Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.17.0 · метрики 2.10.0 · 2026-07-21 04:20 UTC

cokelaer / bioservices

Access to Biological Web Services from Python.

PythonВласна ліцензія★ 340 зірок⑂ 69 форківз серп. 2014 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипІнструмент командного рядкаБібліотекаяк це визначено

cokelaer/bioservices має індекс здоров’я 71 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Engineering Quality (86/100), найнижчий — Security (44/100). Останнє оновлення було 38 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

71
загалом / 100
Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

71
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 63 калібровано до 71 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Thomas CokelaerОсобистий обліковий запис
170 підписників74 публічні репозиторіїз трав. 2011 р.Institut Pasteur

Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікаціяТеги
PyPIbioservices1.16.036 13379115 днів томуbioserviceswebservicesbiologychebiunichemkeggbiomodelseutilsuniprotpicrarrayexpressmusclequickgopdbblastbiomartpantherdbmiriamgeneprofchemblchemspiderhgncpathwaycommonsrheaensembl

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

57Помірний · 21% загального індексу
Як обчислюється оцінка
18/36Свіжість pushостанній push 38 дн. тому
9/36Ритм комітів13/52 тижнів із комітами
18/18Обсяг комітів260 комітів за останній рік
1/10OpenSSF Scorecard: Maintained2 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 1
Використані вхідні дані
commits_last_year260
human_commit_share
days_since_last_push38
active_weeks_last_year13
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізиопубліковано 27 релізів
27/36Свіжість релізівостанній реліз 115 дн. тому
12.6/27Ритм релізівреліз кожні ~141 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releasesнемає даних
Використані вхідні дані
releases_count27
latest_release_tagv1.16.0
releases_from_tagsні
days_since_latest_release115
mean_days_between_releases141
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): OpenSSF Scorecard: Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

60Помірний · 17% загального індексу
Як обчислюється оцінка
41/60Зірки340 зірок
15.3/25Форки69 форків
6.5/15Спостерігачі16 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks69
stars340
watchers16
growth_stateorganic
growth_factor_pct100
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
16.9/22.5Ліцензіяфайл ліцензії наявний, не є визнаною ліцензією
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services
has_pull_request_templateні
Як обчислюється оцінка
60.8/80Щомісячні завантаження36 133 завантажень/місяць у pypi
0/20Залежні пакети в реєстріця екосистема цього не повідомляє
Використані вхідні дані
packagesbioservices
dependents
ecosystemspypi
total_downloads
monthly_downloads36 133
unverified_packages_excluded
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Залежні пакети в реєстрі. Залишкові ваги перенормовано.

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

66Добрий · 23% загального індексу
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-факторна 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
3.7/22.5Розподіл комітівголовний контриб’ютор — автор 84% комітів
13.5/13.5Широта контриб’юторів27 контриб’юторів
10/10OpenSSF Scorecard: Contributorsproject has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled27
top_contributor_share0,836
Як обчислюється оцінка
41.4/42Вирішення issueзакрито 99% issue
25.8/30Прийняття PRзлито 112/130 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptanceза 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15OpenSSF Scorecard: Code-ReviewFound 1/13 approved changesets -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
merged_prs112
open_issues3
closed_issues214
prs_merged_7d
prs_decided_7d
prs_merged_30d
prs_decided_30d
issue_closed_ratio0,986
closed_unmerged_prs18
first_time_authors_30d
first_time_prs_merged_30d
first_time_prs_decided_30d
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
10/30Підтримка власникаособистий (користувацький) обліковий запис
0/20Верифікований доменне застосовно до користувацьких облікових записів
16.1/25Охоплення власника170 підписників у cokelaer
25/25Послужний список74 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~15 р.
Використані вхідні дані
followers170
owner_typeUser
is_verified
owner_logincokelaer
public_repos74
account_age_days5 550
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно1 пакет(ів) у pypi
35/35Свіжість публікаційостання публікація 115 дн. тому
20/20Історія версій79 опублікованих версій
20/20Не застарілийактивний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesbioservices
ecosystemspypi
any_deprecatedні
min_days_since_publish115

