全部标签
目录标签

#pdb

公开记录中带有此标签的全部仓库——标签来自其 GitHub 主题或软件包注册表发布的关键词。健康度量遵循与记录其余部分相同的版本化方法论。

55 条记录
标签为“pdb”按健康指数排序
NuGet
93卓越健康指数
icsharpcode/ILSpy
.NET Decompiler with support for PDB generation, ReadyToRun, Metadata (&more) - cross-platform!
C#★ 26.1K2026年9月16日
MIT2026年9月16日 · 指标 2.10.0
PyPI
87优秀健康指数
BradyAJohnston/MolecularNodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1,354↓ 896/月2026年9月8日
GPL-3.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
87优秀健康指数
inducer/pudb
Full-screen console debugger for Python
Python★ 3,2472026年9月17日
自定义许可证2026年9月17日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm · crates.io
86优秀健康指数
megane-labs/megane
该仓库未发布描述。
TypeScript · Rust★ 31↓ 3,848/月2026年10月18日
MIT2026年10月18日 · 指标 2.10.0
PyPI
83优秀健康指数
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Python★ 52026年9月8日
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
83优秀健康指数
prody/ProDy
A Python Package for Protein Dynamics Analysis
Python · C★ 560↓ 39.2K/月2026年10月18日
自定义许可证2026年10月18日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
83优秀健康指数
project-gemmi/gemmi
macromolecular crystallography library and utilities
C++★ 389↓ 2M/月2026年9月9日
MPL-2.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
crates.io
81优秀健康指数
kent-tokyo/chematic
A pure-Rust cheminformatics library targeting RDKit feature parity — zero C/C++ by default.
Rust · Python★ 28↓ 8,688/月2026年9月9日
Apache-2.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
80优秀健康指数
haddocking/protein-detective
Python package to detect proteins in EM density maps.
Python★ 0↓ 985/月2026年9月8日
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
78良好健康指数
abhishektiwari/hbat
HBAT 2: A Python Package to analyse Hydrogen Bonds and Other Non-covalent Interactions in Macromolecular Structures https://hbat-web.abhishek-tiwari.com
Python★ 11↓ 17.3K/月2026年9月16日
MIT2026年9月16日 · 指标 2.10.0
npm
75良好健康指数
BugSplat-Git/symbol-upload
💻🔀☁️ Cross-platform symbol upload utility and symbol server layout creator for BugSplat
TypeScript★ 14↓ 4,133/月2026年9月8日
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
73良好健康指数
diffpy/diffpy.structure
Crystal structure container and parsers for structure formats.
Python★ 40↓ 18.3K/月2026年10月18日
自定义许可证2026年10月18日 · 指标 2.10.0
PyPI
69良好健康指数
PDBeurope/ccdutils
A set of python tools to deal with PDB chemical components definitions for small molecules, taken from the wwPDB Chemical Component Dictionary, uses RDKit
Python★ 84↓ 62.2K/月2026年9月8日
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
67良好健康指数
cansarigol/pdbr
pdb + Rich library
Python★ 350↓ 3.6M/月2026年10月19日
MIT2026年10月19日 · 指标 2.10.0
PyPI
67良好健康指数
cokelaer/bioservices
Access to Biological Web Services from Python.
Python★ 343↓ 22.2K/月2026年9月12日
自定义许可证2026年9月12日 · 指标 2.10.0
PyPI
65良好健康指数
BioPandas/biopandas
Working with molecular structures in pandas DataFrames
Python★ 7562026年9月12日
BSD-3-Clause2026年9月12日 · 指标 2.10.0
PyPI · npm
65良好健康指数
PDBeurope/mmcif-validator
Real-time VSCode extension and standalone Python script for validating mmCIF/CIF files against the PDBx/mmCIF dictionary or any CIF dictionary.
Python · TypeScript★ 11↓ 1,744/月2026年9月8日
无许可证2026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
65良好健康指数
PDBeurope/rellig
Identifies relevant ligands in the PDB
Python★ 9↓ 82/月2026年9月8日
Apache-2.02026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
65良好健康指数
t-0hmura/mlmm_toolkit
Machine‑Learning / Molecular‑Mechanics (ML/MM) hybrid calculator and CLI toolset for Mechanistic Investigation of Enzymatic Reactions.
Python★ 23↓ 357/月2026年9月9日
GPL-3.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
PyPI
65良好健康指数
t-0hmura/pdb2reaction
End-to-end Reaction-Path Modeling from PDB Structures Using Machine-Learning Interatomic Potentials
Python★ 26↓ 378/月2026年9月5日
GPL-3.02026年9月5日 · 指标 2.10.0
—
62中等健康指数
BioJulia/BioStructures.jl
A Julia package to read, write and manipulate macromolecular structures
Julia★ 1062026年9月10日
自定义许可证2026年9月10日 · 指标 2.10.0
Go · npm
62中等健康指数
imneeteeshyadav98/kubepreflight
Kubernetes upgrade-readiness CLI and Console for detecting deprecated APIs, webhook blockers, PDB risks, unhealthy workloads, node skew, and upgrade action plans.
Go · TypeScript★ 02026年9月13日
Apache-2.02026年9月13日 · 指标 2.10.0
NuGet
60中等健康指数
dotnet/symreader-portable
Reader of Portable PDBs format that implements DiaSymReader interfaces (ISymUnmanagedReader, ISymUnmanagedBinder, etc.).
C# · Shell · PowerShell★ 902026年9月11日
MIT2026年9月11日 · 指标 2.10.0
PyPI
57中等健康指数
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/月2026年9月8日
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
crates.io · PyPI
57中等健康指数
HFooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 21↓ 406/月2026年9月8日
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
crates.io
57中等健康指数
mstange/pdb-addr2line
A Rust crate to symbolicate addresses from PDBs, like addr2line. Uses the `pdb` crate.
Rust★ 40↓ 243.1K/月2026年9月13日
Apache-2.02026年9月13日 · 指标 2.10.0
npm
57中等健康指数
vv137/molterm
A terminal-based molecular structure viewer
C++★ 6↓ 15/月2026年10月18日
MIT2026年10月18日 · 指标 2.10.0
npm
56中等健康指数
Piebald-AI/node-lief
Node.js bindings for LIEF, a library to parse and manipulate ELF, PE, and Mach-O executables.
JavaScript · C++★ 9↓ 36.4K/月2026年9月9日
Apache-2.02026年9月9日 · 指标 2.10.0
crates.io · npm
53中等健康指数
TKanX/bio-forge
A high-performance, pure Rust toolkit for standardizing and preparing biomolecular systems (proteins & nucleic acids). It heals missing atoms, resolves protonation states, adds solvation, and unifies topologies to forge simulation-ready structures.
Rust · TypeScript★ 141↓ 213/月2026年9月8日
MIT2026年9月8日 · 指标 2.10.0
PyPI
53中等健康指数
bretello/pdbpp
pdb++, a drop-in replacement for pdb (the Python debugger)
Python★ 52↓ 1.3M/月2026年9月17日
BSD-3-Clause2026年9月17日 · 指标 2.10.0