Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.34.0 · метрики 2.10.0 · 2026-09-19 03:52 UTC

shenwei356 / LexicMap

LexicMap: efficient sequence alignment against millions of prokaryotic genomes

GoMIT★ 227 зірок⑂ 12 форківз лист. 2023 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипБібліотекаІнструмент командного рядкаяк це визначено
#prokaryotic-genomes#sequence-alignment#sequence-search#alignment#large-scale-dataset#microbial-genomes#bacterial-database#bacterial-genomes#lexichash

shenwei356/LexicMap має індекс здоров’я 63 зі 100, що відповідає смузі «Помірний». Найвищий показник — Vitality (76/100), найнижчий — Community & Adoption (49/100). Останнє оновлення було 3 дні тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

63
загалом / 100
Помірний

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

63
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 59 калібровано до 63 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Wei ShenОсобистий обліковий запис
1 493 підписники121 публічний репозиторійз жовт. 2012 р.Chongqing Medical University, China

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікація
Gogithub.com/shenwei356/LexicMapv0.9.0-11190 днів тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

76Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

84Відмінний
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 3 дн. тому
20.1/36Ритм комітів — 29/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів — 149 комітів за останній рік
10/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
commits_last_year149
human_commit_share1
days_since_last_push3
active_weeks_last_year29

Дисципліна релізів

63Помірний
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 11 релізів
16.2/36Свіжість релізів — останній реліз 189 дн. тому
19.8/27Ритм релізів — реліз кожні ~85,5 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
Використані вхідні дані
releases_count11
latest_release_tagv0.9.0
releases_from_tagsні
days_since_latest_release189
mean_days_between_releases85,5

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

49Слабкий · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

49Слабкий
Як обчислюється оцінка
38.2/60Зірки — 227 зірок
8.7/25Форки — 12 форків
1.7/15Спостерігачі — 3 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks12
stars227
watchers3
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (MIT)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges3
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_servicesshields.io
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

60Помірний · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

22У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
0/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 100% комітів
2.7/13.5Широта контриб’юторів — 2 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled2
top_contributor_share0,998

Реактивність на issue та PR

70Добрий
Як обчислюється оцінка
30.5/42Вирішення issue — закрито 73% issue
30/30Прийняття PR — злито 14/14 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/28 approved changesets -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
merged_prs14
open_issues6
closed_issues16
prs_merged_7d0
prs_decided_7d0
prs_merged_30d1
prs_decided_30d1
issue_closed_ratio0,727
closed_unmerged_prs0
first_time_authors_30d0
first_time_prs_merged_30d0
first_time_prs_decided_30d0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

72Добрий
Як обчислюється оцінка
10/30Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис
0/20Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів
22.8/25Охоплення власника — 1 493 підписників у shenwei356
25/25Послужний список — 121 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~13 р.
Використані вхідні дані
followers1 493
owner_typeUser
is_verified—
owner_loginshenwei356
public_repos121
account_age_days5 075
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

91Відмінний
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у go
26/35Свіжість публікацій — остання публікація 190 дн. тому
20/20Історія версій — 11 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesgithub.com/shenwei356/LexicMap
ecosystemsgo
any_deprecatedні
min_days_since_publish190

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

50Помірний · 19% загального індексу

Інженерні практики

24У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
0/24Процеси CI
24/24Наявні тести
0/16Конфігурація лінтера
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
0/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 0 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_ciні
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configні
has_precommit_configні

Документація

90Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://bioinf.shenwei.me/LexicMap
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 9 тем
0/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsprokaryotic-genomes, sequence-alignment, sequence-search, alignment, large-scale-dataset, microbial-genomes, bacterial-database, bacterial-genomes, lexichash
has_wikiні
homepagehttps://bioinf.shenwei.me/LexicMap
docs_sitehttps://bioinf.shenwei.me/LexicMap
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

56Помірний · 16% загального індексу

Стан безпеки

45Слабкий
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches
0/2.5CI-Tests — 0 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5Code-Review — Found 0/28 approved changesets -- score normalized to 0
2.5/2.5Contributors — project has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
0/10Dangerous-Workflow — немає даних
7.5/7.5Dependency-Update-Tool — update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
7.5/7.5Maintained — 30 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
0/5Packaging — немає даних
0/5Pinned-Dependencies — немає даних
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
0/7.5Token-Permissions — немає даних
7.5/7.5Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated14
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive4
scorecard_aggregate4,5
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Dangerous-Workflow, Packaging, Pinned-Dependencies, Token-Permissions. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
35/35Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень
0/25Непрямі залежності без відомих сповіщень — транзитивний набір не відокремлюється від залежностей розробки й тестування в цьому обсязі
0/40Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories0
affected_packages0
assessed_packages47
unassessed_packages0
affected_by_severitynone
direct_affected_packages0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Непрямі залежності без відомих сповіщень, Немає задавнених сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено 47 резолвлених залежностей із OSV. Цей репозиторій не публікує пакета, який резолвить індекс, тож натомість оцінено граф залежностей репозиторію. Цей граф змішує закріплені версії для розробки й тестування зі справді постачаними залежностями, тож оцінюються лише задекларовані runtime-залежності; транзитивні знахідки подаються як контекст і в оцінку не входять. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

54Помірний · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

20У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
20.3/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 38 з 100 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share0,38
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

62Помірний
Як обчислюється оцінка
12.6/18Розгортання однією командою — go.mod (домовленість інструментарію, без раннера задач)
22/22Автоматизовані тести
0/11Конфігурація лінтера / форматера
11/11Статична перевірка типів — Go (статично типізована)
10/10Відтворюване середовище — lockfile
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — немає даних
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfilesgo.sum
has_dockerfileні
typed_languageтак
bootstrap_files—
has_devcontainerні
has_linter_configні
typecheck_configs—
agent_commit_share0
toolchain_manifestsgo.mod
dependency_bot_commit_share0
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies. Залишкові ваги перенормовано.

Читабельність коду для моделей

98Винятковий
Як обчислюється оцінка
45/45Типізований код — Go (статично типізована)
53.4/55Керовані розміри файлів — 2/70 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageGo
largest_source_bytes88 366
source_files_sampled70
oversized_source_files2

Ключові факти

227зірок GitHub
2контриб'юторів
149комітів за останні 12 місяців
3днів від останнього пушу
11релізів
1бас-фактор
6відкритих issue
Goпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 12 ⇿
0Зірки
12Форки
7Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

0246810121222024-092025-082026-08
Мажорні 0Мінорні 5Патчі 2

Кожна точка охоплює 2 днів.

OpenSSF Scorecard 4.5 / 10
4.5сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-09-19 03:52 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0Branch-Protectionbranch protection not enabled on development/release branches
0CI-Tests0 out of 1 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 0
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0Code-ReviewFound 0/28 approved changesets -- score normalized to 0
10Contributorsproject has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
н/дDangerous-Workflowno workflows found
10Dependency-Update-Toolupdate tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
10Maintained30 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10
н/дPackagingpackaging workflow not detected
н/дPinned-Dependenciesno dependencies found
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
0Signed-ReleasesProject has not signed or included provenance with any releases.
н/дToken-PermissionsNo tokens found
10Vulnerabilities0 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 21
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
Gogithub.com/dustin/go-humanizev1.0.1go.mod
Gogithub.com/edsrzf/mmap-gov1.2.0go.mod
Gogithub.com/iafan/cwalkv0.0.0-20210125030640-586a8832a711go.mod
Gogithub.com/klauspost/pgzipv1.2.6go.mod
Gogithub.com/mattn/go-colorablev0.1.15go.mod
Gogithub.com/mitchellh/go-homedirv1.1.0go.mod
Gogithub.com/pelletier/go-toml/v2v2.4.3go.mod
Gogithub.com/pkg/errorsv0.9.1go.mod
Gogithub.com/rdleal/intervalstv1.5.0go.mod
Gogithub.com/shenwei356/biov0.15.1go.mod
Gogithub.com/shenwei356/go-loggingv0.0.0-20171012171522-c6b9702d88bago.mod
Gogithub.com/shenwei356/kmersv0.1.0go.mod
Gogithub.com/shenwei356/lexichashv0.6.0go.mod
Gogithub.com/shenwei356/utilv0.5.6go.mod
Gogithub.com/shenwei356/wfav0.5.0go.mod
Gogithub.com/shenwei356/xopenv0.4.0go.mod
Gogithub.com/spf13/cobrav1.10.2go.mod
Gogithub.com/twotwotwo/sortsv0.0.0-20160814051341-bf5c1f2b8553go.mod
Gogithub.com/vbauerster/mpb/v8v8.16.1go.mod
Gogonum.org/v1/gonumv0.17.0go.mod
Gogonum.org/v1/plotv0.17.0go.mod
Усі залежності 47

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 21 прямих і 26 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
Gogithub.com/dustin/go-humanizev1.0.1пряма
Gogithub.com/edsrzf/mmap-gov1.2.0пряма
Gogithub.com/iafan/cwalkv0.0.0-20210125030640-586a8832a711пряма
Gogithub.com/klauspost/pgzipv1.2.6пряма
Gogithub.com/mattn/go-colorablev0.1.15пряма
Gogithub.com/mitchellh/go-homedirv1.1.0пряма
Gogithub.com/pelletier/go-toml/v2v2.4.3пряма
Gogithub.com/pkg/errorsv0.9.1пряма
Gogithub.com/rdleal/intervalstv1.5.0пряма
Gogithub.com/shenwei356/biov0.15.1пряма
Gogithub.com/shenwei356/go-loggingv0.0.0-20171012171522-c6b9702d88baпряма
Gogithub.com/shenwei356/kmersv0.1.0пряма
Gogithub.com/shenwei356/lexichashv0.6.0пряма
Gogithub.com/shenwei356/utilv0.5.6пряма
Gogithub.com/shenwei356/wfav0.5.0пряма
Gogithub.com/shenwei356/xopenv0.4.0пряма
Gogithub.com/spf13/cobrav1.10.2пряма
Gogithub.com/twotwotwo/sortsv0.0.0-20160814051341-bf5c1f2b8553пряма
Gogithub.com/vbauerster/mpb/v8v8.16.1пряма
Gogonum.org/v1/gonumv0.17.0пряма
Gogonum.org/v1/plotv0.17.0пряма
Gocodeberg.org/go-fonts/liberationv0.6.0непряма
Gocodeberg.org/go-latex/latexv0.3.0непряма
Gocodeberg.org/go-pdf/fpdfv0.12.0непряма
Gogit.sr.ht/~sbinet/ggv0.8.0непряма
Gogithub.com/acarl005/stripansiv0.0.0-20180116102854-5a71ef0e047dнепряма
Gogithub.com/ajstarks/svgov0.0.0-20211024235047-1546f124cd8bнепряма
Gogithub.com/araddon/dateparsev0.0.0-20210429162001-6b43995a97deнепряма
Gogithub.com/clipperhouse/uax29/v2v2.7.0непряма
Gogithub.com/dsnet/compressv0.0.1непряма
Gogithub.com/elliotwutingfeng/asciisetv0.0.0-20260801111138-45c5fff54b41непряма
Gogithub.com/golang/freetypev0.0.0-20170609003504-e2365dfdc4a0непряма
Gogithub.com/inconshreveable/mousetrapv1.1.0непряма
Gogithub.com/klauspost/compressv1.19.2непряма
Gogithub.com/mattn/go-isattyv0.0.24непряма
Gogithub.com/mattn/go-runewidthv0.0.28непряма
Gogithub.com/pierrec/lz4/v4v4.1.29непряма
Gogithub.com/rogpeppe/go-internalv1.15.0непряма
Gogithub.com/shenwei356/breaderv0.3.2непряма
Gogithub.com/shenwei356/natsortv0.0.0-20220117010048-580176ad49fbнепряма
Gogithub.com/spf13/pflagv1.0.10непряма
Gogithub.com/ulikunitz/xzv0.5.16непряма
Gogithub.com/vbauerster/cupwriterv0.0.4непряма
Gogithub.com/vividcortex/ewmav1.2.0непряма
Gogolang.org/x/imagev0.45.0непряма
Gogolang.org/x/sysv0.47.0непряма
Gogolang.org/x/textv0.41.0непряма
Сповіщення про залежності 0

Цей репозиторій не публікує пакета, який розпізнає індекс, тож оцінено його власний граф залежностей — 47 пакетів, серед яких є й піниї розробки та тестування, що ніколи не постачаються: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 прямі.

Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з shenwei356/LexicMap. Читати поруч →

31ppillot/biomsalignJavaScript library for Multiple Sequence AlignmentУ зоні ризику77dkorunic/betteralignDetect and fix struct field alignment to reduce memory usage in Go programsДобрий63bebop/polyA Go package for engineering organisms.Помірний62evolbioinfo/goalignGoalign : a set of command line tools and an API to manipulate multiple sequence alignments.Помірний99pandas-dev/pandasFlexible and powerful data analysis / manipulation library for Python, providing labeled data structures similar to R data.frame objects, statistical functions, and much moreВинятковий90biopython/biopythonOfficial git repository for Biopython (originally converted from CVS)Відмінний

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — Go.