Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.23.0 · метрики 2.10.0 · 2026-07-21 20:45 UTC

Clinical-Genomics / scout

VCF visualization interface

HTML · PythonBSD-3-Clause★ 179 зірок⑂ 51 форкз жовт. 2014 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипМережевий сервісБібліотекаІнструмент командного рядкаяк це визначено

Clinical-Genomics/scout має індекс здоров’я 95 зі 100, що відповідає смузі «Винятковий». Найвищий показник — Vitality (98/100), найнижчий — AI Readiness (53/100). Останнє оновлення було 1 день тому. Більшість нещодавньої роботи виконують 2 учасники.

95
загалом / 100
Винятковий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

95
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 82 калібровано до 95 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Clinical GenomicsОрганізація
96 підписників123 публічні репозиторіїз січ. 2014 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікаціяТеги
PyPIscout-browser4.113.3-1946 днів томуacmgbeaconcancerclingen-cgc-viccclinvarcnvcoveragednafusiongenome-visualisationlrsmatchmaker-exchangeogmoutlierspanelpanelappphenopacketrnasmasnvstrsvvariant-rankingvariant-triagevariantsvcfweswgswts

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

98Винятковий · 21% загального індексу
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість pushостанній push 1 дн. тому
32.5/36Ритм комітів47/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів376 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained30 commit(s) and 27 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year376
human_commit_share1
days_since_last_push1
active_weeks_last_year47
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізиопубліковано 100 релізів
36/36Свіжість релізівостанній реліз 6 дн. тому
27/27Ритм релізівреліз кожні ~9,1 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releasesнемає даних
Використані вхідні дані
releases_count100
latest_release_tagv4.113.3
releases_from_tagsні
days_since_latest_release6
mean_days_between_releases9,1
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

66Добрий · 17% загального індексу
Як обчислюється оцінка
36.5/60Зірки179 зірок
14.2/25Форки51 форків
6/15Спостерігачі13 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks51
stars179
watchers13
growth_stateorganic
growth_factor_pct100
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензіявизнана ліцензія (BSD-3-Clause)
18/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
6.3/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges
has_contributingтак
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services
has_pull_request_templateтак

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

84Відмінний · 23% загального індексу
Як обчислюється оцінка
25.2/54Бас-факторна 2 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
14/22.5Розподіл комітівголовний контриб’ютор — автор 38% комітів
13.5/13.5Широта контриб’юторів33 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
Використані вхідні дані
bus_factor2
contributors_sampled33
top_contributor_share0,377
Як обчислюється оцінка
38.9/42Вирішення issueзакрито 93% issue
27.6/30Прийняття PRзлито 2 732/2 973 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptanceза 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
13.5/15OpenSSF Scorecard: Code-ReviewFound 29/30 approved changesets -- score normalized to 9
Використані вхідні дані
merged_prs2 732
open_issues245
closed_issues3 097
prs_merged_7d
prs_decided_7d
prs_merged_30d
prs_decided_30d
issue_closed_ratio0,927
closed_unmerged_prs241
first_time_authors_30d
first_time_prs_merged_30d
first_time_prs_decided_30d
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власникау власності організації
0/20Верифікований доменстатус підтвердженого домену для цієї організації не зчитано
14.3/25Охоплення власника96 підписників у Clinical-Genomics
25/25Послужний список123 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~12 р.
Використані вхідні дані
followers96
owner_typeOrganization
is_verified
owner_loginClinical-Genomics
public_repos123
account_age_days4 570
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікаційостання публікація 6 дн. тому
20/20Історія версій194 опублікованих версій
20/20Не застарілийактивний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesscout-browser
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish6

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

96Винятковий · 19% загального індексу
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI9 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
16/16Конфігурація лінтера
9.6/9.6Pre-commit-хуки
6.4/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests30 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigтак
has_linter_configтак
has_precommit_configтак

Документація

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінкаhttps://clinical-genomics.github.io/scout
10/10Опис репозиторію
0/10Теми
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topics
has_wikiтак
homepagehttps://clinical-genomics.github.io/scout
docs_sitehttps://clinical-genomics.github.io/scout
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

66Добрий · 16% загального індексу
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protectionнемає даних
2.5/2.5CI-Tests30 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
6.8/7.5Code-ReviewFound 29/30 approved changesets -- score normalized to 9
2.5/2.5Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Toolno update tool detected
0/5Fuzzingproject is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензіяlicense file detected
7.5/7.5Maintained30 commit(s) and 27 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packagingpackaging workflow detected
0/5Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
5/5SASTSAST tool is run on all commits
2/5Security-Policysecurity policy file detected
0/7.5Signed-Releasesнемає даних
0/7.5Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
6.8/7.5Vulnerabilities1 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate6,4
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Branch-Protection, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
11.5/35Прямі залежності без відомих сповіщеньуражено 1: pdfkit 1.0.0 (high 8.4)
0/25Непрямі залежності без відомих сповіщеньтранзитивний набір не відокремлюється від залежностей розробки й тестування в цьому обсязі
40/40Немає задавнених сповіщеньжодне сповіщення не є публічним довше за 90 дн.
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories2
affected_packages1
assessed_packages118
unassessed_packages0
affected_by_severityhigh 1
direct_affected_packages1
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Непрямі залежності без відомих сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено 118 резолвлених залежностей із OSV. Цей репозиторій не публікує пакета, який резолвить індекс, тож натомість оцінено граф залежностей репозиторію. Цей граф змішує закріплені версії для розробки й тестування зі справді постачаними залежностями, тож оцінюються лише задекларовані runtime-залежності; транзитивні знахідки подаються як контекст і в оцінку не входять. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

53Помірний · 4% загального індексу
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентівнемає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
40/40Читабельна історія комітівнамір зазначено у 100 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url
legible_history_share1
agent_instruction_files
agent_instruction_max_bytes
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командоюMakefile
22/22Автоматизовані тести
11/11Конфігурація лінтера / форматера
0/11Статична перевірка типів
10/10Відтворюване середовищеDockerfile, lockfile
0/10Підтверджена практика роботи з агентамисеред останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8Автоматизоване супроводженняавтоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfilesuv.lock
has_dockerfileтак
typed_languageні
bootstrap_filesMakefile
has_devcontainerні
has_linter_configтак
typecheck_configs
agent_commit_share0
toolchain_manifests
dependency_bot_commit_share0
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований кодHTML без конфігурації перевірки типів
54.7/55Керовані розміри файлів3/566 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageHTML
largest_source_bytes79 453
source_files_sampled566
oversized_source_files3

Ключові факти

179зірок GitHub
33контриб'юторів
376комітів за останні 12 місяців
1днів від останнього пушу
100релізів
2бас-фактор
245відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • deps.dev does not index pypi:scout-browser@4.113.3; advisories assessed against the repository dependency graph instead

Докладніше

Історія зірок і форків 179 ★ / 51 ⇿
179Зірки
51Форки
99Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

040801201602001795162015-012020-102026-07
Мажорні 0Мінорні 1Патчі 42

Кожна точка охоплює 11 днів.

OpenSSF Scorecard 6.4 / 10
6.4сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-21 20:44 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
н/дBranch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10CI-Tests30 out of 30 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
9Code-ReviewFound 29/30 approved changesets -- score normalized to 9
10Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 27 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
10SASTSAST tool is run on all commits
4Security-Policysecurity policy file detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
9Vulnerabilities1 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 36
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPIwerkzeugpyproject.toml
PyPIFlask>=2.0pyproject.toml
PyPIFlask-Bootstrappyproject.toml
PyPIFlask-CORSpyproject.toml
PyPIpath.pypyproject.toml
PyPImarkdownpyproject.toml
PyPIWTFormspyproject.toml
PyPIFlask-WTFpyproject.toml
PyPIFlask-Mailpyproject.toml
PyPIcoloredlogspyproject.toml
PyPIquery_phenomizerpyproject.toml
PyPIFlask-Babel>=3pyproject.toml
PyPIlivereload>=2.7pyproject.toml
PyPItornado>=6.4.1pyproject.toml
PyPIpython-dateutilpyproject.toml
PyPIpymongopyproject.toml
PyPIpathlibpyproject.toml
PyPIpdfkitpyproject.toml
PyPIphenopacketspyproject.toml
PyPIxlsxwriterpyproject.toml
PyPIclickpyproject.toml
PyPIcryptographypyproject.toml
PyPIdefusedxmlpyproject.toml
PyPIimportlib_resourcespyproject.toml
PyPIauthlibpyproject.toml
PyPIflask-loginpyproject.toml
PyPIcyvcf2pyproject.toml
PyPIconfigobjpyproject.toml
PyPIped_parserpyproject.toml
PyPIpydantic>=2pyproject.toml
PyPIPyYaml>=5.1pyproject.toml
PyPIintervaltree==3.0.2pyproject.toml
PyPIanytreepyproject.toml
PyPItabulatepyproject.toml
PyPIflask-ldap3-login>=1.0.2pyproject.toml
PyPIchanjo-report>=4.12.2pyproject.toml
Усі залежності 118

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 36 прямих і 82 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIanytree2.13.0пряма
PyPIauthlib1.7.2пряма
PyPIchanjo-report4.12.2пряма
PyPIclick8.4.2пряма
PyPIcoloredlogs15.0.1пряма
PyPIconfigobj5.0.9пряма
PyPIcryptography49.0.0пряма
PyPIcyvcf20.34.0пряма
PyPIdefusedxml0.7.1пряма
PyPIflask3.1.3пряма
PyPIflask-babel4.0.0пряма
PyPIflask-bootstrap3.3.7.1пряма
PyPIflask-cors6.0.5пряма
PyPIflask-ldap3-login1.0.2пряма
PyPIflask-login0.7.0.dev0пряма
PyPIflask-mail0.10.0пряма
PyPIflask-wtf1.3.0пряма
PyPIimportlib-resources7.1.0пряма
PyPIintervaltree3.0.2пряма
PyPIlivereload2.7.1пряма
PyPImarkdown3.10.2пряма
PyPIpath-py12.5.0пряма
PyPIpathlib1.0.1пряма
PyPIpdfkit1.0.0пряма
PyPIped-parser1.6.6пряма
PyPIphenopackets2.0.2.post5пряма
PyPIpydantic2.13.4пряма
PyPIpymongo4.17.0пряма
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0пряма
PyPIpyyaml6.0.3пряма
PyPIquery-phenomizer1.2.1пряма
PyPItabulate0.10.0пряма
PyPItornado6.5.7пряма
PyPIwerkzeug3.1.8пряма
PyPIwtforms3.2.2пряма
PyPIxlsxwriter3.2.9пряма
PyPIannotated-types0.7.0непряма
PyPIbabel2.18.0непряма
PyPIbackrefs7.0непряма
PyPIblack26.5.1непряма
PyPIblinker1.9.0непряма
PyPIcertifi2026.6.17непряма
PyPIcffi2.1.0непряма
PyPIchanjo4.9.1непряма
PyPIcharset-normalizer3.4.9непряма
PyPIcolorama0.4.6непряма
PyPIcoverage7.15.1непряма
PyPIdnspython2.8.0непряма
PyPIdominate2.9.1непряма
PyPIexceptiongroup1.3.1непряма
PyPIflask-debugtoolbar0.16.0непряма
PyPIflask-sqlalchemy3.1.1непряма
PyPIghp-import2.1.0непряма
PyPIgreenlet3.5.3непряма
PyPIhumanfriendly10.0непряма
PyPIidna3.18непряма
PyPIimportlib-metadata9.0.0непряма
PyPIiniconfig2.3.0непряма
PyPIinvoke3.0.3непряма
PyPIisort8.0.1непряма
PyPIitsdangerous2.2.0непряма
PyPIjinja23.1.6непряма
PyPIjoserfc1.7.3непряма
PyPIldap32.9.1непряма
PyPIlxml6.1.1непряма
PyPImarkdown-include0.8.1непряма
PyPImarkupsafe3.0.3непряма
PyPImergedeep1.3.4непряма
PyPImkdocs1.6.1непряма
PyPImkdocs-get-deps0.2.2непряма
PyPImkdocs-material9.7.6непряма
PyPImkdocs-material-extensions1.3.1непряма
PyPImongomock4.3.0непряма
PyPImypy-extensions1.1.0непряма
PyPInumpy2.2.6непряма
PyPInumpy2.4.6непряма
PyPInumpy2.5.1непряма
PyPIpackaging26.2непряма
PyPIpaginate0.5.7непряма
PyPIpath17.1.1непряма
PyPIpathspec1.1.1непряма
PyPIplatformdirs4.10.0непряма
PyPIpluggy1.6.0непряма
PyPIprotobuf6.33.6непряма
PyPIpyasn10.6.4непряма
PyPIpycparser3.0непряма
PyPIpydantic-core2.46.4непряма
PyPIpygments2.20.0непряма
PyPIpymdown-extensions11.0.1непряма
PyPIpymysql1.2.0непряма
PyPIpyreadline33.5.6непряма
PyPIpyscss1.4.0непряма
PyPIpytest9.1.1непряма
PyPIpytest-cov7.1.0непряма
PyPIpytest-flask1.3.0непряма
PyPIpytest-mock3.15.1непряма
PyPIpytest-test-groups1.2.1непряма
PyPIpytokens0.4.1непряма
PyPIpytz2026.2непряма
PyPIpyyaml-env-tag1.1непряма
PyPIrequests2.34.2непряма
PyPIresponses0.26.2непряма
PyPIruff0.15.21непряма
PyPIscout-browser4.113.3непряма
PyPIsentinels1.1.1непряма
PyPIsix1.17.0непряма
PyPIsortedcontainers2.4.0непряма
PyPIsqlalchemy2.0.51непряма
PyPIsqlservice3.1.0непряма
PyPItoml0.10.2непряма
PyPItomli2.4.1непряма
PyPItoolz1.1.0непряма
PyPItyping-extensions4.16.0непряма
PyPItyping-inspection0.4.2непряма
PyPIurllib32.7.0непряма
PyPIvisitor0.1.3непряма
PyPIwatchdog6.0.0непряма
PyPIzipp4.1.0непряма
Сповіщення про залежності 1

Цей репозиторій не публікує пакета, який розпізнає індекс, тож оцінено його власний граф залежностей — 118 пакетів, серед яких є й піниї розробки та тестування, що ніколи не постачаються: 1 мають відомі сповіщення, з них 1 прямі.

ПакетВерсіяЗв'язокКритичністьСповіщеньВиправлено в
pdfkit1.0.0прямависока2

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.23.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистикаPyPI.