Registro público
Informe de salud del softwareesquema 0.34.0 · métricas 2.10.0 · 2026-09-12 17:53 UTC

Clinical-Genomics / scout

VCF visualization interface

HTML · PythonBSD-3-Clause★ 181 estrellas⑂ 51 forksdesde oct 2014Ver en GitHub ↗
TipoHerramienta de línea de comandosServicio de redBibliotecacómo se determina

Clinical-Genomics/scout tiene un índice de salud de 94 sobre 100, lo que lo sitúa en la banda Excepcional. Su puntuación más alta es Vitality (98/100) y la más baja, AI Readiness (53/100). Se actualizó por última vez hace 1 día. 2 personas concentran la mayor parte del trabajo reciente.

94
global / 100
Excepcional

Índice de salud del software

Las métricas se agrupan en categorías ponderadas sobre una escala estandarizada de 1 a 100. El resultado global parte de su media ponderada, calibrada contra la distribución del registro público para que las bandas tengan significado percentil; cuando la evidencia pública activa la Política de Jurisdicciones de Alto Riesgo, la calificación se ajusta y recibe un límite «En riesgo» de 34.

94
Excepcional93-100El nivel más alto del registro (≈ el 5% superior); cumple prácticamente todos los criterios evaluados
Excelente80-92Sólido en todos los frentes; carencias menores
Bueno65-79Saludable; carencias limitadas y manejables
Moderado50-64Aceptable con carencias notables; se recomienda revisión
Débil35-49Debilidades sustanciales en varias áreas
En riesgo20-34Debilidades significativas; su adopción exige cautela
Crítico1-19Problemas graves (proyecto abandonado, un solo mantenedor, sin higiene)
VitalidadComunidad yAdopciónSostenibilidady GobernanzaCalidad deIngenieríaSeguridadPreparaciónpara IA

Perfil de puntuación

Cada eje es una categoría. La forma importa más que la media: un proyecto sano llena toda la figura, mientras que un perfil de picos y cráteres indica que la fortaleza en una dimensión enmascara el riesgo en otra.

El resultado global ponderado 81 se calibra a 94 en la escala publicada del índice (calibración del registro 2026-08-02).

Titularidad

Clinical GenomicsOrganización
96 seguidores123 repositorios públicosdesde ene 2014

Este repositorio está respaldado por una organización: una custodia compartida y responsable que puede sobrevivir a cualquier mantenedor individual.

Ecosistemas de paquetes

Métricas por categoría

Vitalidad

¿Está vivo el proyecto: se escribe código y se publican versiones?

98Excepcional · 21% del índice global
Cómo se puntúa
36/36Recencia de push — último push hace 1 días
31.8/36Cadencia de commits — 46/52 semanas con commits
18/18Volumen de commits — 365 commits en el último año
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 23 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Datos de entrada utilizados
commits_last_year365
human_commit_share1
days_since_last_push1
active_weeks_last_year46
Cómo se puntúa
27/27Publica versiones — 100 versiones publicadas
36/36Recencia de las versiones — última versión hace 10 días
27/27Cadencia de publicación — una versión cada ~12,7 días
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — sin datos
Datos de entrada utilizados
releases_count100
latest_release_tagv4.114.0
releases_from_tagsno
days_since_latest_release10
mean_days_between_releases12,7
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Los pesos restantes se han renormalizado.

Comunidad y Adopción

¿Tiene el proyecto usuarios, descargas, atención y unas condiciones acogedoras para quienes contribuyen?

64Moderado · 17% del índice global
Cómo se puntúa
36.6/60Estrellas — 181 estrellas
14.2/25Forks — 51 forks
5.8/15Observadores — 12 observadores
Datos de entrada utilizados
forks51
stars181
watchers12
growth_stateorganic
growth_factor_pct100
Cómo se puntúa
22.5/22.5README
22.5/22.5Licencia — licencia reconocida (BSD-3-Clause)
18/18Guía CONTRIBUTING
0/13.5Código de conducta
0/7.2Plantilla de issues
6.3/6.3Plantilla de PR
Datos de entrada utilizados
has_readmesí
has_licensesí
readme_badges3
has_contributingsí
has_issue_templateno
has_code_of_conductno
readme_badge_servicesshields.io
has_pull_request_templatesí
Cómo se puntúa
45/80Descargas mensuales — 2380 descargas/mes en pypi
0/20Dependientes en el registro — no lo informa este ecosistema
Datos de entrada utilizados
packagesscout-browser
dependents—
ecosystemspypi
total_downloads—
monthly_downloads2380
unverified_packages_excluded—
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Dependientes en el registro. Los pesos restantes se han renormalizado.

