License :: OSI Approved :: Apache Software License",
            "Operating System :: OS Independent",
            "Programming Language :: Python :: 3 :: Only",
            "Topic :: Scientific/Engineering :: Bio-Informatics"
          ],
          "ecosystem": "pypi",
          "matches_repo": true,
          "registry_url": "https://pypi.org/project/ms2pip/",
          "is_deprecated": false,
          "latest_version": "4.2.0",
          "repository_url": "https://github.com/compomics/ms2pip",
          "versions_count": 38,
          "total_downloads": null,
          "dependents_count": null,
          "deprecation_note": null,
          "maintainers_count": null,
          "monthly_downloads": 2584,
          "first_published_at": "2019-12-29T20:41:56.441520Z",
          "latest_published_at": "2026-07-13T17:02:38.883370Z",
          "latest_version_yanked": null,
          "days_since_latest_publish": 3
        }
      ]
    },
    "popularity": {
      "forks": 19,
      "stars": 49,
      "watchers": 17,
      "open_issues_and_prs": 5
    },
    "ai_readiness": {
      "has_nix": false,
      "example_dirs": [
        "notebooks"
      ],
      "has_llms_txt": false,
      "has_dockerfile": false,
      "has_mcp_signal": false,
      "bootstrap_files": [],
      "api_schema_files": [],
      "has_devcontainer": false,
      "typecheck_configs": [],
      "largest_source_bytes": 28997,
      "source_files_sampled": 25,
      "oversized_source_files": 0,
      "agent_instruction_files": [],
      "agent_instruction_max_bytes": null
    },
    "dependencies": {
      "manifests": [
        "pyproject.toml"
      ],
      "ecosystems": [
        "pypi"
      ],
      "dependencies": [
        {
          "name": "numpy",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=1.25,<3"
        },
        {
          "name": "pandas",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=1,<3"
        },
        {
          "name": "pyteomics",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=3.5,<5"
        },
        {
          "name": "sqlalchemy",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=1.4,<3"
        },
        {
          "name": "click",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=7,<9"
        },
        {
          "name": "xgboost",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=1.3,<3"
        },
        {
          "name": "lxml",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=4,<7"
        },
        {
          "name": "rich",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=13,<16"
        },
        {
          "name": "pydantic",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=2,<3"
        },
        {
          "name": "werkzeug",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=2,<4"
        },
        {
          "name": "psm_utils",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=1.5,<4"
        },
        {
          "name": "ms2rescore-rs",
          "manifest": "pyproject.toml",
          "ecosystem": "pypi",
          "version_constraint": ">=0.5.0,<2"
        }
      ],
      "all_dependencies": {
        "error": null,
        "source": "github-sbom",
        "packages": [
          {
            "name": "click",
            "direct": true,
            "version": "8.4.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "lxml",
            "direct": true,
            "version": "6.1.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ms2rescore-rs",
            "direct": true,
            "version": "0.5.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "numpy",
            "direct": true,
            "version": "1.15.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "numpy",
            "direct": true,
            "version": "2.4.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pandas",
            "direct": true,
            "version": "0.23.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pandas",
            "direct": true,
            "version": "2.3.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "psm-utils",
            "direct": true,
            "version": "1.5.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pydantic",
            "direct": true,
            "version": "2.13.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pyteomics",
            "direct": true,
            "version": "3.5.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pyteomics",
            "direct": true,
            "version": "4.7.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "rich",
            "direct": true,
            "version": "14.3.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sqlalchemy",
            "direct": true,
            "version": "2.0.51",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "werkzeug",
            "direct": true,
            "version": "3.1.8",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "xgboost",
            "direct": true,
            "version": "2.1.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "aiohappyeyeballs",
            "direct": false,
            "version": "2.7.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "aiohttp",
            "direct": false,
            "version": "3.14.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "aiosignal",
            "direct": false,
            "version": "1.4.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "alabaster",
            "direct": false,
            "version": "1.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "annotated-types",
            "direct": false,
            "version": "0.7.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "anyio",
            "direct": false,
            "version": "4.14.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "appnope",
            "direct": false,
            "version": "0.1.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "asttokens",
            "direct": false,
            "version": "3.0.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "attrs",
            "direct": false,
            "version": "26.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "babel",
            "direct": false,
            "version": "2.18.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "biopython",
            "direct": false,
            "version": "1.72",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "certifi",
            "direct": false,
            "version": "2026.6.17",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "cffi",
            "direct": false,
            "version": "2.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "charset-normalizer",
            "direct": false,
            "version": "3.4.9",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "colorama",
            "direct": false,
            "version": "0.4.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "comm",
            "direct": false,
            "version": "0.2.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "commonmark",
            "direct": false,
            "version": "0.9.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "contourpy",
            "direct": false,
            "version": "1.3.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "cuda-bindings",
            "direct": false,
            "version": "13.3.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "cuda-pathfinder",
            "direct": false,
            "version": "1.5.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "cuda-toolkit",
            "direct": false,
            "version": "13.0.3.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "cycler",
            "direct": false,
            "version": "0.12.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "cython",
            "direct": false,
            "version": "0.29.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "debugpy",
            "direct": false,
            "version": "1.8.21",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "decorator",
            "direct": false,
            "version": "5.3.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "deeplc",
            "direct": false,
            "version": "4.0.0b1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "docutils",
            "direct": false,
            "version": "0.22.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "executing",
            "direct": false,
            "version": "2.2.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "fastobo",
            "direct": false,
            "version": "0.14.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "filelock",
            "direct": false,
            "version": "3.29.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "fonttools",
            "direct": false,
            "version": "4.63.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "frozenlist",
            "direct": false,
            "version": "1.8.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "fsspec",
            "direct": false,
            "version": "2026.6.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "greenlet",
            "direct": false,
            "version": "3.5.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "h11",
            "direct": false,
            "version": "0.16.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "idna",
            "direct": false,
            "version": "3.18",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "im2deep",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "imagesize",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "iniconfig",
            "direct": false,
            "version": "2.3.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ipykernel",
            "direct": false,
            "version": "7.3.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ipython",
            "direct": false,
            "version": "9.15.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ipython-pygments-lexers",
            "direct": false,
            "version": "1.1.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ipywidgets",
            "direct": false,
            "version": "8.1.8",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "jedi",
            "direct": false,
            "version": "0.20.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "jinja2",
            "direct": false,
            "version": "3.1.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "joblib",
            "direct": false,
            "version": "1.5.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "jupyter-client",
            "direct": false,
            "version": "8.9.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "jupyter-core",
            "direct": false,
            "version": "5.9.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "jupyterlab-widgets",
            "direct": false,
            "version": "3.0.16",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "kiwisolver",
            "direct": false,
            "version": "1.5.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "lark",
            "direct": false,
            "version": "1.3.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "lightning",
            "direct": false,
            "version": "2.6.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "lightning-utilities",
            "direct": false,
            "version": "0.15.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "llvmlite",
            "direct": false,
            "version": "0.48.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "markdown-it-py",
            "direct": false,
            "version": "4.2.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "markupsafe",
            "direct": false,
            "version": "3.0.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "matplotlib",
            "direct": false,
            "version": "3.0.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "matplotlib",
            "direct": false,
            "version": "3.11.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "matplotlib-inline",
            "direct": false,
            "version": "0.2.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "mdurl",
            "direct": false,
            "version": "0.1.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ml-dtypes",
            "direct": false,
            "version": "0.5.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "mpmath",
            "direct": false,
            "version": "1.3.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "multidict",
            "direct": false,
            "version": "6.7.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "narwhals",
            "direct": false,
            "version": "2.23.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nest-asyncio2",
            "direct": false,
            "version": "1.7.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "networkx",
            "direct": false,
            "version": "3.6.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "numba",
            "direct": false,
            "version": "0.66.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "numpydoc",
            "direct": false,
            "version": "1.10.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cublas",
            "direct": false,
            "version": "13.1.1.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cuda-cupti",
            "direct": false,
            "version": "13.0.85",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cuda-nvrtc",
            "direct": false,
            "version": "13.0.88",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cuda-runtime",
            "direct": false,
            "version": "13.0.96",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cudnn-cu13",
            "direct": false,
            "version": "9.20.0.48",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cufft",
            "direct": false,
            "version": "12.0.0.61",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cufile",
            "direct": false,
            "version": "1.15.1.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-curand",
            "direct": false,
            "version": "10.4.0.35",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cusolver",
            "direct": false,
            "version": "12.0.4.66",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cusparse",
            "direct": false,
            "version": "12.6.3.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-cusparselt-cu13",
            "direct": false,
            "version": "0.8.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-nccl-cu12",
            "direct": false,
            "version": "2.30.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-nccl-cu13",
            "direct": false,
            "version": "2.29.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-nvjitlink",
            "direct": false,
            "version": "13.3.33",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-nvshmem-cu13",
            "direct": false,
            "version": "3.4.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "nvidia-nvtx",
            "direct": false,
            "version": "13.0.85",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "onnx",
            "direct": false,
            "version": "1.22.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "onnx2torch",
            "direct": false,
            "version": "1.5.15",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "packaging",
            "direct": false,
            "version": "26.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "parso",
            "direct": false,
            "version": "0.8.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pexpect",
            "direct": false,
            "version": "4.9.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pillow",
            "direct": false,
            "version": "12.3.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pip",
            "direct": false,
            "version": "26.1.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "platformdirs",
            "direct": false,
            "version": "4.10.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pluggy",
            "direct": false,
            "version": "1.6.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "prompt-toolkit",
            "direct": false,
            "version": "3.0.52",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "propcache",
            "direct": false,
            "version": "0.5.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "protobuf",
            "direct": false,
            "version": "7.35.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "psims",
            "direct": false,
            "version": "1.3.6",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "psutil",
            "direct": false,
