PyPI
ablab/IsoQuant
Transcript discovery and quantification with long RNA reads (Nanopores and PacBio)
自定义许可证2026年7月17日 · 指标 2.10.0
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#rna-seq
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12 条记录
PyPI
helicalAI/helical
A framework for state-of-the-art pre-trained bio foundation models on genomics and transcriptomics modalities.
AGPL-3.02026年8月22日 · 指标 2.10.0
crates.io · npm
COMBINE-lab/salmon
🐟 🍣 🍱 Highly-accurate & wicked fast transcript-level quantification from RNA-seq reads using selective alignment
BSD-3-Clause2026年7月16日 · 指标 2.10.0
PyPI
cafferychen777/mLLMCelltype
Cell type annotation for single-cell RNA-seq using multi-LLM consensus
MIT2026年8月2日 · 指标 2.10.0
crates.io · npm · PyPI
COMBINE-lab/simpleaf
A rust framework to make using alevin-fry even simpler
BSD-3-Clause2026年8月22日 · 指标 2.10.0
PyPI
CDCgov/tostadas
🧬 💻 TOSTADAS → Toolkit for Open Sequence Triage, Annotation and DAtabase Submission
Apache-2.02026年7月18日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
haqaliz/contig
An agentic bioinformatics analyst: it runs the analysis on your own compute, self-heals failures, verifies the output, and returns a reproducible result.
Apache-2.02026年9月5日 · 指标 2.10.0
PyPI · Go
the-omics-os/lobster
The self-evolving agentic framework for bioinformatics
自定义许可证2026年7月15日 · 指标 2.10.0
crates.io
COMBINE-lab/piscem
Mapping sequencing data to De Bruijn graphs, fast
BSD-3-Clause2026年8月22日 · 指标 2.10.0
Maven
GenomiqueENS/eoulsan
A pipeline and a framework for NGS analysis (RNA-seq and scRNA-seq)
自定义许可证2026年8月16日 · 指标 2.10.0
PyPI
edgardomortiz/Captus
Assembly of Phylogenomic Datasets from High-Throughput Sequencing data
GPL-3.02026年7月28日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
smartsbio/smarts-bio-jupyterlab
该仓库未发布描述。
MIT2026年7月17日 · 指标 2.10.0