Sostenibilidad y Gobernanza

¿Sobrevivirá el proyecto a sus personas: factor bus, capacidad de respuesta, quién lo respalda y mantenimiento del paquete?

80Excelente · 23% del índice global
Cómo se puntúa
25.2/54Factor bus — la mitad de los commits recae en 2 contribuyente(s)
14/22.5Distribución de commits — el principal contribuyente firma el 38% de los commits
13.5/13.5Amplitud de contribuyentes — 33 contribuyentes
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 15 contributing companies or organizations
Datos de entrada utilizados
bus_factor2
contributors_sampled33
top_contributor_share0,377
Cómo se puntúa
38.9/42Resolución de issues — 93% de issues cerradas
27.6/30Aceptación de PR — 2766/3010 PR decididos fusionados
0/13Newcomer PR acceptance — ningún PR de un contribuyente primerizo decidido en 30 d
15/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — all changesets reviewed
Datos de entrada utilizados
merged_prs2766
open_issues247
closed_issues3134
prs_merged_7d7
prs_decided_7d7
prs_merged_30d19
prs_decided_30d19
issue_closed_ratio0,927
closed_unmerged_prs244
first_time_authors_30d0
first_time_prs_merged_30d0
first_time_prs_decided_30d0
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Newcomer PR acceptance. Los pesos restantes se han renormalizado.
Cómo se puntúa
30/30Respaldo de la propiedad — propiedad de una organización
0/20Dominio verificado
14.3/25Alcance del propietario — 96 seguidores de Clinical-Genomics
25/25Trayectoria — 123 repos públicos, cuenta de ~12 años
Datos de entrada utilizados
followers96
owner_typeOrganization
is_verifiedno
owner_loginClinical-Genomics
public_repos123
account_age_days4622
Cómo se puntúa
25/25Publicado y resoluble — 1 paquete(s) en pypi
35/35Recencia de publicación — última publicación hace 10 días
20/20Historial de versiones — 195 versiones en el registro
20/20No obsoleto — activo, ni obsoleto ni retirado
Datos de entrada utilizados
packagesscout-browser
ecosystemspypi
any_deprecatedno
min_days_since_publish10

Calidad de Ingeniería

¿Existen unas prácticas mínimas de ingeniería y documentación?

96Excepcional · 19% del índice global
Cómo se puntúa
24/24Flujos de trabajo de CI — 9 flujo(s) de trabajo
24/24Pruebas presentes
16/16Configuración de linter — pyproject.toml ([tool.ruff], [tool.black], [tool.isort])
9.6/9.6Hooks de pre-commit
6.4/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 30 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Datos de entrada utilizados
has_cisí
has_testssí
has_editorconfigsí
has_linter_configsí
has_precommit_configsí

Documentación

90Excelente
Cómo se puntúa
30/30README
25/25Directorio de documentación
15/15Sitio de documentación / página del proyecto — https://clinical-genomics.github.io/scout
10/10Descripción del repositorio
0/10Topics
10/10Wiki
Datos de entrada utilizados
topics—
has_wikisí
homepagehttps://clinical-genomics.github.io/scout
docs_sitehttps://clinical-genomics.github.io/scout
has_readmesí
has_docs_dirsí
has_descriptionsí

Seguridad

¿Son sólidas las prácticas visibles de seguridad y de cadena de suministro, sin exposición jurisdiccional de alto riesgo sin resolver?

67Bueno · 16% del índice global
Cómo se puntúa
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — sin datos
2.5/2.5CI-Tests — 30 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
7.5/7.5Code-Review — all changesets reviewed
2.5/2.5Contributors — project has 15 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Licencia — license file detected
7.5/7.5Maintained — 30 commit(s) and 23 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packaging — packaging workflow detected
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
5/5SAST — SAST tool is run on all commits
2/5Security-Policy — security policy file detected
0/7.5Signed-Releases — sin datos
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
6.8/7.5Vulnerabilities — 1 existing vulnerabilities detected
Datos de entrada utilizados
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate6,5
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Branch-Protection, Signed-Releases. Los pesos restantes se han renormalizado.
Cómo se puntúa
11.5/35Dependencias directas libres de avisos conocidos — 1 afectados: pdfkit 1.0.0 (high 8.4)
25/25Dependencias indirectas libres de avisos conocidos — ninguna dependencia indirecta tiene un aviso conocido
40/40Sin avisos pendientes — ningún aviso lleva público más de 90 días
Datos de entrada utilizados
sourceosv
advisories2
affected_packages1
assessed_packages80
unassessed_packages0
affected_by_severityhigh 1
direct_affected_packages1
Se cotejó el cierre de dependencias en tiempo de ejecución de pypi:scout-browser@4.114.0 —lo que arrastra la instalación del paquete publicado—: 80 paquetes. No se analiza la alcanzabilidad.

