Усі теги
Тег каталогу

#ngs

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

12 записів
З тегом «ngs»Упорядковано за індексом здоров'я
npm · PyPI
95Винятковийіндекс здоров'я
galaxyproject/galaxy
Data intensive science for everyone.
Python · TypeScript · Vue★ 1 872↓ 245/міс18 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
88Відміннийіндекс здоров'я
broadinstitute/viral-ngs
viral-ngs: command line tools and wrappers for processing raw viral genomic data
Python★ 19719 жовт. 2026 р.
MIT19 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
88Відміннийіндекс здоров'я
pysam-developers/pysam
Pysam is a Python package for reading, manipulating, and writing genomics data such as SAM/BAM/CRAM and VCF/BCF files. It's a lightweight wrapper of the HTSlib API, the same one that powers samtools, bcftools, and tabix.
Cython · Python★ 910↓ 964.7K/міс12 вер. 2026 р.
MIT12 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
87Відміннийіндекс здоров'я
ablab/IsoQuant
A universal toolkit for upstream processing of long RNA reads
Python★ 23910 вер. 2026 р.
Власна ліцензія10 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
—
86Відміннийіндекс здоров'я
samtools/htslib
C library for high-throughput sequencing data formats
C★ 95520 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія20 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
RubyGems
69Добрийіндекс здоров'я
telatin/bamtocov
🏔 coverage extraction from BAM/CRAM files, supporting targets 📊  
Nim · Python · Shell★ 6715 жовт. 2026 р.
MIT15 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
crates.io
63Помірнийіндекс здоров'я
ngless-toolkit/ngless
NGLess: NGS with less work
Rust★ 15218 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія18 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
sortmerna/sortmerna
SortMeRNA: next-generation sequence filtering and alignment tool
C++ · C · Jinja★ 3039 вер. 2026 р.
GPL-3.09 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
53Помірнийіндекс здоров'я
sequana/variant_calling
Опис репозиторію не опубліковано.
Python★ 020 вер. 2026 р.
BSD-3-Clause20 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
51Помірнийіндекс здоров'я
khyox/recentrifuge
Recentrifuge: robust comparative analysis and contamination removal for metagenomics
Python · JavaScript★ 104↓ 308/міс15 жовт. 2026 р.
Власна ліцензія15 жовт. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
45Слабкийіндекс здоров'я
edgardomortiz/Captus
Assembly of Phylogenomic Datasets from High-Throughput Sequencing data
Python★ 4514 вер. 2026 р.
GPL-3.014 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0
PyPI
14Критичнийіндекс здоров'я
antigenomics/arda
High-throughput mapping and domain partitioning of antigen receptor sequences
Python★ 56↓ 6 669/міс27 вер. 2026 р.
GPL-3.027 вер. 2026 р. · метрики 2.10.0