Публічний реєстр
Звіт про здоров'я програмного забезпеченнясхема 0.26.0 · метрики 2.10.0 · 2026-07-22 15:26 UTC

evolbioinfo / gotree

Gotree: a set of command line tools and an API to manipulate phylogenetic trees.

Go · ShellGPL-2.0★ 150 зірок⑂ 19 форківз лип. 2016 р.Переглянути на GitHub ↗
ТипІнструмент командного рядкаяк це визначено
#phylogeny#newick#tree#tree-structure#itol#gotree#nexus

evolbioinfo/gotree має індекс здоров’я 69 зі 100, що відповідає смузі «Добрий». Найвищий показник — Engineering Quality (81/100), найнижчий — Security (37/100). Останнє оновлення було 7 днів тому. Більшість нещодавньої роботи виконує один учасник.

69
загалом / 100
Добрий

Індекс здоров'я програмного забезпечення

Метрики згруповано у зважені категорії на шкалі 1–100. Загальна оцінка починається як їхнє зважене середнє, відкаліброване за розподілом публічного реєстру, тож діапазони мають перцентильний зміст; коли публічні дані активують Політику юрисдикцій високого ризику, рейтинг коригується й отримує верхню межу 34 («У зоні ризику»).

69
Винятковий93-100Верхній щабель реєстру (≈ топ-5%); відповідає практично всім перевіреним критеріям
Відмінний80-92Сильний за всіма напрямами; незначні прогалини
Добрий65-79Здоровий; прогалини обмежені та керовані
Помірний50-64Прийнятний, але з помітними прогалинами; рекомендовано перевірку
Слабкий35-49Суттєві недоліки в кількох сферах
У зоні ризику20-34Суттєві слабкі місця; впровадження потребує обережності
Критичний1-19Серйозні проблеми (покинутий, єдиний мейнтейнер, без базової гігієни)
ЖиттєздатністьСпільнота тавпровадженняСталість таврядуванняІнженернаякістьБезпекаГотовність доШІ

Профіль оцінок

Кожна вісь — окрема категорія. Форма важить більше, ніж середнє: здоровий об'єкт заповнює всю фігуру, тоді як профіль із піками та провалами означає, що сила в одному вимірі маскує ризик в іншому.

Зважений загальний бал 62 калібровано до 69 за шкалою опублікованого індексу (калібрування реєстру 2026-08-02).

Власність

Evolutionary BioinformaticsОрганізація
50 підписників30 публічних репозиторіївз лют. 2017 р.

За цим репозиторієм стоїть організація — спільна, підзвітна опіка, здатна пережити будь-якого окремого мейнтейнера.

Пакетні екосистеми

РеєстрПакетВерсіяЗавантажень / місВерсіїОстання публікація
Gogithub.com/evolbioinfo/gotreev0.5.2-4022 дні тому

Метрики за категоріями

Життєздатність

Чи живий проєкт — чи пишеться код і чи виходять релізи?

68Добрий · 21% загального індексу

Активність розробки

62Помірний
Як обчислюється оцінка
36/36Свіжість push — останній push 7 дн. тому
6.9/36Ритм комітів — 10/52 тижнів із комітами
14.1/18Обсяг комітів — 36 комітів за останній рік
5/10OpenSSF Scorecard: Maintained — 6 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 5
Використані вхідні дані
commits_last_year36
human_commit_share0,95
days_since_last_push7
active_weeks_last_year10

Дисципліна релізів

76Добрий
Як обчислюється оцінка
27/27Випускає релізи — опубліковано 53 релізів
36/36Свіжість релізів — останній реліз 6 дн. тому
12.6/27Ритм релізів — реліз кожні ~217 дн.
0/10OpenSSF Scorecard: Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
Використані вхідні дані
releases_count53
latest_release_tagv0.5.2
releases_from_tagsні
days_since_latest_release6
mean_days_between_releases217

Спільнота та впровадження

Чи має проєкт користувачів, завантаження, увагу та влаштовані умови для контриб’юторів?

51Помірний · 17% загального індексу

Популярність і впровадження

51Помірний
Як обчислюється оцінка
35.3/60Зірки — 150 зірок
10.5/25Форки — 19 форків
5.6/15Спостерігачі — 11 спостерігачів
Використані вхідні дані
forks19
stars150
watchers11
growth_stateunverified
growth_factor_pct100
growth_unverified_reasonno_history

Здоров'я спільноти

50Помірний
Як обчислюється оцінка
22.5/22.5README
22.5/22.5Ліцензія — визнана ліцензія (GPL-2.0)
0/18Настанови CONTRIBUTING
0/13.5Кодекс поведінки
0/7.2Шаблон issue
0/6.3Шаблон PR
Використані вхідні дані
has_readmeтак
has_licenseтак
readme_badges—
has_contributingні
has_issue_templateні
has_code_of_conductні
readme_badge_services—
has_pull_request_templateні

Сталість та врядування

Чи переживе проєкт своїх людей — бас-фактор, реактивність, хто за ним стоїть і як супроводжуються пакети?

