Усі теги
Тег каталогу

#biophysics

Усі репозиторії публічного реєстру з цим тегом — із тем GitHub або ключових слів, які публікують їхні реєстри пакетів. Здоров'я вимірюється за тією ж версіонованою методологією, що й решта реєстру.

12 записів
З тегом «biophysics»Упорядковано за індексом здоров'я
PyPI
81Добрийіндекс здоров'я
MDAnalysis/mdanalysis
MDAnalysis is a Python library to analyze molecular dynamics simulations.
Python★ 1 610↓ 219.6K/міс21 лип. 2026 р.
Власна ліцензія21 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
67Помірнийіндекс здоров'я
elkins/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 1↓ 3 758/міс15 лип. 2026 р.
MIT15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
63Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-pdb
Generate realistic PDB files with mixed secondary structures for testing, education and bioinformatics tool development. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts..
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
61Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-saxs
A lightweight Python library for simulating Small-Angle X-ray Scattering (SAXS) profiles from protein coordinates, with Jupyter Notebook examples.
Python★ 1↓ 3 502/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
Electrostatics/mmcif_pdbx
Yet another version of PDBx/mmCIF Python implementation
Python★ 915 лип. 2026 р.
CC0-1.015 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
60Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/diff-biophys
Differentiable biophysical modeling in JAX (SAXS, NMR, CD), with Jupyter Notebook examples.
Python★ 017 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
59Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-nmr
NMR spectroscopy calculations for protein structures. Jupyter Notebook tutorials are available to visualize the concepts.
Python★ 217 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/diff-ensemble
Differentiable VAE framework for predicting protein structural ensembles (IDPs) consistent with SAXS and NMR data. Built on JAX/Flax.
Python★ 1↓ 158/міс17 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
56Помірнийіндекс здоров'я
elkins-lab/resonance-flow
JAX-native differentiable protein folding framework integrating experimental NMR constraints (RDCs) and biophysical "self-correction." Several Jupyter Notebooks visualize the concepts.
Python★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
53Помірнийіндекс здоров'я
electrostatics/apbs
Software for biomolecular electrostatics and solvation calculations
C · Python · MATLAB★ 13417 лип. 2026 р.
Власна ліцензія17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
48У зоні ризикуіндекс здоров'я
elkins-lab/synth-dynamics
Fast Langevin dynamics engine using the Anisotropic Network Model (ANM) for rapid protein conformational ensemble generation.
Python · Shell★ 117 лип. 2026 р.
MIT17 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0
PyPI
35У зоні ризикуіндекс здоров'я
electrostatics/go2pdb
Extract PDB entries annotated with specific GO codes
Python · Jupyter Notebook★ 2↓ 998/міс15 лип. 2026 р.
Власна ліцензія15 лип. 2026 р. · метрики 1.13.0