Library for mass spectrometry projects
smith-chem-wisc/mzLib має індекс здоров’я 84 зі 100, що відповідає смузі «Відмінний». Найвищий показник — Vitality (94/100), найнижчий — Community & Adoption (59/100). Останнє оновлення — сьогодні. Більшість нещодавньої роботи виконують 3 учасники.
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 71 калібровано до 84 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
| 36/36 | Свіжість push — останній push 0 дн. тому |
| 26.3/36 | Ритм комітів — 38/52 тижнів із комітами |
| 18/18 | Обсяг комітів — 122 комітів за останній рік |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| commits_last_year | 122 |
| human_commit_share | 0,98 |
| days_since_last_push | 0 |
| active_weeks_last_year | 38 |
| 27/27 | Випускає релізи — опубліковано 67 релізів |
| 36/36 | Свіжість релізів — останній реліз 22 дн. тому |
| 27/27 | Ритм релізів — реліз кожні ~15,6 дн. |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних |
| releases_count | 67 |
| latest_release_tag | 1.0.583 |
| releases_from_tags | ні |
| days_since_latest_release | 22 |
| mean_days_between_releases | 15,6 |
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
| 23.2/60 | Зірки — 28 зірок |
| 13.4/25 | Форки — 42 форків |
| 0/15 | Спостерігачі — 1 спостерігачів |
| forks | 42 |
| stars | 28 |
| watchers | 1 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Ліцензія — визнана ліцензія (LGPL-3.0) |
| 18/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 13.5/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | 4 |
| has_contributing | так |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | так |
| readme_badge_services | codecov.io, github.com, shields.io |
| has_pull_request_template | ні |
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
| 36/54 | Бас-фактор — на 3 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 17.3/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 23% комітів |
| 13.5/13.5 | Широта контриб’юторів — 24 контриб’юторів |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 7 contributing companies or organizations |
| bus_factor | 3 |
| contributors_sampled | 24 |
| top_contributor_share | 0,233 |
| 18.9/42 | Вирішення issue — закрито 45% issue |
| 24.2/30 | Прийняття PR — злито 760/943 вирішених PR |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка |
| 13.5/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 29/30 approved changesets -- score normalized to 9 |
| merged_prs | 760 |
| open_issues | 72 |
| closed_issues | 59 |
| prs_merged_7d | 4 |
| prs_decided_7d | 4 |
| prs_merged_30d | 26 |
| prs_decided_30d | 29 |
| issue_closed_ratio | 0,45 |
| closed_unmerged_prs | 183 |
| first_time_authors_30d | 0 |
| first_time_prs_merged_30d | 0 |
| first_time_prs_decided_30d | 0 |
| 30/30 | Підтримка власника — у власності організації |
| 0/20 | Верифікований домен — статус підтвердженого домену для цієї організації не зчитано |
| 8/25 | Охоплення власника — 12 підписників у smith-chem-wisc |
| 24/25 | Послужний список — 43 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~10 р. |
| followers | 12 |
| owner_type | Organization |
| is_verified | — |
| owner_login | smith-chem-wisc |
| public_repos | 43 |
| account_age_days | 3 909 |
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
| 24/24 | Процеси CI — 2 процес(ів) CI |
| 24/24 | Наявні тести |
| 0/16 | Конфігурація лінтера |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 16/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 24 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 8 |
| has_ci | так |
| has_tests | так |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | ні |
| has_precommit_config | ні |
| 30/30 | README |
| 0/25 | Каталог документації |
| 0/15 | Сайт документації / домашня сторінка |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 10/10 | Теми — 8 тем |
| 10/10 | Wiki |
| topics | mass-spectrometry, chemical-formulas, isotopes, chemistry, spectra-files, proteogenomics, proteomics-data, mass-spectrometry-data |
| has_wiki | так |
| homepage | — |
| docs_site | — |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | ні |
| has_description | так |
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
| 0/7.5 | Binary-Artifacts — binaries present in source code |
| 0/7.5 | Branch-Protection — немає даних |
| 2/2.5 | CI-Tests — 24 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 8 |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 6.8/7.5 | Code-Review — Found 29/30 approved changesets -- score normalized to 9 |
| 2.5/2.5 | Contributors — project has 7 contributing companies or organizations |
| 10/10 | Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected |
| 7.5/7.5 | Dependency-Update-Tool — update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 7.5/7.5 | Maintained — 30 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| 5/5 | Packaging — packaging workflow detected |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0/5 | SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — немає даних |
