Усі теги
Тег каталогу

#molecular-dynamics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

14 записів
З тегом «molecular-dynamics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
81Добрийіндекс здоров'я
MDAnalysis/mdanalysis
MDAnalysis is a Python library to analyze molecular dynamics simulations.
Python★ 1 610↓ 219.6K/міс21 лип. 2026 р.
Власна ліцензія21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
79Добрийіндекс здоров'я
glotzerlab/freud
Powerful, efficient particle trajectory analysis in scientific Python.
C++ · Python★ 324↓ 8 442/міс22 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause22 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
deepmodeling/abacus-develop
An electronic structure package based on either plane wave basis or numerical atomic orbitals.
C++★ 28020 лип. 2026 р.
LGPL-3.020 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
77Добрийіндекс здоров'я
mosdef-hub/mbuild
A hierarchical, component based molecule builder
Python★ 221↓ 3 105/міс20 лип. 2026 р.
Власна ліцензія20 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
72Добрийіндекс здоров'я
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1 31715 лип. 2026 р.
GPL-3.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
67Помірнийіндекс здоров'я
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3 758/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
m3g/Packmol
Packmol - Initial configurations for molecular dynamics simulations
Fortran · Tcl★ 36217 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
marcello-sega/pytim
a python package for the interfacial analysis of molecular simulations
Python★ 98↓ 0/міс14 лип. 2026 р.
GPL-3.014 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io · PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
molcrafts/molrs
[WIP] Molcrafts rust kernel
Rust★ 0↓ 76/міс15 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
50Помірнийіндекс здоров'я
pytraj/pytraj
Python interface of cpptraj
Jupyter Notebook · Python★ 19115 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-dynamics
Fast Langevin dynamics engine using the Anisotropic Network Model (ANM) for rapid protein conformational ensemble generation.
Python · Shell★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 217 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
36У зоні ризикуіндекс здоров'я
usnistgov/atomman
Atomistic Manipulation Toolkit
Python★ 96↓ 2 670/міс17 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0