Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.14.0 · метрики 2.10.0 · 2026-07-19 01:06 UTC

computational-cell-analytics / micro-sam

Segment Anything for Microscopy

Jupyter Notebook · PythonMIT★ 701 зірка⑂ 105 форківз трав. 2023 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипБібліотекаДесктопний застосунокяк це визначено
#microscopy-images#segment-anything#segmentation#cell-segmentation#napari#nuclei-segmentation#mitochondria-segmentation#micro-sam#bioimage-analysis

computational-cell-analytics/micro-sam має індекс здоров’я 84 зі 100, що відповідає смузі «Відмінний». Найвищий показник — Vitality (92/100), найнижчий — AI Readiness (34/100). Останнє оновлення було 1 день тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

84
загалом / 100
Відмінний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

84
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 71 калібровано до 84 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

computational-cell-analyticsОрганізація
86 підписників36 публічних репозиторіївз черв. 2022 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікація
PyPImicro_sam1.8.6-71 день тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

92Відмінний · 21% загального індексу

Активність розробки

87Відмінний
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 1 дн. тому
22.8/36Ритм комітів — 33/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів — 157 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 21 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year157
human_commit_share—
days_since_last_push1
active_weeks_last_year33

Дисципліна релізів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 48 релізів
36/36Свіжість релізів — останній реліз 1 дн. тому
27/27Ритм релізів — реліз кожні ~15,5 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count48
latest_release_tagv1.8.6
releases_from_tagsні
days_since_latest_release1
mean_days_between_releases15,5
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

60Помірний · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

68Добрий
Як обчислюється оцінка
46.2/60Зірки — 701 зірок
16.8/25Форки — 105 форків
5/15Спостерігачі — 9 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks105
stars701
watchers9
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (MIT)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges—
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services—
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

73Добрий · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

42Слабкий
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
9.1/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 60% комітів
13.5/13.5Широта контриб’юторів — 20 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 5 contributing companies or organizations
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled20
top_contributor_share0,597

Реактивність на issue та PR

81Відмінний
Як обчислюється оцінка
36.4/42Вирішення issue — закрито 87% issue
27.8/30Прийняття PR — злито 827/892 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
6/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 13/27 approved changesets -- score normalized to 4
Використані вхідні дані
merged_prs827
open_issues52
closed_issues336
prs_merged_7d—
prs_decided_7d—
prs_merged_30d—
prs_decided_30d—
issue_closed_ratio0,866
closed_unmerged_prs65
first_time_authors_30d—
first_time_prs_merged_30d—
first_time_prs_decided_30d—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

80Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен — статус підтвердженого домену для цієї організації не зчитано
13.9/25Охоплення власника — 86 підписників у computational-cell-analytics
19.7/25Послужний список — 36 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~4 р.
Використані вхідні дані
followers86
owner_typeOrganization
is_verified—
owner_logincomputational-cell-analytics
public_repos36
account_age_days1 508
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікацій — остання публікація 1 дн. тому
20/20Історія версій — 7 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesmicro_sam
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish1

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

77Добрий · 19% загального індексу

Інженерні практики

68Добрий
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 6 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
0/16Конфігурація лінтера
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 27 out of 27 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configні
has_precommit_configні

Документація

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://computational-cell-analytics.github.io/micro-sam/
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 9 тем
0/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsmicroscopy-images, segment-anything, segmentation, cell-segmentation, napari, nuclei-segmentation, mitochondria-segmentation, micro-sam, bioimage-analysis
has_wikiні
homepagehttps://computational-cell-analytics.github.io/micro-sam/
docs_sitehttps://computational-cell-analytics.github.io/micro-sam/
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

53Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

53Помірний
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — немає даних
2.5/2.5CI-Tests — 27 out of 27 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
3/7.5Code-Review — Found 13/27 approved changesets -- score normalized to 4
2.5/2.5Contributors — project has 5 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 30 commit(s) and 21 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packaging — packaging workflow detected
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — немає даних
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate5,3
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Branch-Protection, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

34У зоні ризику · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

1Критичний
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
0/40Читабельна історія комітів — немає даних
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share—
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Читабельна історія комітів. Залишкові ваги перенормовано.

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

27У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
0/18Розгортання однією командою
22/22Автоматизовані тести
0/11Конфігурація лінтера / форматера
0/11Статична перевірка типів
0/10Відтворюване середовище
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — немає даних
0/8Автоматизоване супроводження — немає даних
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfiles—
has_dockerfileні
typed_languageні
bootstrap_files—
has_devcontainerні
has_linter_configні
typecheck_configs—
agent_commit_share—
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Підтверджена практика роботи з агентами, Автоматизоване супроводження. Залишкові ваги перенормовано.

