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#molecular-dynamics

公开记录中带有此标签的全部仓库——标签来自其 GitHub 主题或软件包注册表发布的关键词。健康度量遵循与记录其余部分相同的版本化方法论。

14 条记录
标签为“molecular-dynamics”按健康指数排序
PyPI
81良好健康指数
MDAnalysis/mdanalysis
MDAnalysis is a Python library to analyze molecular dynamics simulations.
Python★ 1,610↓ 219.6K/月2026年7月21日
自定义许可证2026年7月21日 · 指标 1.13.0
PyPI
79良好健康指数
glotzerlab/freud
Powerful, efficient particle trajectory analysis in scientific Python.
C++ · Python★ 324↓ 8,442/月2026年7月22日
BSD-3-Clause2026年7月22日 · 指标 1.13.0
PyPI
78良好健康指数
deepmodeling/abacus-develop
An electronic structure package based on either plane wave basis or numerical atomic orbitals.
C++★ 2802026年7月20日
LGPL-3.02026年7月20日 · 指标 1.13.0
PyPI
77良好健康指数
mosdef-hub/mbuild
A hierarchical, component based molecule builder
Python★ 221↓ 3,105/月2026年7月20日
自定义许可证2026年7月20日 · 指标 1.13.0
PyPI
72良好健康指数
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1,3172026年7月15日
GPL-3.02026年7月15日 · 指标 1.13.0
PyPI
67中等健康指数
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3,758/月2026年7月15日
MIT2026年7月15日 · 指标 1.13.0
PyPI
63中等健康指数
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 12026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 1.13.0
PyPI
63中等健康指数
m3g/Packmol
Packmol - Initial configurations for molecular dynamics simulations
Fortran · Tcl★ 3622026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 1.13.0
PyPI
63中等健康指数
marcello-sega/pytim
a python package for the interfacial analysis of molecular simulations
Python★ 98↓ 0/月2026年7月14日
GPL-3.02026年7月14日 · 指标 1.13.0
crates.io · PyPI
60中等健康指数
molcrafts/molrs
[WIP] Molcrafts rust kernel
Rust★ 0↓ 76/月2026年7月15日
BSD-3-Clause2026年7月15日 · 指标 1.13.0
PyPI
50中等健康指数
pytraj/pytraj
Python interface of cpptraj
Jupyter Notebook · Python★ 1912026年7月15日
自定义许可证2026年7月15日 · 指标 1.13.0
PyPI
48存在风险健康指数
elkins-lab/synth-dynamics
Fast Langevin dynamics engine using the Anisotropic Network Model (ANM) for rapid protein conformational ensemble generation.
Python · Shell★ 12026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 1.13.0
crates.io
43存在风险健康指数
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 22026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 1.13.0
PyPI
36存在风险健康指数
usnistgov/atomman
Atomistic Manipulation Toolkit
Python★ 96↓ 2,670/月2026年7月17日
自定义许可证2026年7月17日 · 指标 1.13.0