Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.11.0 · метрики 2.10.0 · 2026-07-15 11:24 UTC

mooreneural / proteintensor

AI-native tensor format (.ptt) for protein-structure ML. Convert a structure or sequence once; load backbone, MSA, ESM embeddings, sparse pair features, and ligands with zero parsing. Feeds AlphaFold/Boltz (Boltz-2 verified). Zarr-backed, lossless, PyTorch/JAX-ready, streams from S3/GCS.

PythonMIT★ 1 зірка⑂ 0 форківз черв. 2026 р.Переглянути на GitHub ↗

ТипБібліотекаІнструмент командного рядкаяк це визначено

#computational-biology #protein-language-model #tensor-format

mooreneural/proteintensor має індекс здоров’я 53 зі 100, що відповідає смузі «Помірний». Найвищий показник — Engineering Quality (76/100), найнижчий — AI Readiness (23/100). Останнє оновлення було 5 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

загалом / 100

Помірний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям

Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини

Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані

Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку

Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах

У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності

Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 52 калібровано до 53 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Clay MooreОсобистий обліковий запис

3 підписники21 публічний репозиторійз бер. 2024 р.Texas A&M University

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Пакетні екосистеми

Реєстр	Пакет	Версія	Завантажень / міс	Версії	Остання публікація	Теги
PyPI	proteintensor	0.4.0	-	4	6 днів тому	protein-structure structural-biology machine-learning tensor zarr alphafold boltz

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

73Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

55Помірний

Як обчислюється оцінка

36/36	Свіжість push — останній push 5 дн. тому
3.5/36	Ритм комітів — 5/52 тижнів із комітами
15.8/18	Обсяг комітів — 57 комітів за останній рік
0/10	OpenSSF Scorecard: Maintained — project was created within the last 90 days. Please review its contents carefully

Використані вхідні дані

commits_last_year	57
human_commit_share	—
days_since_last_push	5
active_weeks_last_year	5

Дисципліна релізів

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

27/27	Випускає релізи — опубліковано 4 релізів
36/36	Свіжість релізів — останній реліз 6 дн. тому
27/27	Ритм релізів — реліз кожні ~11,6 дн.
0/10	OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — немає даних

Використані вхідні дані

releases_count	4
latest_release_tag	v0.4.0
releases_from_tags	ні
days_since_latest_release	6
mean_days_between_releases	11,6

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

43Слабкий · 17% загального індексу

Здоров'я спільноти

92Відмінний

Як обчислюється оцінка

22.5/22.5	README
22.5/22.5	Ліцензія — визнана ліцензія (MIT)
18/18	Настанови CONTRIBUTING
13.5/13.5	Кодекс поведінки
0/7.2	Шаблон issue
6.3/6.3	Шаблон PR

Використані вхідні дані

has_readme	так
has_license	так
readme_badges	—
has_contributing	так
has_issue_template	ні
has_code_of_conduct	так
readme_badge_services	—
has_pull_request_template	так

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

32У зоні ризику · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

13Критичний

Як обчислюється оцінка

9/54	Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
0/22.5	Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 100% комітів
1.4/13.5	Широта контриб’юторів — 1 контриб’юторів
3/10	OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3

Використані вхідні дані

bus_factor	1
contributors_sampled	1
top_contributor_share	1

Реактивність на issue та PR

1Критичний

Як обчислюється оцінка

0/42	Вирішення issue — немає issue або даних
0/30	Прийняття PR — немає вирішених pull request-ів або даних
0/13	Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15	OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

merged_prs	0
open_issues	0
closed_issues	0
prs_merged_7d	—
prs_decided_7d	—
prs_merged_30d	—
prs_decided_30d	—
issue_closed_ratio	—
closed_unmerged_prs	0
first_time_authors_30d	—
first_time_prs_merged_30d	—
first_time_prs_decided_30d	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Вирішення issue, Прийняття PR, Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

36Слабкий

Як обчислюється оцінка

10/30	Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис
0/20	Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів
4.3/25	Охоплення власника — 3 підписників у mooreneural
14.4/25	Послужний список — 21 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~2 р.

Використані вхідні дані

followers	3
owner_type	User
is_verified	—
owner_login	mooreneural
public_repos	21
account_age_days	842

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

92Відмінний

Як обчислюється оцінка

25/25	Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у pypi
35/35	Свіжість публікацій — остання публікація 6 дн. тому
12/20	Історія версій — 4 опублікованих версій
20/20	Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked

Використані вхідні дані

packages	proteintensor
ecosystems	pypi
any_deprecated	ні
min_days_since_publish	6

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

76Добрий · 19% загального індексу

Інженерні практики

60Помірний

Як обчислюється оцінка

24/24	Процеси CI — 1 процес(ів) CI
24/24	Наявні тести
0/16	Конфігурація лінтера
0/9.6	Pre-commit-хуки
0/6.4	.editorconfig
0/20	OpenSSF Scorecard: CI-Tests — немає даних

Використані вхідні дані

has_ci	так
has_tests	так
has_editorconfig	ні
has_linter_config	ні
has_precommit_config	ні

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: CI-Tests. Залишкові ваги перенормовано.

Документація

100Винятковий

Як обчислюється оцінка

30/30	README
25/25	Каталог документації
15/15	Сайт документації / домашня сторінка — https://zenodo.org/records/21266859
10/10	Опис репозиторію
10/10	Теми — 3 тем
10/10	Wiki

Використані вхідні дані

topics	computational-biology, protein-language-model, tensor-format
has_wiki	так
homepage	https://zenodo.org/records/21266859
docs_site	https://zenodo.org/records/21266859
has_readme	так
has_docs_dir	так
has_description	так

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

40Слабкий · 16% загального індексу

Стан безпеки

40Слабкий

Як обчислюється оцінка

7.5/7.5	Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5	Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches
0/2.5	CI-Tests — немає даних
0/2.5	CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5	Code-Review — Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0
0.8/2.5	Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
10/10	Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5	Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5	Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5	Ліцензія — license file detected
0/7.5	Maintained — project was created within the last 90 days. Please review its contents carefully
5/5	Packaging — packaging workflow detected
0/5	Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5	SAST — no SAST tool detected
5/5	Security-Policy — security policy file detected
0/7.5	Signed-Releases — немає даних
0/7.5	Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5	Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected

Використані вхідні дані

source	openssf_scorecard
checks_evaluated	16
scorecard_version	v5.5.0
checks_inconclusive	2
scorecard_aggregate	4

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): CI-Tests, Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

23У зоні ризику · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

1Критичний

Як обчислюється оцінка

0/45	Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15	Машиночитана документація (llms.txt)
0/40	Читабельна історія комітів — немає даних

Використані вхідні дані

has_llms_txt	ні
llms_txt_url	—
legible_history_share	—
agent_instruction_files	—
agent_instruction_max_bytes	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Читабельна історія комітів. Залишкові ваги перенормовано.

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

27У зоні ризику

Як обчислюється оцінка

0/18	Розгортання однією командою
22/22	Автоматизовані тести
0/11	Конфігурація лінтера / форматера
0/11	Статична перевірка типів
0/10	Відтворюване середовище
0/10	Підтверджена практика роботи з агентами — немає даних
0/8	Автоматизоване супроводження — немає даних
0/10	OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0

Використані вхідні дані

has_nix	ні
has_tests	так
lockfiles	—
has_dockerfile	ні
typed_language	ні
bootstrap_files	—
has_devcontainer	ні
has_linter_config	ні
typecheck_configs	—
agent_commit_share	—
toolchain_manifests	—
dependency_bot_commit_share	—

Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Підтверджена практика роботи з агентами, Автоматизоване супроводження. Залишкові ваги перенормовано.

Читабельність коду для моделей

55Помірний

Як обчислюється оцінка

0/45	Типізований код — Python без конфігурації перевірки типів
55/55	Керовані розміри файлів — 0/43 файлів вихідного коду понад 60 КБ

Використані вхідні дані

primary_language	Python
largest_source_bytes	21 315
source_files_sampled	43
oversized_source_files	0

Ключові факти

1зірок GitHub

1контриб'юторів

57комітів за останні 12 місяців

5днів від останнього пушу

4релізів

1бас-фактор

0відкритих issue

PyPIпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository

Докладніше

OpenSSF Scorecard 4.0 / 10

4.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-15 11:24 UTC

10	Binary-Artifacts	no binaries found in the repo
0	Branch-Protection	branch protection not enabled on development/release branches
н/д	CI-Tests	no pull request found
0	CII-Best-Practices	no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0	Code-Review	Found 0/30 approved changesets -- score normalized to 0
3	Contributors	project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3
10	Dangerous-Workflow	no dangerous workflow patterns detected
0	Dependency-Update-Tool	no update tool detected
0	Fuzzing	project is not fuzzed
10	License	license file detected
0	Maintained	project was created within the last 90 days. Please review its contents carefully
10	Packaging	packaging workflow detected
0	Pinned-Dependencies	dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0	SAST	no SAST tool detected
10	Security-Policy	security policy file detected
н/д	Signed-Releases	no releases found
0	Token-Permissions	detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10	Vulnerabilities	0 existing vulnerabilities detected

Прямі залежності 6

Реєстр	Пакет	Обмеження версії	Маніфест
PyPI	zarr	`>=2.18,<3`	pyproject.toml
PyPI	numcodecs	`>=0.12`	pyproject.toml
PyPI	numpy	`>=1.24`	pyproject.toml
PyPI	gemmi	`>=0.6`	pyproject.toml
PyPI	click	`>=8.1`	pyproject.toml
PyPI	rich	`>=13`	pyproject.toml

Усі залежності не зібрано

Не вдалося зібрати розв'язаний набір залежностей для цього звіту: GitHub dependency-graph SBOM unavailable (404); the dependency graph may be disabled for this repository

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.11.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — PyPI.

0/60	Зірки — 1 зірок
0/25	Форки — 0 форків
0/15	Спостерігачі — 0 спостерігачів

forks	0
stars	1
watchers	0
growth_state	unverified
growth_factor_pct	100
growth_unverified_reason	no_history

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Профіль оцінок

Власність

Пакетні екосистеми

Метрики за категоріями

Ключові факти

Попередження щодо збору даних

Докладніше

Зворотний зв’язок

Пов’язані записи