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#molecular-dynamics

Alle Repositories im öffentlichen Register, die dieses Tag tragen — aus ihren GitHub-Topics oder den von ihren Paket-Registries veröffentlichten Schlagwörtern. Die Gesundheit wird nach derselben versionierten Methodik gemessen wie im übrigen Register.

14 Einträge
Getaggt als „molecular-dynamics“Geordnet nach Gesundheitsindex
PyPI
81GutGesundheitsindex
MDAnalysis/mdanalysis
MDAnalysis is a Python library to analyze molecular dynamics simulations.
Python★ 1.610↓ 219.6K/Monat21. Juli 2026
Eigene Lizenz21. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
79GutGesundheitsindex
glotzerlab/freud
Powerful, efficient particle trajectory analysis in scientific Python.
C++ · Python★ 324↓ 8.442/Monat22. Juli 2026
BSD-3-Clause22. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
78GutGesundheitsindex
deepmodeling/abacus-develop
An electronic structure package based on either plane wave basis or numerical atomic orbitals.
C++★ 28020. Juli 2026
LGPL-3.020. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
77GutGesundheitsindex
mosdef-hub/mbuild
A hierarchical, component based molecule builder
Python★ 221↓ 3.105/Monat20. Juli 2026
Eigene Lizenz20. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
72GutGesundheitsindex
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1.31715. Juli 2026
GPL-3.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
67MittelGesundheitsindex
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3.758/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
63MittelGesundheitsindex
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 117. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
63MittelGesundheitsindex
m3g/Packmol
Packmol - Initial configurations for molecular dynamics simulations
Fortran · Tcl★ 36217. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
63MittelGesundheitsindex
marcello-sega/pytim
a python package for the interfacial analysis of molecular simulations
Python★ 98↓ 0/Monat14. Juli 2026
GPL-3.014. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
crates.io · PyPI
60MittelGesundheitsindex
molcrafts/molrs
[WIP] Molcrafts rust kernel
Rust★ 0↓ 76/Monat15. Juli 2026
BSD-3-Clause15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
50MittelGesundheitsindex
pytraj/pytraj
Python interface of cpptraj
Jupyter Notebook · Python★ 19115. Juli 2026
Eigene Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
48GefährdetGesundheitsindex
elkins-lab/synth-dynamics
Fast Langevin dynamics engine using the Anisotropic Network Model (ANM) for rapid protein conformational ensemble generation.
Python · Shell★ 117. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
crates.io
43GefährdetGesundheitsindex
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 217. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
36GefährdetGesundheitsindex
usnistgov/atomman
Atomistic Manipulation Toolkit
Python★ 96↓ 2.670/Monat17. Juli 2026
Eigene Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0