Усі теги
Тег каталогу

#proteomics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

18 записів
З тегом «proteomics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
92Відміннийіндекс здоров'я
PixelgenTechnologies/pixelator
A command-line tool and library to process and analyze sequencing data from Molecular Pixelation (MPX) and Proximity Network (PNA) assays.
Python★ 22↓ 169/міс19 жовт. 2026 р.
MIT19 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
89Відміннийіндекс здоров'я
bigbio/qpx
qpx (Quantitative Proteomics eXchange) format (aka quantms.io) a format to capture a full proteomics experiment
Python★ 26↓ 207/міс19 жовт. 2026 р.
Apache-2.019 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
88Відміннийіндекс здоров'я
K-Dense-AI/scientific-agent-skills
Turn any AI agent into an AI Scientist. The #1 Agent Skills library for science, used by 190,000+ scientists worldwide. 165 ready-to-use validated skills plus 100+ scientific databases covering biology, chemistry, medicine, and drug discovery. Compatible with Cursor, Claude Code, Codex, Pi, Antigravity, and the open Agent Skills standard.
Python★ 45.2K16 вер. 2026 р.
MIT16 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
84Відміннийіндекс здоров'я
CompOmics/ms2rescore
Modular and user-friendly platform for AI-assisted rescoring of peptide identifications
Python★ 66↓ 21.8K/міс14 вер. 2026 р.
Apache-2.014 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · crates.io · npm
83Відміннийіндекс здоров'я
Sigilweaver/OpenTFRaw
Pure-Rust reader for Thermo Fisher .raw mass-spectrometry files, with Python bindings.
Rust★ 13↓ 7 263/міс8 вер. 2026 р.
Власна ліцензія8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
CompOmics/ms2pip
MS²PIP: Fast and accurate peptide spectrum prediction for multiple fragmentation methods, instruments, and labeling techniques.
HTML · Jupyter Notebook★ 50↓ 23.7K/міс14 вер. 2026 р.
Apache-2.014 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
77Добрийіндекс здоров'я
cyanheads/uniprot-mcp-server
Search UniProtKB by protein function, fetch curated records, map IDs across databases, and pull reference proteomes, taxonomy, and sequences via MCP. STDIO or Streamable HTTP.
TypeScript★ 2↓ 946/міс18 жовт. 2026 р.
Apache-2.018 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
75Добрийіндекс здоров'я
MannLabs/alphapeptdeep
Deep learning framework for proteomics
Jupyter Notebook★ 15819 вер. 2026 р.
Apache-2.019 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io
75Добрийіндекс здоров'я
Sigilweaver/OpenMassSpecCore
Shared core types and traits for the OpenProteo proteomics reader family.
Rust★ 1↓ 2 196/міс13 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія13 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
73Добрийіндекс здоров'я
MannLabs/alpharaw
An open-source Python package to unify raw MS data accession and storage.
Python · Jupyter Notebook★ 36↓ 4 389/міс19 жовт. 2026 р.
Apache-2.019 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
71Добрийіндекс здоров'я
TimoLassmann/kalign
A fast multiple sequence alignment program.
C · Python★ 162↓ 9 617/міс19 вер. 2026 р.
Apache-2.019 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · Go
71Добрийіндекс здоров'я
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 45↓ 765/міс8 вер. 2026 р.
Власна ліцензія8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
65Добрийіндекс здоров'я
Vitek-Lab/MSstatsConvert
Converter functions for the MSstats package
R★ 1212 вер. 2026 р.
Власна ліцензія12 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
65Добрийіндекс здоров'я
bijux/bijux-proteomics
Опис репозиторію не опубліковано.
Python★ 2↓ 56/міс8 вер. 2026 р.
Apache-2.08 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
MannLabs/alphaquant
An open-source Python package for accurate and sensitive peptide and protein quantification.
Python · Jupyter Notebook★ 21↓ 655/міс16 жовт. 2026 р.
Apache-2.016 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
51Помірнийіндекс здоров'я
bigbio/quantms-rescoring
quantms and ms2rescore helper functions and scripts
Python★ 1↓ 205/міс19 вер. 2026 р.
Apache-2.019 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
45Слабкийіндекс здоров'я
Bio2Byte/scop3p-api-client
The official Scop3P REST API Python client for retrieving phospho-sites
Python★ 0↓ 97/міс8 вер. 2026 р.
Власна ліцензія8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
16Критичнийіндекс здоров'я
biojs/generator-biojs-webcomponents
Generate all the boilerplate for your next BioJS tool!
JavaScript★ 10↓ 20/міс9 вер. 2026 р.
MIT9 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0