Читабельність коду для моделей

54Помірний
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований код — Jupyter Notebook без конфігурації перевірки типів
54.3/55Керовані розміри файлів — 3/247 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageJupyter Notebook
largest_source_bytes87 623
source_files_sampled247
oversized_source_files3

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40Придатні до запуску приклади — examples, notebooks
Використані вхідні дані
example_dirsexamples, notebooks
has_mcp_signalні
api_schema_files—
interfaces_expected_of—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

701зірок GitHub
20контриб'юторів
157комітів за останні 12 місяців
1днів від останнього пушу
48релізів
1бас-фактор
52відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Докладніше

OpenSSF Scorecard 5.3 / 10
5.3сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-19 01:05 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
н/дBranch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10CI-Tests27 out of 27 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
4Code-ReviewFound 13/27 approved changesets -- score normalized to 4
10Contributorsproject has 5 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 21 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10Vulnerabilities0 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 30
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPIbioimage-cpp>=0.3setup.cfg
PyPIbioimageio.core—setup.cfg
PyPIh5py—setup.cfg
PyPIimagecodecs—setup.cfg
PyPIimageio—setup.cfg
PyPIjoblib—setup.cfg
PyPIkornia—setup.cfg
PyPImagicgui—setup.cfg
PyPImatplotlib—setup.cfg
PyPInapari>=0.7setup.cfg
PyPInatsort—setup.cfg
PyPInetworkx—setup.cfg
PyPInumpy—setup.cfg
PyPIpandas—setup.cfg
PyPIpooch—setup.cfg
PyPIPyQt6—setup.cfg
PyPIpython-elf>=0.9setup.cfg
PyPIscikit-image—setup.cfg
PyPIscikit-learn—setup.cfg
PyPIsegment-anything—setup.cfg
PyPIsuperqt—setup.cfg
PyPItimm—setup.cfg
PyPItorch>=2.5setup.cfg
PyPItorch-em>=0.9setup.cfg
PyPItorchvision—setup.cfg
PyPItqdm—setup.cfg
PyPItrackastra>=0.5.3setup.cfg
PyPIxarray—setup.cfg
PyPIxxhash—setup.cfg
PyPIzarr—setup.cfg
Усі залежності 41

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 30 прямих і 11 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIbioimage-cpp—пряма
PyPIbioimageio-core—пряма
PyPIh5py—пряма
PyPIimagecodecs—пряма
PyPIimageio—пряма
PyPIjoblib—пряма
PyPIkornia—пряма
PyPImagicgui—пряма
PyPImatplotlib—пряма
PyPInapari—пряма
PyPInatsort—пряма
PyPInetworkx—пряма
PyPInumpy—пряма
PyPIpandas—пряма
PyPIpooch—пряма
PyPIpyqt6—пряма
PyPIpython-elf—пряма
PyPIscikit-image—пряма
PyPIscikit-learn—пряма
PyPIsegment-anything—пряма
PyPIsuperqt—пряма
PyPItimm—пряма
PyPItorch—пряма
PyPItorch-em—пряма
PyPItorchvision—пряма
PyPItqdm—пряма
PyPItrackastra—пряма
PyPIxarray—пряма
PyPIxxhash—пряма
PyPIzarr—пряма
PyPIbuild—непряма
PyPIcoverage—непряма
PyPIline-profiler—непряма
PyPIpdoc—непряма
PyPIpytest—непряма
PyPIpytest-cov—непряма
PyPIpytest-qt—непряма
PyPIsetuptools—непряма
PyPIsnakeviz—непряма
PyPItabulate—непряма
PyPItwine—непряма
Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з computational-cell-analytics/micro-sam. Читати поруч →

98docling-project/doclingGet your documents ready for gen AIВинятковий98ultralytics/ultralyticsUltralytics YOLO26, YOLO11, YOLOv8 — object detection, instance segmentation, semantic segmentation, image classification, pose estimation, object trackingВинятковий96napari/naparinapari: a fast, interactive, multi-dimensional image viewer for pythonВинятковий96Slicer/SlicerMulti-platform, free open source software for visualization and image computing.Винятковий94SimpleITK/SimpleITKSimpleITK: a layer built on top of the Insight Toolkit (ITK), intended to simplify and facilitate ITK's use in rapid prototyping, education and interpreted languages.Винятковий92albumentations-team/AlbumentationsXNext-generation Albumentations: dual-licensed for open-source and commercial useВідмінний

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.14.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.