Registro público
Informe de salud del softwareesquema 0.11.0 · métricas 2.10.0 · 2026-07-15 14:46 UTC

bradyajohnston / molecularnodes

Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.

PythonGPL-3.0★ 1317 estrellas⑂ 124 forksdesde abr 2022Ver en GitHub ↗
TipoBibliotecacómo se determina
#blender#biochemistry#protein#protein-structure#protein-visualization#sciart#visualisation#structural-biology#blender-addon#protein-data-bank#molecule#proteins#pdb#molecular-modeling#molecular#molecular-graphics#molecular-dynamics#molecular-structures#mmcif#3d-visualization

bradyajohnston/molecularnodes tiene un índice de salud de 84 sobre 100, lo que lo sitúa en la banda Excelente. Su puntuación más alta es Engineering Quality (87/100) y la más baja, AI Readiness (44/100). Se actualizó por última vez hace 6 días. Una sola persona concentra la mayor parte del trabajo reciente.

84
global / 100
Excelente

Índice de salud del software

Las métricas se agrupan en categorías ponderadas sobre una escala estandarizada de 1 a 100. El resultado global parte de su media ponderada, calibrada contra la distribución del registro público para que las bandas tengan significado percentil; cuando la evidencia pública activa la Política de Jurisdicciones de Alto Riesgo, la calificación se ajusta y recibe un límite «En riesgo» de 34.

84
Excepcional93-100El nivel más alto del registro (≈ el 5% superior); cumple prácticamente todos los criterios evaluados
Excelente80-92Sólido en todos los frentes; carencias menores
Bueno65-79Saludable; carencias limitadas y manejables
Moderado50-64Aceptable con carencias notables; se recomienda revisión
Débil35-49Debilidades sustanciales en varias áreas
En riesgo20-34Debilidades significativas; su adopción exige cautela
Crítico1-19Problemas graves (proyecto abandonado, un solo mantenedor, sin higiene)
VitalidadComunidad yAdopciónSostenibilidady GobernanzaCalidad deIngenieríaSeguridadPreparaciónpara IA

Perfil de puntuación

Cada eje es una categoría. La forma importa más que la media: un proyecto sano llena toda la figura, mientras que un perfil de picos y cráteres indica que la fortaleza en una dimensión enmascara el riesgo en otra.

El resultado global ponderado 71 se calibra a 84 en la escala publicada del índice (calibración del registro 2026-08-02).

Titularidad

Brady JohnstonCuenta personal
462 seguidores124 repositorios públicosdesde feb 2018Freelance scientific animator & developer.

Este repositorio pertenece a una cuenta personal. Un proyecto con un único propietario conlleva más riesgo de continuidad que uno respaldado por una organización.

Ecosistemas de paquetes

RegistroPaqueteVersiónDescargas / mesVersionesÚltima publicación
PyPImolecularnodes4.5.12-27hace 119 días

Métricas por categoría

Vitalidad

¿Está vivo el proyecto: se escribe código y se publican versiones?

82Excelente · 21% del índice global

Actividad de desarrollo

82Excelente
Cómo se puntúa
36/36Recencia de push — último push hace 6 días
21.5/36Cadencia de commits — 31/52 semanas con commits
18/18Volumen de commits — 134 commits en el último año
7/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 0 commit(s) and 9 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 7
Datos de entrada utilizados
commits_last_year134
human_commit_share—
days_since_last_push6
active_weeks_last_year31

Disciplina de publicación

81Excelente
Cómo se puntúa
27/27Publica versiones — 92 versiones publicadas
27/36Recencia de las versiones — última versión hace 119 días
27/27Cadencia de publicación — una versión cada ~20,5 días
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
Datos de entrada utilizados
releases_count92
latest_release_tagv4.5.12
releases_from_tagsno
days_since_latest_release119
mean_days_between_releases20,5

Comunidad y Adopción

¿Tiene el proyecto usuarios, descargas, atención y unas condiciones acogedoras para quienes contribuyen?

