Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-09-05 16:33 UTC

Marcello-Sega / pytim

a python package for the interfacial analysis of molecular simulations

PythonGPL-3.0★ 98 зірок⑂ 38 форківз лют. 2017 р.Переглянути на GitHub ↗

#simulations #molecular-dynamics #data-analysis #mdanalysis #gromacs #namd #charmm #lammps #interfaces #scientific-computing #willard-chandler #molecular-simulations #mdtraj #interfacial-atoms #openmm #python #sasa

Marcello-Sega/pytim має індекс здоров’я 65 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Vitality (69/100), найнижчий — AI Readiness (35/100). Останнє оновлення було 8 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

загалом / 100

Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям

Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини

Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані

Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку

Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах

У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності

Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 60 калібровано до 65 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Marcello SegaОсобистий обліковий запис

54 підписники50 публічних репозиторіївз лист. 2010 р.University College London

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Пакетні екосистеми

Реєстр	Пакет	Версія	Завантажень / міс	Версії	Остання публікація	Теги
PyPI	pytim	1.0.9	-	28	64 дні тому	molecular simulations analysis

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

69Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

54Помірний

Як обчислюється оцінка

28.8/36	Свіжість push — останній push 8 дн. тому
4.2/36	Ритм комітів — 6/52 тижнів із комітами
11.1/18	Обсяг комітів — 16 комітів за останній рік
10/10	OpenSSF Scorecard: Maintained — 11 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10

Використані вхідні дані

commits_last_year	16
human_commit_share	0,99
days_since_last_push	8
active_weeks_last_year	6

Дисципліна релізів

92Відмінний

Як обчислюється оцінка

27/27	Випускає релізи — опубліковано 17 релізів
36/36	Свіжість релізів — останній реліз 64 дн. тому
19.8/27	Ритм релізів — реліз кожні ~77,3 дн.
0/10	OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних

Використані вхідні дані

releases_count	17
latest_release_tag	v1.0.9
releases_from_tags	ні
days_since_latest_release	64
mean_days_between_releases	77,3

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

59Помірний · 17% загального індексу

Здоров'я спільноти

72Добрий

Як обчислюється оцінка

22.5/22.5	README
22.5/22.5	Ліцензія — визнана ліцензія (GPL-3.0)
0/18	Настанови CONTRIBUTING
13.5/13.5	Кодекс поведінки
0/7.2	Шаблон issue
6.3/6.3	Шаблон PR

Використані вхідні дані

has_readme	так
has_license	так
readme_badges	10
has_contributing	ні
has_issue_template	ні
has_code_of_conduct	так
readme_badge_services	badge.fury.io, codecov.io, shields.io, travis-ci.com
has_pull_request_template	так

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

60Помірний · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

32У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

9/54	Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
3.6/22.5	Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 84% комітів
13.5/13.5	Широта контриб’юторів — 10 контриб’юторів
6/10	OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6

Використані вхідні дані

bus_factor	1
contributors_sampled	10
top_contributor_share	0,839

Реактивність на issue та PR

62Помірний

Як обчислюється оцінка

30.7/42	Вирішення issue — закрито 73% issue
23.6/30	Прийняття PR — злито 315/401 вирішених PR
0/13	Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15	OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/19 approved changesets -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

merged_prs	315
open_issues	15
closed_issues	41
prs_merged_7d	0
prs_decided_7d	0
prs_merged_30d	0
prs_decided_30d	0
issue_closed_ratio	0,732
closed_unmerged_prs	86
first_time_authors_30d	0
first_time_prs_merged_30d	0
first_time_prs_decided_30d	0

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

59Помірний

Як обчислюється оцінка

10/30	Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис
0/20	Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів
12.5/25	Охоплення власника — 54 підписників у Marcello-Sega
24.4/25	Послужний список — 50 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~15 р.