            "version": "7.2.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ptyprocess",
            "direct": false,
            "version": "0.7.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pure-eval",
            "direct": false,
            "version": "0.2.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pyarrow",
            "direct": false,
            "version": "25.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pycparser",
            "direct": false,
            "version": "3.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pydantic-core",
            "direct": false,
            "version": "2.46.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pygments",
            "direct": false,
            "version": "2.20.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pyparsing",
            "direct": false,
            "version": "3.3.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pytest",
            "direct": false,
            "version": "9.1.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "python-dateutil",
            "direct": false,
            "version": "2.9.0.post0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pytorch-lightning",
            "direct": false,
            "version": "2.6.5",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pytz",
            "direct": false,
            "version": "2026.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pyyaml",
            "direct": false,
            "version": "6.0.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "pyzmq",
            "direct": false,
            "version": "27.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "recommonmark",
            "direct": false,
            "version": "0.7.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "requests",
            "direct": false,
            "version": "2.34.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "roman-numerals",
            "direct": false,
            "version": "4.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ruff",
            "direct": false,
            "version": "0.15.21",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scikit-learn",
            "direct": false,
            "version": "1.9.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scipy",
            "direct": false,
            "version": "1.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scipy",
            "direct": false,
            "version": "1.17.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "scipy",
            "direct": false,
            "version": "1.18.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "semver",
            "direct": false,
            "version": "3.0.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "setuptools",
            "direct": false,
            "version": "83.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "six",
            "direct": false,
            "version": "1.17.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "snowballstemmer",
            "direct": false,
            "version": "3.1.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "spectrum-utils",
            "direct": false,
            "version": "0.5.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx",
            "direct": false,
            "version": "9.0.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx",
            "direct": false,
            "version": "9.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx-autobuild",
            "direct": false,
            "version": "2025.8.25",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx-automodapi",
            "direct": false,
            "version": "0.22.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx-click",
            "direct": false,
            "version": "6.2.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinx-rtd-theme",
            "direct": false,
            "version": "3.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-applehelp",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-devhelp",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-htmlhelp",
            "direct": false,
            "version": "2.1.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-jquery",
            "direct": false,
            "version": "4.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-jsmath",
            "direct": false,
            "version": "1.0.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-qthelp",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sphinxcontrib-serializinghtml",
            "direct": false,
            "version": "2.0.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "stack-data",
            "direct": false,
            "version": "0.6.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "starlette",
            "direct": false,
            "version": "1.3.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "sympy",
            "direct": false,
            "version": "1.14.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "tables",
            "direct": false,
            "version": "3.4.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "threadpoolctl",
            "direct": false,
            "version": "3.6.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "toml",
            "direct": false,
            "version": "0.10.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "torch",
            "direct": false,
            "version": "2.13.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "torchmetrics",
            "direct": false,
            "version": "1.9.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "torchvision",
            "direct": false,
            "version": "0.28.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "tornado",
            "direct": false,
            "version": "6.5.7",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "tqdm",
            "direct": false,
            "version": "4.68.4",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "traitlets",
            "direct": false,
            "version": "5.15.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "triton",
            "direct": false,
            "version": "3.7.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "ty",
            "direct": false,
            "version": "0.0.58",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "typing-extensions",
            "direct": false,
            "version": "4.16.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "typing-inspection",
            "direct": false,
            "version": "0.4.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "tzdata",
            "direct": false,
            "version": "2026.3",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "urllib3",
            "direct": false,
            "version": "2.7.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "uvicorn",
            "direct": false,
            "version": "0.51.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "watchfiles",
            "direct": false,
            "version": "1.2.0",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "wcwidth",
            "direct": false,
            "version": "0.8.2",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "websockets",
            "direct": false,
            "version": "16.1",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "widgetsnbextension",
            "direct": false,
            "version": "4.0.15",
            "ecosystem": "pypi"
          },
          {
            "name": "yarl",
            "direct": false,
            "version": "1.24.2",
            "ecosystem": "pypi"
          }
        ],
        "collected": true,
        "truncated": false,
        "total_count": 176,
        "direct_count": 15,
        "indirect_count": 161
      }
    },
    "maintainership": {
      "issues": {
        "open_prs": 0,
        "merged_prs": 144,
        "open_issues": 5,
        "closed_ratio": 0.942,
        "closed_issues": 81,
        "closed_unmerged_prs": 39
      },
      "bus_factor": 1,
      "top_contributors": [
        {
          "type": "User",
          "login": "RalfG",
          "commits": 714,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/26458971?u=30690a2aab56588a06b2a1638f9d31611ec30b01&v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "paretje",
          "commits": 123,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/4622838?u=d57592e976ae49ecf811d37909f420fd1e897a7f&v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "sdgroeve",
          "commits": 94,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/12020055?u=0285b6933b2205dd62cc239469d357879df23556&v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "ArthurDeclercq",
          "commits": 66,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/61241434?u=08a07d48b053425283c8af2ce69d5a455b7d4e9c&v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "anasilviacs",
          "commits": 31,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/17022777?v=4"
        },
        {
          "type": "Bot",
          "login": "dependabot-preview[bot]",
          "commits": 23,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/in/2141?v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "jaspervdh",
          "commits": 8,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/103642109?v=4"
        },
        {
          "type": "Bot",
          "login": "dependabot[bot]",
          "commits": 5,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/in/29110?v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "rodvrees",
          "commits": 4,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/93122887?u=97b8766d65fe930ddd141dc1b676ada053c44e78&v=4"
        },
        {
          "type": "User",
          "login": "Cajac102",
          "commits": 3,
          "avatar_url": "https://avatars.githubusercontent.com/u/41333514?u=5e10188310f6d4b69ece9eb9fcf343c640e52688&v=4"
        }
      ],
      "contributors_sampled": 13,
      "top_contributor_share": 0.664
    },
    "quality_signals": {
      "has_ci": true,
      "has_tests": true,
      "ci_workflows": [
        "build_and_publish.yml",
        "test.yml"
      ],
      "has_docs_dir": true,
      "linter_configs": [],
      "has_editorconfig": false,
      "has_linter_config": false,
      "has_precommit_config": false
    },
    "security_signals": {
      "lockfiles": [
        "uv.lock"
      ],
      "scorecard": {
        "checks": [
          {
            "name": "Binary-Artifacts",
            "score": 10,
            "reason": "no binaries found in the repo",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#binary-artifacts"
          },
          {
            "name": "Branch-Protection",
            "score": 8,
            "reason": "branch protection is not maximal on development and all release branches",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#branch-protection"
          },
          {
            "name": "CI-Tests",
            "score": 10,
            "reason": "9 out of 9 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#ci-tests"
          },
          {
            "name": "CII-Best-Practices",
            "score": 0,
            "reason": "no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#cii-best-practices"
          },
          {
            "name": "Code-Review",
            "score": 1,
            "reason": "Found 1/10 approved changesets -- score normalized to 1",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#code-review"
          },
          {
            "name": "Contributors",
            "score": 10,
            "reason": "project has 5 contributing companies or organizations",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#contributors"
          },
          {
            "name": "Dangerous-Workflow",
            "score": 10,
            "reason": "no dangerous workflow patterns detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#dangerous-workflow"
          },
          {
            "name": "Dependency-Update-Tool",
            "score": 10,
            "reason": "update tool detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#dependency-update-tool"
          },
          {
            "name": "Fuzzing",
            "score": 0,
            "reason": "project is not fuzzed",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#fuzzing"
          },
          {
            "name": "License",
            "score": 10,
            "reason": "license file detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#license"
          },
          {
            "name": "Maintained",
            "score": 10,
            "reason": "22 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#maintained"
          },
          {
            "name": "Packaging",
            "score": 10,
            "reason": "packaging workflow detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#packaging"
          },
          {
            "name": "Pinned-Dependencies",
            "score": 0,
            "reason": "dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#pinned-dependencies"
          },
          {
            "name": "SAST",
            "score": 0,
            "reason": "SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#sast"
          },
          {
            "name": "Security-Policy",
            "score": 0,
            "reason": "security policy file not detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#security-policy"
          },
          {
            "name": "Signed-Releases",
            "score": null,
            "reason": "no releases found",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#signed-releases"
          },
          {
            "name": "Token-Permissions",
            "score": 0,
            "reason": "detected GitHub workflow tokens with excessive permissions",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#token-permissions"
          },
          {
            "name": "Vulnerabilities",
            "score": 10,
            "reason": "0 existing vulnerabilities detected",
            "documentation_url": "https://github.com/ossf/scorecard/blob/c395761df6afe1a69e476bc60a013a94bcbc153f/docs/checks.md#vulnerabilities"
          }
        ],
        "commit": "4dc479ea90f7ac3c5caa8c1ccfec426f586cc4e7",
        "ran_at": "2026-07-17T10:59:49Z",
        "aggregate_score": 6.1,
        "scorecard_version": "v5.5.0"
      },
      "has_codeql_workflow": false,
      "has_security_policy": false,
      "has_dependabot_config": false
    }
  },
  "config": {
    "disabled_metrics": [],
    "disabled_categories": [],
    "disabled_components": {}
  },
  "source": {
    "url": "https://github.com/compomics/ms2pip",
    "host": "github.com",
    "name": "ms2pip",
    "owner": "compomics"
  },
  "metrics": {
    "overall": {
      "key": "overall",
      "band": "moderate",
      "name": "Overall health",
      "note": null,
      "notes": [],
      "value": 67,
      "inputs": {
        "security": 61,
        "vitality": 77,
        "community": 49,
        "governance": 68,
        "engineering": 77
      },
      "components": []
    },
    "categories": [
      {
        "key": "vitality",
        "band": "good",
        "name": "Vitality",
        "value": 77,
        "weight": 0.22,
        "metrics": [
          {
            "key": "development_activity",
            "band": "good",
            "name": "Development activity",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 72,
            "inputs": {
              "commits_last_year": 78,
              "human_commit_share": null,
              "days_since_last_push": 3,
              "active_weeks_last_year": 13
            },
            "components": [
              {
                "key": "push_recency",
                "name": "Push recency",
                "detail": "last push 3 days ago",
                "points": 36,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "push_recency",
                    "params": {
                      "days": 3
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 36
              },
              {
                "key": "commit_cadence",
                "name": "Commit cadence",
                "detail": "13/52 weeks with commits",
                "points": 9,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "commit_cadence_weeks",
                    "params": {
                      "weeks": 13
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 36
              },
              {
                "key": "commit_volume",
                "name": "Commit volume",
                "detail": "78 commits in the last year",
                "points": 17,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "commits_last_year",
                    "params": {
                      "count": 78
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 18
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_maintained",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Maintained",
                "detail": "22 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "release_discipline",
            "band": "good",
            "name": "Release discipline",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "openssf_scorecard_signed_releases"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 84,
            "inputs": {
              "releases_count": 26,
              "latest_release_tag": "v4.2.0",
              "releases_from_tags": false,
              "days_since_latest_release": 3,
              "mean_days_between_releases": 139.8
            },
            "components": [
              {
                "key": "ships_releases",
                "name": "Ships releases",
                "detail": "26 releases published",
                "points": 27,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "releases_published",
                    "params": {
                      "count": 26
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 27
              },
              {
                "key": "release_recency",
                "name": "Release recency",
                "detail": "latest release 3 days ago",
                "points": 36,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "release_recency",
                    "params": {
                      "days": 3
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 36
              },
              {
                "key": "release_cadence",
                "name": "Release cadence",
                "detail": "a release every ~139.8 days",
                "points": 12.6,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "release_cadence",
                    "params": {
                      "gap": 139.8
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 27
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_signed_releases",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Signed-Releases",
                "detail": "no releases found",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "abandonment",
            "band": "excellent",
            "name": "Abandonment",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "cap": null,
              "state": "unverified",
              "guards": [],
              "signals": [],
              "red_flag": false,
              "multiplier_pct": 100,
              "declared_reason": null,
              "unverified_reason": "no_commit_sample",
              "unanswered_open_prs": null,
              "unanswered_open_issues": null,
              "days_since_last_merged_pr": null,
              "days_since_last_human_commit": null,
              "days_since_last_human_commit_is_floor": false
            },
            "components": [
              {
                "key": "project_is_still_maintained",
                "name": "Project is still maintained",
                "detail": "maintenance record not established from the collected data",
                "points": 100,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "abandonment_unverified",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 100
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Is the project alive — is code being written and are releases shipping?"
      },
      {
        "key": "community",
        "band": "at_risk",
        "name": "Community & Adoption",
        "value": 49,
        "weight": 0.18,
        "metrics": [
          {
            "key": "popularity",
            "band": "at_risk",
            "name": "Popularity & adoption",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 44,
            "inputs": {
              "forks": 19,
              "stars": 49,
              "watchers": 17,
              "growth_state": "unverified",
              "growth_factor_pct": 100,
              "growth_unverified_reason": "no_history"
            },
            "components": [
              {
                "key": "stars",
                "name": "Stars",
                "detail": "49 stars",
                "points": 27.3,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "stars",
                    "params": {
                      "count": 49
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 60
              },
              {
                "key": "forks",
                "name": "Forks",
                "detail": "19 forks",
                "points": 10.5,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "forks",
                    "params": {
                      "count": 19
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "watchers",
                "name": "Watchers",
                "detail": "17 watchers",
                "points": 6.7,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "watchers",
                    "params": {
                      "count": 17
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 15
              }
            ]
          },
          {
            "key": "community_health",
            "band": "moderate",
            "name": "Community health",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 50,
            "inputs": {
              "has_readme": true,
              "has_license": true,
              "has_contributing": false,
              "has_issue_template": false,
              "has_code_of_conduct": false,
              "has_pull_request_template": false
            },
            "components": [
              {
                "key": "readme",
                "name": "README",
                "detail": null,
                "points": 22.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 22.5
              },
              {
                "key": "license",
                "name": "License",
                "detail": "recognized license (Apache-2.0)",
                "points": 22.5,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "license_standard",
                    "params": {}
                  },
                  {
                    "code": "license_spdx",
                    "params": {
                      "spdx": "Apache-2.0"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 22.5
              },
              {
                "key": "contributing_guide",
                "name": "CONTRIBUTING guide",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 18
              },
              {
                "key": "code_of_conduct",
                "name": "Code of conduct",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 13.5
              },
              {
                "key": "issue_template",
                "name": "Issue template",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.2
              },
              {
                "key": "pr_template",
                "name": "PR template",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 6.3
              }
            ]
          },
          {
            "key": "ecosystem_adoption",
            "band": "moderate",
            "name": "Ecosystem adoption (downloads)",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Registry dependents. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "registry_dependents"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 57,
            "inputs": {
              "packages": [
                "ms2pip"
              ],
              "dependents": null,
              "ecosystems": "pypi",
              "total_downloads": null,
              "monthly_downloads": 2584
            },
            "components": [
              {
                "key": "monthly_downloads",
                "name": "Monthly downloads",
                "detail": "2,584 downloads/month across pypi",
                "points": 45.5,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "downloads_monthly",
                    "params": {
                      "count": 2584,
                      "ecosystems": "pypi"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 80
              },
              {
                "key": "registry_dependents",
                "name": "Registry dependents",
                "detail": "not reported by this ecosystem",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "not_reported_by_this_ecosystem",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 20
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Does the project have users, downloads, attention, and a welcoming setup for contributors?"
      },
      {
        "key": "governance",
        "band": "moderate",
        "name": "Sustainability & Governance",
        "value": 68,
        "weight": 0.24,
        "metrics": [
          {
            "key": "maintainer_resilience",
            "band": "at_risk",
            "name": "Maintainer resilience (bus factor)",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 40,
            "inputs": {
              "bus_factor": 1,
              "contributors_sampled": 13,
              "top_contributor_share": 0.664
            },
            "components": [
              {
                "key": "bus_factor",
                "name": "Bus factor",
                "detail": "1 contributor(s) cover half of all commits",
                "points": 9,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "bus_factor",
                    "params": {
                      "count": 1
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 54
              },
              {
                "key": "commit_distribution",
                "name": "Commit distribution",
                "detail": "top contributor authored 66% of commits",
                "points": 7.6,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "top_contributor_share",
                    "params": {
                      "share": 66
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 22.5
              },
              {
                "key": "contributor_breadth",
                "name": "Contributor breadth",
                "detail": "13 contributors",
                "points": 13.5,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "contributors_sampled",
                    "params": {
                      "count": 13
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 13.5
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_contributors",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Contributors",
                "detail": "project has 5 contributing companies or organizations",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "responsiveness",
            "band": "good",
            "name": "Issue & PR responsiveness",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 76,
            "inputs": {
              "merged_prs": 144,
              "open_issues": 5,
              "closed_issues": 81,
              "issue_closed_ratio": 0.942,
              "closed_unmerged_prs": 39
            },
            "components": [
              {
                "key": "issue_resolution",
                "name": "Issue resolution",
                "detail": "94% of issues closed",
                "points": 44,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "issues_closed_share",
                    "params": {
                      "share": 94
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 46.75
              },
              {
                "key": "pr_acceptance",
                "name": "PR acceptance",
                "detail": "144/183 decided PRs merged",
                "points": 30.1,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "decided_prs_merged",
                    "params": {
                      "merged": 144,
                      "decided": 183
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 38.25
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_code_review",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Code-Review",
                "detail": "Found 1/10 approved changesets -- score normalized to 1",
                "points": 1.5,
                "status": "partial",
                "details": [],
                "max_points": 15
              }
            ]
          },
          {
            "key": "stewardship",
            "band": "good",
            "name": "Ownership & stewardship",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 70,
            "inputs": {
              "followers": 129,
              "owner_type": "Organization",
              "is_verified": null,
              "owner_login": "CompOmics",
              "public_repos": 113,
              "account_age_days": 4132
            },
            "components": [
              {
                "key": "ownership_backing",
                "name": "Ownership backing",
                "detail": "organization-owned",
                "points": 30,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "owner_organization",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 30
              },
              {
                "key": "verified_domain",
                "name": "Verified domain",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 20
              },
              {
                "key": "owner_reach",
                "name": "Owner reach",
                "detail": "129 followers of CompOmics",
                "points": 15.2,
                "status": "partial",
                "details": [
                  {
                    "code": "owner_followers",
                    "params": {
                      "count": 129,
                      "login": "CompOmics"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "track_record",
                "name": "Track record",
                "detail": "113 public repos, account ~11 yr old",
                "points": 25,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "public_repos",
                    "params": {
                      "count": 113
                    }
                  },
                  {
                    "code": "account_age_years",
                    "params": {
                      "years": 11
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              }
            ]
          },
          {
            "key": "package_maintenance",
            "band": "excellent",
            "name": "Package maintenance",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "packages": [
                "ms2pip"
              ],
              "ecosystems": "pypi",
              "any_deprecated": false,
              "min_days_since_publish": 3
            },
            "components": [
              {
                "key": "published_resolvable",
                "name": "Published & resolvable",
                "detail": "1 package(s) on pypi",
                "points": 25,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "packages_published",
                    "params": {
                      "count": 1,
                      "ecosystems": "pypi"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "publish_recency",
                "name": "Publish recency",
                "detail": "latest publish 3 days ago",
                "points": 35,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "publish_recency",
                    "params": {
                      "days": 3
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 35
              },
              {
                "key": "version_history",
                "name": "Version history",
                "detail": "38 published versions",
                "points": 20,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "published_versions",
                    "params": {
                      "count": 38
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 20
              },
              {
                "key": "not_deprecated",
                "name": "Not deprecated",
                "detail": "active, not deprecated or yanked",
                "points": 20,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "package_not_deprecated",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 20
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Will the project survive its people — bus factor, responsiveness, who backs it, and package upkeep?"
      },
      {
        "key": "engineering",
        "band": "good",
        "name": "Engineering Quality",
        "value": 77,
        "weight": 0.2,
        "metrics": [
          {
            "key": "engineering_practices",
            "band": "moderate",
            "name": "Engineering practices",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 68,
            "inputs": {
              "has_ci": true,
              "has_tests": true,
              "has_editorconfig": false,
              "has_linter_config": false,
              "has_precommit_config": false
            },
            "components": [
              {
                "key": "ci_workflows",
                "name": "CI workflows",
                "detail": "2 workflow(s)",
                "points": 24,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "ci_workflows",
                    "params": {
                      "count": 2
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 24
              },
              {
                "key": "tests_present",
                "name": "Tests present",
                "detail": null,
                "points": 24,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 24
              },
              {
                "key": "linter_config",
                "name": "Linter config",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 16
              },
              {
                "key": "pre_commit_hooks",
                "name": "Pre-commit hooks",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 9.6
              },
              {
                "key": "editorconfig",
                "name": ".editorconfig",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 6.4
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_ci_tests",
                "name": "OpenSSF Scorecard: CI-Tests",
                "detail": "9 out of 9 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10",
                "points": 20,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 20
              }
            ]
          },
          {
            "key": "documentation",
            "band": "excellent",
            "name": "Documentation",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 90,
            "inputs": {
              "topics": [
                "machine-learning",
                "mass-spectrometry",
                "peptide-identification",
                "proteomics",
                "spectrum-prediction",
                "peptide-spectrum"
              ],
              "has_wiki": false,
              "homepage": "https://ms2pip.readthedocs.io",
              "has_readme": true,
              "has_docs_dir": true,
              "has_description": true
            },
            "components": [
              {
                "key": "readme",
                "name": "README",
                "detail": null,
                "points": 30,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 30
              },
              {
                "key": "documentation_directory",
                "name": "Documentation directory",
                "detail": null,
                "points": 25,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 25
              },
              {
                "key": "documentation_homepage_site",
                "name": "Documentation / homepage site",
                "detail": "https://ms2pip.readthedocs.io",
                "points": 15,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 15
              },
              {
                "key": "repository_description",
                "name": "Repository description",
                "detail": null,
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "topics",
                "name": "Topics",
                "detail": "6 topics",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "topics_count",
                    "params": {
                      "count": 6
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "wiki",
                "name": "Wiki",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Are baseline engineering and documentation practices in place?"
      },
      {
        "key": "security",
        "band": "moderate",
        "name": "Security",
        "value": 61,
        "weight": 0.16,
        "metrics": [
          {
            "key": "security_posture",
            "band": "moderate",
            "name": "Security posture",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Signed-Releases. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "signed_releases"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 61,
            "inputs": {
              "source": "openssf_scorecard",
              "checks_evaluated": 17,
              "scorecard_version": "v5.5.0",
              "checks_inconclusive": 1,
              "scorecard_aggregate": 6.1
            },
            "components": [
              {
                "key": "binary_artifacts",
                "name": "Binary-Artifacts",
                "detail": "no binaries found in the repo",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "branch_protection",
                "name": "Branch-Protection",
                "detail": "branch protection is not maximal on development and all release branches",
                "points": 6,
                "status": "partial",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "ci_tests",
                "name": "CI-Tests",
                "detail": "9 out of 9 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10",
                "points": 2.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "cii_best_practices",
                "name": "CII-Best-Practices",
                "detail": "no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "code_review",
                "name": "Code-Review",
                "detail": "Found 1/10 approved changesets -- score normalized to 1",
                "points": 0.8,
                "status": "partial",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "contributors",
                "name": "Contributors",
                "detail": "project has 5 contributing companies or organizations",
                "points": 2.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "dangerous_workflow",
                "name": "Dangerous-Workflow",
                "detail": "no dangerous workflow patterns detected",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "dependency_update_tool",
                "name": "Dependency-Update-Tool",
                "detail": "update tool detected",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "fuzzing",
                "name": "Fuzzing",
                "detail": "project is not fuzzed",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "license",
                "name": "License",
                "detail": "license file detected",
                "points": 2.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 2.5
              },
              {
                "key": "maintained",
                "name": "Maintained",
                "detail": "22 commit(s) and 4 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "packaging",
                "name": "Packaging",
                "detail": "packaging workflow detected",
                "points": 5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "pinned_dependencies",
                "name": "Pinned-Dependencies",
                "detail": "dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "sast",
                "name": "SAST",
                "detail": "SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "security_policy",
                "name": "Security-Policy",
                "detail": "security policy file not detected",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 5
              },
              {
                "key": "signed_releases",
                "name": "Signed-Releases",
                "detail": "no releases found",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "token_permissions",
                "name": "Token-Permissions",
                "detail": "detected GitHub workflow tokens with excessive permissions",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              },
              {
                "key": "vulnerabilities",
                "name": "Vulnerabilities",
                "detail": "0 existing vulnerabilities detected",
                "points": 7.5,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 7.5
              }
            ]
          },
          {
            "key": "high_risk_jurisdiction_exposure",
            "band": "excellent",
            "name": "High-Risk Jurisdiction Exposure",
            "note": "Only high-confidence self-published location evidence affects this multiplier. Ambiguous matches are review-only; country evidence is not proof of nationality, citizenship, legal registration, malicious intent, or sanctions status.",
            "notes": [
              {
                "code": "jurisdiction_evidence_limits",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 100,
            "inputs": {
              "meaning": "self-published location evidence; not nationality or citizenship",
              "red_flag": false,
              "exposures": [],
              "policy_countries": [
                "Russia",
                "Iran",
                "North Korea"
              ],
              "review_only_matches": 0,
              "assessed_self_published_locations": 5
            },
            "components": [
              {
                "key": "policy_exposure_multiplier",
                "name": "Policy exposure multiplier",
                "detail": "no confirmed policy-scope location match",
                "points": 100,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "jurisdiction_no_match",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 100
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "Are visible security and supply-chain practices strong, with no malicious dependency and no unresolved high-risk jurisdiction exposure?"