Preparación para IA

¿Hasta qué punto está el repositorio preparado para desarrollarse y mantenerse con agentes de codificación de IA? Tiene un peso deliberadamente pequeño (4%): las herramientas para agentes son una señal real de mantenimiento, pero un repositorio sin ninguna puede alcanzar igualmente 100/100.

53Moderado · 4% del índice global
Cómo se puntúa
0/45Instrucciones para agentes — sin CLAUDE.md / AGENTS.md / reglas de editor
0/15Documentación legible por máquinas (llms.txt)
40/40Historial de commits legible — 100 de 100 commits humanos declaran su intención (asunto estructurado o cuerpo explicativo)
Datos de entrada utilizados
has_llms_txtno
llms_txt_url—
legible_history_share1
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—
Cómo se puntúa
18/18Arranque con un solo comando — Makefile
22/22Pruebas automatizadas
11/11Configuración de lint / formato — pyproject.toml ([tool.ruff], [tool.black], [tool.isort])
0/11Verificación estática de tipos
10/10Entorno reproducible — Dockerfile, lockfile
0/10Práctica demostrada con agentes — ningún commit con autoría de agente entre los últimos 100
0/8Mantenimiento automatizado — no se observan actualizaciones automáticas de dependencias
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Datos de entrada utilizados
has_nixno
has_testssí
lockfilesuv.lock
has_dockerfilesí
typed_languageno
bootstrap_filesMakefile
has_devcontainerno
has_linter_configsí
typecheck_configs—
agent_commit_share0
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share0
Cómo se puntúa
0/45Código verificable por tipos — HTML sin configuración de verificación de tipos
54.7/55Tamaños de archivo manejables — 3/580 archivos fuente de más de 60 KB
Datos de entrada utilizados
primary_languageHTML
largest_source_bytes79.453
source_files_sampled580
oversized_source_files3

Datos clave

181estrellas de GitHub
33contribuidores
365commits en los últimos 12 meses
1días desde el último push
100versiones publicadas
2factor bus
247issues abiertas
PyPIecosistemas de paquetes

Advertencias de recopilación de datos

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
  • Star history carried forward from 2026-07-09: GitHub restricted the stargazers API to repository admins, so it can no longer be collected. The repository has 181 stars today.

Más detalle

Historial de estrellas y forks 179 ★ / 51 ⇿
179Estrellas
51Forks
98Versiones

Cuándo se añadió cada estrella y fork, recopilado de GitHub y agrupado por día. El crecimiento acumulado se sitúa justo encima de las adiciones diarias que lo componen, de modo que ambos se leen en conjunto: la acumulación orgánica sostenida no se parece en nada a un pico abrupto y efímero. Cuando esa diferencia es medible, se informa como autenticidad del crecimiento.

El historial de estrellas se muestra tal como se recogió el 2026-07-09. GitHub restringió la API de stargazers a los administradores del repositorio en julio de 2026, por lo que esta serie ya no puede ampliarse; el total de estrellas indicado arriba sigue actualizándose.

040801201602001795162015-012020-102026-07
Mayor 0Menor 1Parche 41

Cada punto abarca 11 días.

