Публічний реєстрДобрий
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.27.0 · метрики 2.5.0 · 2026-07-24 20:52 UTC
dnanexus / dx-toolkit
DNAnexus platform client libraries
dnanexus/dx-toolkit має індекс здоров’я 75 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Vitality (88/100), найнижчий — Engineering Quality (46/100). Останнє оновлення — сьогодні. Більшість нещодавньої роботи виконують 2 учасники.
75
загалом / 100Індекс здоров'я програмного забезпечення
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
75
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
Профіль оцінок
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 65 калібровано до 75 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
Власність
DNAnexusОрганізація
158 підписників16 публічних репозиторіївз жовт. 2011 р.
За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.
Пакетні екосистеми
| Реєстр | Пакет | Версія | Завантажень / міс | Версії | Остання публікація |
|---|---|---|---|---|---|
| PyPI | dxpy | 0.410.0 | 45 752 | 371 | 10 днів тому |
Метрики за категоріями
Життєздатність
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
88
Активність розробки
88Відмінний
Як обчислюється оцінка
| 36/36 | Свіжість push — останній push 0 дн. тому |
| 24.2/36 | Ритм комітів — 35/52 тижнів із комітами |
| 17.6/18 | Обсяг комітів — 91 комітів за останній рік |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 16 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
Використані вхідні дані
| commits_last_year | 91 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 0 |
| active_weeks_last_year | 35 |
Дисципліна релізів
88Відмінний
Як обчислюється оцінка
| 16.2/27 | Випускає релізи — 100 тегів версій (без релізів GitHub) |
| 36/36 | Свіжість релізів — останній реліз 10 дн. тому |
| 27/27 | Ритм релізів — реліз кожні ~18,7 дн. |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних |
Використані вхідні дані
| releases_count | 100 |
| latest_release_tag | v0.411.0 |
| releases_from_tags | так |
| days_since_latest_release | 10 |
| mean_days_between_releases | 18,7 |
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.
Спільнота та впровадження
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
61
Популярність і впровадження
59Помірний
Як обчислюється оцінка
| 33.2/60 | Зірки — 112 зірок |
| 16.3/25 | Форки — 91 форків |
| 9.9/15 | Спостерігачі — 62 спостерігачів |
Використані вхідні дані
| forks | 91 |
| stars | 112 |
| watchers | 62 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Здоров'я спільноти
50Помірний
Як обчислюється оцінка
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Ліцензія — визнана ліцензія (Apache-2.0) |
| 0/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 0/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
Використані вхідні дані
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | — |
| has_contributing | ні |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | ні |
| readme_badge_services | — |
| has_pull_request_template | ні |
Як обчислюється оцінка
| 62.1/80 | Щомісячні завантаження — 45 752 завантажень/місяць у pypi |
| 0/20 | Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє |
Використані вхідні дані
| packages | dxpy |
| dependents | — |
| ecosystems | pypi |
| total_downloads | — |
| monthly_downloads | 45 752 |
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.
Сталість та врядування
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
74
Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)
63Помірний
Як обчислюється оцінка
| 25.2/54 | Бас-фактор — на 2 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 13.9/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 38% комітів |
| 13.5/13.5 | Широта контриб’юторів — 99 контриб’юторів |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 13 contributing companies or organizations |
Використані вхідні дані
| bus_factor | 2 |
| contributors_sampled | 99 |
| top_contributor_share | 0,382 |
Реактивність на issue та PR
75Добрий
Як обчислюється оцінка
| 0/42 | Вирішення issue — немає issue або даних |
| 24.6/30 | Прийняття PR — злито 1 131/1 379 вирішених PR |
| 0/13 | Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка |
| 9/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 19/30 approved changesets -- score normalized to 6 |
Використані вхідні дані
| merged_prs | 1 131 |
| open_issues | 0 |
| closed_issues | 0 |
| prs_merged_7d | — |
| prs_decided_7d | — |
| prs_merged_30d | — |
| prs_decided_30d | — |
| issue_closed_ratio | — |
| closed_unmerged_prs | 248 |
| first_time_authors_30d | — |
| first_time_prs_merged_30d | — |
| first_time_prs_decided_30d | — |
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Вирішення issue, newcomer_pr_acceptance. Залишкові ваги перенормовано.