      },
      {
        "key": "ai_readiness",
        "band": "at_risk",
        "name": "AI Readiness",
        "value": 30,
        "weight": 0,
        "metrics": [
          {
            "key": "ai_agent_context",
            "band": "critical",
            "name": "Agent context & guidance",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Legible commit history. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "legible_commit_history"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 1,
            "inputs": {
              "has_llms_txt": false,
              "legible_history_share": null,
              "agent_instruction_files": [],
              "agent_instruction_max_bytes": null
            },
            "components": [
              {
                "key": "agent_instructions",
                "name": "Agent instructions",
                "detail": "no CLAUDE.md / AGENTS.md / editor rules",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_agent_instructions",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 45
              },
              {
                "key": "machine_readable_docs_llms_txt",
                "name": "Machine-readable docs (llms.txt)",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 15
              },
              {
                "key": "legible_commit_history",
                "name": "Legible commit history",
                "detail": "no data",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 40
              }
            ]
          },
          {
            "key": "ai_verify_loop",
            "band": "at_risk",
            "name": "Verify loop (build / test / typecheck)",
            "note": "Excluded from scoring (no data or not applicable): Demonstrated agent practice, Automated maintenance. Remaining weights renormalized.",
            "notes": [
              {
                "code": "excluded_no_data",
                "params": {
                  "components": [
                    "demonstrated_agent_practice",
                    "automated_maintenance"
                  ]
                }
              },
              {
                "code": "weights_renormalized",
                "params": {}
              }
            ],
            "value": 39,
            "inputs": {
              "has_nix": false,
              "has_tests": true,
              "lockfiles": [
                "uv.lock"
              ],
              "has_dockerfile": false,
              "typed_language": false,
              "bootstrap_files": [],
              "has_devcontainer": false,
              "has_linter_config": false,
              "typecheck_configs": [],
              "agent_commit_share": null,
              "toolchain_manifests": [],
              "dependency_bot_commit_share": null
            },
            "components": [
              {
                "key": "one_command_bootstrap",
                "name": "One-command bootstrap",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 18
              },
              {
                "key": "automated_tests",
                "name": "Automated tests",
                "detail": null,
                "points": 22,
                "status": "met",
                "details": [],
                "max_points": 22
              },
              {
                "key": "lint_format_config",
                "name": "Lint / format config",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 11
              },
              {
                "key": "static_type_checking",
                "name": "Static type checking",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 11
              },
              {
                "key": "reproducible_environment",
                "name": "Reproducible environment",
                "detail": "lockfile",
                "points": 10,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "file_list",
                    "params": {
                      "files": "lockfile"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "demonstrated_agent_practice",
                "name": "Demonstrated agent practice",
                "detail": "no data",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 10
              },
              {
                "key": "automated_maintenance",
                "name": "Automated maintenance",
                "detail": "no data",
                "points": 0,
                "status": "excluded",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_data",
                    "params": {}
                  }
                ],
                "max_points": 8
              },
              {
                "key": "openssf_scorecard_pinned_dependencies",
                "name": "OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies",
                "detail": "dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 10
              }
            ]
          },
          {
            "key": "ai_code_legibility",
            "band": "moderate",
            "name": "Code legibility for models",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 55,
            "inputs": {
              "primary_language": "HTML",
              "largest_source_bytes": 28997,
              "source_files_sampled": 25,
              "oversized_source_files": 0
            },
            "components": [
              {
                "key": "type_checkable_code",
                "name": "Type-checkable code",
                "detail": "HTML without a type-check config",
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [
                  {
                    "code": "no_typecheck_config_language",
                    "params": {
                      "language": "HTML"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 45
              },
              {
                "key": "manageable_file_sizes",
                "name": "Manageable file sizes",
                "detail": "0/25 source files over 60KB",
                "points": 55,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "oversized_source_files",
                    "params": {
                      "kb": 60,
                      "sampled": 25,
                      "oversized": 0
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 55
              }
            ]
          },
          {
            "key": "ai_interfaces",
            "band": "at_risk",
            "name": "Machine-readable interfaces",
            "note": null,
            "notes": [],
            "value": 40,
            "inputs": {
              "example_dirs": [
                "notebooks"
              ],
              "has_mcp_signal": false,
              "api_schema_files": []
            },
            "components": [
              {
                "key": "api_schema_openapi_graphql_proto",
                "name": "API schema (OpenAPI/GraphQL/proto)",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 40
              },
              {
                "key": "mcp_server",
                "name": "MCP server",
                "detail": null,
                "points": 0,
                "status": "missed",
                "details": [],
                "max_points": 20
              },
              {
                "key": "runnable_examples",
                "name": "Runnable examples",
                "detail": "notebooks",
                "points": 40,
                "status": "met",
                "details": [
                  {
                    "code": "file_list",
                    "params": {
                      "files": "notebooks"
                    }
                  }
                ],
                "max_points": 40
              }
            ]
          }
        ],
        "description": "How well is the repo equipped to be developed and maintained with AI coding agents? An independent, experimental badge — weight 0.0, so it is surfaced on its own and does not affect the overall health score."
      }
    ],
    "metrics_version": "1.13.0"
  },
  "warnings": [],
  "report_type": "repository",
  "generated_at": "2026-07-17T11:00:19.334388Z",
  "schema_version": "0.11.0",
  "badge_url": "https://raw.githubusercontent.com/inspect-software/badges/main/v1/c/compomics/ms2pip.svg",
  "full_name": "compomics/ms2pip",
  "license_state": "standard",
  "license_spdx": "Apache-2.0"
}

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v1.13.0, схема v0.11.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистикаPyPI.