Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-10-21 05:37 UTC

BiocPy / biocframe

Bioconductor-like data frames

PythonMIT★ 6 зірок⑂ 3 форкиз лип. 2022 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипБібліотекаяк це визначено

BiocPy/biocframe має індекс здоров’я 80 зі 100, що відповідає смузі «Відмінний». Найвищий показник — Engineering Quality (93/100), найнижчий — Community & Adoption (47/100). Останнє оновлення було 1 день тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

80
загалом / 100
Відмінний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

80
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 68 калібровано до 80 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

BiocPyОрганізація
164 підписники41 публічний репозиторійз черв. 2022 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікаціяТеги
PyPIbiocframe0.8.110 8676350 днів томуbioconductorbiocpybioinformaticsdataframe

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

63Помірний · 21% загального індексу
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 1 дн. тому
6.2/36Ритм комітів — 9/52 тижнів із комітами
12.7/18Обсяг комітів — 25 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 16 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year25
human_commit_share0,66
days_since_last_push1
active_weeks_last_year9
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 3 релізів
0/36Свіжість релізів — останній реліз 1 411 дн. тому
27/27Ритм релізів — реліз кожні ~4,4 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних
Використані вхідні дані
releases_count3
latest_release_tag0.2.2
releases_from_tagsні
days_since_latest_release1 411
mean_days_between_releases4,4
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

47Слабкий · 17% загального індексу
Як обчислюється оцінка
11.3/60Зірки — 6 зірок
2.5/25Форки — 3 форків
0/15Спостерігачі — 1 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks3
stars6
watchers1
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (MIT)
18/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges7
has_contributingтак
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_servicesgithub.com, readthedocs.org, shields.io
has_pull_request_templateні
Як обчислюється оцінка
53.8/80Щомісячні завантаження — 10 867 завантажень/місяць у pypi
0/20Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє
Використані вхідні дані
packagesbiocframe
dependents—
ecosystemspypi
total_downloads—
monthly_downloads10 867
unverified_packages_excluded—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

66Добрий · 23% загального індексу
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
5.2/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 77% комітів
5.4/13.5Широта контриб’юторів — 4 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 17 contributing companies or organizations
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled4
top_contributor_share0,767
Як обчислюється оцінка
42/42Вирішення issue — закрито 100% issue
29.2/30Прийняття PR — злито 112/115 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
1.5/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 2/17 approved changesets -- score normalized to 1
Використані вхідні дані
merged_prs112
open_issues0
closed_issues35
prs_merged_7d0
prs_decided_7d0
prs_merged_30d0
prs_decided_30d0
issue_closed_ratio1
closed_unmerged_prs3
first_time_authors_30d0
first_time_prs_merged_30d0
first_time_prs_decided_30d0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен
15.9/25Охоплення власника — 164 підписників у BiocPy
20.5/25Послужний список — 41 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~4 р.
Використані вхідні дані
followers164
owner_typeOrganization
is_verifiedні
owner_loginBiocPy
public_repos41
account_age_days1 593

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікацій — остання публікація 50 дн. тому
20/20Історія версій — 63 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesbiocframe
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish50

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

93Винятковий · 19% загального індексу
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 3 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
16/16Конфігурація лінтера — pyproject.toml ([tool.ruff]), tox.ini
9.6/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
14/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 19 out of 24 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 7
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configтак
has_precommit_configтак

Документація

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://biocpy.github.io/biocframe/
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 1 тем
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsdataframe
has_wikiтак
homepagehttps://biocpy.github.io/biocframe/
docs_sitehttps://biocpy.github.io/biocframe/
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

70Добрий · 16% загального індексу

Стан безпеки

62Помірний
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — немає даних
1.8/2.5CI-Tests — 19 out of 24 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 7
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0.8/7.5Code-Review — Found 2/17 approved changesets -- score normalized to 1
2.5/2.5Contributors — project has 17 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
7.5/7.5Dependency-Update-Tool — update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 16 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5Packaging — packaging workflow detected
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
3.5/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 7
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — немає даних
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate6,2
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Branch-Protection, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
35/35Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень
25/25Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень
0/40Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories0
affected_packages0
assessed_packages2
unassessed_packages0
affected_by_severitynone
direct_affected_packages0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Немає задавнених сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:biocframe@0.8.1 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 2 пакетів. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

61Помірний · 4% загального індексу
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
38.8/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 48 з 66 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share0,727
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — docs/Makefile
22/22Автоматизовані тести
11/11Конфігурація лінтера / форматера — pyproject.toml ([tool.ruff]), tox.ini
11/11Статична перевірка типів — src/biocframe/py.typed
0/10Відтворюване середовище
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
8/8Автоматизоване супроводження — 8 з останніх 100 комітів — автоматичні оновлення залежностей
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfiles—
has_dockerfileні
typed_languageні
bootstrap_filesdocs/Makefile
has_devcontainerні
has_linter_configтак
typecheck_configssrc/biocframe/py.typed
agent_commit_share0
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share0,08
Як обчислюється оцінка
27/45Типізований код — Python з конфігурацією перевірки типів (src/biocframe/py.typed)
51.8/55Керовані розміри файлів — 1/17 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languagePython
largest_source_bytes72 949
source_files_sampled17
oversized_source_files1

Ключові факти

6зірок GitHub
4контриб'юторів
25комітів за останні 12 місяців
1днів від останнього пушу
3релізів
1бас-фактор
0відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 3 ⇿
0Зірки
3Форки
3Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

12233312022-112023-052023-10
Мажорні 0Мінорні 0Патчі 2
OpenSSF Scorecard 6.2 / 10
6.2сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-10-21 05:37 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
н/дBranch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
7CI-Tests19 out of 24 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 7
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
1Code-ReviewFound 2/17 approved changesets -- score normalized to 1
10Contributorsproject has 17 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
10Dependency-Update-Toolupdate tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained16 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
7SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 7
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10Vulnerabilities0 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 2
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPIbiocutils>=0.3.3pyproject.toml
PyPInumpy>=1.26.0pyproject.toml
Усі залежності 170

