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#rna-seq

Alle Repositories im öffentlichen Register, die dieses Tag tragen — aus ihren GitHub-Topics oder den von ihren Paket-Registries veröffentlichten Schlagwörtern. Die Gesundheit wird nach derselben versionierten Methodik gemessen wie im übrigen Register.

13 Einträge
Getaggt als „rna-seq“Geordnet nach Gesundheitsindex
PyPI
87ExzellentGesundheitsindex
ablab/IsoQuant
A universal toolkit for upstream processing of long RNA reads
Python★ 23910. Sept. 2026
Eigene Lizenz10. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io · npm
84ExzellentGesundheitsindex
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
Rust★ 930↓ 1.792/Monat8. Sept. 2026
BSD-3-Clause8. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
81ExzellentGesundheitsindex
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
Python · R★ 661↓ 285/Monat15. Sept. 2026
MIT15. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
78GutGesundheitsindex
helicalAI/helical
A framework for state-of-the-art pre-trained bio foundation models on genomics and transcriptomics modalities.
Python★ 234↓ 999/Monat20. Okt. 2026
AGPL-3.020. Okt. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
75GutGesundheitsindex
CDCgov/tostadas
🧬 💻 TOSTADAS → Toolkit for Open Sequence Triage, Annotation and DAtabase Submission
Python · Nextflow · Batchfile★ 2911. Sept. 2026
Apache-2.011. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · Go
71GutGesundheitsindex
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 45↓ 765/Monat8. Sept. 2026
Eigene Lizenz8. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
69GutGesundheitsindex
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
Rust★ 68↓ 41/Monat20. Okt. 2026
BSD-3-Clause20. Okt. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · npm
67GutGesundheitsindex
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 2↓ 1.094/Monat21. Okt. 2026
Apache-2.021. Okt. 2026 · Metriken 2.10.0
crates.io
63MittelGesundheitsindex
COMBINE-lab/piscem
Mapping sequencing data to De Bruijn graphs, fast
Rust · Shell★ 38↓ 22/Monat20. Okt. 2026
BSD-3-Clause20. Okt. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI
45SchwachGesundheitsindex
edgardomortiz/Captus
Assembly of Phylogenomic Datasets from High-Throughput Sequencing data
Python★ 4514. Sept. 2026
GPL-3.014. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
Maven
42SchwachGesundheitsindex
GenomiqueENS/eoulsan
A pipeline and a framework for NGS analysis (RNA-seq and scRNA-seq)
Java★ 5618. Sept. 2026
Eigene Lizenz18. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
PyPI · npm
36SchwachGesundheitsindex
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
TypeScript★ 1↓ 64/Monat9. Sept. 2026
MIT9. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0
npm
17KritischGesundheitsindex
Uauy-Lab/biojs-vis-expression-bar
Keine Repository-Beschreibung veröffentlicht.
JavaScript★ 2↓ 170/Monat9. Sept. 2026
MIT9. Sept. 2026 · Metriken 2.10.0