Усі теги
Тег каталогу

#protein

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

29 записів
З тегом «protein»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
77Добрийіндекс здоров'я
biopython/biopython
Official git repository for Biopython (originally converted from CVS)
Python★ 5 13122 лип. 2026 р.
Власна ліцензія22 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
73Добрийіндекс здоров'я
Lattice-Automation/seqviz
a JavaScript DNA, RNA, and protein sequence viewer
TypeScript★ 325↓ 40K/міс23 лип. 2026 р.
MIT23 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
72Добрийіндекс здоров'я
bradyajohnston/molecularnodes
Toolbox for molecular animations in Blender, powered by Geometry Nodes.
Python★ 1 31715 лип. 2026 р.
GPL-3.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
69Помірнийіндекс здоров'я
haddocking/protein-quest
Python package to search/retrieve/filter proteins and protein structures
Python★ 515 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
67Помірнийіндекс здоров'я
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3 758/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
61Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-saxs
A lightweight Python library for simulating Small-Angle X-ray Scattering (SAXS) profiles from protein coordinates, with Jupyter Notebook examples.
Python★ 1↓ 3 502/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm · PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
full-spectrum-analytics/dash-seqviz
A dash wrapper of the javascript DNA, RNA and protein sequence viewer
Python · JavaScript★ 1↓ 317/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI · crates.io
57Помірнийіндекс здоров'я
hfooladi/pdbrust
A Rust library for parsing PDB (Protein Data Bank) files
Rust★ 20↓ 997/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
54Помірнийіндекс здоров'я
a-r-j/ProteinWorkshop
Benchmarking framework for protein representation learning. Includes a large number of pre-training and downstream task datasets, models and training/task utilities. (ICLR 2024)
Python · Jupyter Notebook★ 27515 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io · npm
49У зоні ризикуіндекс здоров'я
tkanx/bio-forge
A high-performance, pure Rust toolkit for standardizing and preparing biomolecular systems (proteins & nucleic acids). It heals missing atoms, resolves protonation states, adds solvation, and unifies topologies to forge simulation-ready structures.
Rust · TypeScript★ 14115 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
AkhilTeja2209/Proteinspy
Python library and a CLI tool to analyze protein sample files
Python★ 0↓ 975/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
juliocesar-io/nano-protein-viewer-react
React component for visualizing protein structures with the Mol* framework.
TypeScript★ 8↓ 710/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
47У зоні ризикуіндекс здоров'я
beautiful-atoms/beautiful-atoms
Python module for drawing and rendering beautiful atoms and molecules using Blender.
Python★ 19617 лип. 2026 р.
GPL-3.017 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
46У зоні ризикуіндекс здоров'я
JinyuanSun/PymolFold
Protein folding in Pymol
Python★ 149↓ 455/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
45У зоні ризикуіндекс здоров'я
gqy20/protein-mcp
FastMCP-based protein data access tools for bioinformatics research
Python★ 0↓ 682/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
a-r-j/cpdb
Cython implementation of PDB -> DataFrame parsing
Cython · Jupyter Notebook · Python★ 34↓ 20.1K/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
crates.io
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
caltechmsc/dreid-pack
A high-performance, pure Rust library for full-atom protein side-chain packing using the DREIDING force field, Goldstein+Split DEE, and tree-decomposition DP—with native protein–ligand and protein–nucleic acid interface support.
Rust★ 217 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
43У зоні ризикуіндекс здоров'я
uclorengogroup/cath-tools
Protein structure comparison tools such as SSAP and SNAP
C++ · Promela★ 6715 лип. 2026 р.
GPL-3.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
42У зоні ризикуіндекс здоров'я
gemmimol/gemmimol
Macromolecular viewer for crystallographers (WebGL)
JavaScript · TypeScript★ 3↓ 305/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
41У зоні ризикуіндекс здоров'я
calipho-sib/feature-viewer
Library to visualize protein sequence features in javascript using D3 - From SIB CALIPHO group; neXtProt project
JavaScript★ 121↓ 818/міс17 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
38У зоні ризикуіндекс здоров'я
ppillot/biomsalign
JavaScript library for Multiple Sequence Alignment
TypeScript★ 26↓ 23K/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
36У зоні ризикуіндекс здоров'я
amorehead/pdb-tools
A dependency-free cross-platform swiss army knife for PDB files.
Python★ 0↓ 995/міс15 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
36У зоні ризикуіндекс здоров'я
jpuglia/proteinloc
Опис репозиторію не опубліковано.
Python★ 015 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
33У зоні ризикуіндекс здоров'я
calipho-sib/sequence-viewer
neXtProt protein sequence viewer (javascript) - From SIB CALIPHO group; neXtProt project
JavaScript★ 52↓ 247/міс15 лип. 2026 р.
Без ліцензії15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
33У зоні ризикуіндекс здоров'я
micommunity/complexviewer
web based visualisation of molecular interaction data
JavaScript★ 12↓ 502/міс15 лип. 2026 р.
Apache-2.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
31У зоні ризикуіндекс здоров'я
allydunham/proteinnetpy
A python library for working with ProteinNet data
Python★ 415 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
npm
14Критичнийіндекс здоров'я
angelmunoz/drptranslator
A DNA-RNA-Protein translator mini-library in Typescript checkout the docs! or go straight to the npm repository and give it a test! https://www.npmjs.com/package/drptranslator
TypeScript★ 0↓ 175/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
10Критичнийіндекс здоров'я
antigenomics/seqtree
Efficiently search and cluster highly similar short sequences
Python · C++ · TeX★ 0↓ 6 366/міс20 лип. 2026 р.
GPL-3.020 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0