Використані вхідні дані

followers	54
owner_type	User
is_verified	—
owner_login	Marcello-Sega
public_repos	50
account_age_days	5 785

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

25/25	Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35	Свіжість публікацій — остання публікація 64 дн. тому
20/20	Історія версій — 28 опублікованих версій
20/20	Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked

Використані вхідні дані

packages	pytim
ecosystems	pypi
any_deprecated	ні
min_days_since_publish	64

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

60Помірний · 19% загального індексу

Інженерні практики

34У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

24/24	Процеси CI — 3 процес(ів) CI
0/24	Наявні тести
0/16	Конфігурація лінтера
0/9.6	Pre-commit-хуки
0/6.4	.editorconfig
10/20	OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 9 out of 16 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 5

Використані вхідні дані

has_ci	так
has_tests	ні
has_editorconfig	ні
has_linter_config	ні
has_precommit_config	ні

Документація

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

30/30	README
25/25	Каталог документації
15/15	Сайт документації / домашня сторінка — https://marcello-sega.github.io/pytim/
10/10	Опис репозиторію
10/10	Теми — 17 тем
10/10	Wiki

Використані вхідні дані

topics	simulations, molecular-dynamics, data-analysis, mdanalysis, gromacs, namd, charmm, lammps, interfaces, scientific-computing, willard-chandler, molecular-simulations, mdtraj, interfacial-atoms, openmm, python, sasa
has_wiki	так
homepage	https://marcello-sega.github.io/pytim/
docs_site	https://marcello-sega.github.io/pytim/
has_readme	так
has_docs_dir	так
has_description	так

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

58Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

48Слабкий

Як обчислюється оцінка

7.5/7.5	Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5	Branch-Protection — немає даних
1.2/2.5	CI-Tests — 9 out of 16 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 5
0/2.5	CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5	Code-Review — Found 0/19 approved changesets -- score normalized to 0
1.5/2.5	Contributors — project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6
10/10	Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5	Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5	Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5	Ліцензія — license file detected
7.5/7.5	Maintained — 11 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
5/5	Packaging — packaging workflow detected
0.5/5	Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 1
0/5	SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5	Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5	Signed-Releases — немає даних
0/7.5	Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5	Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected

Використані вхідні дані

source	openssf_scorecard
checks_evaluated	16
scorecard_version	v5.5.0
checks_inconclusive	2
scorecard_aggregate	4,8

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Branch-Protection, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

35/35	Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень
25/25	Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень
0/40	Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації

Використані вхідні дані

source	osv
advisories	0
affected_packages	0
assessed_packages	63
unassessed_packages	0
affected_by_severity	none
direct_affected_packages	0

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Немає задавнених сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:pytim@1.0.9 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 63 пакетів. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

35Слабкий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

14Критичний

Як обчислюється оцінка

0/45	Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15	Машиночитана документація (llms.txt)
14.5/40	Читабельна історія комітів — намір зазначено у 27 з 99 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)

Використані вхідні дані

has_llms_txt	ні
llms_txt_url	—
legible_history_share	0,273
agent_instruction_files	—
agent_instruction_max_bytes	—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

19Критичний

Як обчислюється оцінка

18/18	Розгортання однією командою — docs/Makefile
0/22	Автоматизовані тести
0/11	Конфігурація лінтера / форматера
0/11	Статична перевірка типів
0/10	Відтворюване середовище
0/10	Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8	Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
1/10	OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 1

Використані вхідні дані

has_nix	ні
has_tests	ні
lockfiles	—
has_dockerfile	ні
typed_language	ні
bootstrap_files	docs/Makefile
has_devcontainer	ні
has_linter_config	ні
typecheck_configs	—
agent_commit_share	0
toolchain_manifests	—
dependency_bot_commit_share	0

Читабельність коду для моделей

55Помірний

Як обчислюється оцінка

0/45	Типізований код — Python без конфігурації перевірки типів
55/55	Керовані розміри файлів — 0/54 файлів вихідного коду понад 60 КБ

Використані вхідні дані

primary_language	Python
largest_source_bytes	56 209
source_files_sampled	54
oversized_source_files	0

Машиночитні інтерфейси

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

0/40	Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20	Сервер MCP — не застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40	Придатні до запуску приклади — examples