| 0/7.5 | Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 7.5/7.5 | Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected |
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 16 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 2 |
| scorecard_aggregate | 5,7 |
| 17.6/35 | Прямі залежності без відомих сповіщень — уражено 1: OpenMcdf 2.3.1 (moderate 6.2) |
| 0/25 | Непрямі залежності без відомих сповіщень — транзитивний набір не відокремлюється від залежностей розробки й тестування в цьому обсязі |
| 34.6/40 | Немає задавнених сповіщень — 1 пакет(ів) зі сповіщеннями без реакції понад 90 дн.; найдавніше опубліковано 106 дн. тому |
| source | osv |
| advisories | 2 |
| affected_packages | 1 |
| assessed_packages | 30 |
| unassessed_packages | 0 |
| affected_by_severity | moderate 1 |
| direct_affected_packages | 1 |
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
| 0/45 | Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 40/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 92 з 98 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
| has_llms_txt | ні |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,939 |
| agent_instruction_files | — |
| agent_instruction_max_bytes | — |
| 12.6/18 | Розгортання однією командою — mzLib/BayesianEstimation/BayesianEstimation.csproj, mzLib/Chemistry/Chemistry.csproj, mzLib/Chromatography/Chromatography.csproj (домовленість інструментарію, без раннера задач) |
| 22/22 | Автоматизовані тести |
| 0/11 | Конфігурація лінтера / форматера |
| 11/11 | Статична перевірка типів — C# (статично типізована) |
| 0/10 | Відтворюване середовище |
| 10/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — 31 з останніх 100 комітів створено агентом або з його зазначенням |
| 8/8 | Автоматизоване супроводження — 2 з останніх 100 комітів — автоматичні оновлення залежностей |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| has_nix | ні |
| has_tests | так |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | ні |
| typed_language | так |
| bootstrap_files | — |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | ні |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0,31 |
| toolchain_manifests | mzLib/BayesianEstimation/BayesianEstimation.csproj, mzLib/Chemistry/Chemistry.csproj, mzLib/Chromatography/Chromatography.csproj, mzLib/Development/Development.csproj, mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj, mzLib/MassSpectrometry/MassSpectrometry.csproj, mzLib/MzIdentML/MzIdentML.csproj, mzLib/MzLibUtil/MzLibUtil.csproj, mzLib/Omics/Omics.csproj, mzLib/PredictionClients/PredictionClients.csproj, mzLib/Proteomics/Proteomics.csproj, mzLib/Quantification/Quantification.csproj, mzLib/Readers/Readers.csproj, mzLib/SpectralAveraging/SpectralAveraging.csproj, mzLib/Test/Test.csproj, mzLib/Transcriptomics/Transcriptomics.csproj, mzLib/UsefulProteomicsDatabases/UsefulProteomicsDatabases.csproj, mzLib/mzPlot/mzPlot.csproj, mzLib/pepXML/pepXML.csproj |
| dependency_bot_commit_share | 0,02 |
| 45/45 | Типізований код — C# (статично типізована) |
| 53.5/55 | Керовані розміри файлів — 23/829 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
| primary_language | C# |
| largest_source_bytes | 192 727 |
| source_files_sampled | 829 |
| oversized_source_files | 23 |
Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.
Кожна точка охоплює 9 днів.
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 0 | Binary-Artifacts | binaries present in source code |
| н/д | Branch-Protection | internal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md |
| 8 | CI-Tests | 24 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 8 |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 9 | Code-Review | Found 29/30 approved changesets -- score normalized to 9 |
| 10 | Contributors | project has 7 contributing companies or organizations |
| 10 | Dangerous-Workflow | no dangerous workflow patterns detected |
| 10 | Dependency-Update-Tool | update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 10 | Maintained | 30 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| 10 | Packaging | packaging workflow detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0 | SAST | SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| н/д | Signed-Releases | no releases found |
| 0 | Token-Permissions | detected GitHub workflow tokens with excessive permissions |
| 10 | Vulnerabilities | 0 existing vulnerabilities detected |
| Реєстр | Пакет | Обмеження версії | Маніфест |
|---|---|---|---|
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/BayesianEstimation/BayesianEstimation.csproj |
| NuGet | MathNet.Numerics | 5.0.0 | mzLib/BayesianEstimation/BayesianEstimation.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/Chemistry/Chemistry.csproj |
| NuGet | libtorch-cpu | 2.5.1 | mzLib/Chromatography/Chromatography.csproj |
| NuGet | TorchSharp | 0.105.1 | mzLib/Chromatography/Chromatography.csproj |
| NuGet | BenchmarkDotNet | 0.15.8 | mzLib/Development/Development.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/Development/Development.csproj |
