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#pdb

Alle Repositories im öffentlichen Register, die dieses Tag tragen — aus ihren GitHub-Topics oder den von ihren Paket-Registries veröffentlichten Schlagwörtern. Die Gesundheit wird nach derselben versionierten Methodik gemessen wie im übrigen Register.

40 Einträge
Getaggt als „pdb“Geordnet nach Gesundheitsindex
NuGet
78GutGesundheitsindex
icsharpcode/ILSpy
.NET Decompiler with support for PDB generation, ReadyToRun, Metadata (&more) - cross-platform!
C#★ 25.7K17. Juli 2026
MIT17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
72GutGesundheitsindex
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1.31715. Juli 2026
GPL-3.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI · npm
70GutGesundheitsindex
project-gemmi/gemmi
macromolecular crystallography library and utilities
C++★ 364↓ 536.2K/Monat17. Juli 2026
MPL-2.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
69MittelGesundheitsindex
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Python★ 515. Juli 2026
Apache-2.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
67MittelGesundheitsindex
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3.758/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
64MittelGesundheitsindex
cokelaer/bioservices
Access to Biological Web Services from Python.
Python★ 340↓ 36.1K/Monat21. Juli 2026
Eigene Lizenz21. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
63MittelGesundheitsindex
t-0hmura/mlmm_toolkit
Machine‑Learning / Molecular‑Mechanics (ML/MM) hybrid calculator and CLI toolset for Mechanistic Investigation of Enzymatic Reactions.
Python★ 17↓ 387/Monat17. Juli 2026
GPL-3.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
62MittelGesundheitsindex
bugsplat-git/symbol-upload
💻🔀☁️ Cross-platform symbol upload utility and symbol server layout creator for BugSplat
TypeScript · JavaScript★ 13↓ 2.955/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
62MittelGesundheitsindex
t-0hmura/pdb2reaction
End-to-end Reaction-Path Modeling from PDB Structures Using Machine-Learning Interatomic Potentials
Python★ 15↓ 2.374/Monat14. Juli 2026
GPL-3.014. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
61MittelGesundheitsindex
PDBeurope/ccdutils
A set of python tools to deal with PDB chemical components definitions for small molecules, taken from the wwPDB Chemical Component Dictionary, uses RDKit
Python★ 8215. Juli 2026
Apache-2.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
—
57MittelGesundheitsindex
BIoJulia/BIoStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 10517. Juli 2026
Eigene Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI · crates.io
57MittelGesundheitsindex
hfooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 20↓ 997/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
56MittelGesundheitsindex
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 915. Juli 2026
Apache-2.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
55MittelGesundheitsindex
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 75621. Juli 2026
BSD-3-Clause21. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
53MittelGesundheitsindex
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 1015. Juli 2026
Keine Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
52MittelGesundheitsindex
Piebald-AI/node-lief
Node.js bindings for LIEF, a library to parse and manipulate ELF, PE, and Mach-O executables.
JavaScript · C++★ 8↓ 10.2K/Monat17. Juli 2026
Apache-2.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI · npm
50MittelGesundheitsindex
N283T/pdb-mine-builder
Build a Mine-schema database from PDB data. Load PDBj structural biology data into PostgreSQL with RDKit chemical search support.
Python★ 0↓ 1.096/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
50MittelGesundheitsindex
pdbeurope/investigations
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 6↓ 1.071/Monat15. Juli 2026
Keine Lizenz15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
49GefährdetGesundheitsindex
PDBEurope/mmcif-gen
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 617. Juli 2026
Keine Lizenz17. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
48GefährdetGesundheitsindex
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
npm
48GefährdetGesundheitsindex
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
TypeScript★ 8↓ 710/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
48GefährdetGesundheitsindex
n283t/view-cif
CLI tool to view CIF files from various sources in your editor
Python★ 015. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
47GefährdetGesundheitsindex
gotcha/ipdb
Integration of IPython pdb
Python★ 1.97518. Juli 2026
BSD-3-Clause18. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
46GefährdetGesundheitsindex
crabisoft/pdbstore
Publish PDB and PE files to symbols store
Python★ 215. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
46GefährdetGesundheitsindex
scipion-em/scipion-em-atomstructutils
utilities for handling PDB/mmcif atomic structure files
Python★ 017. Juli 2026
AGPL-3.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
45GefährdetGesundheitsindex
gqy20/protein-mcp
FastMCP-based protein data access tools for bioinformatics research
Python★ 0↓ 682/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
44GefährdetGesundheitsindex
diggerdu/apdb
apdb: python debugger for agents
Python★ 0↓ 1.522/Monat15. Juli 2026
BSD-2-Clause15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
43GefährdetGesundheitsindex
PDBeurope/pdbecif
A lightweight pure python package for reading, writing and manipulating mmCIF files distributed by the wwPDB"
Python★ 38↓ 8.169/Monat17. Juli 2026
Apache-2.017. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
PyPI
43GefährdetGesundheitsindex
a-r-j/cpdb
Cython implementation of PDB -> DataFrame parsing
Cython · Jupyter Notebook · Python★ 34↓ 20.1K/Monat15. Juli 2026
MIT15. Juli 2026 · Metriken 1.13.0
—
43GefährdetGesundheitsindex
uclorengogroup/cath-tools
Protein structure comparison tools such as SSAP and SNAP
C++ · Promela★ 6715. Juli 2026
GPL-3.015. Juli 2026 · Metriken 1.13.0