gioodm / wasp-proteins-annotation
Python command-line software for whole-proteomes annotation based on structural homology.
gioodm/wasp-proteins-annotation має індекс здоров’я 27 зі 100, що відповідає смузі «У зоні ризику». Найвищий показник — Vitality (45/100), найнижчий — AI Readiness (11/100). Останнє оновлення було 91 день тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.
Індекс здоров'я програмного забезпечення
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
Профіль оцінок
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 33 калібровано до 27 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
Власність
Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.
Пакетні екосистеми
| Реєстр | Пакет | Версія | Завантажень / міс | Версії | Остання публікація |
|---|---|---|---|---|---|
| PyPI | wasp-proteins-annotationвказує на інший репозиторій — не оцінюється | 2.0 | - | 11 | 133 дні тому |
Метрики за категоріями
Життєздатність
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
Активність розробки
Як обчислюється оцінка
| 9.9/36 | Свіжість push — останній push 91 дн. тому |
| 4.2/36 | Ритм комітів — 6/52 тижнів із комітами |
| 11.3/18 | Обсяг комітів — 17 комітів за останній рік |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| commits_last_year | 17 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 91 |
| active_weeks_last_year | 6 |
Дисципліна релізів
Як обчислюється оцінка
| 27/27 | Випускає релізи — опубліковано 2 релізів |
| 27/36 | Свіжість релізів — останній реліз 92 дн. тому |
| 19.8/27 | Ритм релізів — реліз кожні ~71 дн. |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
Використані вхідні дані
| releases_count | 2 |
| latest_release_tag | v2.0 |
| releases_from_tags | ні |
| days_since_latest_release | 92 |
| mean_days_between_releases | 71 |
Спільнота та впровадження
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
Популярність і впровадження
Як обчислюється оцінка
| 13.7/60 | Зірки — 8 зірок |
| 0/25 | Форки — 0 форків |
| 0/15 | Спостерігачі — 0 спостерігачів |
Використані вхідні дані
| forks | 0 |
| stars | 8 |
| watchers | 0 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Здоров'я спільноти
Як обчислюється оцінка
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Ліцензія — визнана ліцензія (MIT) |
| 0/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 0/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
Використані вхідні дані
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | 0 |
| has_contributing | ні |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | ні |
| readme_badge_services | — |
| has_pull_request_template | ні |
Сталість та врядування
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)
Як обчислюється оцінка
| 9/54 | Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 0/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 100% комітів |
| 1.4/13.5 | Широта контриб’юторів — 1 контриб’юторів |
| 3/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3 |
Використані вхідні дані
| bus_factor | 1 |
| contributors_sampled | 1 |
| top_contributor_share | 1 |
Реактивність на issue та PR
Як обчислюється оцінка
| 0/42 | Вирішення issue — закрито 0% issue |
| 0/30 | Прийняття PR — немає вирішених pull request-ів або даних |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| merged_prs | 0 |
| open_issues | 1 |
| closed_issues | 0 |
| prs_merged_7d | 0 |
| prs_decided_7d | 0 |
| prs_merged_30d | 0 |
| prs_decided_30d | 0 |
| issue_closed_ratio | 0 |
| closed_unmerged_prs | 0 |
| first_time_authors_30d | 0 |
| first_time_prs_merged_30d | 0 |
| first_time_prs_decided_30d | 0 |
Власність та опіка
Як обчислюється оцінка
| 10/30 | Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис |
| 0/20 | Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів |
| 6.9/25 | Охоплення власника — 8 підписників у gioodm |
| 17.2/25 | Послужний список — 15 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~4 р. |
Використані вхідні дані
| followers | 8 |
| owner_type | User |
| is_verified | — |
| owner_login | gioodm |
| public_repos | 15 |
| account_age_days | 1 548 |
Інженерна якість
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
Інженерні практики
Як обчислюється оцінка
| 24/24 | Процеси CI — 1 процес(ів) CI |
| 0/24 | Наявні тести |
| 0/16 | Конфігурація лінтера |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 0/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — немає даних |
Використані вхідні дані
| has_ci | так |
| has_tests | ні |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | ні |
| has_precommit_config | ні |
Документація
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | README |
| 0/25 | Каталог документації |
| 0/15 | Сайт документації / домашня сторінка |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 10/10 | Теми — 6 тем |
| 0/10 | Wiki |
Використані вхідні дані
| topics | alphafold2, genome-annotation, genome-scale-metabolic-model, structural-homology, synthetic-biology, systems-biology |
| has_wiki | ні |
| homepage | — |
| docs_site | — |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | ні |
| has_description | так |
Безпека
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
Стан безпеки
Як обчислюється оцінка
| 7.5/7.5 | Binary-Artifacts — no binaries found in the repo |
| 0/7.5 | Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches |
| 0/2.5 | CI-Tests — немає даних |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0/7.5 | Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 0.8/2.5 | Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3 |
| 10/10 | Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected |
| 0/7.5 | Dependency-Update-Tool — no update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 0/7.5 | Maintained — 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| 5/5 | Packaging — packaging workflow detected |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0/5 | SAST — no SAST tool detected |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 6.8/7.5 | Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 0/7.5 | Vulnerabilities — 11 existing vulnerabilities detected |
Використані вхідні дані
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 17 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 1 |
| scorecard_aggregate | 3,2 |
Сповіщення про залежності
Як обчислюється оцінка
| 11.1/35 | Прямі залежності без відомих сповіщень — уражено 3: urllib3 2.2.1 (high 7.5), biopython 1.84.0 (moderate 4.9), requests 2.32.2 (moderate 5.5) |
| 19/25 | Непрямі залежності без відомих сповіщень — уражено 1: diskcache 5.6.3 (moderate) |
| 26.3/40 | Немає задавнених сповіщень — 4 пакет(ів) зі сповіщеннями без реакції понад 90 дн.; найдавніше опубліковано 814 дн. тому |
Використані вхідні дані
| source | osv |
| advisories | 22 |
| affected_packages | 4 |
| assessed_packages | 79 |
| unassessed_packages | 0 |
| affected_by_severity | high 1, moderate 3 |
| direct_affected_packages | 3 |
Готовність до ШІ
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
Контекст і настанови для агентів
Як обчислюється оцінка
| 0/45 | Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 3/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 2 з 35 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
Використані вхідні дані
| has_llms_txt | ні |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,057 |
| agent_instruction_files | — |
| agent_instruction_max_bytes | — |
Як обчислюється оцінка
| 0/18 | Розгортання однією командою |
| 0/22 | Автоматизовані тести |
| 0/11 | Конфігурація лінтера / форматера |
| 0/11 | Статична перевірка типів |
| 0/10 | Відтворюване середовище |
| 0/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 35 комітів немає створених агентом |
| 0/8 | Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| has_nix | ні |
| has_tests | ні |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | ні |
| typed_language | ні |
| bootstrap_files | — |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | ні |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0 |
| toolchain_manifests | — |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
Читабельність коду для моделей
Як обчислюється оцінка
| 0/45 | Типізований код — Python без конфігурації перевірки типів |
| 55/55 | Керовані розміри файлів — 0/23 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
Використані вхідні дані
| primary_language | Python |
| largest_source_bytes | 29 490 |
| source_files_sampled | 23 |
| oversized_source_files | 0 |
Ключові факти
Попередження щодо збору даних
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
- pypi package 'wasp-proteins-annotation' points at a different repository (https://github.com/gioodm/WASP); excluded from ecosystem scoring
- GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository
Докладніше
OpenSSF Scorecard 3.2 / 10
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 10 | Binary-Artifacts | no binaries found in the repo |
| 0 | Branch-Protection | branch protection not enabled on development/release branches |
| н/д | CI-Tests | no pull request found |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0 | Code-Review | Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 3 | Contributors | project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3 |
| 10 | Dangerous-Workflow | no dangerous workflow patterns detected |
| 0 | Dependency-Update-Tool | no update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 0 | Maintained | 0 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 0 |
| 10 | Packaging | packaging workflow detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0 | SAST | no SAST tool detected |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| 0 | Signed-Releases | Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 9 | Token-Permissions | detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 0 | Vulnerabilities | 11 existing vulnerabilities detected |
Прямі залежності 19
| Реєстр | Пакет | Обмеження версії | Маніфест |
|---|---|---|---|
| PyPI | altair | ==5.2.0 | pyproject.toml |
| PyPI | altair-data-server | ==0.4.1 | pyproject.toml |
| PyPI | altair-saver | ==0.5.0 | pyproject.toml |
| PyPI | altair-viewer | ==0.4.0 | pyproject.toml |
| PyPI | biopython | ==1.84 | pyproject.toml |
| PyPI | cobra | ==0.29.0 | pyproject.toml |
| PyPI | matplotlib | ==3.9.0 | pyproject.toml |
| PyPI | multiprocess | ==0.70.16 | pyproject.toml |
| PyPI | networkx | ==3.3 | pyproject.toml |
| PyPI | numpy | ==1.26.4 | pyproject.toml |
| PyPI | openpyxl | ==3.1.2 | pyproject.toml |
| PyPI | pandas | ==2.2.2 | pyproject.toml |
| PyPI | requests | ==2.32.2 | pyproject.toml |
| PyPI | scipy | ==1.11.4 | pyproject.toml |
| PyPI | statsmodels | ==0.14.2 | pyproject.toml |
| PyPI | tqdm | ==4.66.4 | pyproject.toml |
| PyPI | urllib3 | ==2.2.1 | pyproject.toml |
| PyPI | vl-convert-python | ==1.4.0 | pyproject.toml |
| PyPI | XlsxWriter | ==3.2.0 | pyproject.toml |
Усі залежності не зібрано
Не вдалося зібрати розв'язаний набір залежностей для цього звіту: GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository
Сповіщення про залежності 4
Встановлення pypi:wasp-proteins-annotation@2.0 тягне 79 пакетів, прямих і транзитивних: 4 мають відомі сповіщення, з них 3 — прямі залежності.
| Пакет | Версія | Зв'язок | Критичність | Сповіщень | Виправлено в |
|---|---|---|---|---|---|
| urllib3 | 2.2.1 | пряма | висока | 14 | 2.7.0 |
| biopython | 1.84.0 | пряма | помірна | 2 | 1.87 |
| requests | 2.32.2 | пряма | помірна | 4 | 2.33.0 |
| diskcache | 5.6.3 | непряма | помірна | 2 | — |
Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.
Звіт у форматі JSON машиночитний
Зворотний зв’язок
Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.