73Bueno · 17% del índice global

Popularidad y adopción

75Bueno
Cómo se puntúa
50.6/60Estrellas — 1317 estrellas
17.4/25Forks — 124 forks
7.1/15Observadores — 20 observadores
Datos de entrada utilizados
forks124
stars1317
watchers20
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Salud de la comunidad

70Bueno
Cómo se puntúa
22.5/22.5README
22.5/22.5Licencia — licencia reconocida (GPL-3.0)
18/18Guía CONTRIBUTING
0/13.5Código de conducta
0/7.2Plantilla de issues
0/6.3Plantilla de PR
Datos de entrada utilizados
has_readmesí
has_licensesí
readme_badges—
has_contributingsí
has_issue_templateno
has_code_of_conductno
readme_badge_services—
has_pull_request_templateno

Sostenibilidad y Gobernanza

¿Sobrevivirá el proyecto a sus personas: factor bus, capacidad de respuesta, quién lo respalda y mantenimiento del paquete?

68Bueno · 23% del índice global

Resiliencia de mantenedores (factor bus)

36Débil
Cómo se puntúa
9/54Factor bus — la mitad de los commits recae en 1 contribuyente(s)
3.4/22.5Distribución de commits — el principal contribuyente firma el 85% de los commits
13.5/13.5Amplitud de contribuyentes — 33 contribuyentes
10/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 15 contributing companies or organizations
Datos de entrada utilizados
bus_factor1
contributors_sampled33
top_contributor_share0,847

Capacidad de respuesta a issues y PR

82Excelente
Cómo se puntúa
35/42Resolución de issues — 83% de issues cerradas
27.6/30Aceptación de PR — 503/546 PR decididos fusionados
0/13Newcomer PR acceptance — ningún PR de un contribuyente primerizo decidido en 30 d
9/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 20/30 approved changesets -- score normalized to 6
Datos de entrada utilizados
merged_prs503
open_issues85
closed_issues426
prs_merged_7d—
prs_decided_7d—
prs_merged_30d—
prs_decided_30d—
issue_closed_ratio0,834
closed_unmerged_prs43
first_time_authors_30d—
first_time_prs_merged_30d—
first_time_prs_decided_30d—
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Newcomer PR acceptance. Los pesos restantes se han renormalizado.

Propiedad y custodia

68Bueno
Cómo se puntúa
10/30Respaldo de la propiedad — cuenta personal (usuario)
0/20Dominio verificado — no aplicable a cuentas de usuario
19.2/25Alcance del propietario — 462 seguidores de BradyAJohnston
25/25Trayectoria — 124 repos públicos, cuenta de ~8 años
Datos de entrada utilizados
followers462
owner_typeUser
is_verified—
owner_loginBradyAJohnston
public_repos124
account_age_days3086
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Dominio verificado. Los pesos restantes se han renormalizado.

Mantenimiento de paquetes

100Excepcional
Cómo se puntúa
25/25Publicado y resoluble — 1 paquete(s) en pypi
35/35Recencia de publicación — última publicación hace 119 días
20/20Historial de versiones — 27 versiones en el registro
20/20No obsoleto — activo, ni obsoleto ni retirado
Datos de entrada utilizados
packagesmolecularnodes
ecosystemspypi
any_deprecatedno
min_days_since_publish119

Calidad de Ingeniería

¿Existen unas prácticas mínimas de ingeniería y documentación?

87Excelente · 19% del índice global

Prácticas de ingeniería

78Bueno
Cómo se puntúa
24/24Flujos de trabajo de CI — 5 flujo(s) de trabajo
24/24Pruebas presentes
16/16Configuración de linter
9.6/9.6Hooks de pre-commit
0/6.4.editorconfig
4/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 6 out of 29 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 2
Datos de entrada utilizados
has_cisí
has_testssí
has_editorconfigno
has_linter_configsí
has_precommit_configsí