| NuGet | Microsoft.NET.Test.Sdk | 17.10.0 | mzLib/Development/Development.csproj |
| NuGet | NUnit | 4.1.0 | mzLib/Development/Development.csproj |
| NuGet | NUnit3TestAdapter | 4.5.0 | mzLib/Development/Development.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj |
| NuGet | MathNet.Numerics | 5.0.0 | mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj |
| NuGet | Microsoft.ML | 3.0.1 | mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj |
| NuGet | Microsoft.ML.FastTree | 3.0.1 | mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj |
| NuGet | NetSerializer | 4.1.2 | mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj |
| NuGet | SharpLearning.Optimization | [0.28.0] | mzLib/FlashLFQ/FlashLFQ.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/MassSpectrometry/MassSpectrometry.csproj |
| NuGet | MathNet.Numerics | 5.0.0 | mzLib/MassSpectrometry/MassSpectrometry.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/MzIdentML/MzIdentML.csproj |
| NuGet | Easy.Common | 6.7.0 | mzLib/MzLibUtil/MzLibUtil.csproj |
| NuGet | MathNet.Numerics | 5.0.0 | mzLib/MzLibUtil/MzLibUtil.csproj |
| NuGet | Microsoft.Extensions.ObjectPool | 9.0.0 | mzLib/MzLibUtil/MzLibUtil.csproj |
| NuGet | Microsoft.Win32.Registry | 5.0.0 | mzLib/MzLibUtil/MzLibUtil.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/Omics/Omics.csproj |
| NuGet | Newtonsoft.Json | 13.0.4 | mzLib/PredictionClients/PredictionClients.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/Proteomics/Proteomics.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | OpenMcdf | 2.3.1 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | OpenMcdf.Extensions | 2.3.1 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | System.Data.SQLite | 1.0.118 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | System.Runtime.InteropServices | 4.3.0 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | TopDownProteomics | 0.0.299 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | ZstdSharp.Port | 0.8.7 | mzLib/Readers/Readers.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/SpectralAveraging/SpectralAveraging.csproj |
| NuGet | MathNet.Numerics | 5.0.0 | mzLib/SpectralAveraging/SpectralAveraging.csproj |
| NuGet | Nett | 0.15.0 | mzLib/SpectralAveraging/SpectralAveraging.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/Transcriptomics/Transcriptomics.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/UsefulProteomicsDatabases/UsefulProteomicsDatabases.csproj |
| NuGet | Newtonsoft.Json | 13.0.4 | mzLib/UsefulProteomicsDatabases/UsefulProteomicsDatabases.csproj |
| NuGet | TopDownProteomics | 0.0.299 | mzLib/UsefulProteomicsDatabases/UsefulProteomicsDatabases.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/mzPlot/mzPlot.csproj |
| NuGet | OxyPlot.Wpf | 2.0.0 | mzLib/mzPlot/mzPlot.csproj |
| NuGet | SharpLearning.Optimization | 0.28.0 | mzLib/mzPlot/mzPlot.csproj |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | mzLib/pepXML/pepXML.csproj |
Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 27 прямих і 3 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.
| Реєстр | Пакет | Версія | Зв'язок |
|---|---|---|---|
| NuGet | BenchmarkDotNet | 0.15.8 | пряма |
| NuGet | CsvHelper | 32.0.3 | пряма |
| NuGet | Easy.Common | 6.7.0 | пряма |
| NuGet | libtorch-cpu | 2.5.1 | пряма |
| NuGet | MathNet.Numerics | 5.0.0 | пряма |
| NuGet | Microsoft.Extensions.ObjectPool | 9.0.0 | пряма |
| NuGet | Microsoft.ML | 2.0.0 | пряма |
| NuGet | Microsoft.ML | 3.0.1 | пряма |
| NuGet | Microsoft.ML.FastTree | 2.0.0 | пряма |
| NuGet | Microsoft.ML.FastTree | 3.0.1 | пряма |
| NuGet | Microsoft.NET.Test.Sdk | 17.10.0 | пряма |
| NuGet | Microsoft.Win32.Registry | 5.0.0 | пряма |
| NuGet | NetSerializer | 4.1.1 | пряма |
| NuGet | NetSerializer | 4.1.2 | пряма |
| NuGet | Nett | 0.15.0 | пряма |
| NuGet | Newtonsoft.Json | 13.0.4 | пряма |
| NuGet | NUnit | 4.1.0 | пряма |
| NuGet | NUnit3TestAdapter | 4.5.0 | пряма |
| NuGet | OpenMcdf | 2.3.1 | пряма |
| NuGet | OpenMcdf.Extensions | 2.3.1 | пряма |
| NuGet | OxyPlot.Wpf | 2.0.0 | пряма |
| NuGet | SharpLearning.Optimization | 0.28.0 | пряма |
| NuGet | System.Data.SQLite | 1.0.118 | пряма |
| NuGet | System.Runtime.InteropServices | 4.3.0 | пряма |
| NuGet | TopDownProteomics | 0.0.299 | пряма |
| NuGet | TorchSharp | 0.105.1 | пряма |
| NuGet | ZstdSharp.Port | 0.8.7 | пряма |
| NuGet | Google.Protobuf | 3.28.3 | непряма |
| NuGet | SharpZipLib | 1.4.2 | непряма |
| NuGet | SkiaSharp | 2.88.9 | непряма |
Цей репозиторій не публікує пакета, який розпізнає індекс, тож оцінено його власний граф залежностей — 30 пакетів, серед яких є й піниї розробки та тестування, що ніколи не постачаються: 1 мають відомі сповіщення, з них 1 прямі.
| Пакет | Версія | Зв'язок | Критичність | Сповіщень | Виправлено в |
|---|---|---|---|---|---|
| OpenMcdf | 2.3.1 | пряма | помірна | 2 | 3.1.4 |
Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.
Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.31.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика.