PyPI68中等健康指数EBI-Metagenomics/genome_uploaderPython script to upload bins and MAGs to ENA (European Nucleotide Archive)Python★ 242026年7月17日Apache-2.02026年7月17日 · 指标 1.13.0
PyPI68中等健康指数EBi-Metagenomics/mgnify-pipelines-toolkitThis Python package contains a collection of scripts and tools for including in MGnify pipelinesPython★ 1↓ 1,147/月2026年7月17日Apache-2.02026年7月17日 · 指标 1.13.0
PyPI68中等健康指数gbouras13/pharokkaPharokka is a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.Python★ 218↓ 573/月2026年7月17日MIT2026年7月17日 · 指标 1.13.0
PyPI67中等健康指数rhysnewell/aviaryA hybrid assembly and MAG recovery pipeline (and more!)Python · HTML★ 109↓ 205/月2026年7月17日GPL-3.02026年7月17日 · 指标 1.13.0
—66中等健康指数EBI-Metagenomics/assembly-analysis-pipelineMGnify Assembly Analysis PipelineJavaScript · Nextflow★ 12026年7月18日Apache-2.02026年7月18日 · 指标 1.13.0
—49存在风险健康指数beiko-lab/areteAMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflowPython · Nextflow★ 282026年7月17日MIT2026年7月17日 · 指标 1.13.0