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#ngs

Todos los repositorios del registro público que llevan esta etiqueta, procedente de sus topics de GitHub o de las palabras clave que publican sus registros de paquetes. La salud se mide con la misma metodología versionada que el resto del registro.

12 registros
Con la etiqueta «ngs»Ordenado por índice de salud
npm · PyPI
95Excepcionalíndice de salud
galaxyproject/galaxy
Data intensive science for everyone.
Python · TypeScript · Vue★ 1872↓ 245/mes18 oct 2026
Licencia propia18 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
88Excelenteíndice de salud
broadinstitute/viral-ngs
viral-ngs: command line tools and wrappers for processing raw viral genomic data
Python★ 19719 oct 2026
MIT19 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
88Excelenteíndice de salud
pysam-developers/pysam
Pysam is a Python package for reading, manipulating, and writing genomics data such as SAM/BAM/CRAM and VCF/BCF files. It's a lightweight wrapper of the HTSlib API, the same one that powers samtools, bcftools, and tabix.
Cython · Python★ 910↓ 964.7K/mes12 sept 2026
MIT12 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
87Excelenteíndice de salud
ablab/IsoQuant
A universal toolkit for upstream processing of long RNA reads
Python★ 23910 sept 2026
Licencia propia10 sept 2026 · métricas 2.10.0
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86Excelenteíndice de salud
samtools/htslib
C library for high-throughput sequencing data formats
C★ 95520 oct 2026
Licencia propia20 oct 2026 · métricas 2.10.0
RubyGems
69Buenoíndice de salud
telatin/bamtocov
🏔 coverage extraction from BAM/CRAM files, supporting targets 📊  
Nim · Python · Shell★ 6715 oct 2026
MIT15 oct 2026 · métricas 2.10.0
crates.io
63Moderadoíndice de salud
ngless-toolkit/ngless
NGLess: NGS with less work
Rust★ 15218 oct 2026
Licencia propia18 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
63Moderadoíndice de salud
sortmerna/sortmerna
SortMeRNA: next-generation sequence filtering and alignment tool
C++ · C · Jinja★ 3039 sept 2026
GPL-3.09 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
53Moderadoíndice de salud
sequana/variant_calling
El repositorio no publica descripción.
Python★ 020 sept 2026
BSD-3-Clause20 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
51Moderadoíndice de salud
khyox/recentrifuge
Recentrifuge: robust comparative analysis and contamination removal for metagenomics
Python · JavaScript★ 104↓ 308/mes15 oct 2026
Licencia propia15 oct 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
45Débilíndice de salud
edgardomortiz/Captus
Assembly of Phylogenomic Datasets from High-Throughput Sequencing data
Python★ 4514 sept 2026
GPL-3.014 sept 2026 · métricas 2.10.0
PyPI
14Críticoíndice de salud
antigenomics/arda
High-throughput mapping and domain partitioning of antigen receptor sequences
Python★ 56↓ 6669/mes27 sept 2026
GPL-3.027 sept 2026 · métricas 2.10.0