Biohub / esm
Biohub/esm tiene un índice de salud de 71 sobre 100, lo que lo sitúa en la banda Bueno. Su puntuación más alta es Vitality (77/100) y la más baja, Security (10/100). Se actualizó por última vez hace 3 días. 4 personas concentran la mayor parte del trabajo reciente.
Índice de salud del software
Las métricas se agrupan en categorías ponderadas sobre una escala estandarizada de 1 a 100. El resultado global parte de su media ponderada, calibrada contra la distribución del registro público para que las bandas tengan significado percentil; cuando la evidencia pública activa la Política de Jurisdicciones de Alto Riesgo, la calificación se ajusta y recibe un límite «En riesgo» de 34.
Perfil de puntuación
Cada eje es una categoría. La forma importa más que la media: un proyecto sano llena toda la figura, mientras que un perfil de picos y cráteres indica que la fortaleza en una dimensión enmascara el riesgo en otra.
El resultado global ponderado 63 se calibra a 71 en la escala publicada del índice (calibración del registro 2026-08-02).
Titularidad
Este repositorio está respaldado por una organización: una custodia compartida y responsable que puede sobrevivir a cualquier mantenedor individual.
Ecosistemas de paquetes
| Registro | Paquete | Versión | Descargas / mes | Versiones | Última publicación |
|---|---|---|---|---|---|
| PyPI | esm | 3.4.1.post1 | 27.748 | 27 | hace 38 días |
Métricas por categoría
Vitalidad
¿Está vivo el proyecto: se escribe código y se publican versiones?
Actividad de desarrollo
Cómo se puntúa
| 36/36 | Recencia de push — último push hace 3 días |
| 10.4/36 | Cadencia de commits — 15/52 semanas con commits |
| 13.6/18 | Volumen de commits — 32 commits en el último año |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — sin datos |
Datos de entrada utilizados
| commits_last_year | 32 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 3 |
| active_weeks_last_year | 15 |
Disciplina de publicación
Cómo se puntúa
| 27/27 | Publica versiones — 21 versiones publicadas |
| 36/36 | Recencia de las versiones — última versión hace 39 días |
| 19.8/27 | Cadencia de publicación — una versión cada ~62,2 días |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — sin datos |
Datos de entrada utilizados
| releases_count | 21 |
| latest_release_tag | v3.4.1.post1 |
| releases_from_tags | no |
| days_since_latest_release | 39 |
| mean_days_between_releases | 62,2 |
Comunidad y Adopción
¿Tiene el proyecto usuarios, descargas, atención y unas condiciones acogedoras para quienes contribuyen?
Popularidad y adopción
Cómo se puntúa
| 56.4/60 | Estrellas — 3004 estrellas |
| 21.7/25 | Forks — 403 forks |
| 8.9/15 | Observadores — 41 observadores |
Datos de entrada utilizados
| forks | 403 |
| stars | 3004 |
| watchers | 41 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Salud de la comunidad
Cómo se puntúa
| 22.5/22.5 | README |
| 16.9/22.5 | Licencia — archivo de licencia presente, no es una licencia reconocida |
| 0/18 | Guía CONTRIBUTING |
| 0/13.5 | Código de conducta |
| 0/7.2 | Plantilla de issues |
| 0/6.3 | Plantilla de PR |
Datos de entrada utilizados
| has_readme | sí |
| has_license | sí |
| readme_badges | 0 |
| has_contributing | no |
| has_issue_template | no |
| has_code_of_conduct | no |
| readme_badge_services | — |
| has_pull_request_template | no |
Sostenibilidad y Gobernanza
¿Sobrevivirá el proyecto a sus personas: factor bus, capacidad de respuesta, quién lo respalda y mantenimiento del paquete?
Resiliencia de mantenedores (factor bus)
Cómo se puntúa
| 43.2/54 | Factor bus — la mitad de los commits recae en 4 contribuyente(s) |
| 17.3/22.5 | Distribución de commits — el principal contribuyente firma el 23% de los commits |
| 13.5/13.5 | Amplitud de contribuyentes — 22 contribuyentes |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — sin datos |
Datos de entrada utilizados
| bus_factor | 4 |
| contributors_sampled | 22 |
| top_contributor_share | 0,23 |
Cómo se puntúa
| 31.3/42 | Resolución de issues — 75% de issues cerradas |
| 23.2/30 | Aceptación de PR — 95/123 PR decididos fusionados |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — ningún PR de un contribuyente primerizo decidido en 30 d |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — sin datos |
Datos de entrada utilizados
| merged_prs | 95 |
| open_issues | 65 |
| closed_issues | 191 |
| prs_merged_7d | 1 |
| prs_decided_7d | 1 |
| prs_merged_30d | 1 |
| prs_decided_30d | 2 |
| issue_closed_ratio | 0,746 |
| closed_unmerged_prs | 28 |
| first_time_authors_30d | 0 |
| first_time_prs_merged_30d | 0 |
| first_time_prs_decided_30d | 0 |
Propiedad y custodia
Cómo se puntúa
| 30/30 | Respaldo de la propiedad — propiedad de una organización |
| 0/20 | Dominio verificado |
| 15.1/25 | Alcance del propietario — 127 seguidores de Biohub |
| 9.5/25 | Trayectoria — 12 repos públicos, cuenta de ~0 años |
Datos de entrada utilizados
| followers | 127 |
| owner_type | Organization |
| is_verified | no |
| owner_login | Biohub |
| public_repos | 12 |
| account_age_days | 247 |
Mantenimiento de paquetes
Cómo se puntúa
| 25/25 | Publicado y resoluble — 1 paquete(s) en pypi |
| 35/35 | Recencia de publicación — última publicación hace 38 días |
| 20/20 | Historial de versiones — 27 versiones en el registro |
| 20/20 | No obsoleto — activo, ni obsoleto ni retirado |
Datos de entrada utilizados
| packages | esm |
| ecosystems | pypi |
| any_deprecated | no |
| min_days_since_publish | 38 |
Calidad de Ingeniería
¿Existen unas prácticas mínimas de ingeniería y documentación?
Prácticas de ingeniería
Cómo se puntúa
| 24/24 | Flujos de trabajo de CI — 2 flujo(s) de trabajo |
| 24/24 | Pruebas presentes |
| 16/16 | Configuración de linter — pyproject.toml ([tool.ruff], [tool.isort]) |
| 9.6/9.6 | Hooks de pre-commit |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 0/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — sin datos |
Datos de entrada utilizados
| has_ci | sí |
| has_tests | sí |
| has_editorconfig | no |
| has_linter_config | sí |
| has_precommit_config | sí |
Documentación
Cómo se puntúa
| 30/30 | README |
| 0/25 | Directorio de documentación |
| 0/15 | Sitio de documentación / página del proyecto |
| 0/10 | Descripción del repositorio |
| 0/10 | Topics |
| 10/10 | Wiki |
Datos de entrada utilizados
| topics | — |
| has_wiki | sí |
| homepage | — |
| docs_site | — |
| has_readme | sí |
| has_docs_dir | no |
| has_description | no |
Seguridad
¿Son sólidas las prácticas visibles de seguridad y de cadena de suministro, sin exposición jurisdiccional de alto riesgo sin resolver?
