Усі теги
Тег каталогу

#pdb

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

47 записів
З тегом «pdb»Упорядковано за індексом здоров'я
NuGet
93Винятковийіндекс здоров'я
icsharpcode/ILSpy
.NET Decompiler with support for PDB generation, ReadyToRun, Metadata (&more) - cross-platform!
C#★ 25.8K5 серп. 2026 р.
MIT5 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
84Відміннийіндекс здоров'я
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1 31715 лип. 2026 р.
GPL-3.015 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
84Відміннийіндекс здоров'я
project-gemmi/gemmi
macromolecular crystallography library and utilities
C++★ 364↓ 536.2K/міс17 лип. 2026 р.
MPL-2.017 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
83Відміннийіндекс здоров'я
inducer/pudb
Full-screen console debugger for Python
Python★ 3 251↓ 1.4M/міс13 серп. 2026 р.
Власна ліцензія13 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
81Відміннийіндекс здоров'я
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Python★ 515 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3 758/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
71Добрийіндекс здоров'я
cokelaer/bioservices
Access to Biological Web Services from Python.
Python★ 340↓ 36.1K/міс21 лип. 2026 р.
Власна ліцензія21 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
69Добрийіндекс здоров'я
abhishektiwari/hbat
HBAT 2: A Python Package to analyse Hydrogen Bonds and Other Non-covalent Interactions in Macromolecular Structures https://hbat-web.abhishek-tiwari.com
Python★ 11↓ 21.9K/міс2 серп. 2026 р.
MIT2 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
69Добрийіндекс здоров'я
bugsplat-git/symbol-upload
💻🔀☁️ Cross-platform symbol upload utility and symbol server layout creator for BugSplat
TypeScript · JavaScript★ 13↓ 2 955/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
69Добрийіндекс здоров'я
t-0hmura/mlmm_toolkit
Machine‑Learning / Molecular‑Mechanics (ML/MM) hybrid calculator and CLI toolset for Mechanistic Investigation of Enzymatic Reactions.
Python★ 17↓ 387/міс17 лип. 2026 р.
GPL-3.017 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
67Добрийіндекс здоров'я
PDBeurope/ccdutils
A set of python tools to deal with PDB chemical components definitions for small molecules, taken from the wwPDB Chemical Component Dictionary, uses RDKit
Python★ 8215 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
67Добрийіндекс здоров'я
cansarigol/pdbr
pdb + Rich library
Python★ 34917 серп. 2026 р.
MIT17 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
Go · npm
65Добрийіндекс здоров'я
imneeteeshyadav98/kubepreflight
Kubernetes upgrade-readiness CLI and Console for detecting deprecated APIs, webhook blockers, PDB risks, unhealthy workloads, node skew, and upgrade action plans.
Go · TypeScript★ 026 лип. 2026 р.
Apache-2.026 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
65Добрийіндекс здоров'я
t-0hmura/pdb2reaction
End-to-end Reaction-Path Modeling from PDB Structures Using Machine-Learning Interatomic Potentials
Python★ 26↓ 378/міс5 вер. 2026 р.
GPL-3.05 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
60Помірнийіндекс здоров'я
BIoJulia/BIoStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 10517 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · crates.io
60Помірнийіндекс здоров'я
hfooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 20↓ 997/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io
60Помірнийіндекс здоров'я
mstange/pdb-addr2line
A Rust crate to symbolicate addresses from PDBs, like addr2line. Uses the `pdb` crate.
Rust★ 40↓ 206.5K/міс24 лип. 2026 р.
Apache-2.024 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 915 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
57Помірнийіндекс здоров'я
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 75621 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause21 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
57Помірнийіндекс здоров'я
bretello/pdbpp
pdb++, a drop-in replacement for pdb (the Python debugger)
Python★ 52↓ 1.4M/міс8 серп. 2026 р.
BSD-3-Clause8 серп. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
54Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 1015 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
54Помірнийіндекс здоров'я
Piebald-AI/node-lief
Node.js bindings for LIEF, a library to parse and manipulate ELF, PE, and Mach-O executables.
JavaScript · C++★ 8↓ 10.2K/міс17 лип. 2026 р.
Apache-2.017 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
50Помірнийіндекс здоров'я
N283T/pdb-mine-builder
Build a Mine-schema database from PDB data. Load PDBj structural biology data into PostgreSQL with RDKit chemical search support.
Python★ 0↓ 1 096/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
50Помірнийіндекс здоров'я
pdbeurope/investigations
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 6↓ 1 071/міс15 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
47Слабкийіндекс здоров'я
PDBEurope/mmcif-gen
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 617 лип. 2026 р.
Без ліцензії17 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
45Слабкийіндекс здоров'я
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
45Слабкийіндекс здоров'я
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
TypeScript★ 8↓ 710/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
45Слабкийіндекс здоров'я
n283t/view-cif
CLI tool to view CIF files from various sources in your editor
Python★ 015 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
44Слабкийіндекс здоров'я
crabisoft/pdbstore
Publish PDB and PE files to symbols store
Python★ 215 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
44Слабкийіндекс здоров'я
gotcha/ipdb
Integration of IPython pdb
Python★ 1 97518 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause18 лип. 2026 р. · метрики 2.10.0