Усі теги
Тег каталогу

#microscopy

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

16 записів
З тегом «microscopy»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
94Винятковийіндекс здоров'я
cytomining/pycytominer
Python package for image-based profiling
Python · Jupyter Notebook★ 145↓ 2 226/міс20 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause20 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
94Винятковийіндекс здоров'я
deepinv/deepinv
DeepInverse: a PyTorch library for solving imaging inverse problems using deep learning
Python★ 808↓ 4 843/міс13 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause13 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
94Винятковийіндекс здоров'я
hyperspy/hyperspy
Multidimensional data analysis
Python★ 585↓ 22.5K/міс21 жовт. 2026 р.
GPL-3.021 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
92Відміннийіндекс здоров'я
bioio-devs/bioio
Image reading, metadata management, and image writing for Microscopy images in Python
Python★ 132↓ 27.8K/міс13 жовт. 2026 р.
BSD-3-Clause13 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
91Відміннийіндекс здоров'я
computational-cell-analytics/micro-sam
Segment Anything for Microscopy
Jupyter Notebook · Python★ 72011 вер. 2026 р.
MIT11 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
89Відміннийіндекс здоров'я
LiberTEM/LiberTEM
Open pixelated STEM framework
Python · TypeScript★ 13023 серп. 2026 р.
MIT23 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
87Відміннийіндекс здоров'я
ImagingDataCommons/dicom-microscopy-viewer
Web-based DICOM slide microscopy viewer library
JavaScript★ 129↓ 27.2K/міс18 вер. 2026 р.
MIT18 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
80Відміннийіндекс здоров'я
delmic/odemis
Open Delmic Microscope Software
Python★ 5622 жовт. 2026 р.
GPL-2.022 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
80Відміннийіндекс здоров'я
tlambert03/nd2
Full-featured nd2 (Nikon NIS Elements) file reader for python. Outputs to numpy, dask, and xarray. Exhaustive metadata extraction
Python★ 81↓ 36.9K/міс29 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause29 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
77Добрийіндекс здоров'я
bioio-devs/bioio-lif
A BioIO reader plugin for reading LIF (Leica Image File) images.
Python★ 1↓ 9 781/міс14 жовт. 2026 р.
BSD-3-Clause14 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
73Добрийіндекс здоров'я
OpenHCSDev/openhcs
Typed, reproducible high-content microscopy workflows across GUI, Python, CellProfiler, Napari/Fiji, GPU, and local MCP agents.
Python★ 518 вер. 2026 р.
MIT18 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
69Добрийіндекс здоров'я
Dana-Farber-AIOS/pathml
Tools for computational pathology
Python★ 467↓ 188/міс21 жовт. 2026 р.
GPL-2.021 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
BanerjeeLab-repertoire/pycat-napari
Python Condensate Analysis Toolbox (PyCAT) for bio-image analysis, especially biomolecular condensates and fluorescence microscopy images.
Python★ 1↓ 2 133/міс20 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія20 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
Go · PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
WSILabs/opentile-go
Go library for reading whole-slide pathology images — raw compressed-tile extraction and decoded region reading across 11 WSI formats (Aperio SVS, Hamamatsu NDPI, Philips, OME-TIFF, DICOM WSI, and more).
Go★ 022 жовт. 2026 р.
Apache-2.022 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
29У зоні ризикуіндекс здоров'я
pycroscopy/pycroscopy
Scientific analysis of nanoscale materials imaging data
Jupyter Notebook★ 28013 вер. 2026 р.
MIT13 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
19Критичнийіндекс здоров'я
albumentations-team/albumentations
Fast and flexible image augmentation library. Paper about the library: https://www.mdpi.com/2078-2489/11/2/125
Python★ 15.3K17 вер. 2026 р.
MIT17 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0