Documentación

100Excepcional
Cómo se puntúa
30/30README
25/25Directorio de documentación
15/15Sitio de documentación / página del proyecto — https://bradyajohnston.github.io/MolecularNodes/
10/10Descripción del repositorio
10/10Topics — 20 topics
10/10Wiki
Datos de entrada utilizados
topicsblender, biochemistry, protein, protein-structure, protein-visualization, sciart, visualisation, structural-biology, blender-addon, protein-data-bank, molecule, proteins, pdb, molecular-modeling, molecular, molecular-graphics, molecular-dynamics, molecular-structures, mmcif, 3d-visualization
has_wikisí
homepagehttps://bradyajohnston.github.io/MolecularNodes/
docs_sitehttps://bradyajohnston.github.io/MolecularNodes/
has_readmesí
has_docs_dirsí
has_descriptionsí

Seguridad

¿Son sólidas las prácticas visibles de seguridad y de cadena de suministro, sin exposición jurisdiccional de alto riesgo sin resolver?

46Débil · 16% del índice global

Postura de seguridad

46Débil
Cómo se puntúa
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — sin datos
0.5/2.5CI-Tests — 6 out of 29 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 2
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
4.5/7.5Code-Review — Found 20/30 approved changesets -- score normalized to 6
2.5/2.5Contributors — project has 15 contributing companies or organizations
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Licencia — license file detected
5.2/7.5Maintained — 0 commit(s) and 9 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 7
5/5Packaging — packaging workflow detected
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
7.5/7.5Vulnerabilities — 0 existing vulnerabilities detected
Datos de entrada utilizados
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated17
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive1
scorecard_aggregate4,6
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Branch-Protection. Los pesos restantes se han renormalizado.

Preparación para IA

¿Hasta qué punto está el repositorio preparado para desarrollarse y mantenerse con agentes de codificación de IA? Tiene un peso deliberadamente pequeño (4%): las herramientas para agentes son una señal real de mantenimiento, pero un repositorio sin ninguna puede alcanzar igualmente 100/100.

44Débil · 4% del índice global

Contexto y guía para agentes

1Crítico
Cómo se puntúa
0/45Instrucciones para agentes — sin CLAUDE.md / AGENTS.md / reglas de editor
0/15Documentación legible por máquinas (llms.txt)
0/40Historial de commits legible — sin datos
Datos de entrada utilizados
has_llms_txtno
llms_txt_url—
legible_history_share—
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Historial de commits legible. Los pesos restantes se han renormalizado.

Bucle de verificación (compilación / pruebas / verificación de tipos)

52Moderado
Cómo se puntúa
0/18Arranque con un solo comando
22/22Pruebas automatizadas
11/11Configuración de lint / formato
0/11Verificación estática de tipos
10/10Entorno reproducible — lockfile
0/10Práctica demostrada con agentes — sin datos
0/8Mantenimiento automatizado — sin datos
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Datos de entrada utilizados
has_nixno
has_testssí
lockfilesuv.lock
has_dockerfileno
typed_languageno
bootstrap_files—
has_devcontainerno
has_linter_configsí
typecheck_configs—
agent_commit_share—
toolchain_manifests—
dependency_bot_commit_share—
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Práctica demostrada con agentes, Mantenimiento automatizado. Los pesos restantes se han renormalizado.

Legibilidad del código para modelos

55Moderado
Cómo se puntúa
0/45Código verificable por tipos — Python sin configuración de verificación de tipos
54.6/55Tamaños de archivo manejables — 1/131 archivos fuente de más de 60 KB
Datos de entrada utilizados
primary_languagePython
largest_source_bytes90.872
source_files_sampled131
oversized_source_files1

Interfaces legibles por máquina

100Excepcional
Cómo se puntúa
0/40Esquema de API (OpenAPI/GraphQL/proto) — no aplicable a este tipo de software
0/20Servidor MCP — no aplicable a este tipo de software
40/40Ejemplos ejecutables — examples
Datos de entrada utilizados
example_dirsexamples
has_mcp_signalno
api_schema_files—
interfaces_expected_of—
Excluidos de la puntuación (sin datos o no aplicable): Esquema de API (OpenAPI/GraphQL/proto), Servidor MCP. Los pesos restantes se han renormalizado.

Datos clave

1317estrellas de GitHub
33contribuidores
134commits en los últimos 12 meses
6días desde el último push
92versiones publicadas
1factor bus
85issues abiertas
PyPIecosistemas de paquetes

Más detalle

OpenSSF Scorecard 4.6 / 10
4.6agregado

Evaluación de seguridad independiente y agnóstica en cuanto a herramientas, procedente del proyecto de código abierto OpenSSF Scorecard. Cada comprobación premia una práctica de seguridad, no la herramienta de un proveedor concreto. Las comprobaciones que Scorecard no pudo determinar se marcan como n/d y se excluyen de la puntuación de seguridad (nunca se cuentan como cero).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-15 14:46 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
n/dBranch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
2CI-Tests6 out of 29 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 2
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
6Code-ReviewFound 20/30 approved changesets -- score normalized to 6
10Contributorsproject has 15 contributing companies or organizations
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
7Maintained0 commit(s) and 9 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 7
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
0Signed-ReleasesProject has not signed or included provenance with any releases.
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
10Vulnerabilities0 existing vulnerabilities detected
Dependencias directas 8
RegistroPaqueteRestricción de versiónManifiesto
PyPIdatabpy>=0.7.0pyproject.toml
PyPImdanalysis>=2.10pyproject.toml
PyPIbiotite>=1.5pyproject.toml
PyPImrcfile—pyproject.toml
PyPIstarfile—pyproject.toml
PyPIPyYAML—pyproject.toml
PyPIimdclient>=0.2.3pyproject.toml
PyPIpandas<3.0.0pyproject.toml
Todas las dependencias 183

Conjunto completo de dependencias resueltas según el grafo de dependencias de GitHub: 8 paquetes directos y 175 indirectos (transitivos). El cierre transitivo es completo cuando el repositorio incluye un lockfile.

RegistroPaqueteVersiónRelación
PyPIbiotite1.6.0directa
PyPIdatabpy0.7.0directa
PyPIimdclient0.2.3directa
PyPImdanalysis2.10.0directa
PyPImrcfile1.5.4directa
PyPIpandas2.3.3directa
PyPIpyyaml6.0.3directa
PyPIstarfile0.5.13directa
PyPIannotated-types0.7.0indirecta
PyPIanyio4.12.1indirecta
PyPIappnope0.1.4indirecta
PyPIargon2-cffi25.1.0indirecta
PyPIargon2-cffi-bindings25.1.0indirecta
PyPIarrow1.4.0indirecta
PyPIasttokens3.0.1indirecta
PyPIasync-lru2.2.0indirecta
PyPIattrs25.4.0indirecta
PyPIbabel2.18.0indirecta
PyPIbeartype0.22.9indirecta
PyPIbeautifulsoup44.14.3indirecta
PyPIbiotraj1.2.2indirecta
PyPIblack26.3.1indirecta
PyPIbleach6.3.0indirecta
PyPIbpy5.1.0indirecta
PyPIcertifi2026.2.25indirecta
PyPIcffi2.0.0indirecta
PyPIcfgv3.5.0indirecta
PyPIcharset-normalizer3.4.6indirecta
PyPIclick8.3.1indirecta
PyPIcolorama0.4.6indirecta
PyPIcomm0.2.3indirecta
PyPIcontourpy1.3.3indirecta
PyPIcoverage7.13.4indirecta
PyPIcycler0.12.1indirecta
PyPIcython3.2.4indirecta
PyPIdebugpy1.8.20indirecta
PyPIdecorator5.2.1indirecta
PyPIdefusedxml0.7.1indirecta
PyPIdistlib0.4.0indirecta
PyPIexecnet2.1.2indirecta
PyPIexecuting2.2.1indirecta
PyPIfake-bpy-module20260316indirecta
PyPIfastjsonschema2.21.2indirecta
PyPIfilelock3.25.2indirecta
PyPIfonttools4.62.1indirecta
PyPIfqdn1.5.1indirecta
PyPIgreenlet3.3.2indirecta
PyPIgriddataformats1.1.0indirecta
PyPIgriffe1.15.0indirecta
PyPIh110.16.0indirecta
PyPIhttpcore1.0.9indirecta
PyPIhttpx0.28.1indirecta
PyPIhypothesis6.151.9indirecta
PyPIidentify2.6.18indirecta
PyPIidna3.11indirecta
PyPIimportlib-metadata8.7.1indirecta
PyPIimportlib-resources6.5.2indirecta
PyPIiniconfig2.3.0indirecta
PyPIipykernel7.2.0indirecta
PyPIipython9.11.0indirecta
PyPIipython-pygments-lexers1.1.1indirecta
PyPIipywidgets8.1.8indirecta
PyPIisoduration20.11.0indirecta
PyPIjedi0.19.2indirecta
PyPIjinja23.1.6indirecta
PyPIjoblib1.5.3indirecta
PyPIjson50.13.0indirecta
PyPIjsonpointer3.0.0indirecta
PyPIjsonschema4.26.0indirecta
PyPIjsonschema-specifications2025.9.1indirecta
PyPIjupyter1.1.1indirecta
PyPIjupyter-cache1.0.1indirecta
PyPIjupyter-client8.8.0indirecta
PyPIjupyter-console6.6.3indirecta
PyPIjupyter-core5.9.1indirecta
PyPIjupyter-events0.12.0indirecta
PyPIjupyter-lsp2.3.0indirecta
PyPIjupyter-server2.17.0indirecta
PyPIjupyter-server-terminals0.5.4indirecta
PyPIjupyterlab4.5.6indirecta
PyPIjupyterlab-pygments0.3.0indirecta
PyPIjupyterlab-server2.28.0indirecta
PyPIjupyterlab-widgets3.0.16indirecta
PyPIkiwisolver1.5.0indirecta
PyPIlark1.3.1indirecta
PyPImarkdown-it-py4.0.0indirecta
PyPImarkupsafe3.0.3indirecta
PyPImatplotlib3.10.8indirecta
PyPImatplotlib-inline0.2.1indirecta
PyPImda-xdrlib0.2.0indirecta
PyPImdanalysisdata0.9.0indirecta
PyPImdanalysistests2.10.0indirecta
PyPImdurl0.1.2indirecta
PyPImistune3.2.0indirecta
PyPImmtf-python1.1.3indirecta
PyPImsgpack1.1.2indirecta
PyPImypy-extensions1.1.0indirecta
PyPInbclient0.10.4indirecta
PyPInbconvert7.17.0indirecta
PyPInbformat5.10.4indirecta
PyPInest-asyncio1.6.0indirecta
PyPInetworkx3.6.1indirecta
PyPInodeenv1.10.0indirecta
PyPInodepad0.3.0indirecta
PyPInotebook7.5.5indirecta
PyPInotebook-shim0.2.4indirecta
PyPInumpy1.26.4indirecta
PyPIpackaging26.0indirecta
PyPIpandocfilters1.5.1indirecta
PyPIparso0.8.6indirecta
PyPIpathspec1.0.4indirecta
PyPIpexpect4.9.0indirecta
PyPIpillow12.1.1indirecta
PyPIplatformdirs4.9.4indirecta
PyPIpluggy1.6.0indirecta
PyPIplum-dispatch2.7.1indirecta
PyPIpooch1.9.0indirecta
PyPIpre-commit4.5.1indirecta
PyPIprometheus-client0.24.1indirecta
PyPIprompt-toolkit3.0.52indirecta
PyPIpsutil7.2.2indirecta
PyPIptyprocess0.7.0indirecta
PyPIpure-eval0.2.3indirecta
PyPIpyarrow23.0.1indirecta
PyPIpycparser3.0indirecta
PyPIpydantic2.12.5indirecta
PyPIpydantic-core2.41.5indirecta
PyPIpygments2.19.2indirecta
PyPIpyparsing3.3.2indirecta
PyPIpytest9.0.2indirecta
PyPIpytest-cov7.0.0indirecta
PyPIpytest-xdist3.8.0indirecta
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0indirecta
PyPIpython-discovery1.1.3indirecta
PyPIpython-json-logger4.0.0indirecta
PyPIpytokens0.4.1indirecta
PyPIpytz2026.1.post1indirecta
PyPIpywinpty3.0.3indirecta
PyPIpyzmq27.1.0indirecta
PyPIquarto-cli1.8.27indirecta
PyPIquartodoc0.11.1indirecta
PyPIrdkit2025.9.6indirecta
PyPIreferencing0.37.0indirecta
PyPIrequests2.32.5indirecta
PyPIrfc3339-validator0.1.4indirecta
PyPIrfc3986-validator0.1.1indirecta
PyPIrfc3987-syntax1.1.0indirecta
PyPIrich14.3.3indirecta
PyPIrpds-py0.30.0indirecta
PyPIruff0.15.6indirecta
PyPIscipy1.17.1indirecta
PyPIsend2trash2.1.0indirecta
PyPIsetuptools80.10.2indirecta
PyPIsix1.17.0indirecta
PyPIsortedcontainers2.4.0indirecta
PyPIsoupsieve2.8.3indirecta
PyPIsphobjinv2.3.1.3indirecta
PyPIsqlalchemy2.0.48indirecta
PyPIstack-data0.6.3indirecta
PyPIsyrupy5.1.0indirecta
PyPItabulate0.10.0indirecta
PyPIterminado0.18.1indirecta
PyPIthreadpoolctl3.6.0indirecta
PyPItinycss21.4.0indirecta
PyPItomlkit0.14.0indirecta
PyPItornado6.5.5indirecta
PyPItqdm4.67.3indirecta
PyPItraitlets5.14.3indirecta
PyPItyping-extensions4.15.0indirecta
PyPItyping-inspection0.4.2indirecta
PyPItzdata2025.3indirecta
PyPIuri-template1.3.0indirecta
PyPIurllib32.6.3indirecta
PyPIvirtualenv21.2.0indirecta
PyPIwatchdog6.0.0indirecta
PyPIwcwidth0.6.0indirecta
PyPIwebcolors25.10.0indirecta
PyPIwebencodings0.5.1indirecta
PyPIwebsocket-client1.9.0indirecta
PyPIwheel0.46.3indirecta
PyPIwidgetsnbextension4.0.15indirecta
PyPIzipp3.23.0indirecta
PyPIzstandard0.25.0indirecta
Informe JSON sin procesar legible por máquina

Comentarios

¿Algo no cuadra en este informe, o hay ideas que compartir? Mediciones erróneas, herramientas no detectadas, ideas, preguntas: todo es bienvenido. Cada mensaje se lee y recibe respuesta.

El mensaje se conserva durante el inicio de sesión.

Registros relacionados

Repositorios inspeccionados que comparten etiquetas de catálogo o ecosistemas con bradyajohnston/molecularnodes. Leer en paralelo →

78elkins/synth-pdbGenerate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..Bueno71elkins-lab/synth-pdbGenerate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..Bueno69abhishektiwari/hbatHBAT 2: A Python Package to analyse Hydrogen Bonds and Other Non-covalent Interactions in Macromolecular Structures https://hbat-web.abhishek-tiwari.comBueno39caltechmsc/dreid-packA high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.Débil84project-gemmi/gemmimacromolecular crystallography library and utilitiesExcelente45juliocesar-io/nano-protein-viewer-reactReact component for visualizing protein structures with the Mol* framework.Débil

Las puntuaciones son señales, no garantías. Reflejan prácticas públicamente visibles en GitHub; no son una auditoría de código ni una garantía de seguridad.

Los datos ausentes se excluyen y los pesos se renormalizan; nunca se puntúan como cero. La metodología es versionada y abierta: métricas v2.10.0, esquema v0.11.0 — metodología completa · wiki de métricas.

Cómo se sitúa un resultado dentro del registro general: estadísticas agregadas — PyPI.