PyPI
biopython/biopython
Official git repository for Biopython (originally converted from CVS)
自定义许可证2026年8月28日 · 指标 2.10.0
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#protein-structure
公开记录中带有此标签的全部仓库——标签来自其 GitHub 主题或软件包注册表发布的关键词。健康度量遵循与记录其余部分相同的版本化方法论。
24 条记录
PyPI
BradyAJohnston/MolecularNodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
GPL-3.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
project-gemmi/gemmi
macromolecular crystallography library and utilities
MPL-2.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
haddocking/protein-detective
Python package to detect proteins in EM density maps.
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
abhishektiwari/hbat
HBAT 2: A Python Package to analyse Hydrogen Bonds and Other Non-covalent Interactions in Macromolecular Structures https://hbat-web.abhishek-tiwari.com
MIT2026年9月16日 · 指标 2.10.0
PyPI
sokrypton/ColabFold
Making Protein folding accessible to all!
MIT2026年9月10日 · 指标 2.10.0
PyPI
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
MIT2026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
BSD-3-Clause2026年9月12日 · 指标 2.10.0
—
BioJulia/BioStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
自定义许可证2026年9月10日 · 指标 2.10.0
PyPI
jwohlwend/boltz
Official repository for the Boltz biomolecular interaction models
MIT2026年8月28日 · 指标 2.10.0
PyPI
PDB-REDO/libcifpp
Library containing code to manipulate mmCIF and PDB files
BSD-2-Clause2026年10月18日 · 指标 2.10.0
PyPI
amckenna41/protPy
Calculating a range of protein descriptors using their physicochemical, biological and structural properties 🔬.
MIT2026年10月19日 · 指标 2.10.0
PyPI
mooreneural/ProteinTensor
AI-native tensor format (.ptt) for structural biology ML. Convert a protein/nucleic-acid/ligand structure or sequence once; load backbone, MSA, ESM embeddings, sparse pair features, and ligand pockets with zero parsing. Feeds Boltz-2 (verified), AlphaFold 3, Chai-1, Nesso. Zarr-backed, PyTorch/JAX, streams from S3/GCS.
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
a-r-j/ProteinWorkshop
Benchmarking framework for protein representation learning. Includes a large number of pre-training and downstream task datasets, models and training/task utilities. (ICLR 2024)
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
npm
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
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kliment-olechnovic/voronota
Voronota is a software tool for analyzing three-dimensional structures of biological macromolecules using the Voronoi diagram of atomic balls.
MIT2026年10月18日 · 指标 2.10.0
crates.io
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
MIT2026年9月10日 · 指标 2.10.0
PyPI
a-r-j/CPDB
Cython implementation of PDB -> DataFrame parsing
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
AMarinhoSN/FleXgeo2
Compute differential geometry descriptors for protein conformational ensembles
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
ShintaroMinami/PyDSSP
A simplified implementation of DSSP algorithm for PyTorch and NumPy
MIT2026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
该仓库未发布描述。
MIT2026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
samberry19/bioviper
Enhancements to Biopython for working with biological data
MIT2026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
SBRG/ssbio
A Python framework for structural systems biology
MIT2026年9月9日 · 指标 2.10.0