Власність та опіка
67Добрий
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | Підтримка власника — у власності організації |
| 0/20 | Верифікований домен |
| 15.8/25 | Охоплення власника — 158 підписників у dnanexus |
| 21/25 | Послужний список — 16 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~14 р. |
Використані вхідні дані
| followers | 158 |
| owner_type | Organization |
| is_verified | — |
| owner_login | dnanexus |
| public_repos | 16 |
| account_age_days | 5 381 |
Супровід пакетів
100Винятковий
Як обчислюється оцінка
| 25/25 | Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi |
| 35/35 | Свіжість публікацій — остання публікація 10 дн. тому |
| 20/20 | Історія версій — 371 опублікованих версій |
| 20/20 | Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked |
Використані вхідні дані
| packages | dxpy |
| ecosystems | pypi |
| any_deprecated | ні |
| min_days_since_publish | 10 |
Інженерна якість
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
46
Інженерні практики
24У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
| 0/24 | Процеси CI |
| 24/24 | Наявні тести |
| 0/16 | Конфігурація лінтера |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 0/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 0 out of 19 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| has_ci | ні |
| has_tests | так |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | ні |
| has_precommit_config | ні |
Документація
80Відмінний
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | README |
| 25/25 | Каталог документації |
| 15/15 | Сайт документації / домашня сторінка — http://autodoc.dnanexus.com/ |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 0/10 | Теми |
| 0/10 | Wiki |
Використані вхідні дані
| topics | — |
| has_wiki | ні |
| homepage | http://autodoc.dnanexus.com/ |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | так |
| has_description | так |
Безпека
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
53
Стан безпеки
46Слабкий
Як обчислюється оцінка
| 6.8/7.5 | Binary-Artifacts — binaries present in source code |
| 0/7.5 | Branch-Protection — немає даних |
| 0/2.5 | CI-Tests — 0 out of 19 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0 |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 4.5/7.5 | Code-Review — Found 19/30 approved changesets -- score normalized to 6 |
| 2.5/2.5 | Contributors — project has 13 contributing companies or organizations |
| 0/10 | Dangerous-Workflow — немає даних |
| 7.5/7.5 | Dependency-Update-Tool — update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 7.5/7.5 | Maintained — 16 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| 0/5 | Packaging — немає даних |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0/5 | SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0/5 | Security-Policy — security policy file not detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — немає даних |
| 0/7.5 | Token-Permissions — немає даних |
| 0/7.5 | Vulnerabilities — 21 existing vulnerabilities detected |
Використані вхідні дані
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 13 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 5 |
| scorecard_aggregate | 4,6 |
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): branch_protection, dangerous_workflow, packaging, signed_releases, token_permissions. Залишкові ваги перенормовано.
Сповіщення про залежності
79Добрий
Як обчислюється оцінка
| 14/35 | Прямі залежності без відомих сповіщень — уражено 1: urllib3 2.6.3 (high 7.5) |
| 25/25 | Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень |
| 40/40 | Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не є публічним довше за 90 дн. |
Використані вхідні дані
| source | osv |
| advisories | 4 |
| affected_packages | 1 |
| assessed_packages | 9 |
| unassessed_packages | 0 |
| affected_by_severity | high 1 |
| direct_affected_packages | 1 |
Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:dxpy@0.410.0 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 9 пакетів. Досяжність не аналізується.
