Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-10-25 14:57 UTC

Biohub / esm

Jupyter Notebook · PythonВласна ліцензія★ 3 004 зірки⑂ 403 форкиз черв. 2024 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипБібліотекаяк це визначено

Biohub/esm має індекс здоров’я 71 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Vitality (77/100), найнижчий — Security (10/100). Останнє оновлення було 3 дні тому. Більшість нещодавньої роботи виконують 4 учасники.

71
загалом / 100
Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

71
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 63 калібровано до 71 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

BiohubОрганізація
127 підписників12 публічних репозиторіївз лют. 2026 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікація
PyPIesm3.4.1.post127 7482738 днів тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

77Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

67Добрий
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 3 дн. тому
10.4/36Ритм комітів — 15/52 тижнів із комітами
13.6/18Обсяг комітів — 32 комітів за останній рік
0/10OpenSSF Scorecard: Maintained — немає даних
Використані вхідні дані
commits_last_year32
human_commit_share1
days_since_last_push3
active_weeks_last_year15

Дисципліна релізів

92Відмінний
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 21 релізів
36/36Свіжість релізів — останній реліз 39 дн. тому
19.8/27Ритм релізів — реліз кожні ~62,2 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count21
latest_release_tagv3.4.1.post1
releases_from_tagsні
days_since_latest_release39
mean_days_between_releases62,2

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

67Добрий · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

87Відмінний
Як обчислюється оцінка
56.4/60Зірки — 3 004 зірок
21.7/25Форки — 403 форків
8.9/15Спостерігачі — 41 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks403
stars3 004
watchers41
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

44Слабкий
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
16.9/22.5Ліцензія — файл ліцензії наявний, не є визнаною ліцензією
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges0
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services—
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

77Добрий · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

82Відмінний
Як обчислюється оцінка
43.2/54Бас-фактор — на 4 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
17.3/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 23% комітів
13.5/13.5Широта контриб’юторів — 22 контриб’юторів
0/10OpenSSF Scorecard: Contributors — немає даних
Використані вхідні дані
bus_factor4
contributors_sampled22
top_contributor_share0,23

Реактивність на issue та PR

76Добрий
Як обчислюється оцінка
31.3/42Вирішення issue — закрито 75% issue
23.2/30Прийняття PR — злито 95/123 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — немає даних
Використані вхідні дані
merged_prs95
open_issues65
closed_issues191
prs_merged_7d1
prs_decided_7d1
prs_merged_30d1
prs_decided_30d2
issue_closed_ratio0,746
closed_unmerged_prs28
first_time_authors_30d0
first_time_prs_merged_30d0
first_time_prs_decided_30d0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

55Помірний
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен
15.1/25Охоплення власника — 127 підписників у Biohub
9.5/25Послужний список — 12 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~0 р.
Використані вхідні дані
followers127
owner_typeOrganization
is_verifiedні
owner_loginBiohub
public_repos12
account_age_days247

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікацій — остання публікація 38 дн. тому
20/20Історія версій — 27 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesesm
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish38

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

71Добрий · 19% загального індексу

Інженерні практики

92Відмінний
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 2 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
16/16Конфігурація лінтера — pyproject.toml ([tool.ruff], [tool.isort])
9.6/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
0/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — немає даних
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configтак
has_precommit_configтак

Документація

40Слабкий
Як обчислюється оцінка
30/30README
0/25Каталог документації
0/15Сайт документації / домашня сторінка
0/10Опис репозиторію
0/10Теми
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topics—
has_wikiтак
homepage—
docs_site—
has_readmeтак
has_docs_dirні
has_descriptionні

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

10Критичний · 16% загального індексу

Стан безпеки

1Критичний
Як обчислюється оцінка
0/30Політика безпеки (SECURITY.md)
0/25Конфігурація Dependabot
0/25Файли фіксації залежностей — опублікована бібліотека — lockfile є справою застосунків, не очікується
0/20Процес CodeQL
Використані вхідні дані
sourcefile_signals
lockfiles—
manifestspyproject.toml
has_codeql_workflowні
has_security_policyні
has_dependabot_configні
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Файли фіксації залежностей. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

46Слабкий
Як обчислюється оцінка
7.2/35Прямі залежності без відомих сповіщень — уражено 2: transformers 4.57.6 (critical 9.6), torch 2.11.0 (moderate 5.3)
12.8/25Непрямі залежності без відомих сповіщень — уражено 1: setuptools 81.0.0 (moderate 6.1)
26.2/40Немає задавнених сповіщень — 3 пакет(ів) зі сповіщеннями без реакції понад 90 дн.; найдавніше опубліковано 572 дн. тому
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories15
affected_packages3
assessed_packages112
unassessed_packages0
affected_by_severitycritical 1, moderate 2
direct_affected_packages2
Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:esm@3.4.1.post1 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 112 пакетів. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