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

86Відмінний · 19% загального індексу
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI46 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
16/16Конфігурація лінтера
9.6/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
2/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests1 out of 7 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 1
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configтак
has_precommit_configтак

Документація

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінкаhttp://bioservices.readthedocs.io
10/10Опис репозиторію
10/10Теми11 тем
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topicskegg, unichem, eutils, chembl, chebi, biomodels, quickgo, uniprot, wikipathways, muscle, python
has_wikiтак
homepagehttp://bioservices.readthedocs.io
docs_sitehttp://bioservices.readthedocs.io
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

44Слабкий · 16% загального індексу

Стан безпеки

37Слабкий
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protectionbranch protection not enabled on development/release branches
0.2/2.5CI-Tests1 out of 7 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 1
0.5/2.5CII-Best-Practicesbadge detected: InProgress
0/7.5Code-ReviewFound 1/13 approved changesets -- score normalized to 0
2.5/2.5Contributorsproject has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
10/10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
7.5/7.5Dependency-Update-Toolupdate tool detected
0/5Fuzzingproject is not fuzzed
2.2/2.5Ліцензіяlicense file detected
0.8/7.5Maintained2 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 1
5/5Packagingpackaging workflow detected
0/5Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policysecurity policy file not detected
0/7.5Signed-Releasesнемає даних
0/7.5Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0/7.5Vulnerabilities18 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated17
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive1
scorecard_aggregate3,7
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Signed-Releases. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
14/35Прямі залежності без відомих сповіщеньуражено 1: lxml 5.4.0 (high 7.5)
25/25Непрямі залежності без відомих сповіщеньжодна непряма залежність не має відомих сповіщень
33.7/40Немає задавнених сповіщень1 пакет(ів) зі сповіщеннями без реакції понад 90 дн.; найдавніше опубліковано 90 дн. тому
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories2
affected_packages1
assessed_packages47
unassessed_packages0
affected_by_severityhigh 1
direct_affected_packages1
Звірено з runtime-замиканням залежностей pypi:bioservices@1.16.0 — тим, що тягне за собою встановлення опублікованого пакета, — 47 пакетів. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

48Слабкий · 4% загального індексу
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентівнемає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
0/40Читабельна історія комітівнемає даних
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url
legible_history_share
agent_instruction_files
agent_instruction_max_bytes
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Читабельна історія комітів. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командоюdoc/Makefile
22/22Автоматизовані тести
11/11Конфігурація лінтера / форматера
0/11Статична перевірка типів
0/10Відтворюване середовище
0/10Підтверджена практика роботи з агентаминемає даних
0/8Автоматизоване супроводженнянемає даних
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfiles
has_dockerfileні
typed_languageні
bootstrap_filesdoc/Makefile
has_devcontainerні
has_linter_configтак
typecheck_configs
agent_commit_share
toolchain_manifests
dependency_bot_commit_share
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Підтверджена практика роботи з агентами, Автоматизоване супроводження. Залишкові ваги перенормовано.
Як обчислюється оцінка
0/45Типізований кодPython без конфігурації перевірки типів
53.7/55Керовані розміри файлів3/127 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languagePython
largest_source_bytes67 753
source_files_sampled127
oversized_source_files3
Як обчислюється оцінка
0/40Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto)не застосовно до цього типу програмного забезпечення
0/20Сервер MCPне застосовно до цього типу програмного забезпечення
40/40Придатні до запуску прикладиexamples, notebooks
Використані вхідні дані
example_dirsexamples, notebooks
has_mcp_signalні
api_schema_files
interfaces_expected_of
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto), Сервер MCP. Залишкові ваги перенормовано.

Ключові факти

340зірок GitHub
27контриб'юторів
260комітів за останні 12 місяців
38днів від останнього пушу
27релізів
1бас-фактор
3відкритих issue
PyPIпакетних екосистем

Докладніше

Історія зірок і форків 340 ★ / 0 ⇿
340Зірки

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

012525037534062014-102020-082026-07

Кожна точка охоплює 11 днів.

OpenSSF Scorecard 3.7 / 10
3.7сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-21 04:19 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
0Branch-Protectionbranch protection not enabled on development/release branches
1CI-Tests1 out of 7 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 1
2CII-Best-Practicesbadge detected: InProgress
0Code-ReviewFound 1/13 approved changesets -- score normalized to 0
10Contributorsproject has 3 contributing companies or organizations -- score normalized to 10
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
10Dependency-Update-Toolupdate tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
9Licenselicense file detected
1Maintained2 commit(s) and 0 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 1
10Packagingpackaging workflow detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
н/дSigned-Releasesno releases found
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0Vulnerabilities18 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 16
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
PyPIclick(>=8.1.8,<9.0.0)pyproject.toml
PyPIappdirs(>=1.4.4,<2.0.0)pyproject.toml
PyPImatplotlib(>=3.9)pyproject.toml
PyPIeasydev(>=0.13.3,<0.14.0)pyproject.toml
PyPItqdm(>=4.67.1,<5.0.0)pyproject.toml
PyPIrich-click(>=1.8.5,<2.0.0)pyproject.toml
PyPIcolorlog(>=6.9.0,<7.0.0)pyproject.toml
PyPIbeautifulsoup4(>=4.12.3,<5.0.0)pyproject.toml
PyPIgrequests(>=0.7.0,<0.8.0)pyproject.toml
PyPIrequests(>=2.32.3,<3.0.0)pyproject.toml
PyPIlxml(>=5.3.0,<7.0.0)pyproject.toml
PyPIrequests-cache(>=1.2.1,<2.0.0)pyproject.toml
PyPIwrapt(>=1.17.2,<2.0.0)pyproject.toml
PyPIxmltodict(>=0.14.2,<0.15.0)pyproject.toml
PyPIpandas(>2.2)pyproject.toml
PyPInumpy(>=1.23.2,<=2.4)pyproject.toml
Усі залежності 126

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 16 прямих і 110 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
PyPIappdirs1.4.4пряма
PyPIbeautifulsoup44.15.0пряма
PyPIclick8.1.8пряма
PyPIcolorlog6.10.1пряма
PyPIeasydev0.13.3пряма
PyPIgrequests0.7.0пряма
PyPIlxml6.1.1пряма
PyPImatplotlib3.9.4пряма
PyPInumpy2.0.2пряма
PyPIpandas2.3.3пряма
PyPIrequests2.32.5пряма
PyPIrequests-cache1.3.2пряма
PyPIrich-click1.9.8пряма
PyPItqdm4.68.2пряма
PyPIwrapt1.17.3пряма
PyPIxmltodict0.14.2пряма
PyPIalabaster0.7.16непряма
PyPIappnope0.1.4непряма
PyPIasttokens3.0.1непряма
PyPIattrs26.1.0непряма
PyPIbabel2.18.0непряма
PyPIcattrs25.3.0непряма
PyPIcertifi2026.5.20непряма
PyPIcffi2.0.0непряма
PyPIcharset-normalizer3.4.7непряма
PyPIcolorama0.4.6непряма
PyPIcomm0.2.3непряма
PyPIcontourpy1.3.0непряма
PyPIcoverage6.5.0непряма
PyPIcoveralls3.3.1непряма
PyPIcycler0.12.1непряма
PyPIdebugpy1.8.21непряма
PyPIdecorator5.3.1непряма
PyPIdocopt0.6.2непряма
PyPIdocutils0.20.1непряма
PyPIexceptiongroup1.3.1непряма
PyPIexecnet2.1.2непряма
PyPIexecuting2.2.1непряма
PyPIfastjsonschema2.21.2непряма
PyPIflaky3.8.1непряма
PyPIfonttools4.60.2непряма
PyPIgevent26.5.0непряма
PyPIgreenlet3.2.5непряма
PyPIidna3.18непряма
PyPIimagesize1.5.0непряма
PyPIimportlib-metadata8.7.1непряма
PyPIimportlib-resources6.5.2непряма
PyPIiniconfig2.1.0непряма
PyPIipykernel6.31.0непряма
PyPIipython8.18.1непряма
PyPIipython-pygments-lexers1.1.1непряма
PyPIjedi0.19.2непряма
PyPIjinja23.1.6непряма
PyPIjsonschema4.25.1непряма
PyPIjsonschema-specifications2025.9.1непряма
PyPIjupyter-client8.6.3непряма
PyPIjupyter-core5.8.1непряма
PyPIkiwisolver1.4.7непряма
PyPIline-profiler4.2.0непряма
PyPImarkdown-it-py3.0.0непряма
PyPImarkupsafe3.0.3непряма
PyPImatplotlib-inline0.2.2непряма
PyPImdurl0.1.2непряма
PyPInbclient0.10.2непряма
PyPInbformat5.10.4непряма
PyPInbmake1.5.5непряма
PyPInest-asyncio1.6.0непряма
PyPInest-asyncio21.7.2непряма
PyPInumpydocнепряма
PyPIpackaging26.2непряма
PyPIparso0.8.7непряма
PyPIpexpect4.9.0непряма
PyPIpillowнепряма
PyPIpillow11.3.0непряма
PyPIplatformdirs4.4.0непряма
PyPIpluggy1.6.0непряма
PyPIprompt-toolkit3.0.52непряма
PyPIpsutil7.2.2непряма
PyPIptyprocess0.7.0непряма
PyPIpure-eval0.2.3непряма
PyPIpycparser2.23непряма
PyPIpygments2.20.0непряма
PyPIpyparsing3.3.2непряма
PyPIpytest8.4.2непряма
PyPIpytest-cov4.1.0непряма
PyPIpytest-mock3.15.1непряма
PyPIpytest-runner6.0.1непряма
PyPIpytest-timeout2.4.0непряма
PyPIpytest-xdist3.8.0непряма
PyPIpython-dateutil2.9.0.post0непряма
PyPIpytz2026.2непряма
PyPIpywin32312непряма
PyPIpyzmq27.1.0непряма
PyPIreferencing0.36.2непряма
PyPIrich15.0.0непряма
PyPIrpds-py0.27.1непряма
PyPIsetuptools82.0.1непряма
PyPIsix1.17.0непряма
PyPIsnowballstemmer3.1.1непряма
PyPIsoupsieve2.8.4непряма
PyPIsphinxнепряма
PyPIsphinx7.4.7непряма
PyPIsphinx-copybuttonнепряма
PyPIsphinx-galleryнепряма
PyPIsphinx-gallery0.15.0непряма
PyPIsphinx-rtd-themeнепряма
PyPIsphinx-rtd-theme2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-applehelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-devhelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-htmlhelp2.1.0непряма
PyPIsphinxcontrib-jquery4.1непряма
PyPIsphinxcontrib-jsmath1.0.1непряма
PyPIsphinxcontrib-qthelp2.0.0непряма
PyPIsphinxcontrib-serializinghtml2.0.0непряма
PyPIstack-data0.6.3непряма
PyPItomli2.4.1непряма
PyPItornado6.5.7непряма
PyPItraitlets5.15.1непряма
PyPItyping-extensions4.15.0непряма
PyPItzdata2026.2непряма
PyPIurl-normalize2.2.1непряма
PyPIurllib32.6.3непряма
PyPIwcwidth0.8.1непряма
PyPIzipp3.23.1непряма
PyPIzope-event6.0непряма
PyPIzope-interface8.0.1непряма
Сповіщення про залежності 1

Встановлення pypi:bioservices@1.16.0 тягне 47 пакетів, прямих і транзитивних: 1 мають відомі сповіщення, з них 1 — прямі залежності.

ПакетВерсіяЗв'язокКритичністьСповіщеньВиправлено в
lxml5.4.0прямависока26.1.0

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.17.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистикаPyPI.