PyPI
gbouras13/pharokka
Pharokka is a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.
MIT10 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
Усі теги
Тег каталогу
#metagenomics
Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.
11 записів
PyPI
BigDataBiology/SemiBin
SemiBin: metagenomics binning with self-supervised deep learning
MIT17 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
EBI-Metagenomics/assembly-analysis-pipeline
MGnify Assembly Analysis Pipeline
Apache-2.011 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
EBI-Metagenomics/mgnify-pipelines-toolkit
This Python package contains a collection of scripts and tools for including in MGnify pipelines
Apache-2.010 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
rhysnewell/aviary
A hybrid assembly and MAG recovery pipeline (and more!)
GPL-3.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
EBI-Metagenomics/genome_uploader
Python script to upload bins and MAGs to ENA (European Nucleotide Archive)
Apache-2.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io
ngless-toolkit/ngless
NGLess: NGS with less work
Власна ліцензія18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
geronimp/enrichM
Toolbox for comparative genomics of MAGs
GPL-3.018 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
khyox/recentrifuge
Recentrifuge: robust comparative analysis and contamination removal for metagenomics
Власна ліцензія15 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
beiko-lab/arete
AMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflow
MIT10 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
jolespin/veba
A modular end-to-end suite for in silico recovery, clustering, and analysis of prokaryotic, microeukaryotic, and viral genomes from metagenomes
AGPL-3.014 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0