67Добрий · 23% загального індексу

Стійкість мейнтейнерів (бас-фактор)

22У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
9/54Бас-фактор — на 1 контриб’ютор(ів) припадає половина всіх комітів
0.3/22.5Розподіл комітів — головний контриб’ютор — автор 99% комітів
6.8/13.5Широта контриб’юторів — 5 контриб’юторів
6/10OpenSSF Scorecard: Contributors — project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6
Використані вхідні дані
bus_factor1
contributors_sampled5
top_contributor_share0,986

Реактивність на issue та PR

78Добрий
Як обчислюється оцінка
38/42Вирішення issue — закрито 90% issue
30/30Прийняття PR — злито 9/9 вирішених PR
0/13Newcomer PR acceptance — за 30 дн. не вирішено жодного PR від новачка
0/15OpenSSF Scorecard: Code-Review — Found 1/19 approved changesets -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
merged_prs9
open_issues2
closed_issues19
prs_merged_7d—
prs_decided_7d—
prs_merged_30d—
prs_decided_30d—
issue_closed_ratio0,905
closed_unmerged_prs0
first_time_authors_30d—
first_time_prs_merged_30d—
first_time_prs_decided_30d—
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Newcomer PR acceptance. Залишкові ваги перенормовано.

Власність та опіка

82Відмінний
Як обчислюється оцінка
30/30Підтримка власника — у власності організації
0/20Верифікований домен — статус підтвердженого домену для цієї організації не зчитано
12.3/25Охоплення власника — 50 підписників у evolbioinfo
22.9/25Послужний список — 30 публічних репозиторіїв, вік облікового запису ~9 р.
Використані вхідні дані
followers50
owner_typeOrganization
is_verified—
owner_loginevolbioinfo
public_repos30
account_age_days3 437
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Верифікований домен. Залишкові ваги перенормовано.

Супровід пакетів

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
25/25Опубліковано й доступно — 1 пакет(ів) у go
35/35Свіжість публікацій — остання публікація 22 дн. тому
20/20Історія версій — 40 опублікованих версій
20/20Не застарілий — активний, не deprecated і не yanked
Використані вхідні дані
packagesgithub.com/evolbioinfo/gotree
ecosystemsgo
any_deprecatedні
min_days_since_publish22

Інженерна якість

Чи наявні базові інженерні практики та документація?

81Відмінний · 19% загального індексу

Інженерні практики

68Добрий
Як обчислюється оцінка
24/24Процеси CI — 1 процес(ів) CI
24/24Наявні тести
0/16Конфігурація лінтера
0/9.6Pre-commit-хуки
0/6.4.editorconfig
20/20OpenSSF Scorecard: CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
Використані вхідні дані
has_ciтак
has_testsтак
has_editorconfigні
has_linter_configні
has_precommit_configні

Документація

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
30/30README
25/25Каталог документації
15/15Сайт документації / домашня сторінка — https://research.pasteur.fr/en/software/goalign-gotree/
10/10Опис репозиторію
10/10Теми — 7 тем
10/10Wiki
Використані вхідні дані
topicsphylogeny, newick, tree, tree-structure, itol, gotree, nexus
has_wikiтак
homepagehttps://research.pasteur.fr/en/software/goalign-gotree/
docs_sitehttps://research.pasteur.fr/en/software/goalign-gotree/
has_readmeтак
has_docs_dirтак
has_descriptionтак

Безпека

Чи міцні видимі практики безпеки й ланцюга постачання, без непослабленої пов’язаності з юрисдикціями високого ризику?

37Слабкий · 16% загального індексу

Стан безпеки

30У зоні ризику
Як обчислюється оцінка
7.5/7.5Binary-Artifacts — no binaries found in the repo
0/7.5Branch-Protection — немає даних
2.5/2.5CI-Tests — 3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0/2.5CII-Best-Practices — no effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0/7.5Code-Review — Found 1/19 approved changesets -- score normalized to 0
1.5/2.5Contributors — project has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6
10/10Dangerous-Workflow — no dangerous workflow patterns detected
0/7.5Dependency-Update-Tool — no update tool detected
0/5Fuzzing — project is not fuzzed
2.5/2.5Ліцензія — license file detected
3.8/7.5Maintained — 6 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 5
0/5Packaging — немає даних
0/5Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0/5SAST — SAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0/5Security-Policy — security policy file not detected
0/7.5Signed-Releases — Project has not signed or included provenance with any releases.
0/7.5Token-Permissions — detected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0/7.5Vulnerabilities — 12 existing vulnerabilities detected
Використані вхідні дані
sourceopenssf_scorecard
checks_evaluated16
scorecard_versionv5.5.0
checks_inconclusive2
scorecard_aggregate3
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Branch-Protection, Packaging. Залишкові ваги перенормовано.

Сповіщення про залежності

64Помірний
Як обчислюється оцінка
14/35Прямі залежності без відомих сповіщень — уражено 1: golang.org/x/image v0.11.0 (high 7.5)
0/25Непрямі залежності без відомих сповіщень — транзитивний набір не відокремлюється від залежностей розробки й тестування в цьому обсязі
33.7/40Немає задавнених сповіщень — 1 пакет(ів) зі сповіщеннями без реакції понад 90 дн.; найдавніше опубліковано 756 дн. тому
Використані вхідні дані
sourceosv
advisories16
affected_packages4
assessed_packages39
unassessed_packages0
affected_by_severityhigh 1, moderate 1, unknown 2
direct_affected_packages1
Виключено з оцінювання (немає даних або не застосовно): Непрямі залежності без відомих сповіщень. Залишкові ваги перенормовано. Звірено 39 резолвлених залежностей із OSV. Цей репозиторій не публікує пакета, який резолвить індекс, тож натомість оцінено граф залежностей репозиторію. Цей граф змішує закріплені версії для розробки й тестування зі справді постачаними залежностями, тож оцінюються лише задекларовані runtime-залежності; транзитивні знахідки подаються як контекст і в оцінку не входять. Досяжність не аналізується.

Готовність до ШІ

Наскільки репозиторій оснащений для розробки та супроводу за участі ШІ-агентів? Має свідомо малу вагу (4%): агентний інструментарій — реальний сигнал супроводу, але репозиторій без нього все одно може отримати 100/100.

48Слабкий · 4% загального індексу

Контекст і настанови для агентів

6Критичний
Як обчислюється оцінка
0/45Інструкції для агентів — немає CLAUDE.md / AGENTS.md / правил редактора
0/15Машиночитана документація (llms.txt)
5.6/40Читабельна історія комітів — намір зазначено у 10 з 95 людських комітів (структурований заголовок або пояснювальний текст)
Використані вхідні дані
has_llms_txtні
llms_txt_url—
legible_history_share0,105
agent_instruction_files—
agent_instruction_max_bytes—

Цикл верифікації (збірка / тести / перевірка типів)

61Помірний
Як обчислюється оцінка
18/18Розгортання однією командою — Makefile
22/22Автоматизовані тести
0/11Конфігурація лінтера / форматера
11/11Статична перевірка типів — Go (статично типізована)
10/10Відтворюване середовище — lockfile
0/10Підтверджена практика роботи з агентами — серед останніх 100 комітів немає створених агентом
0/8Автоматизоване супроводження — автоматичних оновлень залежностей не виявлено
0/10OpenSSF Scorecard: Pinned-Dependencies — dependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
Використані вхідні дані
has_nixні
has_testsтак
lockfilesgo.sum
has_dockerfileні
typed_languageтак
bootstrap_filesMakefile
has_devcontainerні
has_linter_configні
typecheck_configs—
agent_commit_share0
toolchain_manifestsgo.mod
dependency_bot_commit_share0

Читабельність коду для моделей

100Винятковий
Як обчислюється оцінка
45/45Типізований код — Go (статично типізована)
54.7/55Керовані розміри файлів — 1/180 файлів вихідного коду понад 60 КБ
Використані вхідні дані
primary_languageGo
largest_source_bytes61 630
source_files_sampled180
oversized_source_files1

Ключові факти

150зірок GitHub
5контриб'юторів
36комітів за останні 12 місяців
7днів від останнього пушу
53релізів
1бас-фактор
2відкритих issue
Goпакетних екосистем

Попередження щодо збору даних

  • Star history unavailable: GitHub GraphQL error: Resource not accessible by personal access token

Докладніше

Історія зірок і форків 0 ★ / 19 ⇿
0Зірки
19Форки
17Релізи

Коли додано кожну зірку й форк — зібрано з GitHub і згруповано за днями. Кумулятивне зростання розміщено просто над денними додаваннями, з яких воно складається, тож їх видно одне проти одного: рівномірне органічне накопичення виглядає зовсім інакше, ніж різкий короткочасний сплеск. Там, де цю різницю можна виміряти, її подано як автентичність росту.

0481216201922018-122022-092026-06
Мажорні 0Мінорні 3Патчі 7

Кожна точка охоплює 7 днів.

OpenSSF Scorecard 3.0 / 10
3.0сукупно

Незалежна, не прив'язана до інструментів оцінка безпеки від відкритого проєкту OpenSSF Scorecard. Кожна перевірка винагороджує практику безпеки, а не інструмент конкретного постачальника. Перевірки, які Scorecard не зміг визначити, позначено н/д і виключено з оцінки безпеки (вони ніколи не зараховуються як нуль).Scorecard v5.5.0 · 2026-07-22 15:26 UTC

10Binary-Artifactsno binaries found in the repo
н/дBranch-Protectioninternal error: error during branchesHandler.setup: internal error: some github tokens can't read classic branch protection rules: https://github.com/ossf/scorecard-action/blob/main/docs/authentication/fine-grained-auth-token.md
10CI-Tests3 out of 3 merged PRs checked by a CI test -- score normalized to 10
0CII-Best-Practicesno effort to earn an OpenSSF best practices badge detected
0Code-ReviewFound 1/19 approved changesets -- score normalized to 0
6Contributorsproject has 2 contributing companies or organizations -- score normalized to 6
10Dangerous-Workflowno dangerous workflow patterns detected
0Dependency-Update-Toolno update tool detected
0Fuzzingproject is not fuzzed
10Licenselicense file detected
5Maintained6 commit(s) and 1 issue activity found in the last 90 days -- score normalized to 5
н/дPackagingpackaging workflow not detected
0Pinned-Dependenciesdependency not pinned by hash detected -- score normalized to 0
0SASTSAST tool is not run on all commits -- score normalized to 0
0Security-Policysecurity policy file not detected
0Signed-ReleasesProject has not signed or included provenance with any releases.
0Token-Permissionsdetected GitHub workflow tokens with excessive permissions
0Vulnerabilities12 existing vulnerabilities detected
Прямі залежності 11
РеєстрПакетОбмеження версіїМаніфест
Gogithub.com/ajstarks/svgov0.0.0-20211024235047-1546f124cd8bgo.mod
Gogithub.com/evolbioinfo/goalignv0.3.7-0.20230906113011-fcecb09f9d43go.mod
Gogithub.com/fredericlemoine/bitsetv1.2.0go.mod
Gogithub.com/fredericlemoine/cobrashellv0.0.0-20180921081141-49c72f93426cgo.mod
Gogithub.com/fredericlemoine/gostatsv0.2.0go.mod
Gogithub.com/golang/freetypev0.0.0-20170609003504-e2365dfdc4a0go.mod
Gogithub.com/jlaffaye/ftpv0.0.0-20210307004419-5d4190119067go.mod
Gogithub.com/llgcode/draw2dv0.0.0-20210313082411-577c1ead272ago.mod
Gogithub.com/spf13/cobrav1.5.0go.mod
Gogolang.org/x/imagev0.11.0go.mod
Gogonum.org/v1/plotv0.14.0go.mod
Усі залежності 39

Повний розв'язаний набір залежностей із графа залежностей GitHub: 11 прямих і 28 непрямих (транзитивних) пакетів. Транзитивне замикання є повним, коли в репозиторії закомічено lockfile.

