Усі теги
Тег каталогу

#rna-seq

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

7 записів
З тегом «rna-seq»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
73Добрийіндекс здоров'я
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
Python★ 23317 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
70Добрийіндекс здоров'я
helicalAI/helical
A framework for state-of-the-art pre-trained bio foundation models on genomics and transcriptomics modalities.
Python★ 221↓ 0/міс13 лип. 2026 р.
AGPL-3.013 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io · npm
67Помірнийіндекс здоров'я
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
Rust★ 91816 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause16 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
61Помірнийіндекс здоров'я
CDCgov/tostadas
🧬 💻 TOSTADAS → Toolkit for Open Sequence Triage, Annotation and DAtabase Submission
Python · Nextflow · Batchfile★ 2918 лип. 2026 р.
Apache-2.018 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · Go
60Помірнийіндекс здоров'я
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
Python★ 4215 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
58Помірнийіндекс здоров'я
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Python · TypeScript★ 0↓ 0/міс14 лип. 2026 р.
Apache-2.014 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
40У зоні ризикуіндекс здоров'я
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
Опис репозиторію не опубліковано.
TypeScript★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0