Усі теги
Тег каталогу

#pdb

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

40 записів
З тегом «pdb»Упорядковано за індексом здоров'я
NuGet
78Добрийіндекс здоров'я
icsharpcode/ILSpy
.NET Decompiler with support for PDB generation, ReadyToRun, Metadata (&more) - cross-platform!
C#★ 25.7K17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
72Добрийіндекс здоров'я
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1 31715 лип. 2026 р.
GPL-3.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
70Добрийіндекс здоров'я
project-gemmi/gemmi
macromolecular crystallography library and utilities
C++★ 364↓ 536.2K/міс17 лип. 2026 р.
MPL-2.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
69Помірнийіндекс здоров'я
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Python★ 515 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
67Помірнийіндекс здоров'я
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3 758/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
64Помірнийіндекс здоров'я
cokelaer/bioservices
Access to Biological Web Services from Python.
Python★ 340↓ 36.1K/міс21 лип. 2026 р.
Власна ліцензія21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
t-0hmura/mlmm_toolkit
Machine‑Learning / Molecular‑Mechanics (ML/MM) hybrid calculator and CLI toolset for Mechanistic Investigation of Enzymatic Reactions.
Python★ 17↓ 387/міс17 лип. 2026 р.
GPL-3.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
62Помірнийіндекс здоров'я
bugsplat-git/symbol-upload
💻🔀☁️ Cross-platform symbol upload utility and symbol server layout creator for BugSplat
TypeScript · JavaScript★ 13↓ 2 955/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
62Помірнийіндекс здоров'я
t-0hmura/pdb2reaction
End-to-end Reaction-Path Modeling from PDB Structures Using Machine-Learning Interatomic Potentials
Python★ 15↓ 2 374/міс14 лип. 2026 р.
GPL-3.014 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
61Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/ccdutils
A set of python tools to deal with PDB chemical components definitions for small molecules, taken from the wwPDB Chemical Component Dictionary, uses RDKit
Python★ 8215 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
57Помірнийіндекс здоров'я
BIoJulia/BIoStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 10517 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · crates.io
57Помірнийіндекс здоров'я
hfooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 20↓ 997/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 915 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
55Помірнийіндекс здоров'я
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 75621 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
53Помірнийіндекс здоров'я
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 1015 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
52Помірнийіндекс здоров'я
Piebald-AI/node-lief
Node.js bindings for LIEF, a library to parse and manipulate ELF, PE, and Mach-O executables.
JavaScript · C++★ 8↓ 10.2K/міс17 лип. 2026 р.
Apache-2.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · npm
50Помірнийіндекс здоров'я
N283T/pdb-mine-builder
Build a Mine-schema database from PDB data. Load PDBj structural biology data into PostgreSQL with RDKit chemical search support.
Python★ 0↓ 1 096/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
50Помірнийіндекс здоров'я
pdbeurope/investigations
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 6↓ 1 071/міс15 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
49У зоні ризикуіндекс здоров'я
PDBEurope/mmcif-gen
This application is designed to create mmcif files from facilities data.
Python★ 617 лип. 2026 р.
Без ліцензії17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
TypeScript★ 8↓ 710/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
n283t/view-cif
CLI tool to view CIF files from various sources in your editor
Python★ 015 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
47У зоні ризикуіндекс здоров'я
gotcha/ipdb
Integration of IPython pdb
Python★ 1 97518 лип. 2026 р.
BSD-3-Clause18 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
46У зоні ризикуіндекс здоров'я
crabisoft/pdbstore
Publish PDB and PE files to symbols store
Python★ 215 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
46У зоні ризикуіндекс здоров'я
scipion-em/scipion-em-atomstructutils
utilities for handling PDB/mmcif atomic structure files
Python★ 017 лип. 2026 р.
AGPL-3.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
45У зоні ризикуіндекс здоров'я
gqy20/protein-mcp
FastMCP-based protein data access tools for bioinformatics research
Python★ 0↓ 682/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
44У зоні ризикуіндекс здоров'я
diggerdu/apdb
apdb: python debugger for agents
Python★ 0↓ 1 522/міс15 лип. 2026 р.
BSD-2-Clause15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
PDBeurope/pdbecif
A lightweight pure python package for reading, writing and manipulating mmCIF files distributed by the wwPDB"
Python★ 38↓ 8 169/міс17 лип. 2026 р.
Apache-2.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
a-r-j/cpdb
Cython implementation of PDB -> DataFrame parsing
Cython · Jupyter Notebook · Python★ 34↓ 20.1K/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
—
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
uclorengogroup/cath-tools
Protein structure comparison tools such as SSAP and SNAP
C++ · Promela★ 6715 лип. 2026 р.
GPL-3.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0