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#metagenomics

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

8 registros
Con la etiqueta «metagenomics»Ordenado por índice de salud
PyPI
80Excelenteíndice de salud
BigDataBiology/SemiBin
SemiBin: metagenomics binning with self-supervised deep learning
Python★ 1748 ago 2026
MIT8 ago 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
80Excelenteíndice de salud
EBI-Metagenomics/genome_uploader
Python script to upload bins and MAGs to ENA (European Nucleotide Archive)
Python★ 2417 jul 2026
Apache-2.017 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
78Buenoíndice de salud
EBi-Metagenomics/mgnify-pipelines-toolkit
This Python package contains a collection of scripts and tools for including in MGnify pipelines
Python★ 1↓ 1147/mes17 jul 2026
Apache-2.017 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
78Buenoíndice de salud
gbouras13/pharokka
Pharokka is a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.
Python★ 218↓ 573/mes17 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
78Buenoíndice de salud
rhysnewell/aviary
A hybrid assembly and MAG recovery pipeline (and more!)
Python · HTML★ 109↓ 205/mes17 jul 2026
GPL-3.017 jul 2026 · métricas 2.10.0
47Débilíndice de salud
beiko-lab/arete
AMR/VF LGT focused bacterial genomics analysis workflow
Python · Nextflow★ 2817 jul 2026
MIT17 jul 2026 · métricas 2.10.0
41Débilíndice de salud
jolespin/veba
A modular end-to-end suite for in silico recovery, clustering, and analysis of prokaryotic, microeukaryotic, and viral genomes from metagenomes
Python★ 10528 jul 2026
AGPL-3.028 jul 2026 · métricas 2.10.0