Усі теги
Тег каталогу

#pdb

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

55 записів
З тегом «pdb»Упорядковано за індексом здоров'я
NuGet
93Винятковийіндекс здоров'я
icsharpcode/ILSpy
.NET Decompiler with support for PDB generation, ReadyToRun, Metadata (&more) - cross-platform!
C#★ 26.1K16 вер. 2026 р.
MIT16 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
87Відміннийіндекс здоров'я
BradyAJohnston/MolecularNodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1 354↓ 896/міс8 вер. 2026 р.
GPL-3.08 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
87Відміннийіндекс здоров'я
inducer/pudb
Full-screen console debugger for Python
Python★ 3 24717 вер. 2026 р.
Власна ліцензія17 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm · crates.io
86Відміннийіндекс здоров'я
megane-labs/megane
Опис репозиторію не опубліковано.
TypeScript · Rust★ 31↓ 3 848/міс18 жовт. 2026 р.
MIT18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
83Відміннийіндекс здоров'я
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Python★ 58 вер. 2026 р.
Apache-2.08 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
83Відміннийіндекс здоров'я
prody/ProDy
A Python Package for Protein Dynamics Analysis
Python · C★ 560↓ 39.2K/міс18 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
83Відміннийіндекс здоров'я
project-gemmi/gemmi
macromolecular crystallography library and utilities
C++★ 389↓ 2M/міс9 вер. 2026 р.
MPL-2.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io
81Відміннийіндекс здоров'я
kent-tokyo/chematic
A pure-Rust cheminformatics library targeting RDKit feature parity — zero C/C++ by default.
Rust · Python★ 28↓ 8 688/міс9 вер. 2026 р.
Apache-2.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
80Відміннийіндекс здоров'я
haddocking/protein-detective
Python package to detect proteins in EM density maps.
Python★ 0↓ 985/міс8 вер. 2026 р.
Apache-2.08 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
78Добрийіндекс здоров'я
abhishektiwari/hbat
HBAT 2: A Python Package to analyse Hydrogen Bonds and Other Non-covalent Interactions in Macromolecular Structures https://hbat-web.abhishek-tiwari.com
Python★ 11↓ 17.3K/міс16 вер. 2026 р.
MIT16 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
75Добрийіндекс здоров'я
BugSplat-Git/symbol-upload
💻🔀☁️ Cross-platform symbol upload utility and symbol server layout creator for BugSplat
TypeScript★ 14↓ 4 133/міс8 вер. 2026 р.
MIT8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
73Добрийіндекс здоров'я
diffpy/diffpy.structure
Crystal structure container and parsers for structure formats.
Python★ 40↓ 18.3K/міс18 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
73Добрийіндекс здоров'я
t-0hmura/pdb2reaction
End-to-end Reaction-Path Modeling from PDB Structures Using Machine-Learning Interatomic Potentials
Python★ 36↓ 469/міс21 жовт. 2026 р.
GPL-3.021 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
69Добрийіндекс здоров'я
PDBeurope/ccdutils
A set of python tools to deal with PDB chemical components definitions for small molecules, taken from the wwPDB Chemical Component Dictionary, uses RDKit
Python★ 84↓ 62.2K/міс8 вер. 2026 р.
Apache-2.08 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
67Добрийіндекс здоров'я
cansarigol/pdbr
pdb + Rich library
Python★ 350↓ 3.6M/міс19 жовт. 2026 р.
MIT19 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
67Добрийіндекс здоров'я
cokelaer/bioservices
Access to Biological Web Services from Python.
Python★ 343↓ 22.2K/міс12 вер. 2026 р.
Власна ліцензія12 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
65Добрийіндекс здоров'я
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 75612 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause12 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI · npm
65Добрийіндекс здоров'я
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 11↓ 1 744/міс8 вер. 2026 р.
Без ліцензії8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
65Добрийіндекс здоров'я
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 9↓ 82/міс8 вер. 2026 р.
Apache-2.08 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
65Добрийіндекс здоров'я
t-0hmura/mlmm_toolkit
Machine‑Learning / Molecular‑Mechanics (ML/MM) hybrid calculator and CLI toolset for Mechanistic Investigation of Enzymatic Reactions.
Python★ 23↓ 357/міс9 вер. 2026 р.
GPL-3.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
62Помірнийіндекс здоров'я
BioJulia/BioStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 10610 вер. 2026 р.
Власна ліцензія10 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
Go · npm
62Помірнийіндекс здоров'я
imneeteeshyadav98/kubepreflight
Kubernetes upgrade-readiness CLI and Console for detecting deprecated APIs, webhook blockers, PDB risks, unhealthy workloads, node skew, and upgrade action plans.
Go · TypeScript★ 013 вер. 2026 р.
Apache-2.013 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
NuGet
60Помірнийіндекс здоров'я
dotnet/symreader-portable
Reader of Portable PDBs format that implements DiaSymReader interfaces (ISymUnmanagedReader, ISymUnmanagedBinder, etc.).
C# · Shell · PowerShell★ 9011 вер. 2026 р.
MIT11 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
57Помірнийіндекс здоров'я
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/міс8 вер. 2026 р.
MIT8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io · PyPI
57Помірнийіндекс здоров'я
HFooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 21↓ 406/міс8 вер. 2026 р.
MIT8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io
57Помірнийіндекс здоров'я
mstange/pdb-addr2line
A Rust crate to symbolicate addresses from PDBs, like addr2line. Uses the `pdb` crate.
Rust★ 40↓ 243.1K/міс13 вер. 2026 р.
Apache-2.013 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
57Помірнийіндекс здоров'я
vv137/molterm
A terminal-based molecular structure viewer
C++★ 6↓ 15/міс18 жовт. 2026 р.
MIT18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
npm
56Помірнийіндекс здоров'я
Piebald-AI/node-lief
Node.js bindings for LIEF, a library to parse and manipulate ELF, PE, and Mach-O executables.
JavaScript · C++★ 9↓ 36.4K/міс9 вер. 2026 р.
Apache-2.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io · npm
53Помірнийіндекс здоров'я
TKanX/bio-forge
A high-performance, pure Rust toolkit for standardizing and preparing biomolecular systems (proteins & nucleic acids). It heals missing atoms, resolves protonation states, adds solvation, and unifies topologies to forge simulation-ready structures.
Rust · TypeScript★ 141↓ 213/міс8 вер. 2026 р.
MIT8 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
53Помірнийіндекс здоров'я
bretello/pdbpp
pdb++, a drop-in replacement for pdb (the Python debugger)
Python★ 52↓ 1.3M/міс17 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause17 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0