cyanheads / uniprot-mcp-server
Search UniProtKB by protein function, fetch curated records, map IDs across databases, and pull reference proteomes, taxonomy, and sequences via MCP. STDIO or Streamable HTTP.
cyanheads/uniprot-mcp-server має індекс здоров’я 77 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Engineering Quality (86/100), найнижчий — Community & Adoption (43/100). Останнє оновлення — сьогодні. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.
Індекс здоров'я програмного забезпечення
Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).
Профіль оцінок
Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.
Зважений загальний бал 66 калібровано до 77 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).
Власність
Цей репозиторій належить особистому обліковому запису. Проєкт з єдиним власником несе більший ризик безперервності, ніж підтримуваний організацією.
Пакетні екосистеми
| Реєстр | Пакет | Версія | Завантажень / міс | Версії | Остання публікація | Теги |
|---|---|---|---|---|---|---|
| npm | @cyanheads/uniprot-mcp-server | 0.2.6 | 946 | 7 | 5 днів тому | uniprotuniprotkbproteinproteomicsbioinformaticsswiss-protproteometaxonomyid-mappingsequenceannotationmcpmcp-servermodel-context-protocoltypescriptbunstdiostreamable-httpai-agent |
Метрики за категоріями
Життєздатність
Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?
Активність розробки
Як обчислюється оцінка
| 36/36 | Свіжість push — останній push 0 дн. тому |
| 6.2/36 | Ритм комітів — 9/52 тижнів із комітами |
| 15.6/18 | Обсяг комітів — 53 комітів за останній рік |
| 10/10 | OpenSSF Scorecard: Maintained — 30 commit(s) and 20 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
Використані вхідні дані
| commits_last_year | 53 |
| human_commit_share | 1 |
| days_since_last_push | 0 |
| active_weeks_last_year | 9 |
Дисципліна релізів
Як обчислюється оцінка
| 27/27 | Випускає релізи — опубліковано 8 релізів |
| 36/36 | Свіжість релізів — останній реліз 5 дн. тому |
| 27/27 | Ритм релізів — реліз кожні ~15,5 дн. |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
Використані вхідні дані
| releases_count | 8 |
| latest_release_tag | v0.2.6 |
| releases_from_tags | ні |
| days_since_latest_release | 5 |
| mean_days_between_releases | 15,5 |
Спільнота та впровадження
Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?
Популярність і впровадження
Як обчислюється оцінка
| 0/60 | Зірки — 2 зірок |
| 0/25 | Форки — 0 форків |
| 0/15 | Спостерігачі — 0 спостерігачів |
Використані вхідні дані
| forks | 0 |
| stars | 2 |
| watchers | 0 |
| growth_state | unverified |
| growth_factor_pct | 100 |
| growth_unverified_reason | no_history |
Здоров'я спільноти
Як обчислюється оцінка
| 22.5/22.5 | README |
| 22.5/22.5 | Ліцензія — визнана ліцензія (Apache-2.0) |
| 18/18 | Настанови CONTRIBUTING |
| 13.5/13.5 | Кодекс поведінки |
| 0/7.2 | Шаблон issue |
| 0/6.3 | Шаблон PR |
Використані вхідні дані
| has_readme | так |
| has_license | так |
| readme_badges | 10 |
| has_contributing | так |
| has_issue_template | ні |
| has_code_of_conduct | так |
| readme_badge_services | shields.io |
| has_pull_request_template | ні |
Впровадження в екосистемі (завантаження)
Як обчислюється оцінка
| 39.7/80 | Щомісячні завантаження — 946 завантажень/місяць у npm |
| 0/20 | Залежні пакети в реєстрі — ця екосистема цього не повідомляє |
Використані вхідні дані
| packages | @cyanheads/uniprot-mcp-server |
| dependents | — |
| ecosystems | npm |
| total_downloads | — |
| monthly_downloads | 946 |
| unverified_packages_excluded | — |
Сталість та врядування
Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?
Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)
Як обчислюється оцінка
| 9/54 | Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів |
| 0/22.5 | Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 100% комітів |
| 1.4/13.5 | Широта контриб’юторів — 1 контриб’юторів |
| 3/10 | OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3 |
Використані вхідні дані
| bus_factor | 1 |
| contributors_sampled | 1 |
| top_contributor_share | 1 |
Реактивність на issue та PR
Як обчислюється оцінка
| 33.9/42 | Вирішення issue — закрито 81% issue |
| 30/30 | Прийняття PR — злито 3/3 вирішених PR |
| 13/13 | Newcomer PR acceptance — злито 3/3 PR від новачків за 30 дн. |
| 0/15 | OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 0/8 approved changesets -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| merged_prs | 3 |
| open_issues | 5 |
| closed_issues | 21 |
| prs_merged_7d | 1 |
| prs_decided_7d | 1 |
| prs_merged_30d | 3 |
| prs_decided_30d | 3 |
| issue_closed_ratio | 0,808 |
| closed_unmerged_prs | 0 |
| first_time_authors_30d | 1 |
| first_time_prs_merged_30d | 3 |
| first_time_prs_decided_30d | 3 |
Власність та опіка
Як обчислюється оцінка
| 10/30 | Підтримка власника — особистий (користувацький) обліковий запис |
| 0/20 | Верифікований домен — не застосовно до користувацьких облікових записів |
| 16.8/25 | Охоплення власника — 213 підписників у cyanheads |
| 25/25 | Послужний список — 175 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~11 р. |
Використані вхідні дані
| followers | 213 |
| owner_type | User |
| is_verified | — |
| owner_login | cyanheads |
| public_repos | 175 |
| account_age_days | 4 311 |
Супровід пакетів
Як обчислюється оцінка
| 25/25 | Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у npm |
| 35/35 | Свіжість публікацій — остання публікація 5 дн. тому |
| 20/20 | Історія версій — 7 опублікованих версій |
| 20/20 | Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked |
Використані вхідні дані
| packages | @cyanheads/uniprot-mcp-server |
| ecosystems | npm |
| any_deprecated | ні |
| min_days_since_publish | 5 |
Інженерна якість
Чи наявні базові інженерні практики та документація?
Інженерні практики
Як обчислюється оцінка
| 24/24 | Процеси CI — 1 процес(ів) CI |
| 24/24 | Наявні тести |
| 16/16 | Конфігурація лінтера — biome.json |
| 0/9.6 | Pre-commit-хуки |
| 0/6.4 | .editorconfig |
| 20/20 | OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
Використані вхідні дані
| has_ci | так |
| has_tests | так |
| has_editorconfig | ні |
| has_linter_config | так |
| has_precommit_config | ні |
Документація
Як обчислюється оцінка
| 30/30 | README |
| 25/25 | Каталог документації |
| 15/15 | Сайт документації / домашня сторінка — https://www.npmjs.com/package/@cyanheads/uniprot-mcp-server |
| 10/10 | Опис репозиторію |
| 10/10 | Теми — 11 тем |
| 0/10 | Wiki |
Використані вхідні дані
| topics | bioinformatics, cyanheads, mcp, model-context-protocol, protein, proteome, proteomics, swiss-prot, typescript, uniprot, uniprotkb |
| has_wiki | ні |
| homepage | https://www.npmjs.com/package/@cyanheads/uniprot-mcp-server |
| docs_site | https://www.npmjs.com/package/@cyanheads/uniprot-mcp-server |
| has_readme | так |
| has_docs_dir | так |
| has_description | так |
Безпека
Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?
Стан безпеки
Як обчислюється оцінка
| 7.5/7.5 | Binary-Artifacts — no binaries found in the repo |
| 0/7.5 | Branch-Protection — branch protection not enabled on development/release branches |
| 2.5/2.5 | CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| 0/2.5 | CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0/7.5 | Code-Review — Found 0/8 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 0.8/2.5 | Contributors — project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3 |
| 10/10 | Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected |
| 0/7.5 | Dependency-Update-Tool — no update tool detected |
| 0/5 | Fuzzing — project is not fuzzed |
| 2.5/2.5 | Ліцензія — license file detected |
| 7.5/7.5 | Maintained — 30 commit(s) and 20 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| 0/5 | Packaging — немає даних |
| 0/5 | Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 5/5 | SAST — SAST tool is run on all commits |
| 5/5 | Security-Policy — security policy file detected |
| 0/7.5 | Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 7.5/7.5 | Token-Permissions — GitHub workflow tokens follow principle of least privilege |
| 6/7.5 | Vulnerabilities — 2 existing vulnerabilities detected |
Використані вхідні дані
| source | openssf_scorecard |
| checks_evaluated | 17 |
| scorecard_version | v5.5.0 |
| checks_inconclusive | 1 |
| scorecard_aggregate | 5,4 |
Сповіщення про залежності
Як обчислюється оцінка
| 35/35 | Прямі залежності без відомих сповіщень — жодна пряма залежність не має відомих сповіщень |
| 25/25 | Непрямі залежності без відомих сповіщень — жодна непряма залежність не має відомих сповіщень |
| 0/40 | Немає задавнених сповіщень — жодне сповіщення не має дати публікації |
Використані вхідні дані
| source | osv |
| advisories | 0 |
| affected_packages | 0 |
| assessed_packages | 36 |
| unassessed_packages | 0 |
| affected_by_severity | none |
| direct_affected_packages | 0 |
Готовність до ШІ
Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.
Контекст і настанови для агентів
Як обчислюється оцінка
| 45/45 | Інструкції для агентів — AGENTS.md, CLAUDE.md |
| 0/15 | Машиночитана документація (llms.txt) |
| 40/40 | Читабельна історія комітів — намір зазначено у 53 з 53 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст) |
Використані вхідні дані
| has_llms_txt | ні |
| llms_txt_url | — |
| legible_history_share | 1 |
| agent_instruction_files | AGENTS.md, CLAUDE.md |
| agent_instruction_max_bytes | 34 121 |
Як обчислюється оцінка
| 0/18 | Розгортання однією командою |
| 22/22 | Автоматизовані тести |
| 11/11 | Конфігурація лінтера / форматера — biome.json |
| 11/11 | Статична перевірка типів — tsconfig.json |
| 10/10 | Відтворюване середовище — Dockerfile |
| 0/10 | Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 53 комітів немає створених агентом |
| 0/8 | Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено |
| 0/10 | OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
Використані вхідні дані
| has_nix | ні |
| has_tests | так |
| lockfiles | — |
| has_dockerfile | так |
| typed_language | так |
| bootstrap_files | — |
| has_devcontainer | ні |
| has_linter_config | так |
| typecheck_configs | tsconfig.json |
| agent_commit_share | 0 |
| toolchain_manifests | — |
| dependency_bot_commit_share | 0 |
Читабельність коду для моделей
Як обчислюється оцінка
| 45/45 | Типізований код — TypeScript (статично типізована) |
| 53.7/55 | Керовані розміри файлів — 1/42 файлів вихідного коду понад 60 КБ |
Використані вхідні дані
| primary_language | TypeScript |
| largest_source_bytes | 70 409 |
| source_files_sampled | 42 |
| oversized_source_files | 1 |
Машиночитні інтерфейси
Як обчислюється оцінка
| 0/40 | Схема API (OpenAPI/GraphQL/proto) — не застосовно до цього типу програмного забезпечення |
| 20/20 | Сервер MCP |
| 0/40 | Придатні до запуску приклади |
Використані вхідні дані
| example_dirs | — |
| has_mcp_signal | так |
| api_schema_files | — |
| interfaces_expected_of | — |
Ключові факти
Попередження щодо збору даних
- Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token
Докладніше
OpenSSF Scorecard 5.4 / 10
Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).
| 10 | Binary-Artifacts | no binaries found in the repo |
| 0 | Branch-Protection | branch protection not enabled on development/release branches |
| 10 | CI-Tests | 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10 |
| 0 | CII-Best-Practices | no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected |
| 0 | Code-Review | Found 0/8 approved changesets -- score normalized to 0 |
| 3 | Contributors | project has 1 contributing companies or organizations -- score normalized to 3 |
| 10 | Dangerous-Workflow | no dangerous workflow patterns detected |
| 0 | Dependency-Update-Tool | no update tool detected |
| 0 | Fuzzing | project is not fuzzed |
| 10 | License | license file detected |
| 10 | Maintained | 30 commit(s) and 20 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 10 |
| н/д | Packaging | packaging workflow not detected |
| 0 | Pinned-Dependencies | dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0 |
| 10 | SAST | SAST tool is run on all commits |
| 10 | Security-Policy | security policy file detected |
| 0 | Signed-Releases | Project has not signed or included provenance with any releases. |
| 10 | Token-Permissions | GitHub workflow tokens follow principle of least privilege |
| 8 | Vulnerabilities | 2 existing vulnerabilities detected |
Прямі залежності 3
| Реєстр | Пакет | Обмеження версії | Маніфест |
|---|---|---|---|
| npm | @cyanheads/mcp-ts-core | ^0.13.15 | package.json |
| npm | pino-pretty | ^13.2.0 | package.json |
| npm | zod | ^4.6.5 | package.json |
Усі залежності 12
Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 3 прямих і 9 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.
| Реєстр | Пакет | Версія | Зв'язок |
|---|---|---|---|
| npm | @cyanheads/mcp-ts-core | ^0.13.15 | пряма |
| npm | pino-pretty | ^13.2.0 | пряма |
| npm | zod | ^4.6.5 | пряма |
| npm | @biomejs/biome | 2.5.15 | непряма |
| npm | @socketsecurity/bun-security-scanner | ^1.1.3 | непряма |
| npm | @types/node | ^26.6.5 | непряма |
| npm | @vitest/coverage-istanbul | ^5.0.3 | непряма |
| npm | depcheck | ^1.4.7 | непряма |
| npm | ignore | ^7.0.12 | непряма |
| npm | tsc-alias | ^1.9.7 | непряма |
| npm | typescript | ^7.0.2 | непряма |
| npm | vitest | ^5.0.3 | непряма |
Сповіщення про залежності 0
Встановлення npm:@cyanheads/uniprot-mcp-server@0.2.6 тягне 36 пакетів, прямих і транзитивних: 0 мають відомі сповіщення, з них 0 — прямі залежності.
Жодне відоме сповіщення не стосується оцінених залежностей.
Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.
Звіт у форматі JSON машиночитний
Зворотний зв’язок
Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.
Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.
Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.34.0 — повна методологія · вікі метрик.
Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — npm.