Готовність до ШІ
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
57
Контекст і настанови для агентів
71Добрий
Як обчислюється оцінка
| 45/45 | Інструкції для агентів — .github/copilot-instructions.md |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 25.6/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 48 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
Використані вхідні дані
| has_llms_txt | ні |
| legible_history_share | 0,48 |
| agent_instruction_files | .github/copilot-instructions.md |
| agent_instruction_max_bytes | 316 |
Як обчислюється оцінка
| 18/18 | Розгортання однією командою — Makefile, doc/examples/dx-assets/qiime_microbiome_example/Makefile, doc/examples/dx-cpp-apps/hello_world_app/Makefile, doc/examples/dx-cpp-apps/hello_world_app/src/Makefile, doc/examples/dx-java-apps/hello_world_java/Makefile, doc/examples/dx-java-apps/parallelism_java/Makefile, src/Makefile, src/cpp/Makefile, src/cpp/test/Makefile, src/dx-verify-file/Makefile, src/python/doc/Makefile, src/ua/Makefile |
| 22/22 | Автоматизовані тести |
| 0/11 | Конфігурація лінтера / форматера |
| 0/11 | Статична перевірка типів |
| 10/10 | Відтворюване середовище — Dockerfile |
| 0/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом |
| 5/8 | Автоматизоване супроводження — автоматизацію залежностей налаштовано, але у вибірці комітів її не видно |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| has_nix | ні |
| has_tests | так |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | так |
| typed_language | ні |
| bootstrap_files | Makefile, doc/examples/dx-assets/qiime_microbiome_example/Makefile, doc/examples/dx-cpp-apps/hello_world_app/Makefile, doc/examples/dx-cpp-apps/hello_world_app/src/Makefile, doc/examples/dx-java-apps/hello_world_java/Makefile, doc/examples/dx-java-apps/parallelism_java/Makefile, src/Makefile, src/cpp/Makefile, src/cpp/test/Makefile, src/dx-verify-file/Makefile, src/python/doc/Makefile, src/ua/Makefile |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | ні |
| typecheck_configs | — |
| agent_commit_share | 0 |
| toolchain_manifests | src/java/pom.xml |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
Читабельність коду для моделей
53Помірний
Як обчислюється оцінка
| 0/45 | Типізований код — Python без конфігурації перевірки типів |
| 52.7/55 | Керовані розміри файлів — 12/289 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
Використані вхідні дані
| primary_language | Python |
| largest_source_bytes | 1 967 816 |
| source_files_sampled | 289 |
| oversized_source_files | 12 |
Машиночитні інтерфейси
40Слабкий
Як обчислюється оцінка
| 0/40 | Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) |
| 0/20 | Сервер MCP |
| 40/40 | Придатні до запуску приклади — examples |
Використані вхідні дані
| example_dirs | examples |
| has_mcp_signal | ні |
| api_schema_files | — |
Ключові факти
112зірок GitHub
99контриб'юторів
91комітів за останні 12 місяців
0днів від останнього пушу
100релізів
2бас-фактор
0відкритих issue
—пакетних екосистем
Попередження щодо збору даних
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
- Could not fetch maven package 'com.dnanexus:dnanexus-api' from its registry
Докладніше
Історія зірок і форків 0 ★ / 91 ⇿
0Зірки
91Форки
98Релізи
Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.
Мажорні 0Мінорні 79Патчі 19
Кожна точка охоплює 13 днів.
OpenSSF Scorecard 4.6 / 10
4.6сукупно
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 9 | Binary-Artifacts | binaries present in source code |
| н/д | Branch-Protection | internal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md |
| 0 | CI-Tests | 0 out of 19 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0 |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 6 | Code-Review | Found 19/30 approved changesets -- score normalized to 6 |
| 10 | Contributors | project has 13 contributing companies or organizations |
| н/д | Dangerous-Workflow | no workflows found |
| 10 | Dependency-Update-Tool | update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 10 | Maintained | 16 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| н/д | Packaging | packaging workflow not detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 0 | SAST | SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0 |
| 0 | Security-Policy | security policy file not detected |
| н/д | Signed-Releases | no releases found |
| н/д | Token-Permissions | No tokens found |
| 0 | Vulnerabilities | 21 existing vulnerabilities detected |
Прямі залежності 8
| Реєстр | Пакет | Обмеження версії | Маніфест |
|---|---|---|---|
| Maven | org.apache.logging.log4j:log4j-core | 2.17.1 | src/java/pom.xml |
| Maven | org.apache.logging.log4j:log4j-api | 2.17.1 | src/java/pom.xml |
| Maven | org.apache.httpcomponents:httpclient | 4.5.14 | src/java/pom.xml |
| Maven | commons-io:commons-io | 2.18.0 | src/java/pom.xml |
| Maven | commons-codec:commons-codec | 1.10 | src/java/pom.xml |
| Maven | com.fasterxml.jackson.core:jackson-core | 2.18.2 | src/java/pom.xml |
| Maven | com.fasterxml.jackson.core:jackson-databind | 2.18.2 | src/java/pom.xml |
| Maven | com.google.guava:guava | 33.4.0-jre | src/java/pom.xml |
Усі залежності 38
Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 8 прямих і 30 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.
| Реєстр | Пакет | Версія | Зв'язок |
|---|---|---|---|
| Maven | com.fasterxml.jackson.core:jackson-core | 2.18.2 | пряма |
| Maven | com.fasterxml.jackson.core:jackson-databind | 2.18.2 | пряма |
| Maven | com.google.guava:guava | 33.4.0-jre | пряма |
| Maven | commons-codec:commons-codec | 1.10 | пряма |
| Maven | commons-io:commons-io | 2.18.0 | пряма |
| Maven | org.apache.httpcomponents:httpclient | 4.5.14 | пряма |
| Maven | org.apache.logging.log4j:log4j-api | 2.17.1 | пряма |
| Maven | org.apache.logging.log4j:log4j-core | 2.17.1 | пряма |
| Maven | com.dnanexus:maven-dependency-plugin | 0.1.0-SNAPSHOT | непряма |
| Maven | junit:junit | 4.13.1 | непряма |
| Maven | org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin | 2.0.2 | непряма |
| Maven | org.apache.maven.plugins:maven-javadoc-plugin | 2.8.1 | непряма |
| Maven | org.apache.maven.plugins:maven-source-plugin | 2.4 | непряма |
| Maven | org.mockito:mockito-core | 2.0.96-beta | непряма |
| PyPI | argcomplete | — | непряма |
| PyPI | awscrt | — | непряма |
| PyPI | certifi | — | непряма |
| PyPI | crc32c | — | непряма |
| PyPI | mock | 5.2.0 | непряма |
| PyPI | numpy | — | непряма |
| PyPI | pandas | 2.0.3 | непряма |
| PyPI | pandas | 2.2.3 | непряма |
| PyPI | parameterized | 0.8.1 | непряма |
| PyPI | pexpect | 4.6 | непряма |
| PyPI | pip | 26.0 | непряма |
| PyPI | psutil | — | непряма |
| PyPI | pyreadline3 | 3.5.6 | непряма |
| PyPI | pytest | 7.4.2 | непряма |
| PyPI | pytest-timeout | 2.1.0 | непряма |
| PyPI | pytest-xdist | 3.3.1 | непряма |
| PyPI | python-dateutil | — | непряма |
| PyPI | requests | — | непряма |
| PyPI | setuptools | 78.1.1 | непряма |
| PyPI | sphinx | 7.1.2 | непряма |
| PyPI | urllib3 | — | непряма |
| PyPI | websocket-client | — | непряма |
| PyPI | wheel | 0.42.0 | непряма |
| PyPI | xattr | 1.1.4 | непряма |
Сповіщення про залежності 1
Встановлення pypi:dxpy@0.410.0 тягне 9 пакетів, прямих і транзитивних: 1 мають відомі сповіщення, з них 1 — прямі залежності.
| Пакет | Версія | Зв'язок | Критичність | Сповіщень | Виправлено в |
|---|---|---|---|---|---|
| urllib3 | 2.6.3 | пряма | висока | 4 | 2.7.0 |
Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.
Звіт у форматі JSON машиночитний
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.5.0, схема v0.27.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.