Використані вхідні дані

example_dirs	examples
has_mcp_signal	ні
api_schema_files	—
interfaces_expected_of	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

98зірок GitHub

10контриб'юторів

16комітів за останні 12 місяців

8днів від останнього пушу

17релізів

1бас-фактор

15відкритих issue

PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
pypi download statistics for 'pytim' unavailable this scan (stats endpoint failed after retries); adoption may be under-evidenced

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 38 ⇿

0Зірки

38Форки

10Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

Мажорні 1Мінорні 2Патчі 7

Кожна точка охоплює 8 днів.

OpenSSF Scorecard 4.8 / 10

4.8сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-09-05 16:32 UTC

10	Binary-Artifacts	no binaries found in the repo
н/д	Branch-Protection	internal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
5	CI-Tests	9 out of 16 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 5
0	CII-Best-Practices	no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0	Code-Review	Found 0/19 approved changesets -- score normalized to 0
6	Contributors	project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6
10	Dangerous-Workflow	no dangerous workflow patterns detected
0	Dependency-Update-Tool	no update tool detected
0	Fuzzing	project is not fuzzed
10	License	license file detected
10	Maintained	11 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
10	Packaging	packaging workflow detected
1	Pinned-Dependencies	dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 1
0	SAST	SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0	Security-Policy	security policy file not detected
н/д	Signed-Releases	no releases found
0	Token-Permissions	detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10	Vulnerabilities	0 existing vulnerabilities detected

Прямі залежності 12

Реєстр	Пакет	Обмеження версії	Маніфест
PyPI	numpy	`>=2.1.3`	pyproject.toml
PyPI	cython	`>=3.0.11`	pyproject.toml
PyPI	gsd	`>3.0.0`	pyproject.toml
PyPI	MDAnalysis	`>=2.8.0`	pyproject.toml
PyPI	scipy	`>=1.15.0`	pyproject.toml
PyPI	setuptools	`—`	pyproject.toml
PyPI	PyWavelets	`>=1.8.0`	pyproject.toml
PyPI	scikit-image	`>=0.25.0rc0`	pyproject.toml
PyPI	sphinx	`>=7.4.0`	pyproject.toml
PyPI	matplotlib	`—`	pyproject.toml
PyPI	pytest	`—`	pyproject.toml
PyPI	dask	`>=2024.7.0`	pyproject.toml

Усі залежності 19

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 12 прямих і 7 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

Реєстр	Пакет	Версія	Зв'язок
PyPI	cython	`—`	пряма
PyPI	dask	`—`	пряма
PyPI	gsd	`—`	пряма
PyPI	matplotlib	`—`	пряма
PyPI	mdanalysis	`—`	пряма
PyPI	numpy	`—`	пряма
PyPI	pytest	`—`	пряма
PyPI	pywavelets	`—`	пряма
PyPI	scikit-image	`—`	пряма
PyPI	scipy	`—`	пряма
PyPI	setuptools	`—`	пряма
PyPI	sphinx	`—`	пряма
PyPI	build	`—`	непряма
PyPI	codecov	`—`	непряма
PyPI	mdtraj	`—`	непряма
PyPI	nose	`—`	непряма
PyPI	openmm	`—`	непряма
PyPI	packaging	`—`	непряма
PyPI	pytest-cov	`—`	непряма

Сповіщення про залежності 0

Встановлення pypi:pytim@1.0.9 тягне 63 пакетів, прямих і транзитивних: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 — прямі залежності.

Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.

32.2/60	Зірки — 98 зірок
13.1/25	Форки — 38 форків
2.7/15	Спостерігачі — 4 спостерігачів

forks	38
stars	98
watchers	4
growth_state	unverified
growth_factor_pct	100
growth_unverified_reason	no_history

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Профіль оцінок

Власність

Пакетні екосистеми

Метрики за категоріями

Ключові факти

Попередження щодо збору даних

Докладніше

Зворотний зв’язок

Пов’язані записи