Postura de seguridad
Cómo se puntúa
| 0/30 | Política de seguridad (SECURITY.md) |
| 0/25 | Configuración de Dependabot |
| 0/25 | Lockfiles de dependencias — biblioteca publicada — los lockfiles son cosa de las aplicaciones, no se esperan aquí |
| 0/20 | Flujo de trabajo de CodeQL |
Datos de entrada utilizados
| source | file_signals |
| lockfiles | — |
| manifests | pyproject.toml |
| has_codeql_workflow | no |
| has_security_policy | no |
| has_dependabot_config | no |
Avisos de dependencias
Cómo se puntúa
| 7.2/35 | Dependencias directas libres de avisos conocidos — 2 afectados: transformers 4.57.6 (critical 9.6), torch 2.11.0 (moderate 5.3) |
| 12.8/25 | Dependencias indirectas libres de avisos conocidos — 1 afectados: setuptools 81.0.0 (moderate 6.1) |
| 26.2/40 | Sin avisos pendientes — 3 paquete(s) con avisos sin atender más allá de 90 días; el más antiguo publicado hace 572 días |
Datos de entrada utilizados
| source | osv |
| advisories | 15 |
| affected_packages | 3 |
| assessed_packages | 112 |
| unassessed_packages | 0 |
| affected_by_severity | critical 1, moderate 2 |
| direct_affected_packages | 2 |
Preparación para IA
¿Hasta qué punto está el repositorio preparado para desarrollarse y mantenerse con agentes de codificación de IA? Tiene un peso deliberadamente pequeño (4%): las herramientas para agentes son una señal real de mantenimiento, pero un repositorio sin ninguna puede alcanzar igualmente 100/100.
Contexto y guía para agentes
Cómo se puntúa
| 0/45 | Instrucciones para agentes — sin CLAUDE.md / AGENTS.md / reglas de editor |
| 0/15 | Documentación legible por máquinas (llms.txt) |
| 40/40 | Historial de commits legible — 82 de 100 commits humanos declaran su intención (asunto estructurado o cuerpo explicativo) |
Datos de entrada utilizados
| has_llms_txt | no |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 0,82 |
| agent_instruction_files | — |
| agent_instruction_max_bytes | — |
Cómo se puntúa
| 18/18 | Arranque con un solo comando — tests/Makefile |
| 22/22 | Pruebas automatizadas |
| 11/11 | Configuración de lint / formato — pyproject.toml ([tool.ruff], [tool.isort]) |
| 0/11 | Verificación estática de tipos |
| 10/10 | Entorno reproducible — Dockerfile |
| 10/10 | Práctica demostrada con agentes — 6 de los últimos 100 commits con autoría o crédito de agente |
| 0/8 | Mantenimiento automatizado — no se observan actualizaciones automáticas de dependencias |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — sin datos |
Datos de entrada utilizados
| has_nix | no |
| has_tests | sí |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | sí |
| typed_language | no |
| bootstrap_files | tests/Makefile |
| has_devcontainer | no |
| has_linter_config | sí |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0,06 |
| toolchain_manifests | — |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
Legibilidad del código para modelos
Cómo se puntúa
| 0/45 | Código verificable por tipos — Jupyter Notebook sin configuración de verificación de tipos |
| 54.2/55 | Tamaños de archivo manejables — 3/212 archivos fuente de más de 60 KB |
Datos de entrada utilizados
| primary_language | Jupyter Notebook |
| largest_source_bytes | 108.748 |
| source_files_sampled | 212 |
| oversized_source_files | 3 |
Interfaces legibles por máquina
Cómo se puntúa
| 0/40 | Esquema de API (OpenAPI/GraphQL/proto) — no aplicable a este tipo de software |
| 0/20 | Servidor MCP — no aplicable a este tipo de software |
| 40/40 | Ejemplos ejecutables — cookbook, notebooks |
Datos de entrada utilizados
| example_dirs | cookbook, notebooks |
| has_mcp_signal | no |
| api_schema_files | — |
| interfaces_expected_of | — |
Datos clave
Advertencias de recopilación de datos
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
- OpenSSF Scorecard did not return a usable result (killed by SIGKILL — most likely the container's memory limit); skipping Scorecard checks
Más detalle
Historial de estrellas y forks 0 ★ / 403 ⇿
Cuándo se añadió cada estrella y fork, recopilado de GitHub y agrupado por día. El crecimiento acumulado se sitúa justo encima de las adiciones diarias que lo componen, de modo que ambos se leen en conjunto: la acumulación orgánica sostenida no se parece en nada a un pico abrupto y efímero. Cuando esa diferencia es medible, se informa como autenticidad del crecimiento.
