Усі теги
Тег каталогу

#metagenomics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

8 записів
З тегом «metagenomics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
80Відміннийіндекс здоров'я
BigDataBiology/SemiBin
SemiBin: metagenomics binning with self-supervised deep learning
Python★ 1748 серп. 2026 р.
MIT8 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
80Відміннийіндекс здоров'я
EBI-Metagenomics/genome_uploader
Python script to upload bins and MAGs to ENA (European Nucleotide Archive)
Python★ 2417 лип. 2026 р.
Apache-2.017 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
78Добрийіндекс здоров'я
EBI-Metagenomics/assembly-analysis-pipeline
MGnify Assembly Analysis Pipeline
JavaScript · Nextflow★ 118 лип. 2026 р.
Apache-2.018 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
EBi-Metagenomics/mgnify-pipelines-toolkit
This Python package contains a collection of scripts and tools for including in MGnify pipelines
Python★ 1↓ 1 147/міс17 лип. 2026 р.
Apache-2.017 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
gbouras13/pharokka
Pharokka is a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.
Python★ 218↓ 573/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
rhysnewell/aviary
A hybrid assembly and MAG recovery pipeline (and more!)
Python · HTML★ 109↓ 205/міс17 лип. 2026 р.
GPL-3.017 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
47Слабкийіндекс здоров'я
beiko-lab/arete
AMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflow
Python · Nextflow★ 2817 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
41Слабкийіндекс здоров'я
jolespin/veba
A modular end-to-end suite for in silico recovery, clustering, and analysis of prokaryotic, microeukaryotic, and viral genomes from metagenomes
Python★ 10528 лип. 2026 р.
AGPL-3.028 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0