PyPI
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
Eigene Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
Alle Tags
Katalog-Tag
#rna-seq
Alle Repositories im öffentlichen Register, die dieses Tag tragen — aus ihren GitHub-Topics oder den von ihren Paket-Registries veröffentlichten Schlagwörtern. Die Gesundheit wird nach derselben versionierten Methodik gemessen wie im übrigen Register.
12 Einträge
PyPI
helicalAI/helical
A framework for state-of-the-art pre-trained bio foundation models on genomics and transcriptomics modalities.
AGPL-3.022. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io · npm
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
BSD-3-Clause16. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
MIT2. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
BSD-3-Clause22. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
CDCgov/tostadas
🧬 💻 TOSTADAS → Toolkit for Open Sequence Triage, Annotation and DAtabase Submission
Apache-2.018. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · npm
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Apache-2.05. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · Go
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Eigene Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io
COMBINE-lab/piscem
Mapping sequencing data to De Bruijn graphs, fast
BSD-3-Clause22. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
Maven
GenomiqueENS/eoulsan
A pipeline and a framework for NGS analysis (RNA-seq and scRNA-seq)
Eigene Lizenz16. Aug. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
edgardomortiz/Captus
Assembly of Phylogenomic Datasets from High-Throughput Sequencing data
GPL-3.028. Juli 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · npm
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
MIT17. Juli 2026 · Metriken 2.10.0