РеєстрПакетВерсіяЗв'язок
Gogithub.com/ajstarks/svgov0.0.0-20211024235047-1546f124cd8bпряма
Gogithub.com/evolbioinfo/goalignv0.3.7-0.20230906113011-fcecb09f9d43пряма
Gogithub.com/fredericlemoine/bitsetv1.2.0пряма
Gogithub.com/fredericlemoine/cobrashellv0.0.0-20180921081141-49c72f93426cпряма
Gogithub.com/fredericlemoine/gostatsv0.2.0пряма
Gogithub.com/golang/freetypev0.0.0-20170609003504-e2365dfdc4a0пряма
Gogithub.com/jlaffaye/ftpv0.0.0-20210307004419-5d4190119067пряма
Gogithub.com/llgcode/draw2dv0.0.0-20210313082411-577c1ead272aпряма
Gogithub.com/spf13/cobrav1.5.0пряма
Gogolang.org/x/imagev0.11.0пряма
Gogonum.org/v1/plotv0.14.0пряма
Gogioui.orgv0.2.0непряма
Gogioui.org/cpuv0.0.0-20220412190645-f1e9e8c3b1f7непряма
Gogioui.org/shaderv1.0.6непряма
Gogioui.org/xv0.2.0непряма
Gogit.sr.ht/~sbinet/ggv0.5.0непряма
Gogithub.com/abiosoft/ishellv2.0.0+incompatibleнепряма
Gogithub.com/abiosoft/readlinev0.0.0-20180607040430-155bce2042dbнепряма
Gogithub.com/andybalholm/strokev0.0.0-20221221101821-bd29b49d73f0непряма
Gogithub.com/armon/go-radixv1.0.0непряма
Gogithub.com/campoy/embedmdv1.0.0непряма
Gogithub.com/fatih/colorv1.10.0непряма
Gogithub.com/flynn-archive/go-shlexv0.0.0-20150515145356-3f9db97f8568непряма
Gogithub.com/go-fonts/liberationv0.3.1непряма
Gogithub.com/go-latex/latexv0.0.0-20230307184459-12ec69307ad9непряма
Gogithub.com/go-pdf/fpdfv0.8.0непряма
Gogithub.com/go-text/typesettingv0.0.0-20230803102845-24e03d8b5372непряма
Gogithub.com/inconshreveable/mousetrapv1.0.1непряма
Gogithub.com/mattn/go-colorablev0.1.8непряма
Gogithub.com/mattn/go-isattyv0.0.12непряма
Gogithub.com/pmezard/go-difflibv1.0.0непряма
Gogithub.com/spf13/pflagv1.0.5непряма
Gogithub.com/ulikunitz/xzv0.5.10непряма
Gogolang.org/x/expv0.0.0-20230801115018-d63ba01acd4bнепряма
Gogolang.org/x/exp/shinyv0.0.0-20230801115018-d63ba01acd4bнепряма
Gogolang.org/x/sysv0.11.0непряма
Gogolang.org/x/textv0.12.0непряма
Gogonum.org/v1/gonumv0.14.0непряма
Gorsc.io/pdfv0.1.1непряма
Сповіщення про залежності 4

Цей репозиторій не публікує пакета, який розпізнає індекс, тож оцінено його власний граф залежностей — 39 пакетів, серед яких є й піниї розробки та тестування, що ніколи не постачаються: 4 мають відомі сповіщення, з них 1 прямі.

ПакетВерсіяЗв'язокКритичністьСповіщеньВиправлено в
golang.org/x/imagev0.11.0прямависока120.43.0
github.com/ulikunitz/xzv0.5.10непрямапомірна20.5.15
golang.org/x/sysv0.11.0непряманевідома10.44.0
golang.org/x/textv0.12.0непряманевідома10.39.0

Сповіщення означає, що версія, записана в графі залежностей, потрапляє в уражений діапазон. Досяжність не аналізується, а граф містить піниї розробки й тестування — знахідка може стосуватися інструментів, а не поставленого коду.

Звіт у форматі JSON машиночитний

Зворотний зв’язок

Помітили щось хибне у цьому звіті або маєте чим поділитися? Неправильні вимірювання, непомічені інструменти, ідеї, запитання — усе доречно. Кожне повідомлення читається й отримує відповідь.

Повідомлення збережеться під час входу.

Пов’язані записи

Перевірені репозиторії, що мають спільні каталожні теги або екосистеми з evolbioinfo/gotree. Читати поруч →

80ddddddO/gtreeEasily output ASCII tree from Go program or Markdown unordered list . There's also CLI tool that can output tree from JSON, YAML, or TOML! It's called *xtree*.Відмінний63evolbioinfo/goalignGoalign : a set of command line tools and an API to manipulate multiple sequence alignments.Помірний92metaopt/optreeOpTree: Optimized PyTree UtilitiesВідмінний88saschagrunert/indextreeArena based tree 🌲 structure by using indices instead of reference counted pointersВідмінний80CodeWithDennis/filament-select-treeThe multi-level select field lets you pick one or multiple options from a list that is neatly organized into different levels.Відмінний56BilalAslim/baumBaum is an implementation of the Nested Set pattern for Laravel. PHP 7.3-8.4, Laravel 5.8-12 SupportedПомірний

Оцінки — це сигнали, а не гарантії. Вони відображають публічно видимі практики на GitHub — це не аудит коду й не гарантія безпеки.

Відсутні дані виключаються, а ваги перенормовуються — нуль за відсутність ніколи не ставиться. Методологія версіонована й відкрита: метрики v2.10.0, схема v0.26.0 — повна методологія · вікі метрик.

Як окремий результат виглядає на тлі всього реєстру: сукупна статистика — Go.