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#metagenomics

公开记录中带有此标签的全部仓库——标签来自其 GitHub 主题或软件包注册表发布的关键词。健康度量遵循与记录其余部分相同的版本化方法论。

8 条记录
标签为“metagenomics”按健康指数排序
PyPI
80优秀健康指数
BigDataBiology/SemiBin
SemiBin: metagenomics binning with self-supervised deep learning
Python★ 1742026年8月8日
MIT2026年8月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
80优秀健康指数
EBI-Metagenomics/genome_uploader
Python script to upload bins and MAGs to ENA (European Nucleotide Archive)
Python★ 242026年7月17日
Apache-2.02026年7月17日 · 指标 2.10.0
PyPI
78良好健康指数
EBi-Metagenomics/mgnify-pipelines-toolkit
This Python package contains a collection of scripts and tools for including in MGnify pipelines
Python★ 1↓ 1,147/月2026年7月17日
Apache-2.02026年7月17日 · 指标 2.10.0
PyPI
78良好健康指数
gbouras13/pharokka
Pharokka is a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.
Python★ 218↓ 573/月2026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 2.10.0
PyPI
78良好健康指数
rhysnewell/aviary
A hybrid assembly and MAG recovery pipeline (and more!)
Python · HTML★ 109↓ 205/月2026年7月17日
GPL-3.02026年7月17日 · 指标 2.10.0
—
47薄弱健康指数
beiko-lab/arete
AMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflow
Python · Nextflow★ 282026年7月17日
MIT2026年7月17日 · 指标 2.10.0
—
41薄弱健康指数
jolespin/veba
A modular end-to-end suite for in silico recovery, clustering, and analysis of prokaryotic, microeukaryotic, and viral genomes from metagenomes
Python★ 1052026年7月28日
AGPL-3.02026年7月28日 · 指标 2.10.0