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 7 прямих і 163 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIbiocutils—пряма
PyPIbiocutils0.4.1пряма
PyPInumpy—пряма
PyPInumpy2.0.2пряма
PyPInumpy2.2.6пряма
PyPInumpy2.4.6пряма
PyPInumpy2.5.2пряма
PyPIaccessible-pygments0.0.5непряма
PyPIalabaster0.7.16непряма
PyPIalabaster1.0.0непряма
PyPIappnope1.0.0непряма
PyPIast-serialize0.8.0непряма
PyPIasttokens3.0.2непряма
PyPIattrs26.1.0непряма
PyPIbabel2.18.0непряма
PyPIbeautifulsoup44.15.0непряма
PyPIcertifi2026.7.22непряма
PyPIcffi2.0.0непряма
PyPIcffi2.1.1непряма
PyPIcharset-normalizer3.5.1непряма
PyPIclick8.1.8непряма
PyPIclick8.4.2непряма
PyPIcolorama0.4.6непряма
PyPIcomm0.2.3непряма
PyPIcoverage7.10.7непряма
PyPIcoverage7.15.4непряма
PyPIdebugpy1.8.21непряма
PyPIdecorator5.3.1непряма
PyPIdocutils0.21.2непряма
PyPIdocutils0.22.4непряма
PyPIexceptiongroup1.3.1непряма
PyPIexecuting2.2.1непряма
PyPIfastjsonschema2.21.2непряма
PyPIfastjsonschema2.22.2непряма
PyPIfuro—непряма
PyPIfuro2025.12.19непряма
PyPIgreenlet3.2.5непряма
PyPIgreenlet3.5.5непряма
PyPIidna3.19непряма
PyPIimagesize1.5.0непряма
PyPIimagesize2.0.1непряма
PyPIimportlib-metadata8.7.1непряма
PyPIimportlib-metadata9.0.0непряма
PyPIiniconfig2.1.0непряма
PyPIiniconfig2.3.0непряма
PyPIipykernel6.31.0непряма
PyPIipykernel7.3.0непряма
PyPIipython8.18.1непряма
PyPIipython8.39.0непряма
PyPIipython9.16.1непряма
PyPIipython-pygments-lexers1.1.1непряма
PyPIjedi0.19.2непряма
PyPIjedi0.20.0непряма
PyPIjinja23.1.6непряма
PyPIjsonschema4.25.1непряма
PyPIjsonschema4.26.0непряма
PyPIjsonschema-specifications2025.9.1непряма
PyPIjupyter-cache1.0.1непряма
PyPIjupyter-client8.6.3непряма
PyPIjupyter-client8.9.1непряма
PyPIjupyter-core5.8.1непряма
PyPIjupyter-core5.9.1непряма
PyPIlibrt0.15.0непряма
PyPIlinkify-it-py2.0.3непряма
PyPIlinkify-it-py2.1.1непряма
PyPImarkdown-it-py3.0.0непряма
PyPImarkdown-it-py4.2.0непряма
PyPImarkupsafe3.0.3непряма
PyPImatplotlib-inline0.2.2непряма
PyPImdit-py-plugins0.4.2непряма
PyPImdit-py-plugins0.6.1непряма
PyPImdurl0.1.2непряма
PyPImypy1.19.1непряма
PyPImypy2.3.1непряма
PyPImypy-extensions1.1.0непряма
PyPImyst-nb—непряма
PyPImyst-nb1.3.0непряма
PyPImyst-nb1.4.0непряма
PyPImyst-parser—непряма
PyPImyst-parser3.0.1непряма
PyPImyst-parser4.0.1непряма
PyPImyst-parser5.1.0непряма
PyPInbclient0.10.2непряма
PyPInbclient0.11.0непряма
PyPInbformat5.10.4непряма
PyPInbformat5.11.1непряма
PyPInest-asyncio1.6.0непряма
PyPInest-asyncio21.7.2непряма
PyPIpackaging26.3непряма
PyPIpandas—непряма
PyPIpandas2.3.3непряма
PyPIpandas3.0.5непряма
PyPIparso0.8.7непряма
PyPIpathspec1.1.1непряма
PyPIpexpect4.9.0непряма
PyPIplatformdirs4.11.4непряма
PyPIplatformdirs4.4.0непряма
PyPIpluggy1.6.0непряма
PyPIpolars—непряма
PyPIpolars1.36.1непряма
PyPIpolars1.44.0непряма
PyPIpolars-runtime-321.36.1непряма
PyPIpolars-runtime-321.44.0непряма
PyPIprompt-toolkit3.0.52непряма
PyPIprompt-toolkit3.0.53непряма
PyPIpsutil7.2.2непряма
PyPIptyprocess0.7.0непряма
PyPIpure-eval0.2.3непряма
PyPIpycparser2.23непряма
PyPIpycparser3.0непряма
PyPIpygments2.21.0непряма
PyPIpytest—непряма
PyPIpytest8.4.2непряма
PyPIpytest9.1.1непряма
PyPIpytest-cov—непряма
PyPIpytest-cov7.1.0непряма
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0непряма
PyPIpytz2026.3.post1непряма
PyPIpywin32312непряма
PyPIpyyaml6.0.3непряма
PyPIpyzmq27.2.0непряма
PyPIreferencing0.36.2непряма
PyPIreferencing0.37.0непряма
PyPIrequests2.32.5непряма
PyPIrequests2.34.2непряма
PyPIroman-numerals4.1.0непряма
PyPIrpds-py0.27.1непряма
PyPIrpds-py0.30.0непряма
PyPIrpds-py2026.6.3непряма
PyPIsetuptools—непряма
PyPIsetuptools82.0.1непряма
PyPIsetuptools84.0.0непряма
PyPIsix1.17.0непряма
PyPIsnowballstemmer3.1.1непряма
PyPIsoupsieve2.8.4непряма
PyPIsoupsieve2.9.2непряма
PyPIsphinx—непряма
PyPIsphinx7.4.7непряма
PyPIsphinx8.1.3непряма
PyPIsphinx9.0.4непряма
PyPIsphinx9.1.0непряма
PyPIsphinx-autodoc-typehints—непряма
PyPIsphinx-autodoc-typehints2.3.0непряма
PyPIsphinx-autodoc-typehints3.0.1непряма
PyPIsphinx-autodoc-typehints3.13.4непряма
PyPIsphinx-autodoc-typehints3.6.1непряма
PyPIsphinx-basic-ng1.0.0b2непряма
PyPIsphinxcontrib-applehelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-devhelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-htmlhelp2.1.0непряма
PyPIsphinxcontrib-jsmath1.0.1непряма
PyPIsphinxcontrib-qthelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-serializinghtml2.0.0непряма
PyPIsqlalchemy2.0.52непряма
PyPIstack-data0.6.3непряма
PyPItabulate0.10.0непряма
PyPItabulate0.9.0непряма
PyPItomli2.4.1непряма
PyPItornado6.5.8непряма
PyPItraitlets5.15.1непряма
PyPItraitlets5.16.1непряма
PyPItyping-extensions4.16.0непряма
PyPItzdata2026.3непряма
PyPIuc-micro-py1.0.3непряма
PyPIuc-micro-py2.0.0непряма
PyPIurllib32.6.3непряма
PyPIurllib32.7.0непряма
PyPIwcwidth0.8.2непряма
PyPIzipp3.23.1непряма
PyPIzipp4.1.0непряма
Сповіщення про залежності 0

Встановлення pypi:biocframe@0.8.1 тягне 2 пакетів, прямих і транзитивних: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 — прямі залежності.

Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.