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#molecular-dynamics

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

14 registros
Con la etiqueta «molecular-dynamics»Ordenado por índice de salud
PyPI
81Buenoíndice de salud
MDAnalysis/mdanalysis
MDAnalysis is a Python library to analyze molecular dynamics simulations.
Python★ 1610↓ 219.6K/mes21 jul 2026
Licencia propia21 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
79Buenoíndice de salud
glotzerlab/freud
Powerful, efficient particle trajectory analysis in scientific Python.
C++ · Python★ 324↓ 8442/mes22 jul 2026
BSD-3-Clause22 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
78Buenoíndice de salud
deepmodeling/abacus-develop
An electronic structure package based on either plane wave basis or numerical atomic orbitals.
C++★ 28020 jul 2026
LGPL-3.020 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
77Buenoíndice de salud
mosdef-hub/mbuild
A hierarchical, component based molecule builder
Python★ 221↓ 3105/mes20 jul 2026
Licencia propia20 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
72Buenoíndice de salud
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 131715 jul 2026
GPL-3.015 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
67Moderadoíndice de salud
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3758/mes15 jul 2026
MIT15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
63Moderadoíndice de salud
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
63Moderadoíndice de salud
m3g/Packmol
Packmol - Initial configurations for molecular dynamics simulations
Fortran · Tcl★ 36217 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
63Moderadoíndice de salud
marcello-sega/pytim
a python package for the interfacial analysis of molecular simulations
Python★ 98↓ 0/mes14 jul 2026
GPL-3.014 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io · PyPI
60Moderadoíndice de salud
molcrafts/molrs
[WIP] Molcrafts rust kernel
Rust★ 0↓ 76/mes15 jul 2026
BSD-3-Clause15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
50Moderadoíndice de salud
pytraj/pytraj
Python interface of cpptraj
Jupyter Notebook · Python★ 19115 jul 2026
Licencia propia15 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
48En riesgoíndice de salud
elkins-lab/synth-dynamics
Fast Langevin dynamics engine using the Anisotropic Network Model (ANM) for rapid protein conformational ensemble generation.
Python · Shell★ 117 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
crates.io
43En riesgoíndice de salud
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 217 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 1.13.0
PyPI
36En riesgoíndice de salud
usnistgov/atomman
Atomistic Manipulation Toolkit
Python★ 96↓ 2670/mes17 jul 2026
Licencia propia17 jul 2026 · métricas 1.13.0