67Добрий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

40Слабкий
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
40/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 82 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share0,82
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

79Добрий
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — tests/Makefile
22/22Автоматизовані тести
11/11Конфігурація лінтера / форматера — pyproject.toml ([tool.ruff], [tool.isort])
0/11Статична перевірка типів
10/10Відтворюване середовище — Dockerfile
10/10Підтверджена практика роботи з агентами — 6 з останніх 100 комітів створено агентом або з його зазначенням
0/8Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — немає даних
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfiles—
has_dockerfileтак
typed_languageні
bootstrap_filestests/Makefile
has_devcontainerні
has_linter_configтак
typecheck_configs—
agent_commit_share0,06
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share0

Читабельність коду для моделей

54Помірний
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований код — Jupyter Notebook без конфігурації перевірки типів
54.2/55Керовані розміри файлів — 3/212 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageJupyter Notebook
largest_source_bytes108 748
source_files_sampled212
oversized_source_files3

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40Придатні до запуску приклади — cookbook, notebooks
Використані вхідні дані
example_dirscookbook, notebooks
has_mcp_signalні
api_schema_files—
interfaces_expected_of—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

3 004зірок GitHub
22контриб'юторів
32комітів за останні 12 місяців
3днів від останнього пушу
21релізів
4бас-фактор
65відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
  • OpenSSF Scorecard did not return a usable result (killed by SIGKILL — most likely the container's memory limit); skipping Scorecard checks

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 403 ⇿
0Зірки
403Форки
21Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

0100200300400387542024-062025-082026-10
Мажорні 0Мінорні 3Патчі 14

Кожна точка охоплює 3 днів.

Прямі залежності 26
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPItorch>=2.11.0,<2.12.0pyproject.toml
PyPItransformers>=4.57.6,<5.0.0pyproject.toml
PyPIipython—pyproject.toml
PyPIeinops—pyproject.toml
PyPIbiotite>=1.0.0pyproject.toml
PyPIrdkit—pyproject.toml
PyPImsgpack-numpy—pyproject.toml
PyPIbiopython—pyproject.toml
PyPIscikit-learn—pyproject.toml
PyPIbrotli—pyproject.toml
PyPIattrs—pyproject.toml
PyPIpandas—pyproject.toml
PyPIcloudpathlib—pyproject.toml
PyPIhttpx—pyproject.toml
PyPItenacity—pyproject.toml
PyPIzstd—pyproject.toml
PyPIipywidgets—pyproject.toml
PyPIpy3dmol—pyproject.toml
PyPIpydssp—pyproject.toml
PyPIboto3—pyproject.toml
PyPIhuggingface_hub—pyproject.toml
PyPIsafetensors—pyproject.toml
PyPIpygtrie—pyproject.toml
PyPIdna_features_viewer—pyproject.toml
PyPIaccelerate—pyproject.toml
PyPItriton==3.6.*pyproject.toml
Усі залежності 6

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 4 прямих і 2 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIbiotite—пряма
PyPItorch—пряма
PyPItransformers—пряма
PyPItriton—пряма
PyPIesm—непряма
PyPIpytest—непряма
Сповіщення про залежності 3

Встановлення pypi:esm@3.4.1.post1 тягне 112 пакетів, прямих і транзитивних: 3 мають відомі сповіщення, з них 2 — прямі залежності.

ПакетВерсіяЗв'язокКритичністьСповіщеньВиправлено в
transformers4.57.6прямакритична115.10.0
torch2.11.0прямапомірна12.13.0
setuptools81.0.0непрямапомірна384.1.0

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з Biohub/esm. Читати поруч →

100aws/aws-sam-cliCLI tool to build, test, debug, and deploy Serverless applications using AWS SAMВинятковий100awslabs/mcpOpen source MCP Servers for AWSВинятковий100onnx/onnxOpen standard for machine learning interoperabilityВинятковий100apache/arrowApache Arrow is the universal columnar format and multi-language toolbox for fast data interchange and in-memory analyticsВинятковий100microsoft/onnxruntimeONNX Runtime: cross-platform, high performance ML inferencing and training acceleratorВинятковий100streamlit/streamlitStreamlit — A faster way to build and share data apps.Винятковий

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.