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#metagenomics

公开记录中带有此标签的全部仓库——标签来自其 GitHub 主题或软件包注册表发布的关键词。健康度量遵循与记录其余部分相同的版本化方法论。

11 条记录
标签为“metagenomics”按健康指数排序
PyPI
84优秀健康指数
gbouras13/pharokka
Pharokka is a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.
Python★ 2292026年9月10日
MIT2026年9月10日 · 指标 2.10.0
PyPI
77良好健康指数
BigDataBiology/SemiBin
SemiBin: metagenomics binning with self-supervised deep learning
Python★ 175↓ 394/月2026年9月17日
MIT2026年9月17日 · 指标 2.10.0
PyPI
77良好健康指数
EBI-Metagenomics/mgnify-pipelines-toolkit
This Python package contains a collection of scripts and tools for including in MGnify pipelines
Python★ 12026年9月10日
Apache-2.02026年9月10日 · 指标 2.10.0
PyPI
77良好健康指数
rhysnewell/aviary
A hybrid assembly and MAG recovery pipeline (and more!)
Python · HTML★ 118↓ 199/月2026年9月9日
GPL-3.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
75良好健康指数
EBI-Metagenomics/genome_uploader
Python script to upload bins and MAGs to ENA (European Nucleotide Archive)
Python★ 242026年9月9日
Apache-2.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
crates.io
63中等健康指数
ngless-toolkit/ngless
NGLess: NGS with less work
Rust★ 1522026年10月18日
自定义许可证2026年10月18日 · 指标 2.10.0
PyPI
54中等健康指数
geronimp/enrichM
Toolbox for comparative genomics of MAGs
Python★ 93↓ 115/月2026年10月18日
GPL-3.02026年10月18日 · 指标 2.10.0
PyPI
51中等健康指数
khyox/recentrifuge
Recentrifuge: robust comparative analysis and contamination removal for metagenomics
Python · JavaScript★ 104↓ 308/月2026年10月15日
自定义许可证2026年10月15日 · 指标 2.10.0
—
38薄弱健康指数
beiko-lab/arete
AMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflow
Python · Nextflow★ 282026年9月10日
MIT2026年9月10日 · 指标 2.10.0
—
38薄弱健康指数
jolespin/veba
A modular end-to-end suite for in silico recovery, clustering, and analysis of prokaryotic, microeukaryotic, and viral genomes from metagenomes
Python★ 1062026年9月14日
AGPL-3.02026年9月14日 · 指标 2.10.0