OpenSSF Scorecard 6.5 / 10
6.5agregado

Evaluación de seguridad independiente y agnóstica en cuanto a herramientas, procedente del proyecto de código abierto OpenSSF Scorecard. Cada comprobación premia una práctica de seguridad, no la herramienta de un proveedor concreto. Las comprobaciones que Scorecard no pudo determinar se marcan como n/d y se excluyen de la puntuación de seguridad (nunca se cuentan como cero).Scorecard v5.5.0 · 2026-09-12 17:53 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
n/dBranch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10CI-Tests30 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
10Code-Reviewall changesets reviewed
10Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 23 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
10SASTSAST tool is run on all commits
4Security-Policysecurity policy file detected
n/dSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
9Vulnerabilities1 existing vulnerabilities detected
Dependencias directas 36
RegistroPaqueteRestricción de versiónManifiesto
PyPIwerkzeug—pyproject.toml
PyPIFlask>=2.0pyproject.toml
PyPIFlask-Bootstrap—pyproject.toml
PyPIFlask-CORS—pyproject.toml
PyPIpath.py—pyproject.toml
PyPImarkdown—pyproject.toml
PyPIWTForms—pyproject.toml
PyPIFlask-WTF—pyproject.toml
PyPIFlask-Mail—pyproject.toml
PyPIcoloredlogs—pyproject.toml
PyPIquery_phenomizer—pyproject.toml
PyPIFlask-Babel>=3pyproject.toml
PyPIlivereload>=2.7pyproject.toml
PyPItornado>=6.4.1pyproject.toml
PyPIpython-dateutil—pyproject.toml
PyPIpymongo—pyproject.toml
PyPIpathlib—pyproject.toml
PyPIpdfkit—pyproject.toml
PyPIphenopackets—pyproject.toml
PyPIxlsxwriter—pyproject.toml
PyPIclick—pyproject.toml
PyPIcryptography—pyproject.toml
PyPIdefusedxml—pyproject.toml
PyPIimportlib_resources—pyproject.toml
PyPIauthlib—pyproject.toml
PyPIflask-login—pyproject.toml
PyPIcyvcf2—pyproject.toml
PyPIconfigobj—pyproject.toml
PyPIped_parser—pyproject.toml
PyPIpydantic>=2pyproject.toml
PyPIPyYaml>=5.1pyproject.toml
PyPIintervaltree==3.0.2pyproject.toml
PyPIanytree—pyproject.toml
PyPItabulate—pyproject.toml
PyPIflask-ldap3-login>=1.0.2pyproject.toml
PyPIchanjo-report>=4.12.2pyproject.toml
Todas las dependencias 122

Conjunto completo de dependencias resueltas según el grafo de dependencias de GitHub: 36 paquetes directos y 86 indirectos (transitivos). El cierre transitivo es completo cuando el repositorio incluye un lockfile.