Cada punto abarca 3 días.
Dependencias directas 26
| Registro | Paquete | Restricción de versión | Manifiesto |
|---|---|---|---|
| PyPI | torch | >=2.11.0,<2.12.0 | pyproject.toml |
| PyPI | transformers | >=4.57.6,<5.0.0 | pyproject.toml |
| PyPI | ipython | — | pyproject.toml |
| PyPI | einops | — | pyproject.toml |
| PyPI | biotite | >=1.0.0 | pyproject.toml |
| PyPI | rdkit | — | pyproject.toml |
| PyPI | msgpack-numpy | — | pyproject.toml |
| PyPI | biopython | — | pyproject.toml |
| PyPI | scikit-learn | — | pyproject.toml |
| PyPI | brotli | — | pyproject.toml |
| PyPI | attrs | — | pyproject.toml |
| PyPI | pandas | — | pyproject.toml |
| PyPI | cloudpathlib | — | pyproject.toml |
| PyPI | httpx | — | pyproject.toml |
| PyPI | tenacity | — | pyproject.toml |
| PyPI | zstd | — | pyproject.toml |
| PyPI | ipywidgets | — | pyproject.toml |
| PyPI | py3dmol | — | pyproject.toml |
| PyPI | pydssp | — | pyproject.toml |
| PyPI | boto3 | — | pyproject.toml |
| PyPI | huggingface_hub | — | pyproject.toml |
| PyPI | safetensors | — | pyproject.toml |
| PyPI | pygtrie | — | pyproject.toml |
| PyPI | dna_features_viewer | — | pyproject.toml |
| PyPI | accelerate | — | pyproject.toml |
| PyPI | triton | ==3.6.* | pyproject.toml |
Todas las dependencias 6
Conjunto completo de dependencias resueltas según el grafo de dependencias de GitHub: 4 paquetes directos y 2 indirectos (transitivos). El cierre transitivo es completo cuando el repositorio incluye un lockfile.
| Registro | Paquete | Versión | Relación |
|---|---|---|---|
| PyPI | biotite | — | directa |
| PyPI | torch | — | directa |
| PyPI | transformers | — | directa |
| PyPI | triton | — | directa |
| PyPI | esm | — | indirecta |
| PyPI | pytest | — | indirecta |
Avisos de dependencias 3
Instalar pypi:esm@3.4.1.post1 arrastra 112 paquetes, directos y transitivos: 3 tienen avisos conocidos, de los cuales 2 son dependencias directas.
| Paquete | Versión | Relación | Gravedad | Avisos | Corregido en |
|---|---|---|---|---|---|
| transformers | 4.57.6 | directa | crítica | 11 | 5.10.0 |
| torch | 2.11.0 | directa | moderada | 1 | 2.13.0 |
| setuptools | 81.0.0 | indirecta | moderada | 3 | 84.1.0 |
Un aviso significa que la versión registrada en el grafo de dependencias cae dentro del rango afectado de un aviso. No se analiza la alcanzabilidad, y el grafo incluye fijaciones de desarrollo y prueba: un hallazgo puede referirse al utillaje y no al software distribuido.
Informe JSON sin procesar legible por máquina
Comentarios
¿Algo no cuadra en este informe, o hay ideas que compartir? Mediciones erróneas, herramientas no detectadas, ideas, preguntas: todo es bienvenido. Cada mensaje se lee y recibe respuesta.
Las puntuaciones son señales, no garantías. Reflejan prácticas públicamente visibles en GitHub; no son una auditoría de código ni una garantía de seguridad.
Los datos ausentes se excluyen y los pesos se renormalizan; nunca se puntúan como cero. La metodología es versionada y abierta: métricas v2.10.0, esquema v0.34.0 — metodología completa · wiki de métricas.
Cómo se sitúa un resultado dentro del registro general: estadísticas agregadas — PyPI.