Усі теги
Тег каталогу

#nextflow

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

7 записів
З тегом «nextflow»Упорядковано за індексом здоров'я
npm
91Відміннийіндекс здоров'я
nvuillam/npm-groovy-lint
Lint, format and auto-fix your Groovy / Jenkinsfile / Gradle files using command line
JavaScript · Groovy★ 247↓ 115.4K/міс15 вер. 2026 р.
MIT15 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
77Добрийіндекс здоров'я
EBI-Metagenomics/assembly-analysis-pipeline
MGnify Assembly Analysis Pipeline
JavaScript · Nextflow★ 111 вер. 2026 р.
Apache-2.011 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
75Добрийіндекс здоров'я
CDCgov/tostadas
🧬 💻 TOSTADAS → Toolkit for Open Sequence Triage, Annotation and DAtabase Submission
Python · Nextflow · Batchfile★ 2911 вер. 2026 р.
Apache-2.011 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
67Добрийіндекс здоров'я
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 2↓ 1 094/міс21 жовт. 2026 р.
Apache-2.021 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
62Помірнийіндекс здоров'я
bactopia/bactopia
A flexible pipeline for complete analysis of bacterial genomes
Nextflow★ 52319 жовт. 2026 р.
MIT19 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
45Слабкийіндекс здоров'я
edmundmiller/nextflow-mode
Emacs major mode for Nextflow
Emacs Lisp★ 2618 жовт. 2026 р.
GPL-3.018 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
38Слабкийіндекс здоров'я
beiko-lab/arete
AMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflow
Python · Nextflow★ 2810 вер. 2026 р.
MIT10 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0