Усі теги
Тег каталогу

#computational-biophysics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

9 записів
З тегом «computational-biophysics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
67Помірнийіндекс здоров'я
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3 758/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
61Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-saxs
A lightweight Python library for simulating Small-Angle X-ray Scattering (SAXS) profiles from protein coordinates, with Jupyter Notebook examples.
Python★ 1↓ 3 502/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/diff-biophys
Differentiable biophysical modeling in JAX (SAXS, NMR, CD), with Jupyter Notebook examples.
Python★ 017 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-nmr
NMR spectroscopy calculations for protein structures. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts.
Python★ 217 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/diff-ensemble
Differentiable VAE framework for predicting protein structural ensembles (IDPs) consistent with SAXS and NMR data. Built on JAX/Flax.
Python★ 1↓ 158/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/resonance-flow
JAX-native differentiable protein folding framework integrating experimental NMR constraints (RDCs) and biophysical "self-correction." Several Jupyter Notebooks visualize the concepts.
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
52Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-cryo-em
Generate realistic synthetic 3D Cryo-EM densities from structural models for testing algorithms and training ML models.
Python · Jupyter Notebook★ 217 лип. 2026 р.
Без ліцензії17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-dynamics
Fast Langevin dynamics engine using the Anisotropic Network Model (ANM) for rapid protein conformational ensemble generation.
Python · Shell★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0