RegistroPaqueteVersiónRelación
PyPIanytree2.13.0directa
PyPIauthlib1.8.0directa
PyPIchanjo-report4.12.2directa
PyPIclick8.5.0directa
PyPIcoloredlogs15.0.1directa
PyPIconfigobj5.0.9directa
PyPIcryptography50.0.1directa
PyPIcyvcf20.34.0directa
PyPIdefusedxml0.7.1directa
PyPIflask3.1.3directa
PyPIflask-babel4.0.0directa
PyPIflask-bootstrap3.3.7.1directa
PyPIflask-cors6.0.5directa
PyPIflask-ldap3-login1.0.2directa
PyPIflask-login0.7.0.dev0directa
PyPIflask-mail0.10.0directa
PyPIflask-wtf1.3.0directa
PyPIimportlib-resources7.1.0directa
PyPIintervaltree3.0.2directa
PyPIlivereload2.7.1directa
PyPImarkdown3.10.3directa
PyPIpath-py12.5.0directa
PyPIpathlib1.0.1directa
PyPIpdfkit1.0.0directa
PyPIped-parser1.6.6directa
PyPIphenopackets2.0.2.post5directa
PyPIpydantic2.13.5directa
PyPIpymongo4.17.0directa
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0directa
PyPIpyyaml6.0.3directa
PyPIquery-phenomizer1.2.1directa
PyPItabulate0.10.0directa
PyPItornado6.5.8directa
PyPIwerkzeug3.1.8directa
PyPIwtforms3.2.2directa
PyPIxlsxwriter3.2.9directa
PyPIannotated-types0.8.0indirecta
PyPIbabel2.18.0indirecta
PyPIbackrefs8.0indirecta
PyPIblack26.5.1indirecta
PyPIblinker1.9.0indirecta
PyPIcertifi2026.7.22indirecta
PyPIcffi2.1.1indirecta
PyPIchanjo4.9.1indirecta
PyPIcharset-normalizer3.5.1indirecta
PyPIcolorama0.4.6indirecta
PyPIcoverage7.16.0indirecta
PyPIdnspython2.8.0indirecta
PyPIdominate2.9.1indirecta
PyPIexceptiongroup1.3.1indirecta
PyPIflake87.3.0indirecta
PyPIflask-debugtoolbar0.16.0indirecta
PyPIflask-sqlalchemy3.1.1indirecta
PyPIghp-import2.1.0indirecta
PyPIgreenlet3.5.5indirecta
PyPIhumanfriendly10.0indirecta
PyPIidna3.19indirecta
PyPIimportlib-metadata9.0.1indirecta
PyPIiniconfig2.3.0indirecta
PyPIinvoke3.0.3indirecta
PyPIisort9.0.1indirecta
PyPIitsdangerous2.2.0indirecta
PyPIjinja23.1.6indirecta
PyPIjoserfc1.7.5indirecta
PyPIldap32.9.1indirecta
PyPIlxml6.1.2indirecta
PyPImarkdown-include0.8.1indirecta
PyPImarkupsafe3.0.3indirecta
PyPImccabe0.7.0indirecta
PyPImergedeep1.3.4indirecta
PyPImkdocs1.6.1indirecta
PyPImkdocs-get-deps0.2.2indirecta
PyPImkdocs-material9.7.7indirecta
PyPImkdocs-material-extensions1.3.1indirecta
PyPImongomock4.3.0indirecta
PyPImypy-extensions1.1.0indirecta
PyPInumpy2.2.6indirecta
PyPInumpy2.4.6indirecta
PyPInumpy2.5.2indirecta
PyPIpackaging26.3indirecta
PyPIpaginate0.5.7indirecta
PyPIpath17.1.1indirecta
PyPIpathspec1.1.1indirecta
PyPIplatformdirs4.11.6indirecta
PyPIpluggy1.6.0indirecta
PyPIprotobuf6.33.6indirecta
PyPIpyasn10.6.4indirecta
PyPIpycodestyle2.14.0indirecta
PyPIpycparser3.0indirecta
PyPIpydantic-core2.46.5indirecta
PyPIpyflakes3.4.0indirecta
PyPIpygments2.21.0indirecta
PyPIpymdown-extensions11.0.2indirecta
PyPIpymysql1.2.0indirecta
PyPIpyreadline33.5.6indirecta
PyPIpyscss1.4.0indirecta
PyPIpytest9.1.1indirecta
PyPIpytest-cov7.1.0indirecta
PyPIpytest-flask1.3.0indirecta
PyPIpytest-mock3.15.1indirecta
PyPIpytest-test-groups1.2.1indirecta
PyPIpytokens0.4.1indirecta
PyPIpytz2026.3.post1indirecta
PyPIpyyaml-env-tag1.1indirecta
PyPIrequests2.34.2indirecta
PyPIresponses0.26.3indirecta
PyPIruff0.16.5indirecta
PyPIscout-browser4.114.0indirecta
PyPIsentinels1.1.1indirecta
PyPIsix1.17.0indirecta
PyPIsortedcontainers2.4.0indirecta
PyPIsqlalchemy2.0.52indirecta
PyPIsqlservice3.1.0indirecta
PyPItoml0.10.2indirecta
PyPItomli2.4.1indirecta
PyPItoolz1.1.0indirecta
PyPItyping-extensions4.16.0indirecta
PyPItyping-inspection0.4.4indirecta
PyPIurllib32.7.0indirecta
PyPIvisitor0.1.3indirecta
PyPIwatchdog6.0.0indirecta
PyPIzipp4.1.0indirecta
Avisos de dependencias 1

Instalar pypi:scout-browser@4.114.0 arrastra 80 paquetes, directos y transitivos: 1 tienen avisos conocidos, de los cuales 1 son dependencias directas.

PaqueteVersiónRelaciónGravedadAvisosCorregido en
pdfkit1.0.0directaalta2—

Un aviso significa que la versión registrada en el grafo de dependencias cae dentro del rango afectado de un aviso. No se analiza la alcanzabilidad, y el grafo incluye fijaciones de desarrollo y prueba: un hallazgo puede referirse al utillaje y no al software distribuido.

Informe JSON sin procesar legible por máquina

Comentarios

¿Algo no cuadra en este informe, o hay ideas que compartir? Mediciones erróneas, herramientas no detectadas, ideas, preguntas: todo es bienvenido. Cada mensaje se lee y recibe respuesta.

El mensaje se conserva durante el inicio de sesión.

Las puntuaciones son señales, no garantías. Reflejan prácticas públicamente visibles en GitHub; no son una auditoría de código ni una garantía de seguridad.

Los datos ausentes se excluyen y los pesos se renormalizan; nunca se puntúan como cero. La metodología es versionada y abierta: métricas v2.10.0, esquema v0.34.0 — metodología completa · wiki de métricas.

Cómo se sitúa un resultado dentro del registro general: estadísticas agregadas — PyPI.